Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2A9PBU7

Protein Details
Accession A0A2A9PBU7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-389LGNYSKPGKRTSKKTKAQTGLQQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-293RRKKRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPLIHDENAPSMVLNPIQSGPSKIKHLDELASELGSDAASIRANEGEAASYGVFFDDTEYDYMQHLRDLNTGGGEVVFVESDSSGNKGKGKQKQSLEDALRTLDLEHKSSGVLDEEILPSKNLTRVTYEAQQDVPDSIRGFQPDMDHRLREVLEALEDDAYVDDDDDIFQALAKDGRELEDFEFDQGDDDDGWESDDTAKPTKEYRDAIPDLVRASDDEPEQGPSQDWLHDFNSFKKEQKKGSMPVVPSQSEMQSNWTTTTNGGRRKKRRGALTDASSYSMTSSSLVRTEQMTLLDARFERLEERYNEDMEDDAGSVSVMSTASSTTGPVRGDFDDILDEFLGNYSKPGKRTSKKTKAQTGLQQLDEIRRELGPPRIRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.62
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.53
8 0.51
9 0.57
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.42
14 0.39
15 0.38
16 0.34
17 0.27
18 0.27
19 0.24
20 0.16
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.14
28 0.15
29 0.19
30 0.22
31 0.24
32 0.29
33 0.3
34 0.32
35 0.34
36 0.36
37 0.35
38 0.31
39 0.31
40 0.27
41 0.24
42 0.22
43 0.17
44 0.14
45 0.11
46 0.1
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.08
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.12
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.11
84 0.09
85 0.07
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.09
95 0.11
96 0.14
97 0.21
98 0.29
99 0.37
100 0.43
101 0.49
102 0.54
103 0.59
104 0.61
105 0.64
106 0.59
107 0.53
108 0.47
109 0.4
110 0.34
111 0.27
112 0.22
113 0.19
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.1
122 0.09
123 0.07
124 0.09
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.15
135 0.17
136 0.21
137 0.27
138 0.27
139 0.25
140 0.24
141 0.24
142 0.21
143 0.19
144 0.17
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.23
155 0.24
156 0.23
157 0.22
158 0.24
159 0.23
160 0.19
161 0.17
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.08
207 0.1
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.15
212 0.18
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.27
217 0.29
218 0.3
219 0.29
220 0.27
221 0.23
222 0.21
223 0.18
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.17
241 0.18
242 0.21
243 0.27
244 0.26
245 0.31
246 0.36
247 0.4
248 0.41
249 0.48
250 0.51
251 0.5
252 0.56
253 0.56
254 0.5
255 0.51
256 0.5
257 0.42
258 0.36
259 0.33
260 0.27
261 0.23
262 0.21
263 0.21
264 0.18
265 0.18
266 0.19
267 0.18
268 0.17
269 0.17
270 0.25
271 0.26
272 0.34
273 0.42
274 0.51
275 0.59
276 0.68
277 0.76
278 0.75
279 0.78
280 0.76
281 0.76
282 0.75
283 0.72
284 0.67
285 0.59
286 0.54
287 0.44
288 0.37
289 0.28
290 0.2
291 0.14
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.14
300 0.15
301 0.14
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.22
313 0.21
314 0.28
315 0.29
316 0.3
317 0.29
318 0.28
319 0.25
320 0.2
321 0.18
322 0.11
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.17
341 0.17
342 0.2
343 0.19
344 0.18
345 0.18
346 0.17
347 0.18
348 0.15
349 0.14
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.09
354 0.1
355 0.16
356 0.2
357 0.22
358 0.31
359 0.4
360 0.48
361 0.59
362 0.69
363 0.73
364 0.79
365 0.87
366 0.89
367 0.87
368 0.86
369 0.85
370 0.84
371 0.8
372 0.71
373 0.65
374 0.57
375 0.56
376 0.49
377 0.41
378 0.32
379 0.26
380 0.27
381 0.28
382 0.35
383 0.36