Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VJP5

Protein Details
Accession A0A0L6VJP5    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-85ASFIQQKRPRFHTNHPYSRPPIHydrophilic
460-483ARARDELRKERRKEREREMRMNNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-295RFKHKKIPRGPPSPPAPILRSPP
467-476RKERRKERER
664-666KRR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATLLQTLPAPSHPTLEEEEVESAHETSTHEASISAPPVQIPPYGARKGWKPRLLDQLSRSMNASFIQQKRPRFHTNHPYSRPPIIHQTSTSSFGDGGAYPECHIAQYPLEMGRKKHVSSAESTLFESRIYHNPADELAVQRRQASVGNTLALTVDGEGKIDYTKIAKQGHRDGRHVQAQFKDLVPLAHRADLDESAREMQRPSAEEVQATTDRTRLQLEKITNTRIKAAQPKHVPETGGSVSFVRYTPNGEEGKQRIIKMVETVEDPLEPPRFKHKKIPRGPPSPPAPILRSPPRKVTSEEQKNWMIPPCISNWKNNKGYTIPLDKRLAADGRGLQDTHINDRFAQLSESLYVADRVAREDVRQRAMLKQRLAQKEKEEKEENLRLLAQRAREERSGISRVVAGTSSGNNMSAALAGYGSDSGSDDHQGGDSERGGQRSKKAGEADDSDGSEEADDEAARARDELRKERRKEREREMRMNNMGNEKRAQHFARTQNRDIGEKIALGLAKPTMSKESMIDSRLFNQEKLNGSFGDEDSYNLYDRPLFSGSSAAAAIYKRGGATADDDEPSGATDERYGGGTEEGISHAMRNDRFGLGVAGKGFEGAELQESRDGPVQFERDTTLMASDPFAIDAFLDEAKKGVKRGLDPGSSKNRDEDPQDSKKRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.28
4 0.27
5 0.24
6 0.24
7 0.21
8 0.22
9 0.2
10 0.16
11 0.13
12 0.13
13 0.11
14 0.14
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.15
20 0.19
21 0.2
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.19
26 0.21
27 0.2
28 0.18
29 0.21
30 0.28
31 0.31
32 0.32
33 0.35
34 0.43
35 0.52
36 0.6
37 0.59
38 0.57
39 0.61
40 0.7
41 0.72
42 0.7
43 0.64
44 0.64
45 0.61
46 0.56
47 0.5
48 0.39
49 0.34
50 0.27
51 0.29
52 0.27
53 0.29
54 0.39
55 0.43
56 0.51
57 0.57
58 0.64
59 0.68
60 0.66
61 0.71
62 0.72
63 0.77
64 0.8
65 0.79
66 0.8
67 0.75
68 0.76
69 0.68
70 0.61
71 0.61
72 0.56
73 0.53
74 0.46
75 0.48
76 0.44
77 0.46
78 0.42
79 0.32
80 0.26
81 0.23
82 0.23
83 0.16
84 0.16
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.14
96 0.17
97 0.23
98 0.25
99 0.27
100 0.34
101 0.38
102 0.37
103 0.4
104 0.4
105 0.37
106 0.39
107 0.45
108 0.41
109 0.38
110 0.38
111 0.35
112 0.3
113 0.27
114 0.24
115 0.2
116 0.22
117 0.26
118 0.25
119 0.24
120 0.25
121 0.25
122 0.26
123 0.24
124 0.22
125 0.22
126 0.25
127 0.26
128 0.26
129 0.26
130 0.24
131 0.25
132 0.22
133 0.22
134 0.19
135 0.2
136 0.19
137 0.18
138 0.17
139 0.15
140 0.12
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.11
152 0.17
153 0.24
154 0.26
155 0.33
156 0.43
157 0.52
158 0.54
159 0.56
160 0.54
161 0.55
162 0.6
163 0.56
164 0.5
165 0.43
166 0.41
167 0.39
168 0.34
169 0.29
170 0.22
171 0.22
172 0.19
173 0.21
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.19
178 0.2
179 0.21
180 0.2
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.17
189 0.18
190 0.21
191 0.24
192 0.24
193 0.23
194 0.23
195 0.26
196 0.25
197 0.24
198 0.2
199 0.16
200 0.17
201 0.18
202 0.2
203 0.17
204 0.18
205 0.23
206 0.25
207 0.3
208 0.33
209 0.39
210 0.39
211 0.38
212 0.38
213 0.34
214 0.36
215 0.38
216 0.38
217 0.4
218 0.44
219 0.48
220 0.48
221 0.48
222 0.44
223 0.35
224 0.37
225 0.29
226 0.24
227 0.2
228 0.16
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.1
233 0.09
234 0.11
235 0.11
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.23
240 0.24
241 0.31
242 0.32
243 0.3
244 0.27
245 0.27
246 0.26
247 0.23
248 0.22
249 0.16
250 0.14
251 0.15
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.24
260 0.29
261 0.31
262 0.41
263 0.48
264 0.55
265 0.64
266 0.74
267 0.72
268 0.75
269 0.77
270 0.74
271 0.7
272 0.64
273 0.57
274 0.49
275 0.43
276 0.38
277 0.4
278 0.43
279 0.45
280 0.43
281 0.48
282 0.48
283 0.46
284 0.47
285 0.49
286 0.5
287 0.52
288 0.53
289 0.5
290 0.49
291 0.47
292 0.45
293 0.4
294 0.31
295 0.21
296 0.19
297 0.18
298 0.25
299 0.25
300 0.31
301 0.35
302 0.42
303 0.47
304 0.46
305 0.45
306 0.37
307 0.39
308 0.36
309 0.39
310 0.32
311 0.32
312 0.33
313 0.31
314 0.3
315 0.29
316 0.25
317 0.17
318 0.17
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.14
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.17
331 0.18
332 0.15
333 0.15
334 0.1
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.16
349 0.19
350 0.2
351 0.22
352 0.22
353 0.27
354 0.35
355 0.39
356 0.35
357 0.37
358 0.42
359 0.49
360 0.52
361 0.48
362 0.49
363 0.53
364 0.53
365 0.56
366 0.51
367 0.44
368 0.48
369 0.5
370 0.42
371 0.34
372 0.32
373 0.26
374 0.26
375 0.26
376 0.21
377 0.21
378 0.23
379 0.25
380 0.24
381 0.25
382 0.24
383 0.27
384 0.27
385 0.22
386 0.2
387 0.18
388 0.17
389 0.16
390 0.14
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.08
420 0.12
421 0.13
422 0.16
423 0.18
424 0.19
425 0.23
426 0.29
427 0.3
428 0.3
429 0.31
430 0.31
431 0.32
432 0.34
433 0.34
434 0.28
435 0.27
436 0.23
437 0.21
438 0.19
439 0.15
440 0.11
441 0.07
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.09
450 0.13
451 0.18
452 0.28
453 0.37
454 0.46
455 0.53
456 0.62
457 0.71
458 0.77
459 0.8
460 0.81
461 0.81
462 0.81
463 0.85
464 0.81
465 0.79
466 0.75
467 0.71
468 0.63
469 0.61
470 0.54
471 0.46
472 0.43
473 0.36
474 0.34
475 0.36
476 0.35
477 0.31
478 0.37
479 0.45
480 0.52
481 0.57
482 0.57
483 0.56
484 0.57
485 0.53
486 0.46
487 0.4
488 0.3
489 0.23
490 0.21
491 0.16
492 0.15
493 0.12
494 0.12
495 0.1
496 0.09
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.13
501 0.14
502 0.14
503 0.19
504 0.21
505 0.23
506 0.24
507 0.22
508 0.25
509 0.32
510 0.33
511 0.28
512 0.28
513 0.31
514 0.34
515 0.35
516 0.34
517 0.26
518 0.26
519 0.27
520 0.24
521 0.22
522 0.17
523 0.15
524 0.16
525 0.17
526 0.15
527 0.13
528 0.14
529 0.12
530 0.13
531 0.16
532 0.15
533 0.14
534 0.14
535 0.16
536 0.15
537 0.15
538 0.14
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.1
548 0.09
549 0.13
550 0.16
551 0.17
552 0.17
553 0.18
554 0.17
555 0.16
556 0.16
557 0.14
558 0.1
559 0.08
560 0.09
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.12
575 0.17
576 0.17
577 0.19
578 0.21
579 0.21
580 0.21
581 0.21
582 0.21
583 0.17
584 0.19
585 0.16
586 0.15
587 0.14
588 0.14
589 0.13
590 0.09
591 0.09
592 0.07
593 0.11
594 0.11
595 0.13
596 0.16
597 0.16
598 0.19
599 0.24
600 0.23
601 0.21
602 0.27
603 0.29
604 0.26
605 0.27
606 0.27
607 0.22
608 0.23
609 0.21
610 0.17
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.12
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.09
619 0.08
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.11
624 0.1
625 0.11
626 0.15
627 0.18
628 0.18
629 0.2
630 0.24
631 0.27
632 0.35
633 0.42
634 0.46
635 0.47
636 0.55
637 0.62
638 0.62
639 0.59
640 0.56
641 0.53
642 0.5
643 0.52
644 0.5
645 0.49
646 0.55
647 0.64