Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VTM2

Protein Details
Accession A0A0L6VTM2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-43NKVTRSKVSKSLKRDKAQAKLARRVQQKKAEAHydrophilic
429-457TTITPLQPARPSKKRKQKSKTSAGIEEKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-39SKSLKRDKAQAKLARRVQQK
438-448RPSKKRKQKSK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAVINSTSQIANKVTRSKVSKSLKRDKAQAKLARRVQQKKAEAADPTLREARLKANVPRTIERTKEWLGDDVDDERMLPVKVEYSAQTEEGTDGAEPGLENVHFDMGRLHDLFAPYMNQDIPPAASTDEPPHTEQDPLPDQAPNRPEEPAVELQDQPRTLITTSPRPSEFTLAFVHELGGLFGGSRHCDVIPRKTKRFELTRVCRWACERGYGSMVVIGEAHGGRNRSGPTHMTISRLPYGPTASFRMTSIVPSKAIPGHAKPTSHFPELVLSNFSTPLGLSIGTLLQSVFPPLPELVGRQVVSMQNQRDFVFFRRYRYVFAEREKVFLKEGDETIRTRLQEIGPRFTLKVRWLKRGTLAGGLNQNVLPGQIGKERKLGELERQQEASRAGRRRQERSKVADGTSTCSQNLSFLDPSAPTASSSETGPTTITPLQPARPSKKRKQKSKTSAGIEEKFLRGERSDSEDPETSEQPRKSGGLNEFMKNVKQRASQGRNTSRELEWEWKPNMGVSRRKFFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.48
4 0.5
5 0.56
6 0.62
7 0.65
8 0.68
9 0.75
10 0.78
11 0.79
12 0.83
13 0.82
14 0.8
15 0.82
16 0.81
17 0.79
18 0.79
19 0.81
20 0.79
21 0.81
22 0.8
23 0.79
24 0.8
25 0.78
26 0.75
27 0.72
28 0.68
29 0.6
30 0.58
31 0.56
32 0.48
33 0.47
34 0.43
35 0.38
36 0.35
37 0.33
38 0.33
39 0.33
40 0.38
41 0.4
42 0.45
43 0.5
44 0.54
45 0.59
46 0.59
47 0.58
48 0.55
49 0.51
50 0.48
51 0.47
52 0.45
53 0.41
54 0.4
55 0.35
56 0.33
57 0.32
58 0.27
59 0.25
60 0.2
61 0.18
62 0.14
63 0.14
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.16
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.09
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.15
115 0.18
116 0.2
117 0.21
118 0.23
119 0.23
120 0.24
121 0.23
122 0.25
123 0.26
124 0.25
125 0.24
126 0.24
127 0.24
128 0.27
129 0.3
130 0.25
131 0.23
132 0.22
133 0.21
134 0.2
135 0.25
136 0.23
137 0.24
138 0.24
139 0.25
140 0.25
141 0.29
142 0.28
143 0.23
144 0.19
145 0.16
146 0.14
147 0.17
148 0.19
149 0.25
150 0.28
151 0.31
152 0.31
153 0.32
154 0.33
155 0.34
156 0.3
157 0.24
158 0.23
159 0.2
160 0.2
161 0.18
162 0.16
163 0.12
164 0.12
165 0.09
166 0.07
167 0.05
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.13
176 0.17
177 0.26
178 0.36
179 0.43
180 0.48
181 0.51
182 0.56
183 0.58
184 0.61
185 0.6
186 0.6
187 0.61
188 0.64
189 0.68
190 0.64
191 0.59
192 0.54
193 0.52
194 0.42
195 0.39
196 0.32
197 0.26
198 0.27
199 0.25
200 0.23
201 0.17
202 0.16
203 0.11
204 0.09
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.2
219 0.21
220 0.21
221 0.22
222 0.24
223 0.24
224 0.23
225 0.21
226 0.17
227 0.18
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.18
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.26
251 0.29
252 0.28
253 0.27
254 0.21
255 0.23
256 0.23
257 0.24
258 0.17
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.13
289 0.14
290 0.17
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.22
295 0.23
296 0.21
297 0.22
298 0.22
299 0.28
300 0.27
301 0.3
302 0.35
303 0.36
304 0.38
305 0.42
306 0.45
307 0.4
308 0.43
309 0.47
310 0.4
311 0.43
312 0.41
313 0.36
314 0.3
315 0.26
316 0.23
317 0.17
318 0.17
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.21
323 0.22
324 0.21
325 0.19
326 0.21
327 0.2
328 0.25
329 0.27
330 0.3
331 0.29
332 0.3
333 0.3
334 0.29
335 0.29
336 0.29
337 0.36
338 0.35
339 0.42
340 0.43
341 0.45
342 0.48
343 0.5
344 0.44
345 0.41
346 0.37
347 0.31
348 0.32
349 0.31
350 0.27
351 0.22
352 0.2
353 0.14
354 0.13
355 0.1
356 0.06
357 0.08
358 0.13
359 0.16
360 0.17
361 0.22
362 0.24
363 0.25
364 0.29
365 0.29
366 0.32
367 0.37
368 0.4
369 0.38
370 0.39
371 0.38
372 0.36
373 0.37
374 0.34
375 0.34
376 0.37
377 0.39
378 0.45
379 0.52
380 0.58
381 0.65
382 0.69
383 0.7
384 0.7
385 0.74
386 0.71
387 0.65
388 0.61
389 0.52
390 0.48
391 0.44
392 0.38
393 0.29
394 0.25
395 0.24
396 0.21
397 0.21
398 0.2
399 0.16
400 0.15
401 0.16
402 0.16
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.13
407 0.13
408 0.15
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.14
417 0.16
418 0.16
419 0.19
420 0.21
421 0.25
422 0.32
423 0.4
424 0.45
425 0.52
426 0.61
427 0.67
428 0.75
429 0.81
430 0.85
431 0.88
432 0.9
433 0.91
434 0.92
435 0.91
436 0.88
437 0.87
438 0.84
439 0.77
440 0.71
441 0.64
442 0.54
443 0.47
444 0.4
445 0.33
446 0.26
447 0.25
448 0.23
449 0.28
450 0.31
451 0.31
452 0.35
453 0.35
454 0.37
455 0.38
456 0.38
457 0.34
458 0.39
459 0.38
460 0.34
461 0.34
462 0.33
463 0.31
464 0.36
465 0.35
466 0.37
467 0.4
468 0.41
469 0.42
470 0.43
471 0.46
472 0.43
473 0.42
474 0.39
475 0.39
476 0.46
477 0.53
478 0.59
479 0.63
480 0.68
481 0.75
482 0.74
483 0.73
484 0.69
485 0.59
486 0.56
487 0.53
488 0.49
489 0.45
490 0.48
491 0.45
492 0.43
493 0.43
494 0.41
495 0.44
496 0.45
497 0.49
498 0.48