FuNGI

A0A0L6VJK0

Protein Details

Accession

A0A0L6VJK0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
230-249	KSTRCKTGFHNPKQDKNHSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 9, cyto 5, pero 1, E.R. 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MANNVPRSAPVVPIAPVGANDGFRQAMLKTALETIPQLNEENYSIWKDKVTALLKLRGVLTALNNTQIPLGESDNAELTMLLLSKMDSVTHQNVVTADNSESAQKIWSSIKERFASSQSSNRARMFNDFLYVKFQEDAIETFVTDIKVSIKKLVDVGIELPQDILAYLVLFKFPNSLQSLKRQIMHSDKDLTVKFETSSKPTEAALFNSKGKSSKASGNERLDGPNSSSKSTRCKTGFHNPKQDKNHSSDNCWHLHPEIAPDWWRESQEQWKANKGKEKTNYFMSLLTLWIESGDPKSRIILDSGASAHIFNDERFFEYLEFGEFDVIKTGKHNATMPIKGKGTVRLTWGKASIALSNCLYVPDIVINLISAGKLDSKGCTLRAENSNFIVSKDGKLVLKGLIKNGLYSVNNPSSIGSKNNDTLANISLPKELLRETHEKFGHASIQRIEPFIDRSISKSERDQFECKACILAKITKQSFNNESKLASRPFEHLHLDLIGPIKPESSLKHRFILTVVDNHTGYLAGFPLVNKDDTTDVLIDLLESEKSRRGYFPSLICSDGGGEFIGHRAERANRTIVESMRATLNGSGIPKRFWHEIVKSCCLGLNQLPKKGNTSSPWELLHDRQFPTNFLRPIGTPAVVLNMTGIKGRKFDSKGEEGRLIGFNVPLLLYRVITQSGRIVESKHVRFLKRDDSVIKVDVDNELQFLPEDYPRSQELVPPAIESTPANNHRENNPDRDDSAESDENSSDESNHEIEQQLTQPTSTPTPPVQQTSRILRDRSLIKPPTRYGFHHYYEPNTFESAIRCNDAKYWKQAIEKERFSNSSRHEPNTILGMKFERENNKIKLSLPNHIEHGLEELGLTNCKTSTTPLTPNLKLREASDDDHSRFKKLNINYRSAIGLLNHIAQLTRPDISFAVSSLARYSVKPGMTHWHEVKKVWQYLKGTADLKLTLEIKHPNQLLQIYSDASWGDDPQDRTSQSGHLCFLFGSLISWNSSKQRCVTYSSTEAELNPLVDAFHEGIWLKALLAEMWHIQLDAATHLIDDPDLLEQLMISEEEFNLKFTNEHLIDNKGLDDKPNSPSPVTGSVGILPPLFLFRFLFSVTSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.17
3	0.16
4	0.18
5	0.17
6	0.16
7	0.16
8	0.17
9	0.16
10	0.15
11	0.17
12	0.12
13	0.16
14	0.17
15	0.18
16	0.17
17	0.2
18	0.21
19	0.21
20	0.23
21	0.19
22	0.19
23	0.2
24	0.2
25	0.17
26	0.19
27	0.19
28	0.19
29	0.19
30	0.22
31	0.23
32	0.22
33	0.23
34	0.22
35	0.23
36	0.3
37	0.31
38	0.34
39	0.37
40	0.43
41	0.43
42	0.44
43	0.42
44	0.34
45	0.31
46	0.26
47	0.24
48	0.25
49	0.24
50	0.25
51	0.25
52	0.24
53	0.24
54	0.21
55	0.2
56	0.14
57	0.16
58	0.15
59	0.16
60	0.17
61	0.17
62	0.17
63	0.15
64	0.12
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.07
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.16
76	0.19
77	0.23
78	0.23
79	0.23
80	0.23
81	0.24
82	0.23
83	0.19
84	0.16
85	0.14
86	0.15
87	0.15
88	0.14
89	0.13
90	0.14
91	0.12
92	0.14
93	0.17
94	0.23
95	0.28
96	0.33
97	0.41
98	0.41
99	0.44
100	0.44
101	0.43
102	0.43
103	0.42
104	0.45
105	0.46
106	0.5
107	0.53
108	0.52
109	0.52
110	0.47
111	0.48
112	0.46
113	0.38
114	0.38
115	0.34
116	0.31
117	0.34
118	0.34
119	0.29
120	0.23
121	0.22
122	0.17
123	0.18
124	0.19
125	0.16
126	0.15
127	0.13
128	0.14
129	0.15
130	0.14
131	0.12
132	0.11
133	0.13
134	0.17
135	0.18
136	0.23
137	0.22
138	0.23
139	0.25
140	0.27
141	0.23
142	0.2
143	0.21
144	0.21
145	0.2
146	0.19
147	0.17
148	0.14
149	0.13
150	0.12
151	0.1
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.05
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.1
160	0.1
161	0.15
162	0.19
163	0.23
