Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CT43

Protein Details
Accession Q6CT43    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-93LTGISKSSVRRRKRKLRDELKPKMDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-85VRRRKRKLRD
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG kla:KLLA0_C15565g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MVAKKRTALRTKAAKVTTVEKDHAVQPLTELPPDPKAFLHQPRETKKEKLQNKSQNFISRITDVGKNLTGISKSSVRRRKRKLRDELKPKMDDLLISLQQEGVIRNDEPSQEDLAVEKKASLNSSVTKVITSDAYGSIRGSAPQHKGQLRKNEPNIRNQRGAKALAQQESKRFNEVLLNETFQKNPFDALKEAIRMRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.56
3 0.57
4 0.55
5 0.5
6 0.45
7 0.39
8 0.39
9 0.38
10 0.39
11 0.32
12 0.24
13 0.21
14 0.26
15 0.25
16 0.24
17 0.22
18 0.2
19 0.25
20 0.26
21 0.26
22 0.19
23 0.23
24 0.3
25 0.38
26 0.44
27 0.44
28 0.52
29 0.59
30 0.65
31 0.64
32 0.63
33 0.63
34 0.64
35 0.67
36 0.67
37 0.7
38 0.74
39 0.75
40 0.74
41 0.71
42 0.69
43 0.63
44 0.56
45 0.48
46 0.39
47 0.34
48 0.31
49 0.28
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.16
56 0.13
57 0.11
58 0.14
59 0.17
60 0.21
61 0.3
62 0.38
63 0.46
64 0.56
65 0.65
66 0.73
67 0.78
68 0.85
69 0.86
70 0.88
71 0.89
72 0.9
73 0.89
74 0.86
75 0.76
76 0.66
77 0.56
78 0.46
79 0.35
80 0.27
81 0.21
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.11
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.12
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.16
112 0.17
113 0.16
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.13
128 0.16
129 0.21
130 0.25
131 0.31
132 0.35
133 0.42
134 0.47
135 0.56
136 0.59
137 0.64
138 0.69
139 0.73
140 0.72
141 0.76
142 0.79
143 0.74
144 0.74
145 0.66
146 0.62
147 0.56
148 0.55
149 0.47
150 0.45
151 0.44
152 0.42
153 0.46
154 0.43
155 0.46
156 0.5
157 0.49
158 0.45
159 0.39
160 0.34
161 0.35
162 0.33
163 0.31
164 0.27
165 0.28
166 0.28
167 0.29
168 0.3
169 0.25
170 0.26
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.24
175 0.25
176 0.28
177 0.3
178 0.33