FuNGI

A0A0L6VT38

Protein Details

Accession

A0A0L6VT38

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-62	TPDPRNRQTYLRSRHKPIHRPPHNRVPTLS	Hydrophilic
556-580	CEDCLMSKSKRDRQRLSNNERLQPM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 15.5, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs

Amino Acid Sequences

MGNLFDNALTELRESTSARPKDPPPQINIIEGTPDPRNRQTYLRSRHKPIHRPPHNRVPTLSIASCSLFPSLRSMAAISKRDLRDENLSLSEMDDILLKIALTSTIDDGIKVGVAECKSGLDGFHLISDTFTLRSRSAHLGIIRDLLDLRFNLQDKSADLDSHFRKIENLVKQLTRSDFQVTEESLTGLFFQLSLPNPESYPFVNVSRQLDFRMEAGNYRVNNADLLRIAKTELALYRQSKKSNYDRKPDRSYPNKPDGSNPQNKTPSNTSPAIPKWCPKCRSRDHASADCPKNTSSTGSSNTQRAATAPPRPTFTIQSAEAQDNSVSLLQPEDPTIQSITPQQLNPDVTQAEMDWLMKNGATLFGLDSCASHTFTNNLNLLSDCITLRKPIPLITATNTTTSFVTVVGKMTLINKTGSITINNVYFSPDATSTLLSAECLRLGGGNIEVDDSGNVGVRFSSGFCFQSFSINRRWQVPAIVRPGSVPLVFVPPIKVCNIKQSESTCLSAEIALKTSDALLWHRRLGHISLKRIIKMCAAGKFPGLPDRLTNKDFVCEDCLMSKSKRDRQRLSNNERLQPMDVIVSDVLGPFVESFMGMSLLEFSTLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.22
3	0.31
4	0.34
5	0.36
6	0.42
7	0.46
8	0.53
9	0.61
10	0.61
11	0.57
12	0.62
13	0.61
14	0.59
15	0.56
16	0.46
17	0.39
18	0.33
19	0.31
20	0.29
21	0.31
22	0.33
23	0.37
24	0.41
25	0.4
26	0.47
27	0.53
28	0.57
29	0.63
30	0.68
31	0.7
32	0.73
33	0.8
34	0.84
35	0.84
36	0.85
37	0.86
38	0.85
39	0.87
40	0.88
41	0.9
42	0.88
43	0.81
44	0.72
45	0.67
46	0.62
47	0.59
48	0.51
49	0.41
50	0.34
51	0.32
52	0.31
53	0.25
54	0.21
55	0.16
56	0.15
57	0.19
58	0.18
59	0.18
60	0.18
61	0.18
62	0.22
63	0.29
64	0.32
65	0.3
66	0.36
67	0.37
68	0.4
69	0.41
70	0.39
71	0.39
72	0.39
73	0.4
74	0.33
75	0.33
76	0.29
77	0.27
78	0.23
79	0.15
80	0.13
81	0.1
82	0.08
83	0.07
84	0.08
85	0.07
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.07
91	0.08
92	0.1
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.1
97	0.1
98	0.09
99	0.08
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.11
108	0.09
109	0.11
110	0.1
111	0.11
112	0.11
113	0.11
114	0.1
115	0.12
116	0.1
117	0.1
118	0.12
119	0.13
120	0.13
121	0.14
122	0.18
123	0.22
124	0.23
125	0.26
126	0.26
127	0.27
128	0.27
129	0.29
130	0.25
131	0.21
132	0.19
133	0.15
134	0.15
135	0.12
136	0.13
137	0.14
138	0.15
139	0.15
140	0.16
141	0.17
142	0.16
143	0.21
144	0.2
145	0.16
146	0.16
147	0.24
148	0.25
149	0.28
150	0.28
151	0.23
152	0.23
153	0.27
154	0.33
155	0.32
156	0.35
157	0.34
158	0.35
159	0.37
160	0.4
161	0.38
162	0.32
163	0.27
164	0.26
165	0.22
166	0.23
167	0.25
168	0.21
169	0.2
170	0.19
171	0.17
172	0.13
173	0.12
174	0.1
175	0.08
176	0.07
177	0.05
178	0.05
179	0.08
180	0.09
181	0.12
182	0.14
183	0.14
184	0.15
185	0.16
186	0.17
187	0.15
188	0.17
189	0.15
190	0.15
191	0.17
192	0.2
193	0.22
194	0.23
195	0.23
196	0.22
197	0.21
198	0.19
199	0.18
200	0.18
201	0.15
202	0.13
203	0.15
204	0.18
205	0.17
206	0.18
207	0.18
208	0.15
209	0.16
210	0.15
211	0.14
212	0.11
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.12
222	0.16
223	0.19
224	0.25
225	0.29
226	0.32
227	0.33
228	0.39
229	0.46
230	0.52
231	0.57
232	0.6
233	0.65
234	0.7
235	0.76
236	0.77
237	0.76
238	0.74
239	0.76
240	0.74
241	0.74
242	0.7