164	0.25
165	0.34
166	0.42
167	0.43
168	0.47
169	0.43
170	0.46
171	0.51
172	0.53
173	0.48
174	0.46
175	0.44
176	0.46
177	0.44
178	0.41
179	0.34
180	0.3
181	0.26
182	0.25
183	0.27
184	0.26
185	0.29
186	0.27
187	0.27
188	0.26
189	0.29
190	0.26
191	0.28
192	0.29
193	0.29
194	0.3
195	0.31
196	0.32
197	0.3
198	0.3
199	0.29
200	0.26
201	0.3
202	0.36
203	0.43
204	0.51
205	0.54
206	0.55
207	0.53
208	0.52
209	0.46
210	0.4
211	0.34
212	0.33
213	0.29
214	0.28
215	0.3
216	0.3
217	0.38
218	0.38
219	0.43
220	0.38
221	0.41
222	0.46
223	0.54
224	0.62
225	0.62
226	0.71
227	0.69
228	0.75
229	0.8
230	0.81
231	0.75
232	0.7
233	0.71
234	0.62
235	0.61
236	0.6
237	0.57
238	0.51
239	0.47
240	0.43
241	0.33
242	0.33
243	0.28
244	0.25
245	0.21
246	0.22
247	0.23
248	0.23
249	0.26
250	0.25
251	0.26
252	0.23
253	0.25
254	0.31
255	0.37
256	0.42
257	0.41
258	0.49
259	0.52
260	0.56
261	0.6
262	0.54
263	0.55
264	0.57
265	0.61
266	0.56
267	0.56
268	0.55
269	0.48
270	0.45
271	0.37
272	0.29
273	0.23
274	0.19
275	0.13
276	0.09
277	0.09
278	0.08
279	0.07
280	0.1
281	0.15
282	0.15
283	0.15
284	0.16
285	0.17
286	0.18
287	0.18
288	0.17
289	0.12
290	0.13
291	0.14
292	0.14
293	0.13
294	0.12
295	0.1
296	0.11
297	0.12
298	0.1
299	0.12
300	0.12
301	0.14
302	0.14
303	0.16
304	0.13
305	0.14
306	0.14
307	0.12
308	0.12
309	0.1
310	0.11
311	0.1
312	0.09
313	0.12
314	0.11
315	0.1
316	0.11
317	0.15
318	0.15
319	0.17
320	0.18
321	0.21
322	0.27
323	0.33
324	0.34
325	0.35
326	0.35
327	0.35
328	0.35
329	0.35
330	0.34
331	0.3
332	0.32
333	0.33
334	0.34
335	0.34
336	0.34
337	0.27
338	0.25
339	0.24
340	0.23
341	0.18
342	0.19
343	0.17
344	0.16
345	0.16
346	0.14
347	0.14
348	0.09
349	0.08
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.1
365	0.12
366	0.13
367	0.15
368	0.16
369	0.21
370	0.27
371	0.3
372	0.29
373	0.29
374	0.3
375	0.28
376	0.27
377	0.25
378	0.19
379	0.16
380	0.16
381	0.17
382	0.15
383	0.15
384	0.16
385	0.16
386	0.2
387	0.2
388	0.2
389	0.22
390	0.22
391	0.22
392	0.21
393	0.21
394	0.17
395	0.18
396	0.22
397	0.19
398	0.19
399	0.19
400	0.19
401	0.17
402	0.18
403	0.19
404	0.16
405	0.16
406	0.17
407	0.19
408	0.19
409	0.17
410	0.18
411	0.16
412	0.16
413	0.15
414	0.14
415	0.12
416	0.12
417	0.12
418	0.11
419	0.1
420	0.1
421	0.14
422	0.19
423	0.21
424	0.28
425	0.29
426	0.28
427	0.29
428	0.29
429	0.31
430	0.26
431	0.26
432	0.2
433	0.24
434	0.24
435	0.24
436	0.23
437	0.18
438	0.19
439	0.17
440	0.17
441	0.13
442	0.15
443	0.2
444	0.22
445	0.22
446	0.25
447	0.29
448	0.33
449	0.38
450	0.38
451	0.35
452	0.37
453	0.37
454	0.32
455	0.29
456	0.23
457	0.2
458	0.2
459	0.22
460	0.21
461	0.27
462	0.29
463	0.32
464	0.33
465	0.35
466	0.38
467	0.39
468	0.38
469	0.31
470	0.3
471	0.27
472	0.31
473	0.28
474	0.23
475	0.2
476	0.2
477	0.21
478	0.23
479	0.22
480	0.18
481	0.17
482	0.17
483	0.15
484	0.14
485	0.13
486	0.11
487	0.1
488	0.09
