Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M8NTN1

Protein Details
Accession A0A0M8NTN1    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-165KLIGRHKRKRTEDGESRPRRKEGRREKKSRRADEGGDEGGSSRRRERKQRDDKPEVDEBasic
182-201MDEAMKKPAKRRFRKQDGIDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-157GRHKRKRTEDGESRPRRKEGRREKKSRRADEGGDEGGSSRRRERKQR
184-196EAMKKPAKRRFRK
434-442AAARKASRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPDRKVVSPAASPEPEIPEQVATPVAGDNNEGENIIDPISEAKELTEDVDDELHAANDDEDDEDKLSDDESILSEVDEAQFDNFDPENVDVDDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRTEDGESRPRRKEGRREKKSRRADEGGDEGGSSRRRERKQRDDKPEVDEETLDPETRRRRALDRAMDEAMKKPAKRRFRKQDGIDLESMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAINRQEGKPAMHKLKLLPEVIMLLNRNQYTSALVDPEINLLEAVRFFLEPLDDGAMPAYNIQRDLLTAITKLPINKDALIASGIGKVVVFYTKSKRTERRIKEMAEKLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEADYDPTKVVRRAPPTAQEIEAEARARAMLPPRLLNRARVDRTNVSYTVVPRQTAVRESQFARPLGASGEDRFRKMQARQAAARKASRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.37
4 0.39
5 0.35
6 0.32
7 0.28
8 0.22
9 0.21
10 0.21
11 0.18
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.09
27 0.07
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.13
79 0.15
80 0.11
81 0.13
82 0.17
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.33
99 0.42
100 0.5
101 0.61
102 0.68
103 0.76
104 0.76
105 0.77
106 0.77
107 0.78
108 0.8
109 0.81
110 0.81
111 0.76
112 0.75
113 0.72
114 0.7
115 0.71
116 0.71
117 0.72
118 0.76
119 0.83
120 0.88
121 0.91
122 0.93
123 0.9
124 0.86
125 0.8
126 0.73
127 0.67
128 0.6
129 0.51
130 0.4
131 0.32
132 0.25
133 0.23
134 0.22
135 0.19
136 0.21
137 0.28
138 0.34
139 0.45
140 0.55
141 0.62
142 0.71
143 0.8
144 0.84
145 0.84
146 0.81
147 0.77
148 0.72
149 0.63
150 0.52
151 0.43
152 0.32
153 0.28
154 0.25
155 0.19
156 0.14
157 0.17
158 0.22
159 0.24
160 0.26
161 0.25
162 0.28
163 0.36
164 0.45
165 0.49
166 0.46
167 0.47
168 0.46
169 0.45
170 0.42
171 0.35
172 0.33
173 0.28
174 0.25
175 0.28
176 0.34
177 0.44
178 0.52
179 0.61
180 0.66
181 0.72
182 0.81
183 0.78
184 0.79
185 0.75
186 0.69
187 0.59
188 0.48
189 0.38
190 0.28
191 0.24
192 0.14
193 0.08
194 0.04
195 0.03
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.11
204 0.12
205 0.16
206 0.17
207 0.19
208 0.22
209 0.23
210 0.23
211 0.21
212 0.19
213 0.15
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.15
220 0.21
221 0.24
222 0.26
223 0.27
224 0.27
225 0.32
226 0.34
227 0.3
228 0.24
229 0.2
230 0.2
231 0.19
232 0.19
233 0.13
234 0.1
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.15
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.13
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.1
302 0.18
303 0.25
304 0.31
305 0.39
306 0.47
307 0.55
308 0.65
309 0.69
310 0.72
311 0.72
312 0.72
313 0.73
314 0.72
315 0.67
316 0.59
317 0.51
318 0.42
319 0.41
320 0.37
321 0.28
322 0.22
323 0.2
324 0.22
325 0.23
326 0.25
327 0.21
328 0.23
329 0.27
330 0.33
331 0.39
332 0.37
333 0.39
334 0.42
335 0.43
336 0.42
337 0.41
338 0.35
339 0.28
340 0.32
341 0.33
342 0.35
343 0.32
344 0.31
345 0.29
346 0.32
347 0.33
348 0.29
349 0.31
350 0.32
351 0.37
352 0.42
353 0.46
354 0.49
355 0.51
356 0.52
357 0.47
358 0.4
359 0.36
360 0.33
361 0.31
362 0.25
363 0.19
364 0.16
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.19
369 0.21
370 0.24
371 0.31
372 0.34
373 0.42
374 0.44
375 0.47
376 0.5
377 0.54
378 0.56
379 0.55
380 0.59
381 0.56
382 0.61
383 0.59
384 0.51
385 0.44
386 0.42
387 0.4
388 0.42
389 0.38
390 0.33
391 0.29
392 0.32
393 0.33
394 0.33
395 0.36
396 0.33
397 0.35
398 0.38
399 0.44
400 0.47
401 0.44
402 0.42
403 0.36
404 0.31
405 0.28
406 0.29
407 0.24
408 0.21
409 0.31
410 0.31
411 0.34
412 0.35
413 0.36
414 0.4
415 0.41
416 0.46
417 0.46
418 0.51
419 0.57
420 0.64
421 0.7
422 0.69