Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VDR1

Protein Details
Accession A0A0L6VDR1    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-62KTVDPPSNTTQKKKSKKKQQPNTALPAAAHydrophilic
265-294NSANTPKPLQNTRKPKKKGGKGGKVKITNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-51KKKSKKK
276-290TRKPKKKGGKGGKVK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MASKFPSLPAPRFAPQKSSPLSQPQPTPTVEPHKTVDPPSNTTQKKKSKKKQQPNTALPAAAAPPPPPPLDNSGPGRQFATQIFKLVDALKQRNGPMNLSDLEAQTGVRGLLSEHTDVPFNQELYDAFNSHERVNVIEKGCVKLWSYRPDYDINNPQQVLELLQRLSNRCGMPIATLKNSWPNVMSAITELENDGKVLVSRTEGHPGKEGVPKVVVFDELGYRQNLGPTRGALDPEFREMWHSLQTPSVHDLPIELQEAGLTSSNSANTPKPLQNTRKPKKKGGKGGKVKITNTHLKDLGIDLSKDYLPPPKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.48
3 0.53
4 0.52
5 0.51
6 0.5
7 0.53
8 0.57
9 0.55
10 0.57
11 0.53
12 0.53
13 0.5
14 0.49
15 0.46
16 0.49
17 0.46
18 0.44
19 0.42
20 0.43
21 0.44
22 0.44
23 0.46
24 0.41
25 0.44
26 0.47
27 0.54
28 0.53
29 0.57
30 0.64
31 0.65
32 0.71
33 0.77
34 0.81
35 0.82
36 0.89
37 0.93
38 0.94
39 0.95
40 0.95
41 0.92
42 0.9
43 0.81
44 0.7
45 0.59
46 0.49
47 0.39
48 0.31
49 0.23
50 0.15
51 0.15
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.18
56 0.22
57 0.25
58 0.3
59 0.33
60 0.38
61 0.38
62 0.38
63 0.37
64 0.31
65 0.3
66 0.26
67 0.28
68 0.22
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.24
77 0.25
78 0.28
79 0.29
80 0.34
81 0.35
82 0.33
83 0.27
84 0.27
85 0.24
86 0.23
87 0.22
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.06
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.16
112 0.17
113 0.13
114 0.12
115 0.14
116 0.16
117 0.15
118 0.17
119 0.13
120 0.13
121 0.16
122 0.2
123 0.18
124 0.19
125 0.2
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.18
130 0.19
131 0.24
132 0.28
133 0.32
134 0.31
135 0.33
136 0.35
137 0.35
138 0.35
139 0.38
140 0.34
141 0.32
142 0.31
143 0.28
144 0.26
145 0.24
146 0.2
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.18
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.22
166 0.23
167 0.21
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.19
190 0.2
191 0.22
192 0.24
193 0.24
194 0.26
195 0.3
196 0.29
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.2
201 0.19
202 0.16
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.16
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.18
220 0.2
221 0.19
222 0.22
223 0.22
224 0.18
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.22
229 0.23
230 0.19
231 0.24
232 0.25
233 0.24
234 0.27
235 0.27
236 0.21
237 0.19
238 0.19
239 0.16
240 0.18
241 0.17
242 0.13
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.18
256 0.24
257 0.27
258 0.33
259 0.42
260 0.5
261 0.58
262 0.68
263 0.74
264 0.79
265 0.81
266 0.85
267 0.86
268 0.87
269 0.88
270 0.88
271 0.88
272 0.89
273 0.92
274 0.91
275 0.87
276 0.79
277 0.76
278 0.72
279 0.71
280 0.64
281 0.61
282 0.53
283 0.46
284 0.45
285 0.38
286 0.37
287 0.3
288 0.27
289 0.21
290 0.23
291 0.23
292 0.22
293 0.22