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.1
493	0.17
494	0.24
495	0.25
496	0.29
497	0.29
498	0.29
499	0.28
500	0.3
501	0.24
502	0.21
503	0.21
504	0.2
505	0.19
506	0.19
507	0.18
508	0.14
509	0.12
510	0.08
511	0.06
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.06
516	0.07
517	0.08
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.09
522	0.1
523	0.08
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.04
531	0.04
532	0.05
533	0.09
534	0.1
535	0.11
536	0.12
537	0.15
538	0.19
539	0.22
540	0.24
541	0.25
542	0.25
543	0.25
544	0.24
545	0.2
546	0.17
547	0.13
548	0.11
549	0.06
550	0.05
551	0.04
552	0.05
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.07
557	0.1
558	0.12
559	0.14
560	0.16
561	0.16
562	0.19
563	0.22
564	0.2
565	0.2
566	0.18
567	0.17
568	0.15
569	0.14
570	0.12
571	0.1
572	0.1
573	0.08
574	0.09
575	0.11
576	0.11
577	0.12
578	0.13
579	0.16
580	0.17
581	0.17
582	0.22
583	0.24
584	0.32
585	0.37
586	0.39
587	0.36
588	0.34
589	0.33
590	0.28
591	0.24
592	0.2
593	0.25
594	0.25
595	0.3
596	0.32
597	0.31
598	0.35
599	0.35
600	0.34
601	0.27
602	0.32
603	0.29
604	0.3
605	0.31
606	0.3
607	0.3
608	0.3
609	0.33
610	0.29
611	0.26
612	0.27
613	0.27
614	0.26
615	0.3
616	0.33
617	0.28
618	0.24
619	0.24
620	0.21
621	0.25
622	0.24
623	0.19
624	0.13
625	0.12
626	0.13
627	0.12
628	0.11
629	0.08
630	0.07
631	0.07
632	0.08
633	0.09
634	0.08
635	0.1
636	0.12
637	0.18
638	0.19
639	0.23
640	0.27
641	0.34
642	0.36
643	0.38
644	0.38
645	0.32
646	0.32
647	0.29
648	0.24
649	0.17
650	0.13
651	0.09
652	0.08
653	0.08
654	0.06
655	0.07
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.11
664	0.12
665	0.13
666	0.13
667	0.13
668	0.18
669	0.26
670	0.27
671	0.31
672	0.34
673	0.34
674	0.37
675	0.4
676	0.42
677	0.37
678	0.39
679	0.34
680	0.34
681	0.35
682	0.34
683	0.3
684	0.22
685	0.2
686	0.17
687	0.17
688	0.12
689	0.1
690	0.09
691	0.08
692	0.07
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.12
697	0.11
698	0.14
699	0.15
700	0.18
701	0.17
702	0.18
703	0.2
704	0.2
705	0.2
706	0.18
707	0.18
708	0.15
709	0.16
710	0.13
711	0.13
712	0.17
713	0.21
714	0.24
715	0.26
716	0.28
717	0.31
718	0.39
719	0.4
720	0.39
721	0.39
722	0.38
723	0.36
724	0.37
725	0.35
726	0.29
727	0.32
728	0.27
729	0.23
730	0.23
731	0.22
732	0.19
733	0.18
734	0.16
735	0.1
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.1
740	0.11
741	0.11
742	0.11
743	0.12
744	0.14
745	0.13
746	0.12
747	0.12
748	0.12
749	0.14
750	0.16
751	0.15
752	0.16
753	0.16
754	0.21
755	0.24
756	0.27
757	0.27
758	0.3
759	0.35
760	0.4
761	0.46
762	0.46
763	0.44
764	0.41
765	0.44
766	0.44
767	0.43
768	0.45
769	0.43
770	0.43
771	0.48
772	0.49
773	0.5
774	0.49
775	0.48
776	0.46
777	0.46
778	0.45
779	0.46
780	0.44
781	0.43
782	0.42
783	0.41
784	0.35
785	0.29
786	0.27
787	0.21
788	0.22
789	0.21
790	0.19
791	0.19
792	0.18
793	0.17
794	0.21
795	0.27
796	0.29
797	0.32
798	0.36