243	0.63
244	0.6
245	0.6
246	0.59
247	0.59
248	0.54
249	0.52
250	0.54
251	0.53
252	0.53
253	0.49
254	0.44
255	0.4
256	0.39
257	0.32
258	0.31
259	0.34
260	0.36
261	0.32
262	0.34
263	0.37
264	0.44
265	0.48
266	0.46
267	0.53
268	0.54
269	0.61
270	0.63
271	0.64
272	0.63
273	0.64
274	0.66
275	0.66
276	0.61
277	0.54
278	0.48
279	0.39
280	0.33
281	0.27
282	0.23
283	0.16
284	0.16
285	0.19
286	0.22
287	0.23
288	0.23
289	0.24
290	0.22
291	0.19
292	0.17
293	0.18
294	0.18
295	0.23
296	0.26
297	0.27
298	0.29
299	0.31
300	0.32
301	0.29
302	0.28
303	0.25
304	0.21
305	0.23
306	0.22
307	0.21
308	0.19
309	0.17
310	0.15
311	0.11
312	0.1
313	0.08
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.11
327	0.13
328	0.14
329	0.14
330	0.14
331	0.17
332	0.19
333	0.18
334	0.18
335	0.15
336	0.13
337	0.13
338	0.12
339	0.09
340	0.08
341	0.08
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.09
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.13
363	0.18
364	0.17
365	0.16
366	0.15
367	0.15
368	0.16
369	0.15
370	0.13
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.12
376	0.14
377	0.13
378	0.14
379	0.17
380	0.17
381	0.19
382	0.2
383	0.24
384	0.23
385	0.24
386	0.23
387	0.21
388	0.18
389	0.17
390	0.14
391	0.09
392	0.1
393	0.09
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.12
400	0.12
401	0.12
402	0.11
403	0.12
404	0.14
405	0.14
406	0.13
407	0.13
408	0.14
409	0.15
410	0.15
411	0.14
412	0.14
413	0.13
414	0.13
415	0.13
416	0.11
417	0.12
418	0.12
419	0.12
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.09
424	0.09
425	0.08
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.06
440	0.05
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.08
448	0.1
449	0.1
450	0.12
451	0.12
452	0.15
453	0.15
454	0.24
455	0.26
456	0.27
457	0.34
458	0.39
459	0.4
460	0.42
461	0.45
462	0.37
463	0.41
464	0.45
465	0.43
466	0.43
467	0.43
468	0.39
469	0.36
470	0.37
471	0.32
472	0.25
473	0.19
474	0.13
475	0.15
476	0.16
477	0.16
478	0.17
479	0.16
480	0.18
481	0.19
482	0.23
483	0.2
484	0.29
485	0.33
486	0.33
487	0.37
488	0.38
489	0.43
490	0.41
491	0.43
492	0.33
493	0.29
494	0.28
495	0.24
496	0.24
497	0.18
498	0.16
499	0.14
500	0.14
501	0.13
502	0.12
503	0.12
504	0.11
505	0.14
506	0.2
507	0.22
508	0.26
509	0.27
510	0.28
511	0.3
512	0.33
513	0.38
514	0.38
515	0.42
516	0.46
517	0.49
518	0.52
519	0.51
520	0.48
521	0.42
522	0.41
523	0.4
524	0.38
525	0.37
526	0.34
527	0.34
528	0.35
529	0.33
530	0.33
531	0.3
532	0.25
533	0.28
534	0.34
535	0.38
536	0.38
537	0.4
538	0.34
539	0.37
540	0.37
541	0.33
542	0.32
543	0.27
544	0.27
545	0.26
546	0.27
547	0.26
548	0.27
549	0.33
550	0.37
551	0.45
552	0.54
553	0.61
554	0.68
555	0.74
556	0.84
557	0.86
558	0.86
559	0.87
560	0.85
561	0.82
562	0.77
563	0.69
564	0.6
565	0.5
566	0.42
567	0.34
568	0.26
569	0.22
570	0.18
571	0.16
572	0.13
573	0.12
574	0.11
575	0.08
576	0.08
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.05
581	0.06
582	0.06
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.08
587	0.08

A0A0L6VT38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer