Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VCZ5

Protein Details
Accession A0A0L6VCZ5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-127GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKVVEQVIEDVPAQNAVEGGTEEVPIDMSQRNPNGIEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKKPPETEAEMMIEVFKYTERVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKVKEQEKQALIEEYKQQGKELPEDYKTDKKAWDSNAITPGTPFMTLLTESLRYWIVYKMNTDKGWSQIQVILSDASVPGEGEHKIMDFVRRQRTQPSYDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFADQKKGKGCYTCGQPGHHSSQCQGKPKEKVDEHDTMQKPVERKPFIFLDVGILREYLAVELNIGGLPFQFDLERAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKTNLARMGGFLTDCGTLNLKRIETILEGLASREDEIFRRRREAEERQDQSAKRRKIDNDSQQAHTQSSPSTTQPLPSSHQGTPSNLNLPPKPAFPSGNIGQTTQSAIPGLGTTSFSMLSNADIVKNRFIIRTANMDAAAMLKAELSGKLELPKSAAGVQDSPKTSLETSDATQVEPNTSLEAQGPSDAKPPTPEPAHSKPPDAGNSESADTINGDDSSRDAARPGLPDEESDLTITSAAPAQKRKAEELESVQPVIGTIEDSVVLSEDEDEEETPGDVSVFVPGEPSRPGPLKMLGNNMVEQEDTVKLWEPGYRERYFRQKFGIELNDEVEKRKIVKYYVEGLAWVLAYYYQGCQSWQWYYPYHYSPFASDFTNLEEFEINFNLGQPFKPYEQLMGVFPAASKSHIPEAYHGLMIDDDSPIKDFYPEEFEIDMNGKKMLWQGVALLPFIEQDRLLSSMKGCEEGLAPHDKARNEPGHVVMFCGEAHPQYENFCKIYQKRDNTEAVTLDPAHANGVFGSASPDPDCIPGSTFCSPLPTVGLPDISNDKSIFARFFVAAQLVPHRSLLLNGVTLERPTLSNYDRDKTRRGGNQAHGGNQHYGGDGFHQQRRDFGDGPGIMNYQNNHSSSGPAGGYWNPSRAGPGNHPPHHPPPQPAYSYDYTIPRPQAPYSASTNYGSNNTRGGYRPPYGASHPTAHNPYANHNSNGGYVPPVRYGGTGVGLPQRAPIAYPPPPPSSSTHYSRAGYRPPGIIPAVTRTVPNYHPPGLAQHPSRPPHYQSRGRYLFIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.68
4 0.7
5 0.66
6 0.61
7 0.58
8 0.5
9 0.43
10 0.38
11 0.3
12 0.24
13 0.2
14 0.15
15 0.11
16 0.1
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.14
30 0.21
31 0.24
32 0.26
33 0.27
34 0.28
35 0.3
36 0.29
37 0.29
38 0.25
39 0.24
40 0.23
41 0.22
42 0.22
43 0.17
44 0.16
45 0.13
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.13
53 0.17
54 0.23
55 0.25
56 0.32
57 0.42
58 0.49
59 0.57
60 0.56
61 0.57
62 0.57
63 0.6
64 0.53
65 0.47
66 0.42
67 0.34
68 0.32
69 0.27
70 0.2
71 0.15
72 0.13
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.13
77 0.14
78 0.17
79 0.2
80 0.28
81 0.37
82 0.44
83 0.47
84 0.45
85 0.46
86 0.45
87 0.44
88 0.39
89 0.32
90 0.29
91 0.27
92 0.25
93 0.24
94 0.21
95 0.21
96 0.18
97 0.15
98 0.1
99 0.13
100 0.19
101 0.26
102 0.37
103 0.46
104 0.55
105 0.66
106 0.74
107 0.8
108 0.81
109 0.78
110 0.74
111 0.76
112 0.75
113 0.73
114 0.75
115 0.71
116 0.68
117 0.71
118 0.65
119 0.59
120 0.57
121 0.55
122 0.47
123 0.44
124 0.42
125 0.4
126 0.4
127 0.4
128 0.39
129 0.37
130 0.4
131 0.38
132 0.36
133 0.33
134 0.35
135 0.37
136 0.35
137 0.34
138 0.32
139 0.36
140 0.41
141 0.45
142 0.45
143 0.43
144 0.42
145 0.42
146 0.46
147 0.46
148 0.5
149 0.45
150 0.48
151 0.51
152 0.48
153 0.43
154 0.36
