Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VDU6

Protein Details
Accession A0A0L6VDU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-303RDRDRDRDRERHSRDDRDRRTRDDHRGYRDKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-290DRDRERDRDRDRDRERHSRDDRDR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MDLGACAKTHSQKLKGEYEAALKRSQSDNPEESTDIVSPHELQSMRREYENNILGFVEECDRRIRAAQKRLEKTPEENNRTTALMREIGEIQTAYEGAMAEVENLGESGQVDQSMAELAKAEALKAEKLEKERELQQLTETSGASGHQKLRVCDICGAYLSILDSDRRLADHFGGKMHLGYLQLRQTIEEWRTRPHGLNAPSLLNNNPGLTAGLQAAHFGQQRAQAAAAQNSSTPVNEWGSRGEKGREHEGRMPPPASSSGGDRDRDRDRERDRDRDRDRERHSRDDRDRRTRDDHRGYRDKDYDDRRPSRRDVDEYDKRKHDDDRLPKDDRDKRRRYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.57
3 0.55
4 0.49
5 0.5
6 0.5
7 0.46
8 0.43
9 0.36
10 0.37
11 0.37
12 0.39
13 0.36
14 0.37
15 0.38
16 0.38
17 0.41
18 0.39
19 0.37
20 0.35
21 0.3
22 0.22
23 0.2
24 0.18
25 0.16
26 0.16
27 0.19
28 0.17
29 0.18
30 0.26
31 0.32
32 0.32
33 0.33
34 0.34
35 0.33
36 0.41
37 0.45
38 0.36
39 0.3
40 0.28
41 0.26
42 0.25
43 0.23
44 0.18
45 0.13
46 0.14
47 0.16
48 0.16
49 0.17
50 0.22
51 0.3
52 0.34
53 0.43
54 0.51
55 0.58
56 0.64
57 0.69
58 0.7
59 0.65
60 0.61
61 0.62
62 0.64
63 0.61
64 0.57
65 0.53
66 0.49
67 0.46
68 0.41
69 0.33
70 0.25
71 0.21
72 0.2
73 0.2
74 0.19
75 0.18
76 0.18
77 0.16
78 0.13
79 0.1
80 0.09
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.13
114 0.14
115 0.17
116 0.21
117 0.2
118 0.23
119 0.28
120 0.32
121 0.31
122 0.29
123 0.27
124 0.25
125 0.25
126 0.23
127 0.17
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.15
135 0.17
136 0.17
137 0.23
138 0.25
139 0.24
140 0.25
141 0.24
142 0.21
143 0.19
144 0.19
145 0.13
146 0.11
147 0.09
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.17
175 0.19
176 0.21
177 0.2
178 0.21
179 0.25
180 0.27
181 0.27
182 0.27
183 0.31
184 0.29
185 0.31
186 0.3
187 0.29
188 0.28
189 0.27
190 0.24
191 0.19
192 0.17
193 0.13
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.17
216 0.14
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.16
227 0.19
228 0.21
229 0.23
230 0.24
231 0.25
232 0.28
233 0.37
234 0.37
235 0.39
236 0.45
237 0.49
238 0.5
239 0.51
240 0.48
241 0.39
242 0.37
243 0.34
244 0.28
245 0.22
246 0.21
247 0.23
248 0.27
249 0.3
250 0.29
251 0.33
252 0.37
253 0.44
254 0.45
255 0.47
256 0.49
257 0.57
258 0.62
259 0.68
260 0.68
261 0.72
262 0.74
263 0.76
264 0.78
265 0.77
266 0.78
267 0.78
268 0.78
269 0.78
270 0.79
271 0.79
272 0.81
273 0.82
274 0.85
275 0.85
276 0.84
277 0.8
278 0.81
279 0.79
280 0.8
281 0.79
282 0.77
283 0.76
284 0.81
285 0.78
286 0.78
287 0.75
288 0.69
289 0.67
290 0.67
291 0.67
292 0.68
293 0.72
294 0.7
295 0.7
296 0.71
297 0.72
298 0.71
299 0.67
300 0.65
301 0.66
302 0.7
303 0.7
304 0.73
305 0.71
306 0.67
307 0.64
308 0.62
309 0.61
310 0.61
311 0.65
312 0.67
313 0.68
314 0.7
315 0.7
316 0.75
317 0.75
318 0.75
319 0.75