Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M9VQQ2

Protein Details
Accession A0A0M9VQQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-132AEDRVKERKMPKEKKDKKEKKEKKEKKKKSEEAEAKNKPBasic
213-239IVTRGKAFTKEKNKKKRGSYRGGLIDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-126KERKMPKEKKDKKEKKEKKEKKKKSEEA
221-230TKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.666, nucl 10.5, cyto 10.5, cyto_mito 8.333, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGSTKKARREEDTATLSVSAETVSLVHAFLHTHTPKLAPKFASKYPNLALEDQAGNADALSNALVSLVKTAVSVPKSELSVLLRTDDEEEEEAEDRVKERKMPKEKKDKKEKKEKKEKKKKSEEAEAKNKPEEVDANVSIPAPAAPEAVVEETMEVEVPAPQPKKKGPVQGQRFQRVKSENVVFLDERLKDMSYDAKSGAGDWGAKASADLIVTRGKAFTKEKNKKKRGSYRGGLIDQGSHSIKFTYDDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.47
3 0.42
4 0.36
5 0.29
6 0.22
7 0.13
8 0.08
9 0.07
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.18
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.23
23 0.29
24 0.33
25 0.38
26 0.32
27 0.38
28 0.43
29 0.48
30 0.53
31 0.49
32 0.49
33 0.46
34 0.49
35 0.45
36 0.4
37 0.34
38 0.29
39 0.28
40 0.23
41 0.2
42 0.14
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.17
69 0.16
70 0.16
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.11
85 0.11
86 0.15
87 0.2
88 0.3
89 0.41
90 0.5
91 0.59
92 0.67
93 0.77
94 0.82
95 0.88
96 0.88
97 0.87
98 0.89
99 0.9
100 0.89
101 0.91
102 0.91
103 0.91
104 0.92
105 0.93
106 0.93
107 0.94
108 0.91
109 0.86
110 0.86
111 0.84
112 0.81
113 0.81
114 0.75
115 0.66
116 0.58
117 0.52
118 0.41
119 0.33
120 0.25
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.09
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.04
146 0.06
147 0.11
148 0.13
149 0.15
150 0.18
151 0.21
152 0.28
153 0.31
154 0.4
155 0.45
156 0.53
157 0.61
158 0.65
159 0.71
160 0.74
161 0.72
162 0.64
163 0.6
164 0.53
165 0.47
166 0.47
167 0.42
168 0.36
169 0.34
170 0.36
171 0.3
172 0.28
173 0.29
174 0.23
175 0.2
176 0.18
177 0.17
178 0.14
179 0.15
180 0.2
181 0.17
182 0.18
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.18
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.18
206 0.23
207 0.31
208 0.4
209 0.5
210 0.6
211 0.71
212 0.79
213 0.83
214 0.89
215 0.9
216 0.89
217 0.88
218 0.86
219 0.84
220 0.83
221 0.76
222 0.68
223 0.58
224 0.51
225 0.41
226 0.38
227 0.3
228 0.22
229 0.2
230 0.18
231 0.18
232 0.18