155 0.34
156 0.25
157 0.21
158 0.16
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.14
170 0.17
171 0.19
172 0.19
173 0.24
174 0.29
175 0.34
176 0.35
177 0.37
178 0.35
179 0.35
180 0.38
181 0.34
182 0.29
183 0.26
184 0.27
185 0.24
186 0.23
187 0.19
188 0.14
189 0.13
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.16
203 0.2
204 0.28
205 0.37
206 0.4
207 0.42
208 0.49
209 0.54
210 0.56
211 0.57
212 0.6
213 0.59
214 0.64
215 0.65
216 0.6
217 0.6
218 0.54
219 0.46
220 0.38
221 0.31
222 0.23
223 0.23
224 0.2
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.08
231 0.04
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.17
241 0.17
242 0.2
243 0.25
244 0.26
245 0.27
246 0.29
247 0.27
248 0.35
249 0.35
250 0.35
251 0.33
252 0.34
253 0.35
254 0.35
255 0.35
256 0.29
257 0.32
258 0.35
259 0.4
260 0.45
261 0.45
262 0.45
263 0.46
264 0.48
265 0.51
266 0.47
267 0.41
268 0.35
269 0.41
270 0.44
271 0.49
272 0.48
273 0.48
274 0.53
275 0.58
276 0.66
277 0.59
278 0.6
279 0.57
280 0.58
281 0.53
282 0.55
283 0.51
284 0.43
285 0.43
286 0.41
287 0.36
288 0.37
289 0.43
290 0.37
291 0.36
292 0.38
293 0.38
294 0.37
295 0.36
296 0.29
297 0.26
298 0.23
299 0.23
300 0.19
301 0.16
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.07
354 0.06
355 0.08
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.16
361 0.18
362 0.21
363 0.23
364 0.24
365 0.24
366 0.24
367 0.25
368 0.19
369 0.18
370 0.14
371 0.11
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.14
378 0.16
379 0.15
380 0.14
381 0.15
382 0.15
383 0.14
384 0.15
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.16
396 0.22
397 0.24
398 0.29
399 0.3
400 0.34
401 0.41
402 0.48
403 0.52
404 0.55
405 0.57
406 0.56
407 0.6
408 0.57
409 0.59
410 0.59
411 0.53
412 0.47
413 0.5
414 0.49
415 0.53
416 0.62
417 0.62
418 0.63
419 0.62
420 0.61
421 0.58
422 0.55
423 0.47
424 0.38
425 0.28
426 0.19
427 0.18
428 0.16
429 0.14
430 0.17
431 0.16
432 0.18
433 0.2
434 0.22
435 0.23
436 0.25
437 0.29
438 0.26
439 0.32
440 0.32
441 0.31
442 0.32
443 0.3
444 0.3
445 0.27
446 0.29
447 0.23
448 0.25
449 0.25
450 0.22
451 0.24
452 0.23
453 0.22
454 0.21
455 0.26
456 0.24
457 0.28
458 0.28
459 0.25
460 0.23
461 0.22
462 0.22
463 0.16
464 0.14
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.09
482 0.11
483 0.12
484 0.13
485 0.14
486 0.15
487 0.14
488 0.15
489 0.15
490 0.14
491 0.19
492 0.19
493 0.18
494 0.17
495 0.17
496 0.16
497 0.14
498 0.12
499 0.07
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.1
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.1
517 0.12
518 0.14
519 0.17
520 0.17
521 0.18
522 0.17
523 0.17
524 0.16
525 0.15
526 0.15
527 0.12
528 0.12
529 0.16
530 0.16
531 0.15
532 0.16
533 0.15
534 0.14
