Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VAI1

Protein Details
Accession A0A0L6VAI1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-23TSPTSKRSRLDSPQQQQQQNHydrophilic
295-320SPHEKAAPVKKEKKRKREGPGQLARNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-313KAAPVKKEKKRKREG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSQTSPTSKRSRLDSPQQQQQQNALVLPSHSWKPAHTSNSTTTNQFNTGNKLGLAGLSNPNDVGSSAAEDNRPSASGSGTYPTGSTNNNVQTDFDAMNDAVGIAGVDIAAEEELARTQATLYRTSNRNYSSYSQLPQQQPWMKTPRVKLLDFLDKPALTLMVQHIAASFQLKTLEPAILDVLTQAAEARMHSLIVDSIAAKDHRVASSHLRPPPLYPSSMPKGKQKEREAEAMYDQVVYDEPERILSMLARVEGEEERKARLERESTEGEGADAGPGGSQLQQSGLLGTGVEGGSPHEKAAPVKKEKKRKREGPGQLARNMSEDARARQSNQTAMRSVGGRSKYSWLSGGVVSGGSNKALPTSLMASLPAPKFAPQTSSGAQTQQGPSTPTASDHHSAHPTSSTNRASAPFGPSSSSTPSSSSLAAATSTSRPKKESSHFHHLSSRLGGPIPAKHPSSLSPHIGLKDCLFALERERGTGAGKGTGSKSLFKAYLNPNPPATNSHSNPSASSADLPYPPPPPSSNTSSTQFYHHLLRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.72
3 0.77
4 0.81
5 0.79
6 0.73
7 0.68
8 0.63
9 0.55
10 0.47
11 0.38
12 0.3
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.21
17 0.23
18 0.22
19 0.22
20 0.29
21 0.36
22 0.39
23 0.38
24 0.42
25 0.44
26 0.51
27 0.52
28 0.48
29 0.43
30 0.4
31 0.4
32 0.39
33 0.36
34 0.35
35 0.35
36 0.34
37 0.31
38 0.28
39 0.25
40 0.21
41 0.2
42 0.16
43 0.2
44 0.2
45 0.2
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.17
50 0.14
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.14
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.14
61 0.13
62 0.12
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.21
74 0.26
75 0.28
76 0.28
77 0.27
78 0.26
79 0.29
80 0.26
81 0.19
82 0.16
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.1
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.03
91 0.03
92 0.02
93 0.02
94 0.02
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.05
105 0.09
106 0.11
107 0.16
108 0.19
109 0.26
110 0.3
111 0.32
112 0.38
113 0.37
114 0.37
115 0.37
116 0.38
117 0.38
118 0.38
119 0.37
120 0.37
121 0.42
122 0.43
123 0.4
124 0.46
125 0.45
126 0.43
127 0.48
128 0.5
129 0.47
130 0.5
131 0.53
132 0.53
133 0.52
134 0.5
135 0.47
136 0.46
137 0.51
138 0.46
139 0.45
140 0.39
141 0.33
142 0.33
143 0.3
144 0.24
145 0.14
146 0.15
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.2
194 0.28
195 0.35
196 0.36
197 0.36
198 0.36
199 0.36
200 0.41
201 0.35
202 0.29
203 0.24
204 0.27
205 0.31
206 0.36
207 0.37
208 0.37
209 0.44
210 0.49
211 0.57
212 0.57
213 0.58
214 0.56
215 0.61
216 0.56
217 0.48
218 0.42
219 0.34
220 0.28
221 0.2
222 0.16
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.17
249 0.18
250 0.17
251 0.21
252 0.22
253 0.21
254 0.21
255 0.2
256 0.16
257 0.14
258 0.12
259 0.07
260 0.05
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.17
288 0.24
289 0.32
290 0.42
291 0.5
292 0.6
293 0.68
294 0.77
295 0.8
296 0.81
297 0.82
298 0.83
299 0.85
300 0.85
301 0.85
302 0.78
303 0.72
304 0.64
305 0.56
306 0.46
307 0.37
308 0.27
309 0.22
310 0.19
311 0.17
312 0.22
313 0.22
314 0.22
315 0.25
316 0.27
317 0.29
318 0.31
319 0.31
320 0.27
321 0.27
322 0.26
323 0.24
324 0.23
325 0.22
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.22
330 0.22
331 0.22
332 0.22
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.06
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.14
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.19
362 0.16
363 0.2
364 0.21
365 0.24
366 0.24
367 0.23
368 0.24
369 0.25
370 0.24
371 0.21
372 0.21
373 0.19
374 0.19
375 0.2
376 0.19
377 0.17
378 0.18
379 0.21
380 0.23
381 0.22
382 0.26
383 0.27
384 0.27
385 0.26
386 0.26
387 0.24
388 0.23
389 0.29
390 0.27
391 0.24
392 0.25
393 0.26
394 0.27
395 0.27
396 0.29
397 0.23
398 0.22
399 0.23
400 0.23
401 0.24
402 0.26
403 0.26
404 0.23
405 0.23
406 0.25
407 0.24
408 0.23
409 0.2
410 0.16
411 0.13
412 0.13
413 0.11
414 0.11
415 0.14
416 0.22
417 0.27
418 0.28
419 0.3
420 0.33
421 0.41
422 0.48
423 0.54
424 0.54
425 0.61
426 0.61
427 0.63
428 0.66
429 0.6
430 0.54
431 0.47
432 0.4
433 0.3
434 0.28
435 0.26
436 0.23
437 0.26
438 0.27
439 0.28
440 0.28
441 0.27
442 0.28
443 0.3
444 0.35
445 0.36
446 0.36
447 0.34
448 0.36
449 0.39
450 0.4
451 0.38
452 0.31
453 0.28
454 0.24
455 0.21
456 0.19
457 0.17
458 0.19
459 0.25
460 0.24
461 0.22
462 0.23
463 0.23
464 0.23
465 0.25
466 0.22
467 0.19
468 0.19
469 0.2
470 0.21
471 0.27
472 0.27
473 0.27
474 0.28
475 0.29
476 0.3
477 0.28
478 0.35
479 0.37
480 0.45
481 0.46
482 0.48
483 0.46
484 0.47
485 0.47
486 0.44
487 0.44
488 0.44
489 0.41
490 0.43
491 0.44
492 0.43
493 0.42
494 0.42
495 0.36
496 0.28
497 0.28
498 0.25
499 0.24
500 0.25
501 0.27
502 0.26
503 0.27
504 0.27
505 0.28
506 0.28
507 0.3
508 0.34
509 0.39
510 0.41
511 0.42
512 0.45
513 0.46
514 0.45
515 0.45
516 0.42
517 0.38