FuNGI

A0A0L6V5M0

Protein Details

Accession

A0A0L6V5M0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
242-265	GEKGQKRCTKGYHNPKQDKNHNEE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MAAAPIGNPTAATMLSASSSTNDGFRQAMLKSGLDQIPQLTEENYSIWKDKMASLLKLRGVLTKLESTTLALDEDLNAELTFLLISKLDSVTHSNIVTADNRDSAKELWKAIKDRFASSQASNRARIFNEFLYIKFREDAVEAFITDIKISIKKLVDVGIELPQDILAYLILFKFPDNLQILKRQIMHSDKDLSVEFVCNHLNQFNNENKAEINETVSTTQATLYSNKGKSKFQNNDAGSSGEKGQKRCTKGYHNPKQDKNHNEESCWHLHPEVAPAWWREAQEKWKSTQKTNYFMSLVTLWIENGNNKSKIILDSGSSSHVFNDSRFFEQLSLGDLDVIRTGKKDANLAIKGQGRVRLEWGNGTLILENCLYVPDIVVNLISPGLLDAKGCLVKAKSGKFSVIKDDIELFTGKISNNMYSVRNPTKIGANSLYSYYANDSTESLKDTHEKYGHASLQRINSLIGHQISKAERDAFECKACVLSKITKQSFNLESKPTSKVFERLHLDLIGPITPQAKIGSRFILTVVDNFSGYLAGFPLIKKDDTTEILINLLESENKRLGYYPNMICSDGGGEFTGNSKSPWELIHGYALPPNYLKPLGSSAVVLDMNRQKGKKFEVKGQEGVLIGYNVMLRSFRILLKSGAVINSKHVRFLKSPTFIENSDSDFIPEMATEMERETRPLPELRQETEPEDDERDDGETHDDIMIDDVTPDSNSDEEIVDQLVPQPEQPPTRILRDRSQLKPPISRIFFHVDDLVLVGPGNQFKEKFEIRFKNSSCHEPNTILGMKFERIGHKILLSQPKHIEHGLEELGLQNCKPSQTPLTPNLKLTEATDEEHALFKKENINYRSAIGLMNYVAGYTRPDISFAVSSLARFSIKPGIQHWHEVRKVWQYLRTTKELKLTLQIQQPSQLLEIYSDASWADDPQHRTSQSGYLCYLFGSPVSWNSCRQHNVTYSSTEAELNPLVDAFHEGTWLKALLSDIWDIQVDAASHYIDDPELNEKLLMTDEEFFQKYSNSHYIDNKGLDDKLKKFGSNPKTRHIDLKTKGIRQEVKAKSINIILIRTFDMLADALTKPAQKSSINNLIKTVDPSFPFLKIKSLQSRGVLPGEIRQSTLLYWFLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.09
6	0.11
7	0.11
8	0.13
9	0.13
10	0.14
11	0.15
12	0.15
13	0.17
14	0.15
15	0.2
16	0.21
17	0.21
18	0.21
19	0.28
20	0.29
21	0.26
22	0.27
23	0.23
24	0.22
25	0.23
26	0.22
27	0.16
28	0.15
29	0.16
30	0.17
31	0.18
32	0.19
33	0.2
34	0.19
35	0.21
36	0.21
37	0.22
38	0.29
39	0.31
40	0.35
41	0.38
42	0.44
43	0.44
44	0.46
45	0.44
46	0.41
47	0.37
48	0.34
49	0.32
50	0.31
51	0.3
52	0.28
53	0.27
54	0.24
55	0.24
56	0.21
57	0.17
58	0.12
59	0.12
60	0.11
61	0.12
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.06
70	0.06
71	0.05
72	0.06
73	0.07
74	0.08
75	0.09
76	0.11
77	0.16
78	0.19
79	0.22
80	0.21
81	0.2
82	0.2
83	0.22
84	0.23
85	0.22
86	0.21
87	0.22
88	0.22
89	0.22
90	0.24
91	0.24
92	0.28
93	0.28
94	0.3
95	0.33
96	0.39
97	0.43
98	0.44
99	0.5
100	0.46
101	0.46
102	0.47
103	0.45
104	0.43
105	0.41
106	0.45
107	0.47
108	0.49
109	0.5
110	0.47
111	0.47
112	0.44
113	0.45
114	0.42
115	0.33
116	0.35
117	0.31
118	0.3
119	0.31
120	0.31
121	0.29
122	0.25
123	0.24
124	0.19
125	0.19
126	0.19
127	0.18
128	0.17
129	0.15
130	0.15
131	0.16
132	0.15
133	0.14
134	0.14
135	0.11
136	0.13
137	0.14
138	0.18
139	0.18
140	0.19
141	0.21
142	0.23
143	0.21
144	0.2
145	0.21
146	0.21
147	0.2
148	0.19
149	0.17
150	0.14
151	0.13
152	0.12
153	0.1
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.06
160	0.07
161	0.09
162	0.09
163	0.16
164	0.18
165	0.21
166	0.23
167	0.3
168	0.33
169	0.35
170	0.38
171	0.33
172	0.37
173	0.4
174	0.41
175	0.38
176	0.41
