Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2A9P878

Protein Details
Accession A0A2A9P878    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-190AVRRLFKKQRKWGKDSKLAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-294KKRKPKGIRIK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPRYWCKHCSCYVRDTKLERQNHEATGRHQGAIQRSLRNMHREHEREEREKDQARQEIARLNGLVSGRGGAAPGTTASQARPREATEAERQQQREQLAELGVAMPETLRSDMAMAGEWTVTSTRVIGGEEDDGEAKATGVRKREATSEGQGNADDVGDENEEEAVRRLFKKQRKWGKDSKLAQGDDEARELDALLSGTVIALKTRRGSDNARDRDRDEPQQHIKIDEKAVVGIKREVGTELEAGPVVSGRAEPDPVKEEPDTTAEGLVGAEKTVVFKKRKPKGIRIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.79
3 0.78
4 0.73
5 0.73
6 0.76
7 0.73
8 0.72
9 0.7
10 0.72
11 0.72
12 0.74
13 0.68
14 0.66
15 0.63
16 0.61
17 0.6
18 0.53
19 0.47
20 0.5
21 0.48
22 0.4
23 0.38
24 0.37
25 0.37
26 0.41
27 0.43
28 0.37
29 0.37
30 0.43
31 0.46
32 0.49
33 0.45
34 0.43
35 0.48
36 0.48
37 0.51
38 0.55
39 0.58
40 0.57
41 0.6
42 0.59
43 0.56
44 0.58
45 0.58
46 0.56
47 0.54
48 0.51
49 0.47
50 0.46
51 0.43
52 0.38
53 0.36
54 0.28
55 0.23
56 0.22
57 0.2
58 0.18
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.2
77 0.23
78 0.24
79 0.27
80 0.29
81 0.35
82 0.39
83 0.43
84 0.44
85 0.42
86 0.44
87 0.4
88 0.33
89 0.26
90 0.22
91 0.17
92 0.15
93 0.13
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.05
98 0.04
99 0.03
100 0.04
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.09
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.16
136 0.17
137 0.19
138 0.21
139 0.21
140 0.22
141 0.23
142 0.23
143 0.21
144 0.2
145 0.18
146 0.15
147 0.12
148 0.08
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.14
162 0.22
163 0.3
164 0.39
165 0.49
166 0.59
167 0.65
168 0.72
169 0.76
170 0.78
171 0.81
172 0.75
173 0.74
174 0.71
175 0.63
176 0.55
177 0.49
178 0.43
179 0.34
180 0.3
181 0.21
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.09
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.1
198 0.13
199 0.16
200 0.19
201 0.25
202 0.34
203 0.44
204 0.51
205 0.54
206 0.54
207 0.54
208 0.57
209 0.57
210 0.57
211 0.5
212 0.49
213 0.51
214 0.55
215 0.53
216 0.5
217 0.48
218 0.42
219 0.41
220 0.35
221 0.28
222 0.23
223 0.27
224 0.25
225 0.25
226 0.22
227 0.23
228 0.2
229 0.2
230 0.19
231 0.17
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.12
246 0.12
247 0.16
248 0.2
249 0.21
250 0.25
251 0.24
252 0.23
253 0.23
254 0.25
255 0.24
256 0.2
257 0.2
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.1
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.1
267 0.16
268 0.24
269 0.27
270 0.34
271 0.44
272 0.54
273 0.64
274 0.7