535 0.13
536 0.13
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.08
543 0.09
544 0.1
545 0.09
546 0.13
547 0.13
548 0.12
549 0.14
550 0.15
551 0.17
552 0.18
553 0.2
554 0.23
555 0.28
556 0.36
557 0.35
558 0.36
559 0.34
560 0.35
561 0.36
562 0.31
563 0.27
564 0.21
565 0.21
566 0.2
567 0.19
568 0.15
569 0.12
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.08
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.08
582 0.09
583 0.11
584 0.12
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.14
589 0.14
590 0.13
591 0.11
592 0.1
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.06
597 0.07
598 0.08
599 0.1
600 0.13
601 0.15
602 0.18
603 0.2
604 0.21
605 0.22
606 0.24
607 0.24
608 0.26
609 0.29
610 0.27
611 0.26
612 0.24
613 0.2
614 0.17
615 0.15
616 0.1
617 0.05
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.07
645 0.08
646 0.09
647 0.11
648 0.12
649 0.14
650 0.14
651 0.18
652 0.2
653 0.21
654 0.25
655 0.26
656 0.26
657 0.25
658 0.24
659 0.2
660 0.17
661 0.15
662 0.12
663 0.08
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.1
670 0.11
671 0.17
672 0.23
673 0.25
674 0.27
675 0.29
676 0.4
677 0.41
678 0.41
679 0.39
680 0.34
681 0.34
682 0.37
683 0.39
684 0.29
685 0.27
686 0.26
687 0.26
688 0.24
689 0.24
690 0.2
691 0.16
692 0.16
693 0.17
694 0.18
695 0.16
696 0.19
697 0.22
698 0.26
699 0.27
700 0.25
701 0.23
702 0.21
703 0.2
704 0.16
705 0.12
706 0.06
707 0.04
708 0.04
709 0.05
710 0.05
711 0.06
712 0.07
713 0.07
714 0.08
715 0.1
716 0.13
717 0.15
718 0.17
719 0.17
720 0.21
721 0.25
722 0.28
723 0.28
724 0.27
725 0.25
726 0.24
727 0.25
728 0.22
729 0.19
730 0.16
731 0.15
732 0.16
733 0.18
734 0.16
735 0.14
736 0.14
737 0.13
738 0.13
739 0.13
740 0.1
741 0.08
742 0.09
743 0.1
744 0.09
745 0.09
746 0.1
747 0.13
748 0.13
749 0.16
750 0.16
751 0.16
752 0.17
753 0.18
754 0.16
755 0.15
756 0.14
757 0.11
758 0.11
759 0.11
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.15
765 0.17
766 0.18
767 0.18
768 0.23
769 0.24
770 0.23
771 0.21
772 0.16
773 0.14
774 0.14
775 0.12
776 0.07
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.07
781 0.08
782 0.08
783 0.08
784 0.09
785 0.16
786 0.16
787 0.17
788 0.17
789 0.17
790 0.17
791 0.19
792 0.19
793 0.12
794 0.12
795 0.1
796 0.1
797 0.13
798 0.13
799 0.11
800 0.11
801 0.12
802 0.15
803 0.16
804 0.15
805 0.13
806 0.11
807 0.11
808 0.11
809 0.1
810 0.06
811 0.06
812 0.08
813 0.1
814 0.11
815 0.11
816 0.11
817 0.14
818 0.14
819 0.15
820 0.14
821 0.12
822 0.12
823 0.13
824 0.15
825 0.17
826 0.17
827 0.19
828 0.23
829 0.23
830 0.24
831 0.3
832 0.31
833 0.29
834 0.3
835 0.3
836 0.31
837 0.31
838 0.29
839 0.23
840 0.2
841 0.16
842 0.15
843 0.13
844 0.08
845 0.09
846 0.1
847 0.1
848 0.12
849 0.17
850 0.19
851 0.2
852 0.21
853 0.27
854 0.3
855 0.39
856 0.45
857 0.49
858 0.52
859 0.56
860 0.58
861 0.53
862 0.53
863 0.44
864 0.36
865 0.31
866 0.25
867 0.21
868 0.17
869 0.14
870 0.12
871 0.11
872 0.1
873 0.07
874 0.08
875 0.06
876 0.06
877 0.1
878 0.09
879 0.1
880 0.11
881 0.11
882 0.11
883 0.13
884 0.14
885 0.11
886 0.13
887 0.13
888 0.18
889 0.19
890 0.19
891 0.18
892 0.21
893 0.2
894 0.18
895 0.2
896 0.16
897 0.16
898 0.16
899 0.18
900 0.14
901 0.16
902 0.2
903 0.17
904 0.19
905 0.17
906 0.18
907 0.17
908 0.19
909 0.18
910 0.14
911 0.16
912 0.14
913 0.14
914 0.14
915 0.14
916 0.13
917 0.13
918 0.18
919 0.17
920 0.18
921 0.17
922 0.17
923 0.16
924 0.16
925 0.18
926 0.14
927 0.13
928 0.13
929 0.15
930 0.15
931 0.15
932 0.15
933 0.12
934 0.12
935 0.12
936 0.16
937 0.16
938 0.23
939 0.27
940 0.33
941 0.39
942 0.43
943 0.46
944 0.46
945 0.53
946 0.53
947 0.56
948 0.59
949 0.59
950 0.64
951 0.61
952 0.61
953 0.56
954 0.51
955 0.45
956 0.37
957 0.31
958 0.22
959 0.2
960 0.15
961 0.15
962 0.19
963 0.22
964 0.25
965 0.3
966 0.29
967 0.33
968 0.38
969 0.41
970 0.36
971 0.32
972 0.36
973 0.32
974 0.34
975 0.32
976 0.27
977 0.21
978 0.22
979 0.22
980 0.19
981 0.22
982 0.22
983 0.23
984 0.23
985 0.24
986 0.22
987 0.25
988 0.2
989 0.16
990 0.17
991 0.15
992 0.21
993 0.22
994 0.23
995 0.2
996 0.2
997 0.24
998 0.26
999 0.29
1000 0.3
1001 0.39
1002 0.46
1003 0.5
1004 0.54
1005 0.57
1006 0.62
1007 0.67
1008 0.64
1009 0.6
1010 0.58
1011 0.61
1012 0.59
1013 0.55
1014 0.53
1015 0.46
1016 0.45
1017 0.43
1018 0.4
1019 0.37
1020 0.4
1021 0.41
1022 0.38
1023 0.38
1024 0.35
1025 0.37
1026 0.35
1027 0.35
1028 0.36
1029 0.36
1030 0.35
1031 0.33
1032 0.34
1033 0.3
1034 0.34
1035 0.32
1036 0.27
1037 0.26
1038 0.24
1039 0.26
1040 0.27
1041 0.31
1042 0.32
1043 0.32
1044 0.34
1045 0.34
1046 0.37
1047 0.39
1048 0.42
1049 0.41
1050 0.39
1051 0.39
1052 0.42
1053 0.45
1054 0.43
1055 0.41
1056 0.37
1057 0.4
1058 0.45
1059 0.47
1060 0.42
1061 0.39
1062 0.38
1063 0.36
1064 0.36
1065 0.29
1066 0.24
1067 0.21
1068 0.22
1069 0.22
1070 0.22
1071 0.21
1072 0.2
1073 0.2
1074 0.18
1075 0.17
1076 0.15
1077 0.16
1078 0.2
1079 0.2
1080 0.2
1081 0.2
1082 0.2
1083 0.18
1084 0.18
1085 0.2
1086 0.22
1087 0.28
1088 0.35
1089 0.38
1090 0.42
1091 0.44
1092 0.46
1093 0.46
1094 0.46
1095 0.47
1096 0.46
1097 0.48
1098 0.48
1099 0.49
1100 0.52
1101 0.54
1102 0.54
1103 0.53
1104 0.51
1105 0.48
1106 0.43
1107 0.46
1108 0.41
1109 0.36
1110 0.3
1111 0.3
1112 0.3
1113 0.28
1114 0.27
1115 0.26
1116 0.29
1117 0.3
1118 0.36
1119 0.36
1120 0.35
1121 0.35
1122 0.36
1123 0.39
1124 0.42
1125 0.46
1126 0.43
1127 0.45
1128 0.51
1129 0.54
1130 0.59
1131 0.58
1132 0.58
1133 0.61
1134 0.66
1135 0.67
1136 0.67
1137 0.73
1138 0.73