177	0.36
178	0.36
179	0.35
180	0.3
181	0.25
182	0.24
183	0.2
184	0.16
185	0.18
186	0.16
187	0.17
188	0.17
189	0.19
190	0.19
191	0.24
192	0.28
193	0.32
194	0.32
195	0.31
196	0.29
197	0.29
198	0.29
199	0.24
200	0.21
201	0.16
202	0.18
203	0.18
204	0.18
205	0.16
206	0.13
207	0.13
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.16
212	0.24
213	0.28
214	0.33
215	0.36
216	0.41
217	0.47
218	0.55
219	0.59
220	0.57
221	0.62
222	0.58
223	0.59
224	0.54
225	0.48
226	0.39
227	0.32
228	0.29
229	0.26
230	0.28
231	0.26
232	0.34
233	0.39
234	0.43
235	0.47
236	0.5
237	0.54
238	0.62
239	0.71
240	0.73
241	0.77
242	0.81
243	0.84
244	0.87
245	0.86
246	0.83
247	0.79
248	0.79
249	0.7
250	0.63
251	0.58
252	0.54
253	0.5
254	0.44
255	0.37
256	0.26
257	0.26
258	0.24
259	0.25
260	0.2
261	0.17
262	0.19
263	0.18
264	0.22
265	0.23
266	0.23
267	0.21
268	0.25
269	0.32
270	0.38
271	0.4
272	0.41
273	0.47
274	0.5
275	0.53
276	0.58
277	0.56
278	0.54
279	0.53
280	0.53
281	0.45
282	0.41
283	0.38
284	0.28
285	0.22
286	0.16
287	0.14
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.15
293	0.21
294	0.21
295	0.21
296	0.21
297	0.21
298	0.22
299	0.22
300	0.18
301	0.14
302	0.15
303	0.16
304	0.18
305	0.18
306	0.16
307	0.14
308	0.16
309	0.15
310	0.13
311	0.17
312	0.17
313	0.19
314	0.2
315	0.2
316	0.18
317	0.18
318	0.18
319	0.16
320	0.14
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.11
327	0.08
328	0.08
329	0.1
330	0.12
331	0.13
332	0.16
333	0.18
334	0.25
335	0.27
336	0.27
337	0.31
338	0.33
339	0.33
340	0.33
341	0.34
342	0.28
343	0.27
344	0.29
345	0.26
346	0.23
347	0.23
348	0.22
349	0.18
350	0.16
351	0.16
352	0.14
353	0.11
354	0.12
355	0.1
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.03
371	0.03
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.07
377	0.08
378	0.08
379	0.1
380	0.09
381	0.14
382	0.19
383	0.23
384	0.25
385	0.26
386	0.3
387	0.31
388	0.33
389	0.35
390	0.33
391	0.3
392	0.27
393	0.27
394	0.23
395	0.21
396	0.2
397	0.13
398	0.1
399	0.11
400	0.1
401	0.11
402	0.12
403	0.11
404	0.12
405	0.14
406	0.15
407	0.16
408	0.23
409	0.24
410	0.25
411	0.26
412	0.25
413	0.29
414	0.29
415	0.3
416	0.25
417	0.23
418	0.22
419	0.22
420	0.22
421	0.16
422	0.16
423	0.14
424	0.13
425	0.12
426	0.11
427	0.11
428	0.12
429	0.12
430	0.13
431	0.12
432	0.12
433	0.15
434	0.16
435	0.21
436	0.21
437	0.2
438	0.22
439	0.26
440	0.29
441	0.27
442	0.28
443	0.26
444	0.27
445	0.28
446	0.25
447	0.2
448	0.17
449	0.15
450	0.16
451	0.14
452	0.12
453	0.11
454	0.14
455	0.14
456	0.15
457	0.15
458	0.14
459	0.13
460	0.16
461	0.2
462	0.18
463	0.19
464	0.17
465	0.16
466	0.17
467	0.17
468	0.15
469	0.15
470	0.17
471	0.21
472	0.3
473	0.32
474	0.33
475	0.33
476	0.37
477	0.39
478	0.39
479	0.37
480	0.31
481	0.31
482	0.3
483	0.32
484	0.28
485	0.25
486	0.22
487	0.26
488	0.25
489	0.3
490	0.31
491	0.3
492	0.3
493	0.28
494	0.27
495	0.21
496	0.2
497	0.13
498	0.09
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.1
505	0.11
506	0.13
507	0.14
508	0.14
509	0.14
510	0.14
511	0.15
512	0.12
513	0.11
514	0.12
515	0.1
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.07
520	0.07
521	0.06
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.09
531	0.11
532	0.13
533	0.15
534	0.14
535	0.13
536	0.13
537	0.13
538	0.11
539	0.09
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.08
544	0.09
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.12
549	0.14
550	0.2
551	0.18
552	0.21
553	0.22
554	0.23
555	0.21
556	0.2
557	0.18
558	0.11
559	0.11
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.1
572	0.11
573	0.11
574	0.13
575	0.13
576	0.13
577	0.14
578	0.14
579	0.11
580	0.1
581	0.1
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.08
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.1
590	0.08
591	0.1
592	0.11
593	0.1
594	0.11
595	0.14
596	0.17
597	0.19
598	0.2
599	0.18
600	0.21
601	0.27
602	0.31
603	0.3
604	0.35
605	0.41
606	0.45
607	0.46
608	0.44
609	0.4
610	0.32
611	0.3
612	0.22
613	0.13
614	0.09
615	0.07
616	0.07
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.04
621	0.06
622	0.08
623	0.08
624	0.1
625	0.11
626	0.12
627	0.13
628	0.14
629	0.13
630	0.14
631	0.15
632	0.13
633	0.16
634	0.22
635	0.21
636	0.25
637	0.25
638	0.26
639	0.26
640	0.32
641	0.35
642	0.33
643	0.34
644	0.33
645	0.34
646	0.32
647	0.32
648	0.28
649	0.23
650	0.2
651	0.19
652	0.16
653	0.14
654	0.13
655	0.11
656	0.09
657	0.06
658	0.05
659	0.06
660	0.05
661	0.06
662	0.09
663	0.09
664	0.1
665	0.11
666	0.12
667	0.14
668	0.16
669	0.16
670	0.21
671	0.24
672	0.25
673	0.28
674	0.28
675	0.28
676	0.29
677	0.29
678	0.23
679	0.22
680	0.19
681	0.16
682	0.15
683	0.14
684	0.11
685	0.1
686	0.11
687	0.09
688	0.1
689	0.09
690	0.09
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.06
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.08
711	0.09
712	0.09
713	0.09
714	0.11
715	0.14
716	0.15
717	0.17
718	0.19
719	0.2
720	0.28
721	0.33
722	0.35
723	0.38
724	0.45
725	0.51
726	0.51
727	0.57
728	0.57
729	0.56
730	0.58
731	0.56
732	0.56
733	0.51
734	0.47
735	0.42
736	0.41
737	0.38
738	0.33
739	0.29
740	0.2
741	0.18
742	0.17
743	0.13
744	0.07
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.07
749	0.09
750	0.1
751	0.1
752	0.11
753	0.17
754	0.2
755	0.23
756	0.32
757	0.38
758	0.43
759	0.51
760	0.51
761	0.53
762	0.53
763	0.57
764	0.52
765	0.48
766	0.45
767	0.38
768	0.38
769	0.36
770	0.36
771	0.28
772	0.24
773	0.22
774	0.2
775	0.21
776	0.22
777	0.19
778	0.18
779	0.2
780	0.2
781	0.19
782	0.22
783	0.26
784	0.34
785	0.31
786	0.34
787	0.37
788	0.38
789	0.39
790	0.36
791	0.3
792	0.22
793	0.24
794	0.2
795	0.15
796	0.13
797	0.14
798	0.15
799	0.15
800	0.13
801	0.11
802	0.11
803	0.12
804	0.13
805	0.14
806	0.18
807	0.24
808	0.3
809	0.37
810	0.46
811	0.46
812	0.47
813	0.46
814	0.41
815	0.35
816	0.3
817	0.28
818	0.2
819	0.2
820	0.19
821	0.19
822	0.18
823	0.21
824	0.2
825	0.16
826	0.15
827	0.15
828	0.21
829	0.24
830	0.32
831	0.31
832	0.34
833	0.34
834	0.34
835	0.33
836	0.27
837	0.23
838	0.15
839	0.14
840	0.1
841	0.1
842	0.09
843	0.08
844	0.07
845	0.07
846	0.08
847	0.08
848	0.11
849	0.1
850	0.12
851	0.12
852	0.15
853	0.15
854	0.14
855	0.16
856	0.13
857	0.13
858	0.13
859	0.14
860	0.12
861	0.12
862	0.14
863	0.19
864	0.2
865	0.23
866	0.25
867	0.31
868	0.32
869	0.41
870	0.43
871	0.44
872	0.45
873	0.44
874	0.46
875	0.47
876	0.51
877	0.46
878	0.47
879	0.44
880	0.5
881	0.54
882	0.56
883	0.51
884	0.48
885	0.53
886	0.49
887	0.44
888	0.42
889	0.4
890	0.4
891	0.43
892	0.43
893	0.36
894	0.38
895	0.37
896	0.31
897	0.29
898	0.23
899	0.16
900	0.14
901	0.15
902	0.12
903	0.11
904	0.1
905	0.09
906	0.09
907	0.09
908	0.09
909	0.12
910	0.16
911	0.21
912	0.25
913	0.32
914	0.31
915	0.32
916	0.34
917	0.36
918	0.33
919	0.32
920	0.29
921	0.24
922	0.24
923	0.23
924	0.22
925	0.15
926	0.12
927	0.1
928	0.1
929	0.13
930	0.19
931	0.2
932	0.25
933	0.28
934	0.35
935	0.38
936	0.4
937	0.41
938	0.41
939	0.45
940	0.42
941	0.43
942	0.38
943	0.36
944	0.34
945	0.28
946	0.23
947	0.2
948	0.18
949	0.15
950	0.13
951	0.11
952	0.1
953	0.09
954	0.12
955	0.1
956	0.09
957	0.11
958	0.11
959	0.12
960	0.13
961	0.13
962	0.11
963	0.1
964	0.11
965	0.1
966	0.13
967	0.14
968	0.12
969	0.13
970	0.14
971	0.12
972	0.11
973	0.12
974	0.1
975	0.09
976	0.1
977	0.09
978	0.09
979	0.09
980	0.09
981	0.07
982	0.08
983	0.08
984	0.12
985	0.13
986	0.13
987	0.13
988	0.13
989	0.13
990	0.14
991	0.14
992	0.11
993	0.12
994	0.13
995	0.18
996	0.18
997	0.18
998	0.17
999	0.18
1000	0.17
1001	0.23
1002	0.28
1003	0.27
1004	0.31
1005	0.36
1006	0.41
1007	0.44
1008	0.46
1009	0.41
1010	0.37
1011	0.36
1012	0.38
1013	0.39
1014	0.37
1015	0.4
1016	0.41
1017	0.39
1018	0.41
1019	0.49
1020	0.54
1021	0.58
1022	0.59
1023	0.6
1024	0.64
1025	0.66
1026	0.7
1027	0.67
1028	0.66
1029	0.61
1030	0.67
1031	0.66
1032	0.65
1033	0.67
1034	0.67
1035	0.66
1036	0.61
1037	0.67
1038	0.61
1039	0.62
1040	0.61
1041	0.57
1042	0.52
1043	0.48
1044	0.47
1045	0.39
1046	0.36
1047	0.29
1048	0.26
1049	0.26
1050	0.24
1051	0.21
1052	0.16
1053	0.14
1054	0.12
1055	0.11
1056	0.12
1057	0.11
1058	0.11
1059	0.13
1060	0.16
1061	0.15
1062	0.18
1063	0.22
1064	0.22
1065	0.27
1066	0.35
1067	0.44
1068	0.46
1069	0.46
1070	0.46
1071	0.44
1072	0.43
1073	0.42
1074	0.36
1075	0.31
1076	0.27
1077	0.32
1078	0.31
1079	0.33
1080	0.35
1081	0.32
1082	0.36
1083	0.35
1084	0.42
1085	0.47
1086	0.51
1087	0.51
1088	0.51
1089	0.55
1090	0.52
1091	0.5
1092	0.43
1093	0.35
1094	0.35
1095	0.37
1096	0.34
1097	0.3
1098	0.27
1099	0.25
1100	0.24
1101	0.26

A0A0L6V5M0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer