Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2A9PI27

Protein Details
Accession A0A2A9PI27    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-140ASFHTSSPQPKKKKKKGAPSSMMAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-133PKKKKKKG
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 11, nucl 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034103  Lsm8  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005688  C:U6 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01727  LSm8  
Amino Acid Sequences MTMLQTSSREVEEAILTMSQLNPACLSTFGAVAAPSKNFPEALARSPYRAVHIFSQVSLETGGRERPSCDRRRRALSLSGDHRRLPARICVGHLGLETGELQLRSSEPARVSLLVVASFHTSSPQPKKKKKKGAPSSMMATLGGYLNKKVLVVTVDSRTLIGTLLAADHSTNLVLDKAVERVIREPDDPENSLEVKLGVYVVRGDNVCVVGLVDESLDQSIDWTQVRGSLIGSTKHV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.13
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.15
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.13
26 0.14
27 0.2
28 0.21
29 0.24
30 0.31
31 0.3
32 0.31
33 0.34
34 0.34
35 0.31
36 0.3
37 0.28
38 0.24
39 0.29
40 0.28
41 0.25
42 0.27
43 0.22
44 0.2
45 0.18
46 0.15
47 0.1
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.15
53 0.23
54 0.32
55 0.4
56 0.49
57 0.56
58 0.61
59 0.68
60 0.71
61 0.67
62 0.67
63 0.63
64 0.61
65 0.61
66 0.6
67 0.55
68 0.5
69 0.48
70 0.41
71 0.36
72 0.3
73 0.27
74 0.26
75 0.24
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.21
81 0.16
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.06
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.08
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.13
110 0.22
111 0.3
112 0.39
113 0.49
114 0.6
115 0.69
116 0.8
117 0.82
118 0.84
119 0.86
120 0.88
121 0.84
122 0.77
123 0.7
124 0.6
125 0.52
126 0.41
127 0.3
128 0.2
129 0.14
130 0.11
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.1
148 0.07
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.14
169 0.19
170 0.2
171 0.2
172 0.22
173 0.24
174 0.28
175 0.29
176 0.27
177 0.26
178 0.24
179 0.24
180 0.21
181 0.17
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.1
196 0.1
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.17
217 0.2