Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6UJY6

Protein Details
Accession A0A0L6UJY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-176QLKELRKKTRSNIWHQRQEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-164KKQAKNRKFEAQLKELRKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036053  PABP-dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MKNSKGGFLLDNEQDDARLLKQARQIEELKRQRLKQAEKLSQAPHLSLDKSKNPQCTVCGSIELDLQLLQIFKVPEQTDVLCVEETAELKDSELLPHLLKANPHQSTYSNMMLFLREQVEAYAFSEKKWGSAEALDEEFERRETAKKQAKNRKFEAQLKELRKKTRSNIWHQRQEAAHVHSFETLRNSSGTQMQKCSGCGLQNEARLNIQRTDDQLQGTVEFEKLENAEKAYATLHNCYLSQYDSYLRLSHSADPAADPKPSARVRLIKFLPPHVTPGRLFSIFRPFGPIYRVTLNYHHTPDGLPFFSGTAVIEFYTESQASLAQTEMHCSELDRHTIAVEEYDDRRDRSGRGMALINSSTTTSPQSKWAQAAPFVPLTPSDSLTVHNNRRPSQQSSFSSEGQPPVSKWANAQNQQQPYLLNPNSSSISPTTTTSKWASPQTPHISGHNSPDPSGQPIMSQKQVDPCNLFIKGLSPELESGDLFHAFKQFGTIVSARVMKNETTGVSKQFGFVSFTTEEATANALKAMDGVSLGQSSNRIVVRLHELKKIKEGRPSKLVSPPPITHVLEETSTNRQGPELLLSSGPMQQAVPEPQTPGKKNALEVQTASPMVQEAQLTQTIGGSRLSSALASPSILSACGSPTTSSVSMGPTTERQRMAAAVGRLQEGADEGMMSELLELLMALPTRERKLCLFNPQVLATKVSEAREIIETPDELLPPPKSQPVTASNLALAANPTTETPVRSSAQPGLVAPSSNKAITGSPAHDTSITGSPSSRRSEVAEPEFTSLASLGRLGVTEIVAIMLEQPHRVGPDILPPCSTDAWRTKKKETEVWLDEKIFSLPSIHQQKQKIGEKLFRIVKGFGLKNAPKITVDLLDSHPLRPLALLMTLFPEILKEKIRPSSSSDVPVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.22
4 0.16
5 0.2
6 0.2
7 0.23
8 0.29
9 0.36
10 0.38
11 0.43
12 0.48
13 0.49
14 0.58
15 0.62
16 0.66
17 0.67
18 0.66
19 0.69
20 0.72
21 0.73
22 0.72
23 0.73
24 0.73
25 0.71
26 0.75
27 0.7
28 0.67
29 0.6
30 0.51
31 0.44
32 0.39
33 0.36
34 0.35
35 0.39
36 0.4
37 0.48
38 0.53
39 0.56
40 0.57
41 0.57
42 0.54
43 0.53
44 0.49
45 0.42
46 0.4
47 0.33
48 0.3
49 0.29
50 0.26
51 0.2
52 0.15
53 0.14
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.18
61 0.19
62 0.19
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.23
67 0.25
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.13
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.18
84 0.21
85 0.2
86 0.22
87 0.27
88 0.34
89 0.34
90 0.35
91 0.35
92 0.33
93 0.36
94 0.4
95 0.38
96 0.29
97 0.27
98 0.26
99 0.25
100 0.25
101 0.22
102 0.19
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.2
110 0.18
111 0.18
112 0.24
113 0.23
114 0.24
115 0.25
116 0.25
117 0.19
118 0.21
119 0.23
120 0.2
121 0.22
122 0.2
123 0.19
124 0.19
125 0.18
126 0.16
127 0.15
128 0.12
129 0.16
130 0.19
131 0.29
132 0.36
133 0.43
134 0.53
135 0.63
136 0.71
137 0.75
138 0.78
139 0.77
140 0.78
141 0.79
142 0.76
143 0.75
144 0.75
145 0.75
146 0.78
147 0.75
148 0.74
149 0.71
150 0.7
151 0.67
152 0.69
153 0.69
154 0.7
155 0.75
156 0.77
157 0.81
158 0.76
159 0.75
160 0.66
161 0.63
162 0.59
163 0.53
164 0.47
165 0.39
166 0.38
167 0.35
168 0.34
169 0.29
170 0.28
171 0.23
172 0.19
173 0.19
174 0.19
175 0.17
176 0.24
177 0.3
178 0.28
179 0.3
180 0.32
181 0.33
182 0.33
183 0.34
184 0.29
185 0.25
186 0.23
187 0.27
188 0.28
189 0.33
190 0.34
191 0.32
192 0.32
193 0.33
194 0.35
195 0.31
196 0.28
197 0.25
198 0.27
199 0.3
200 0.29
201 0.26
202 0.24
203 0.22
204 0.2
205 0.19
206 0.16
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.17
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.17
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.18
242 0.21
243 0.2
244 0.18
245 0.15
246 0.14
247 0.21
248 0.22
249 0.23
250 0.26
251 0.32
252 0.35
253 0.43
254 0.46
255 0.43
256 0.44
257 0.47
258 0.46
259 0.39
260 0.42
261 0.35
262 0.36
263 0.3
264 0.32
265 0.3
266 0.27
267 0.27
268 0.23
269 0.31
270 0.28
271 0.28
272 0.3
273 0.27
274 0.27
275 0.3
276 0.29
277 0.22
278 0.25
279 0.27
280 0.23
281 0.27
282 0.29
283 0.3
284 0.31
285 0.28
286 0.25
287 0.23
288 0.23
289 0.23
290 0.19
291 0.15
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.09
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.14
319 0.14
320 0.16
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.13
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.18
334 0.19
335 0.18
336 0.2
337 0.24
338 0.2
339 0.21
340 0.23
341 0.22
342 0.23
343 0.22
344 0.17
345 0.13
346 0.13
347 0.11
348 0.1
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.19
353 0.22
354 0.23
355 0.24
356 0.27
357 0.25
358 0.25
359 0.25
360 0.21
361 0.19
362 0.17
363 0.15
364 0.12
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.18
372 0.25
373 0.27
374 0.29
375 0.32
376 0.33
377 0.38
378 0.42
379 0.42
380 0.4
381 0.43
382 0.44
383 0.46
384 0.48
385 0.44
386 0.42
387 0.37
388 0.33
389 0.27
390 0.24
391 0.17
392 0.19
393 0.19
394 0.17
395 0.17
396 0.24
397 0.3
398 0.34
399 0.4
400 0.41
401 0.42
402 0.43
403 0.42
404 0.34
405 0.28
406 0.31
407 0.25
408 0.2
409 0.18
410 0.18
411 0.19
412 0.18
413 0.18
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.15
419 0.14
420 0.18
421 0.18
422 0.19
423 0.2
424 0.23
425 0.24
426 0.22
427 0.3
428 0.32
429 0.33
430 0.33
431 0.31
432 0.32
433 0.3
434 0.32
435 0.29
436 0.24
437 0.22
438 0.23
439 0.21
440 0.19
441 0.19
442 0.14
443 0.11
444 0.14
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.16
449 0.22
450 0.24
451 0.24
452 0.22
453 0.22
454 0.22
455 0.21
456 0.21
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.12
462 0.1
463 0.1
464 0.11
465 0.11
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.12
482 0.16
483 0.14
484 0.15
485 0.16
486 0.13
487 0.14
488 0.14
489 0.13
490 0.13
491 0.15
492 0.15
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.15
497 0.15
498 0.14
499 0.13
500 0.15
501 0.14
502 0.14
503 0.14
504 0.14
505 0.13
506 0.1
507 0.12
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.11
529 0.19
530 0.26
531 0.28
532 0.31
533 0.34
534 0.34
535 0.43
536 0.49
537 0.44
538 0.45
539 0.48
540 0.47
541 0.51
542 0.53
543 0.48
544 0.48
545 0.49
546 0.46
547 0.46
548 0.42
549 0.38
550 0.41
551 0.38
552 0.3
553 0.27
554 0.24
555 0.19
556 0.19
557 0.18
558 0.17
559 0.18
560 0.18
561 0.16
562 0.15
563 0.15
564 0.14
565 0.15
566 0.12
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.14
572 0.13
573 0.11
574 0.09
575 0.09
576 0.12
577 0.14
578 0.15
579 0.13
580 0.15
581 0.2
582 0.27
583 0.28
584 0.3
585 0.33
586 0.32
587 0.33
588 0.38
589 0.36
590 0.31
591 0.31
592 0.28
593 0.25
594 0.24
595 0.22
596 0.15
597 0.13
598 0.11
599 0.1
600 0.08
601 0.06
602 0.08
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.1
607 0.09
608 0.1
609 0.1
610 0.08
611 0.07
612 0.08
613 0.08
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.06
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.08
629 0.09
630 0.13
631 0.13
632 0.14
633 0.13
634 0.14
635 0.14
636 0.14
637 0.15
638 0.16
639 0.21
640 0.24
641 0.24
642 0.23
643 0.24
644 0.24
645 0.24
646 0.23
647 0.2
648 0.18
649 0.19
650 0.18
651 0.18
652 0.17
653 0.14
654 0.1
655 0.09
656 0.06
657 0.05
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.04
662 0.04
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.03
667 0.03
668 0.04
669 0.04
670 0.05
671 0.07
672 0.1
673 0.13
674 0.15
675 0.17
676 0.18
677 0.27
678 0.31
679 0.39
680 0.42
681 0.43
682 0.45
683 0.46
684 0.47
685 0.4
686 0.37
687 0.28
688 0.27
689 0.25
690 0.23
691 0.22
692 0.18
693 0.19
694 0.19
695 0.19
696 0.16
697 0.15
698 0.14
699 0.15
700 0.16
701 0.15
702 0.13
703 0.17
704 0.17
705 0.17
706 0.2
707 0.23
708 0.22
709 0.23
710 0.28
711 0.29
712 0.34
713 0.34
714 0.33
715 0.28
716 0.28
717 0.27
718 0.22
719 0.17
720 0.1
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.11
725 0.11
726 0.12
727 0.14
728 0.18
729 0.2
730 0.21
731 0.24
732 0.25
733 0.27
734 0.26
735 0.24
736 0.24
737 0.23
738 0.23
739 0.2
740 0.19
741 0.19
742 0.18
743 0.18
744 0.15
745 0.15
746 0.17
747 0.21
748 0.19
749 0.2
750 0.21
751 0.22
752 0.21
753 0.2
754 0.2
755 0.22
756 0.2
757 0.18
758 0.18
759 0.21
760 0.25
761 0.3
762 0.27
763 0.23
764 0.27
765 0.33
766 0.4
767 0.43
768 0.43
769 0.4
770 0.41
771 0.4
772 0.35
773 0.29
774 0.21
775 0.15
776 0.1
777 0.09
778 0.07
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.06
785 0.06
786 0.06
787 0.05
788 0.05
789 0.06
790 0.08
791 0.08
792 0.09
793 0.1
794 0.11
795 0.12
796 0.14
797 0.15
798 0.13
799 0.22
800 0.27
801 0.27
802 0.27
803 0.27
804 0.28
805 0.29
806 0.29
807 0.26
808 0.31
809 0.39
810 0.48
811 0.54
812 0.59
813 0.65
814 0.7
815 0.71
816 0.68
817 0.69
818 0.67
819 0.66
820 0.64
821 0.58
822 0.52
823 0.45
824 0.38
825 0.29
826 0.22
827 0.18
828 0.14
829 0.22
830 0.31
831 0.36
832 0.41
833 0.45
834 0.52
835 0.59
836 0.66
837 0.65
838 0.62
839 0.65
840 0.63
841 0.68
842 0.67
843 0.61
844 0.55
845 0.48
846 0.46
847 0.47
848 0.44
849 0.4
850 0.43
851 0.42
852 0.47
853 0.49
854 0.46
855 0.38
856 0.38
857 0.37
858 0.3
859 0.29
860 0.25
861 0.25
862 0.31
863 0.31
864 0.3
865 0.31
866 0.27
867 0.26
868 0.23
869 0.21
870 0.14
871 0.16
872 0.16
873 0.13
874 0.16
875 0.16
876 0.16
877 0.14
878 0.14
879 0.13
880 0.16
881 0.2
882 0.2
883 0.25
884 0.34
885 0.38
886 0.38
887 0.43
888 0.48
889 0.49