FuNGI

A0A0L6VP66

Protein Details

Accession

A0A0L6VP66

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
265-285	TEESRKCKKGWHNPNAAHPKS	Hydrophilic
479-498	KITRASFKSKHKKASRPFEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MLFNSTQQRGMLSLPSSGCFLFCPSNRLDQTLNPTPSNLGPDHCYCMADHLPQTTAASNMDKINSTILKTAIKAIPLLTMDNYTLWKNRVENMLDLQELRTSLTSPTGVLSASEDVQLRTILTSKLESTIHANVITHDNEKSSKMIWKSISNYFASSQASNRARIFNSVLHLQSNPNEVQDFITRVKTSISQLHEVGIDLPKDIIAYLILHKLPPSMSNISQQITHSEKEITSELVLDHLRLYMNDQQFLASTSSSKTFPTSLLTEESRKCKKGWHNPNAAHPKSNCWFLYPHLRPVENSGEASVSSFHSSISKLTANFILDSGSSSHMVSDINFFVTIDLKEQGVVRTSSGEESLEIKGIGTIKLSNEFGDLFLNRVLYVPNLVINLLSVRCLVLDDFNIQFLKNSFSLSRNNQIIMSGRYEGNLPCLNFTNYEEKSHLSSSEQLHKSLGHVSYHRIRQKLGMPLRNIVSCEACALSKITRASFKSKHKKASRPFEELHLELIGSISPTSRNGDRYILTVVDSHTRYCSATPLILKSDVFETLTSIIDFEAKRFGYYPSVLHSDRGGEFINSSMEAYCKEHLIKSRTSDPYTPQQNGLAERHNRTIIESLRTILTDSKLSKKYWSDVVKVSTLTLNQIPSHRSSKSPYELFKGRSIPINFFRPIGNPVSFLIQPKQPGSKIYPKGSRGRLIGYNEELLSYRILAEDGSIVDTKSLQFLDFLPERHSLSDDDDCFEIVNEKICQSVPPLNEKEDAEVPLEEDRIEIKAEPVEISNSDQLEAMPVLSEESDDEIADLLVPATSGRVLRERTSRIKPVKYSHLTGDPTSFKKAASSEESDKWLKATDEELENIENHDVWEDMNEEPPSHLRTTWVFCTKSATLSAAEKKKARLCIQGFLQLPGIDYDETFAPTGKFSTLLVLLAFAIDKKLPLRQFDVKSAFLYAPLKETLYIKTPEGSKRRSPYLRLKKSLYGLKQAPANWFETLTAWFKDINFVQSTSDPCLYIHQDGDSFIFFHVDDLIVAGKVEVFEELFLLRFPNSTAHEPDTLLGMELCQDRKSISLSQPKLIQKGLELLGMEDSRLVLTPLSPGIQLTKATDQEKKAFKDLNINYRSHTGLLNFLACRTRPDLAPAVSILSSFNNEPGINHWKQVLHCWKYLKGTIDLKLTLRPDSSDESNCLKYFTDATWADDLETRLSRSGSICFWKACPVAWNSKKQKNISLSSTEAELNALSDGVQESQWVTYLVEELWKEKLNPTEFNVDNQGLVEKIKNFGSNSKTKHLDIKMKWLRELKDSNQINVKLIPSESMVADALTKPSNAESLKRLQERCFLVLFTPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.24
4	0.22
5	0.2
6	0.16
7	0.19
8	0.22
9	0.23
10	0.26
11	0.27
12	0.37
13	0.38
14	0.41
15	0.4
16	0.37
17	0.45
18	0.5
19	0.52
20	0.42
21	0.42
22	0.41
23	0.4
24	0.4
25	0.33
26	0.26
27	0.26
28	0.29
29	0.33
30	0.32
31	0.3
32	0.25
33	0.3
34	0.31
35	0.31
36	0.31
37	0.27
38	0.27
39	0.27
40	0.29
41	0.24
42	0.22
43	0.19
44	0.2
45	0.2
46	0.21
47	0.22
48	0.21
49	0.21
50	0.25
51	0.25
52	0.24
53	0.24
54	0.25
55	0.25
56	0.25
57	0.31
58	0.28
59	0.27
60	0.25
61	0.23
62	0.24
63	0.23
64	0.24
65	0.18
66	0.18
67	0.17
68	0.18
69	0.19
70	0.18
71	0.21
72	0.21
73	0.24
74	0.24
75	0.28
76	0.34
77	0.35
78	0.36
79	0.37
80	0.39
81	0.36
82	0.34
83	0.31
84	0.25
85	0.22
86	0.2
87	0.16
88	0.13
89	0.13
90	0.15
91	0.15
92	0.13
93	0.14
94	0.13
95	0.12
96	0.11
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.14
101	0.14
102	0.14
103	0.15
104	0.15
105	0.13
106	0.12
107	0.14
108	0.12
109	0.13
110	0.15
111	0.15
112	0.19
113	0.19
114	0.19
115	0.22
116	0.25
117	0.25
118	0.23
119	0.22
120	0.21
121	0.25
122	0.26
123	0.23
124	0.2
125	0.2
126	0.21
127	0.23
128	0.22
129	0.2
130	0.25
131	0.25
132	0.31
133	0.33
134	0.38
135	0.41
136	0.46
137	0.48
138	0.43
139	0.42
140	0.37
141	0.37
142	0.33
143	0.29
144	0.25
145	0.3
146	0.31
147	0.33
148	0.34
149	0.36
150	0.34
151	0.36
152	0.38
153	0.31
154	0.32
155	0.33
156	0.31
157	0.28
158	0.29
159	0.27
160	0.27
161	0.28
162	0.25
163	0.21
164	0.21
165	0.19
166	0.21
167	0.22
168	0.23
169	0.2
170	0.25
171	0.23
172	0.23
173	0.25
174	0.25
175	0.26
176	0.29
177	0.32
178	0.3
179	0.3
180	0.31
181	0.29
182	0.27
183	0.25
184	0.22
185	0.17
186	0.14
187	0.13
188	0.12
189	0.12
190	0.11
191	0.09
192	0.06
193	0.07
194	0.09
195	0.13
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.19
203	0.2
204	0.22
205	0.28
206	0.31
207	0.3
208	0.31
209	0.3
210	0.3
211	0.29
212	0.27
213	0.23
214	0.22
215	0.21
216	0.22
217	0.23
218	0.18
219	0.15
220	0.15
221	0.13
222	0.15
223	0.15
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.14
230	0.19
231	0.21
232	0.22
233	0.22
234	0.21
235	0.21
236	0.23
237	0.2
238	0.13
239	0.12
240	0.12
241	0.14
242	0.15
243	0.15
244	0.15
245	0.15
246	0.15
247	0.19
248	0.18
249	0.18
250	0.22
251	0.24
252	0.29
253	0.32
254	0.4
255	0.43
256	0.43
257	0.41
258	0.45
259	0.53
260	0.58
261	0.64
262	0.66
263	0.7
264	0.72
265	0.82
266	0.84
267	0.76
268	0.71
269	0.6
270	0.58
271	0.5
272	0.53
273	0.42
274	0.34
275	0.33
276	0.31
277	0.41
278	0.37
279	0.42
280	0.4
281	0.41
282	0.39
283	0.43
284	0.46
285	0.36
286	0.33
287	0.26
288	0.21
289	0.2
290	0.2
291	0.16
292	0.11
293	0.11
294	0.1
295	0.1
296	0.11
297	0.12
298	0.12
299	0.15
300	0.16
301	0.14
302	0.17
303	0.19
304	0.19
305	0.18
306	0.18
307	0.15
308	0.11
309	0.12
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.11
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.12
325	0.11
326	0.1
327	0.11
328	0.1
329	0.11
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.13
334	0.11
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.12
340	0.1
341	0.12
342	0.12
343	0.11
344	0.1
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.1
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.13
353	0.14
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.13
359	0.12
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.08
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.09
375	0.07
376	0.08
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.08
384	0.1
385	0.1
386	0.12
387	0.12
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.14
392	0.12
393	0.14
394	0.14
395	0.16
396	0.23
397	0.26
398	0.32
399	0.3
400	0.31
401	0.29
402	0.28
403	0.29
404	0.25
405	0.23
406	0.18
407	0.16
408	0.16
409	0.17
410	0.16
411	0.18
412	0.19
413	0.16
414	0.16
415	0.18
416	0.19
417	0.19
418	0.21
419	0.24
420	0.22
421	0.25
422	0.24
423	0.23
424	0.25
425	0.24
426	0.22
427	0.16
428	0.2
429	0.22
430	0.3
431	0.3
432	0.28
433	0.28
434	0.28
435	0.27
436	0.27
437	0.25
438	0.18
439	0.18
440	0.22
441	0.28
442	0.36
443	0.39
444	0.35
445	0.34
446	0.36
447	0.4
448	0.45
449	0.46
450	0.44
451	0.42
452	0.44
453	0.46
454	0.42
455	0.37
456	0.29
457	0.22
458	0.16
459	0.15
460	0.12
461	0.1
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.12
466	0.13
467	0.14
468	0.19
469	0.22
470	0.28
471	0.35
472	0.45
473	0.52
474	0.58
475	0.66
476	0.7
477	0.77
478	0.79
479	0.82
480	0.78
481	0.75
482	0.69
483	0.65
484	0.6
485	0.51
486	0.43
487	0.31
488	0.24
489	0.17
490	0.16
491	0.1
492	0.06
493	0.05
494	0.04
495	0.05
496	0.06
497	0.09
498	0.1
499	0.12
500	0.14
501	0.16
502	0.17
503	0.18
504	0.18
505	0.16
506	0.15
507	0.14
508	0.13
509	0.16
510	0.16
511	0.15
512	0.14
513	0.14
514	0.14
515	0.13
516	0.15
517	0.11
518	0.13
519	0.14
520	0.15
521	0.16
522	0.17
523	0.16
524	0.15
525	0.15
526	0.13
527	0.12
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.12
539	0.11
540	0.12
541	0.13
542	0.14
543	0.14
544	0.15
545	0.15
546	0.14
547	0.19
548	0.19
549	0.19
550	0.18
551	0.17
552	0.16
553	0.18
554	0.15
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.1
559	0.08
560	0.08
561	0.06
562	0.06
563	0.07
564	0.09
565	0.09
566	0.09
567	0.1
568	0.12
569	0.18
570	0.21
571	0.23
572	0.24
573	0.32
574	0.35
575	0.37
576	0.37
577	0.34
578	0.39
579	0.42
580	0.39
581	0.32
582	0.3
583	0.29
584	0.3
585	0.29
586	0.27
587	0.26
588	0.27
589	0.28
590	0.27
591	0.25
592	0.23
593	0.26
594	0.22
595	0.21
596	0.19
597	0.18
598	0.17
599	0.17
600	0.16
601	0.13
602	0.12
603	0.12
604	0.13
605	0.19
606	0.22
607	0.23
608	0.26
609	0.26
610	0.27
611	0.32
612	0.34
613	0.3
614	0.3
615	0.32
616	0.3
617	0.28
618	0.27
619	0.19
620	0.16
621	0.14
622	0.12
623	0.11
624	0.11
625	0.12
626	0.13
627	0.16
628	0.19
629	0.18
630	0.19
631	0.21
632	0.25
633	0.3
634	0.32
635	0.3
636	0.32
637	0.36
638	0.37
639	0.37
640	0.34
641	0.29
642	0.32
643	0.31
644	0.3
645	0.3
646	0.32
647	0.28
648	0.27
649	0.26
650	0.21
651	0.22
652	0.22
653	0.18
654	0.14
655	0.14
656	0.16
657	0.16
658	0.16
659	0.15
660	0.14
661	0.15
662	0.15
663	0.17
664	0.16
665	0.17
666	0.21
667	0.29
668	0.32
669	0.37
670	0.41
671	0.43
672	0.5
673	0.51
674	0.49
675	0.41
676	0.39
677	0.37
678	0.34
679	0.32
680	0.26
681	0.24
682	0.2
683	0.19
684	0.16
685	0.12
686	0.1
687	0.07
688	0.06
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.05
696	0.06
697	0.05
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.05
704	0.06
705	0.06
706	0.11
707	0.13
708	0.13
709	0.15
710	0.17
711	0.17
712	0.17
713	0.18
714	0.14
715	0.15
716	0.19
717	0.16
718	0.16
719	0.15
720	0.15
721	0.13
722	0.13
723	0.11
724	0.07
725	0.09
726	0.08
727	0.08
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.11
732	0.15
733	0.15
734	0.21
735	0.23
736	0.24
737	0.26
738	0.26
739	0.25
740	0.22
741	0.22
742	0.16
743	0.14
744	0.13
745	0.12
746	0.12
747	0.09
748	0.08
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.06
753	0.06
754	0.07
755	0.07
756	0.08
757	0.08
758	0.08
759	0.08
760	0.1
761	0.11
762	0.11
763	0.11
764	0.1
765	0.1
766	0.1
767	0.09
768	0.07
769	0.05
770	0.05
771	0.05
772	0.04
773	0.05
774	0.04
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.03
784	0.03
785	0.03
786	0.03
787	0.03
788	0.04
789	0.04
790	0.06
791	0.1
792	0.12
793	0.15
794	0.21
795	0.26
796	0.32
797	0.38
798	0.46
799	0.48
800	0.52
801	0.54
802	0.54
803	0.58
804	0.55
805	0.52
806	0.46
807	0.46
808	0.43
809	0.38
810	0.38
811	0.31
812	0.29
813	0.3
814	0.27
815	0.21
816	0.2
817	0.21
818	0.2
819	0.21
820	0.25
821	0.26
822	0.28
823	0.33
824	0.32
825	0.31
826	0.27
827	0.24
828	0.19
829	0.15
830	0.14
831	0.13
832	0.13
833	0.14
834	0.15
835	0.14
836	0.14
837	0.14
838	0.12
839	0.09
840	0.08
841	0.07
842	0.06
843	0.05
844	0.06
845	0.07
846	0.07
847	0.1
848	0.11
849	0.1
850	0.11
851	0.13
852	0.15
853	0.14
854	0.14
855	0.13
856	0.16
857	0.2
858	0.25
859	0.3
860	0.28
861	0.27
862	0.33
863	0.31
864	0.3
865	0.27
866	0.22
867	0.17
868	0.21
869	0.29
870	0.28
871	0.32
872	0.32
873	0.36
874	0.39
875	0.45
876	0.43
877	0.45
878	0.42
879	0.44
880	0.44
881	0.47
882	0.43
883	0.37
884	0.35
885	0.26
886	0.24
887	0.18
888	0.17
889	0.1
890	0.09
891	0.09
892	0.08
893	0.09
894	0.09
895	0.09
896	0.08
897	0.08
898	0.09
899	0.08
900	0.08
901	0.07
902	0.09
903	0.09
904	0.09
905	0.08
906	0.08
907	0.07
908	0.07
909	0.07
910	0.05
911	0.05
912	0.05
913	0.06
914	0.07
915	0.12
916	0.15
917	0.18
918	0.24
919	0.31
920	0.34
921	0.41
922	0.44
923	0.4
924	0.38
925	0.38
926	0.31
927	0.26
928	0.25
929	0.18
930	0.16
931	0.15
932	0.15
933	0.14
934	0.15
935	0.15
936	0.18
937	0.19
938	0.17
939	0.2
940	0.24
941	0.31
942	0.36
943	0.4
944	0.42
945	0.46
946	0.54
947	0.56
948	0.59
949	0.62
950	0.67
951	0.71
952	0.7
953	0.69
954	0.65
955	0.66
956	0.67
957	0.59
958	0.56
959	0.49
960	0.46
961	0.46
962	0.43
963	0.41
964	0.35
965	0.33
966	0.25
967	0.23
968	0.21
969	0.18
970	0.19
971	0.17
972	0.16
973	0.14
974	0.15
975	0.14
976	0.18
977	0.18
978	0.19
979	0.17
980	0.17
981	0.19
982	0.2
983	0.22
984	0.22
985	0.22
986	0.19
987	0.17
988	0.21
989	0.21
990	0.21
991	0.19
992	0.16
993	0.16
994	0.16
995	0.17
996	0.14
997	0.11
998	0.1
999	0.1
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.07
1004	0.06
1005	0.06
1006	0.07
1007	0.06
1008	0.06
1009	0.05
1010	0.05
1011	0.05
1012	0.05
1013	0.05
1014	0.04
1015	0.04
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.05
1019	0.06
1020	0.06
1021	0.06
1022	0.07
1023	0.08
1024	0.11
1025	0.15
1026	0.19
1027	0.23
1028	0.25
1029	0.26
1030	0.26
1031	0.26
1032	0.23
1033	0.19
1034	0.16
1035	0.12
1036	0.08
1037	0.1
1038	0.12
1039	0.13
1040	0.12
1041	0.12
1042	0.12
1043	0.14
1044	0.18
1045	0.2
1046	0.26
1047	0.35