799	0.38
800	0.43
801	0.48
802	0.52
803	0.54
804	0.56
805	0.53
806	0.52
807	0.51
808	0.48
809	0.49
810	0.46
811	0.48
812	0.47
813	0.46
814	0.44
815	0.42
816	0.41
817	0.41
818	0.39
819	0.28
820	0.25
821	0.23
822	0.22
823	0.24
824	0.28
825	0.26
826	0.28
827	0.35
828	0.38
829	0.4
830	0.41
831	0.4
832	0.45
833	0.42
834	0.45
835	0.42
836	0.4
837	0.38
838	0.38
839	0.36
840	0.26
841	0.26
842	0.19
843	0.14
844	0.12
845	0.11
846	0.1
847	0.11
848	0.11
849	0.08
850	0.08
851	0.09
852	0.1
853	0.11
854	0.17
855	0.22
856	0.28
857	0.35
858	0.42
859	0.45
860	0.51
861	0.53
862	0.5
863	0.45
864	0.41
865	0.4
866	0.37
867	0.36
868	0.37
869	0.39
870	0.37
871	0.45
872	0.45
873	0.4
874	0.38
875	0.39
876	0.39
877	0.4
878	0.48
879	0.45
880	0.51
881	0.49
882	0.49
883	0.47
884	0.4
885	0.34
886	0.24
887	0.21
888	0.16
889	0.16
890	0.15
891	0.14
892	0.13
893	0.12
894	0.14
895	0.13
896	0.13
897	0.11
898	0.13
899	0.13
900	0.15
901	0.15
902	0.12
903	0.14
904	0.12
905	0.13
906	0.12
907	0.15
908	0.14
909	0.14
910	0.18
911	0.2
912	0.22
913	0.22
914	0.23
915	0.3
916	0.34
917	0.41
918	0.43
919	0.46
920	0.46
921	0.47
922	0.52
923	0.52
924	0.54
925	0.5
926	0.5
927	0.45
928	0.49
929	0.52
930	0.5
931	0.43
932	0.38
933	0.37
934	0.32
935	0.29
936	0.27
937	0.24
938	0.19
939	0.23
940	0.27
941	0.27
942	0.33
943	0.33
944	0.3
945	0.33
946	0.33
947	0.3
948	0.26
949	0.25
950	0.2
951	0.19
952	0.19
953	0.15
954	0.14
955	0.14
956	0.11
957	0.13
958	0.17
959	0.19
960	0.22
961	0.28
962	0.27
963	0.28
964	0.29
965	0.31
966	0.31
967	0.31
968	0.29
969	0.25
970	0.24
971	0.22
972	0.21
973	0.17
974	0.12
975	0.1
976	0.09
977	0.1
978	0.12
979	0.13
980	0.15
981	0.22
982	0.26
983	0.28
984	0.3
985	0.36
986	0.36
987	0.42
988	0.44
989	0.43
990	0.46
991	0.45
992	0.44
993	0.38
994	0.36
995	0.33
996	0.29
997	0.22
998	0.17
999	0.14
1000	0.11
1001	0.1
1002	0.13
1003	0.1
1004	0.09
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.13
1009	0.13
1010	0.1
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.11
1016	0.1
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.11
1023	0.1
1024	0.1
1025	0.08
1026	0.08
1027	0.08
1028	0.09
1029	0.08
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.07
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.07
1036	0.06
1037	0.07
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.06
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.12
1044	0.13
1045	0.13
1046	0.14
1047	0.14
1048	0.14
1049	0.14
1050	0.24
1051	0.21
1052	0.24
1053	0.26
1054	0.29
1055	0.3
1056	0.31
1057	0.32
1058	0.26
1059	0.25
1060	0.25
1061	0.27
1062	0.27
1063	0.31
1064	0.37
1065	0.38
1066	0.35
1067	0.36
1068	0.37
1069	0.38
1070	0.37
1071	0.33
1072	0.27
1073	0.27
1074	0.28
1075	0.28
1076	0.23
1077	0.17
1078	0.15
1079	0.17
1080	0.15
1081	0.14
1082	0.14
1083	0.14
1084	0.16
1085	0.17

A0A0L6VJK0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer