Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VJE5

Protein Details
Accession A0A0L6VJE5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32RTELAPRKFKYRKAFKGKPPIRTGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-27RKFKYRKAFKGKPP
Subcellular Location(s) mito 9, cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037212  Med7/Med21-like  
IPR009244  Mediatior_Med7  
IPR044888  Mediatior_Med7_sf  
IPR016180  Ribosomal_L10e/L16  
IPR036920  Ribosomal_L10e/L16_sf  
IPR000114  Ribosomal_L16  
IPR020798  Ribosomal_L16_CS  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05983  Med7  
PF00252  Ribosomal_L16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00701  RIBOSOMAL_L16_2  
CDD cd01433  Ribosomal_L16_L10e  
Amino Acid Sequences MSGQQRTRTELAPRKFKYRKAFKGKPPIRTGGSTVGTTLEHGQYGLRVLEACRLSAKTLHSCETAIKRAIKPTKGAKCYLRVFPDLPVCVKGNETRMGKGKGPFEYWACRAAVGRVIFEVGGGGIQREMAFAALQHAKPRLPVKSEFIQLNSKPRLGAILLEESQNKLTHHTVATLNPKTIISNMYKLFTNHNITLATKLQQAAAGENYAQISKHPFNQNKQSAIVAQEVDFDLRTLVEPPHLQWIRENEGWSSFGDQEPWPHAAPRPSLEGMPKLYHQLEPKHALQALLNTLIHAYIQLLDVLANQGPVSLSTTPSHPITSKTDQIVSHIELAAFNMHGLCNDLRPRKRKTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.71
3 0.75
4 0.76
5 0.77
6 0.79
7 0.79
8 0.85
9 0.85
10 0.9
11 0.89
12 0.87
13 0.83
14 0.8
15 0.73
16 0.66
17 0.6
18 0.56
19 0.52
20 0.42
21 0.35
22 0.3
23 0.25
24 0.23
25 0.22
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.13
32 0.12
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.22
43 0.27
44 0.28
45 0.3
46 0.33
47 0.31
48 0.31
49 0.36
50 0.37
51 0.38
52 0.36
53 0.39
54 0.38
55 0.46
56 0.53
57 0.5
58 0.51
59 0.55
60 0.59
61 0.58
62 0.61
63 0.57
64 0.58
65 0.6
66 0.6
67 0.54
68 0.48
69 0.45
70 0.44
71 0.45
72 0.38
73 0.35
74 0.31
75 0.27
76 0.24
77 0.25
78 0.23
79 0.22
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.33
84 0.36
85 0.38
86 0.4
87 0.41
88 0.36
89 0.37
90 0.36
91 0.33
92 0.34
93 0.31
94 0.3
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.2
99 0.22
100 0.17
101 0.16
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.08
120 0.11
121 0.12
122 0.14
123 0.16
124 0.15
125 0.19
126 0.23
127 0.23
128 0.23
129 0.25
130 0.28
131 0.31
132 0.34
133 0.32
134 0.31
135 0.34
136 0.31
137 0.37
138 0.34
139 0.3
140 0.26
141 0.25
142 0.23
143 0.17
144 0.17
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.15
159 0.15
160 0.17
161 0.25
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.21
166 0.19
167 0.18
168 0.17
169 0.11
170 0.15
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.18
175 0.2
176 0.21
177 0.24
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.19
182 0.21
183 0.19
184 0.16
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.11
200 0.12
201 0.19
202 0.27
203 0.32
204 0.38
205 0.48
206 0.52
207 0.49
208 0.49
209 0.43
210 0.36
211 0.33
212 0.29
213 0.2
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.21
229 0.22
230 0.22
231 0.24
232 0.29
233 0.33
234 0.34
235 0.34
236 0.25
237 0.26
238 0.27
239 0.23
240 0.21
241 0.16
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.2
248 0.17
249 0.18
250 0.21
251 0.23
252 0.25
253 0.25
254 0.28
255 0.26
256 0.27
257 0.29
258 0.29
259 0.28
260 0.28
261 0.26
262 0.25
263 0.26
264 0.28
265 0.3
266 0.32
267 0.35
268 0.38
269 0.39
270 0.39
271 0.39
272 0.35
273 0.31
274 0.29
275 0.25
276 0.23
277 0.21
278 0.17
279 0.16
280 0.15
281 0.14
282 0.1
283 0.08
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.11
298 0.1
299 0.12
300 0.13
301 0.16
302 0.19
303 0.2
304 0.22
305 0.2
306 0.23
307 0.28
308 0.34
309 0.38
310 0.38
311 0.41
312 0.38
313 0.41
314 0.42
315 0.36
316 0.33
317 0.28
318 0.25
319 0.21
320 0.21
321 0.19
322 0.14
323 0.12
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.12
328 0.12
329 0.17
330 0.26
331 0.35
332 0.43
333 0.51