1048	0.37
1049	0.4
1050	0.48
1051	0.5
1052	0.49
1053	0.45
1054	0.37
1055	0.28
1056	0.31
1057	0.28
1058	0.22
1059	0.19
1060	0.16
1061	0.18
1062	0.17
1063	0.16
1064	0.11
1065	0.1
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.05
1070	0.05
1071	0.07
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.09
1075	0.09
1076	0.11
1077	0.13
1078	0.14
1079	0.16
1080	0.19
1081	0.23
1082	0.27
1083	0.32
1084	0.33
1085	0.39
1086	0.46
1087	0.46
1088	0.47
1089	0.47
1090	0.45
1091	0.5
1092	0.52
1093	0.54
1094	0.52
1095	0.49
1096	0.46
1097	0.44
1098	0.44
1099	0.34
1100	0.3
1101	0.21
1102	0.2
1103	0.21
1104	0.23
1105	0.2
1106	0.2
1107	0.23
1108	0.21
1109	0.24
1110	0.23
1111	0.24
1112	0.21
1113	0.26
1114	0.31
1115	0.28
1116	0.3
1117	0.27
1118	0.25
1119	0.22
1120	0.22
1121	0.18
1122	0.12
1123	0.13
1124	0.12
1125	0.12
1126	0.13
1127	0.13
1128	0.13
1129	0.18
1130	0.25
1131	0.24
1132	0.25
1133	0.26
1134	0.27
1135	0.28
1136	0.38
1137	0.43
1138	0.39
1139	0.43
1140	0.47
1141	0.48
1142	0.5
1143	0.54
1144	0.48
1145	0.45
1146	0.45
1147	0.45
1148	0.45
1149	0.44
1150	0.4
1151	0.4
1152	0.38
1153	0.33
1154	0.28
1155	0.25
1156	0.24
1157	0.27
1158	0.31
1159	0.29
1160	0.31
1161	0.34
1162	0.37
1163	0.36
1164	0.33
1165	0.28
1166	0.25
1167	0.24
1168	0.21
1169	0.24
1170	0.21
1171	0.24
1172	0.25
1173	0.25
1174	0.24
1175	0.25
1176	0.26
1177	0.21
1178	0.22
1179	0.2
1180	0.19
1181	0.2
1182	0.2
1183	0.19
1184	0.21
1185	0.22
1186	0.26
1187	0.28
1188	0.28
1189	0.28
1190	0.33
1191	0.33
1192	0.31
1193	0.32
1194	0.31
1195	0.39
1196	0.44
1197	0.54
1198	0.57
1199	0.63
1200	0.7
1201	0.68
1202	0.72
1203	0.69
1204	0.69
1205	0.64
1206	0.6
1207	0.56
1208	0.49
1209	0.47
1210	0.39
1211	0.31
1212	0.25
1213	0.18
1214	0.13
1215	0.1
1216	0.09
1217	0.06
1218	0.07
1219	0.08
1220	0.08
1221	0.08
1222	0.08
1223	0.08
1224	0.09
1225	0.1
1226	0.1
1227	0.09
1228	0.08
1229	0.1
1230	0.1
1231	0.13
1232	0.14
1233	0.14
1234	0.18
1235	0.2
1236	0.21
1237	0.24
1238	0.32
1239	0.32
1240	0.35
1241	0.38
1242	0.43
1243	0.41
1244	0.44
1245	0.45
1246	0.37
1247	0.33
1248	0.3
1249	0.27
1250	0.19
1251	0.19
1252	0.19
1253	0.15
1254	0.17
1255	0.2
1256	0.23
1257	0.24
1258	0.3
1259	0.36
1260	0.41
1261	0.45
1262	0.51
1263	0.53
1264	0.51
1265	0.58
1266	0.6
1267	0.62
1268	0.57
1269	0.63
1270	0.63
1271	0.63
1272	0.67
1273	0.65
1274	0.6
1275	0.59
1276	0.63
1277	0.56
1278	0.58
1279	0.57
1280	0.56
1281	0.57
1282	0.56
1283	0.49
1284	0.45
1285	0.42
1286	0.34
1287	0.31
1288	0.27
1289	0.21
1290	0.21
1291	0.18
1292	0.17
1293	0.16
1294	0.13
1295	0.15
1296	0.14
1297	0.15
1298	0.14
1299	0.14
1300	0.13
1301	0.14
1302	0.2
1303	0.2
1304	0.23
1305	0.26
1306	0.33
1307	0.43
1308	0.5
1309	0.52
1310	0.5
1311	0.56
1312	0.57
1313	0.56
1314	0.49
1315	0.41

A0A0L6VP66

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer