Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2A9PJH6

Protein Details
Accession A0A2A9PJH6    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-102PPTPDKWYRVWEKYKREHDEBasic
386-407AALPRKRKTVDIFMRPKKKRVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-145EKNTSKIVERKFLPRAGRVGPKR
262-272KKKKPAVLRAA
390-395RKRKTV
397-406IFMRPKKKRV
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVKSLMELAAMACIKNIRSLEGIGDYLPYQSIRQILLKVDNASQLRQIEVNSPQLQGETGEIWIKIIEKDFPLEYKANAYKPPTPDKWYRVWEKYKREHDEALQESESQLKTALASLKKDKEKNTSKIVERKFLPRAGRVGPKRAVGPRDHSSNTLTFNLGSRTKTNTGASIMRKVRREVKEIATIHGALSRPVRPGTGASDLKRAPAAMIGEHRRAAQPQFRTSAQPSAIEQYEKRATVISDCESDVDDNGEDFFGEAVKKKKPAVLRAASPSKPAAKAQPQPEASTKAATQKHEDASTAKSMAGRGSATLANKFGQRSANRPRATASSSADKASPESATHVEDATTSEPDSYLPTTKTVQDGAVSPKSPEEVIGSLSPPAAHAALPRKRKTVDIFMRPKKKRVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.19
4 0.19
5 0.17
6 0.18
7 0.19
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.17
12 0.18
13 0.15
14 0.14
15 0.14
16 0.12
17 0.1
18 0.12
19 0.14
20 0.16
21 0.18
22 0.2
23 0.23
24 0.28
25 0.31
26 0.32
27 0.31
28 0.35
29 0.34
30 0.33
31 0.34
32 0.29
33 0.26
34 0.25
35 0.24
36 0.22
37 0.25
38 0.31
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.26
43 0.25
44 0.2
45 0.18
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.25
64 0.29
65 0.29
66 0.32
67 0.35
68 0.37
69 0.41
70 0.49
71 0.46
72 0.48
73 0.54
74 0.55
75 0.58
76 0.6
77 0.63
78 0.63
79 0.69
80 0.71
81 0.73
82 0.78
83 0.8
84 0.79
85 0.76
86 0.7
87 0.64
88 0.65
89 0.58
90 0.52
91 0.43
92 0.36
93 0.31
94 0.32
95 0.28
96 0.18
97 0.15
98 0.11
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.17
103 0.21
104 0.28
105 0.35
106 0.42
107 0.47
108 0.48
109 0.53
110 0.59
111 0.61
112 0.63
113 0.62
114 0.63
115 0.67
116 0.66
117 0.63
118 0.56
119 0.57
120 0.53
121 0.51
122 0.47
123 0.42
124 0.43
125 0.41
126 0.48
127 0.44
128 0.47
129 0.44
130 0.42
131 0.44
132 0.44
133 0.43
134 0.37
135 0.4
136 0.37
137 0.4
138 0.39
139 0.36
140 0.34
141 0.32
142 0.31
143 0.26
144 0.22
145 0.16
146 0.16
147 0.19
148 0.18
149 0.18
150 0.16
151 0.2
152 0.22
153 0.25
154 0.24
155 0.22
156 0.23
157 0.27
158 0.27
159 0.3
160 0.33
161 0.35
162 0.36
163 0.38
164 0.44
165 0.42
166 0.45
167 0.42
168 0.41
169 0.45
170 0.43
171 0.42
172 0.34
173 0.31
174 0.26
175 0.24
176 0.19
177 0.12
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.19
187 0.21
188 0.2
189 0.25
190 0.25
191 0.25
192 0.24
193 0.21
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.08
198 0.13
199 0.16
200 0.17
201 0.18
202 0.19
203 0.17
204 0.18
205 0.2
206 0.21
207 0.22
208 0.24
209 0.27
210 0.27
211 0.3
212 0.3
213 0.32
214 0.27
215 0.24
216 0.22
217 0.22
218 0.22
219 0.2
220 0.18
221 0.18
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.19
229 0.15
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.08
247 0.12
248 0.15
249 0.18
250 0.19
251 0.23
252 0.28
253 0.35
254 0.41
255 0.43
256 0.45
257 0.51
258 0.56
259 0.53
260 0.49
261 0.45
262 0.38
263 0.35
264 0.32
265 0.31
266 0.33
267 0.39
268 0.42
269 0.48
270 0.46
271 0.47
272 0.49
273 0.47
274 0.39
275 0.35
276 0.31
277 0.31
278 0.34
279 0.32
280 0.34
281 0.34
282 0.36
283 0.35
284 0.35
285 0.29
286 0.28
287 0.28
288 0.24
289 0.19
290 0.17
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.13
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.17
301 0.17
302 0.19
303 0.19
304 0.2
305 0.25
306 0.25
307 0.32
308 0.41
309 0.49
310 0.48
311 0.48
312 0.48
313 0.45
314 0.46
315 0.43
316 0.37
317 0.36
318 0.36
319 0.37
320 0.35
321 0.3
322 0.28
323 0.25
324 0.22
325 0.14
326 0.17
327 0.18
328 0.19
329 0.19
330 0.18
331 0.16
332 0.15
333 0.17
334 0.15
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.12
340 0.15
341 0.15
342 0.17
343 0.16
344 0.19
345 0.21
346 0.23
347 0.25
348 0.24
349 0.22
350 0.2
351 0.22
352 0.27
353 0.3
354 0.29
355 0.27
356 0.27
357 0.27
358 0.26
359 0.23
360 0.19
361 0.15
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.17
366 0.18
367 0.17
368 0.14
369 0.15
370 0.12
371 0.11
372 0.16
373 0.25
374 0.33
375 0.43
376 0.47
377 0.51
378 0.52
379 0.58
380 0.6
381 0.61
382 0.63
383 0.65
384 0.71
385 0.75
386 0.84
387 0.83