FuNGI

A0A0L6V901

Protein Details

Accession

A0A0L6V901

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
219-247	AALFSSKDKRKNNSRSTKTKNSNRCTQNY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MADANNTNAQPAAARPNQSDGFRQAMLKTALETIPQLTEENYPIWKDKMEALLELRGLLTTLNSPARVLFSDDNAELKLLLISKMDSVTHNNVVTSDNRDSAKALWQSIKERFASSQSSNRARVFNNFLYLVFREDNIEQFVTETKVAIKKLVDVGIDLPQDVLAYLILFKFPTTLHSLKRQVMHSDKELTVQFVCNHLTQYNNEAKAETKEDSGTTDAALFSSKDKRKNNSRSTKTKNSNRCTQNYHNPKQDENHTADSCWHLHPDKAPDWWKEDQAKWKASKSESNYFMSLLTLWVERGDNKSRIILDSGASAHIFNDKRFFSQLTLGMFEEIKTGKEDATLPIKGKGSVRMRWGDRVLELKNCLYVPDIVINLVSAGNLDQNGCKIHSESGRFSVKKNGISVLEGKVVGNLYTVENPTSIGSTDKEAHYSPSGDHIKEIHESYGHASIQRLSQMIPSQITNREKQEFQCKSCVVSKITKKPFKLTSQTVKKPWERIHLDLIGPIKPQSLGRHKYILSVTDNATGYLAGFPLVHKSDTSEALINLLENEKRRLGYFPSQICSDGGGEFLGTRLVQFLKHNHIKQLISEPYHPEHNGRAERANRTIVESMRATFKASNLKKNMWHYVVKSCCLALNQIPKKSEELSPWEVMQGYKLPNDYLKPLGNPVIYLNNRRKKGEKFSEKGAEGRLVGYNPAFRSYKILASDGSVVDSKHVQFLKKLDDQTSTTIDIEEPLTVESNDEPSDEESEDHSPWTQIRNQEGNDDTNEGEAQTPENQTPAPEPAQQPTTRILRDRSTLRPPMRYGFHHYYEPKTFEGAMRCNEDDKWLEAIGKEIDSIESHKVCPNTILGIKYERTSDAILLSNPKHIEHGLEELGLLDARPTSIPLTPNKHLKDADDEEFEAFKRLNINYRSAVGLLNYISMHTRPDISFAVSSLARFSTKPGIQHWHEVKKVWLYLKHTKDLKLTLKVKNPDKLLEIYSDATWGDDPKTRTSQSGYLCYLYGSLISWNSCRQRNITYSSTEAELNPLVDSFHEGTWLRSLLSDIWRTEANAVTHFIDDQDLDERLHLSDEDFAELLKTTHYIDNKGLDDKLKKFGSNPKTRHIDLKTKGIRQEIKNNNIKVVLIKTEDMIADSMTKASPINVVLKLTNTIDPTFTNKKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.29
3	0.36
4	0.4
5	0.42
6	0.44
7	0.39
8	0.39
9	0.37
10	0.37
11	0.31
12	0.33
13	0.33
14	0.29
15	0.26
16	0.25
17	0.24
18	0.23
19	0.23
20	0.18
21	0.17
22	0.17
23	0.17
24	0.15
25	0.17
26	0.18
27	0.19
28	0.2
29	0.21
30	0.23
31	0.24
32	0.23
33	0.22
34	0.25
35	0.29
36	0.28
37	0.29
38	0.29
39	0.31
40	0.3
41	0.28
42	0.24
43	0.17
44	0.15
45	0.12
46	0.1
47	0.08
48	0.13
49	0.16
50	0.16
51	0.16
52	0.17
53	0.2
54	0.2
55	0.24
56	0.21
57	0.21
58	0.25
59	0.25
60	0.26
61	0.24
62	0.23
63	0.17
64	0.16
65	0.14
66	0.11
67	0.11
68	0.1
69	0.11
70	0.12
71	0.13
72	0.14
73	0.15
74	0.19
75	0.24
76	0.28
77	0.28
78	0.27
79	0.26
80	0.27
81	0.28
82	0.28
83	0.26
84	0.25
85	0.25
86	0.26
87	0.27
88	0.26
89	0.32
90	0.29
91	0.3
92	0.31
93	0.35
94	0.41
95	0.46
96	0.49
97	0.42
98	0.41
99	0.39
100	0.38
101	0.4
102	0.39
103	0.41
104	0.44
105	0.5
106	0.53
107	0.54
108	0.54
109	0.49
110	0.51
111	0.51
112	0.45
113	0.43
114	0.38
115	0.35
116	0.35
117	0.34
118	0.31
119	0.24
120	0.21
121	0.2
122	0.2
123	0.22
124	0.21
125	0.21
126	0.16
127	0.16
128	0.18
129	0.17
130	0.16
131	0.14
132	0.16
133	0.19
134	0.2
135	0.22
136	0.21
137	0.22
138	0.26
139	0.28
140	0.24
141	0.21
142	0.22
143	0.25
144	0.24
145	0.2
146	0.16
147	0.13
148	0.13
149	0.12
150	0.1
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.11
161	0.17
162	0.21
163	0.25
164	0.34
165	0.41
166	0.44
167	0.5
168	0.5
169	0.5
170	0.53
171	0.54
172	0.49
173	0.49
174	0.45
175	0.43
176	0.41
177	0.35
178	0.29
179	0.27
180	0.24
181	0.2
182	0.22
183	0.19
184	0.2
185	0.19
186	0.2
187	0.19
188	0.25
189	0.29
190	0.29
191	0.29
192	0.27
193	0.28
194	0.29
195	0.32
196	0.26
197	0.2
198	0.19
199	0.2
200	0.21
201	0.21
202	0.18
203	0.14
204	0.14
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.09
209	0.11
210	0.21
211	0.26
212	0.33
213	0.4
214	0.49
215	0.59
216	0.69
217	0.77
218	0.78
219	0.82
220	0.84
221	0.87
222	0.89
223	0.89
224	0.88
225	0.87
226	0.83
227	0.84
228	0.81
229	0.78
230	0.75
231	0.74
232	0.75
233	0.75
234	0.76
235	0.75
236	0.7
237	0.67
238	0.64
239	0.62
240	0.57
241	0.52
242	0.51
243	0.43
244	0.41
245	0.39
246	0.37
247	0.32
248	0.27
249	0.26
250	0.2
251	0.21
252	0.25
253	0.31
254	0.3
255	0.35
256	0.4
257	0.38
258	0.43
259	0.43
260	0.45
261	0.45
262	0.47
263	0.49
264	0.51
265	0.55
266	0.53
267	0.55
268	0.55
269	0.52
270	0.55
271	0.53
272	0.54
273	0.51
274	0.51
275	0.47
276	0.42
277	0.38
278	0.3
279	0.23
280	0.15
281	0.12
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.1
287	0.15
288	0.21
289	0.22
290	0.23
291	0.26
292	0.26
293	0.26
294	0.27
295	0.22
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.14
300	0.13
301	0.12
302	0.1
303	0.15
304	0.16
305	0.15
306	0.19
307	0.19
308	0.21
309	0.23
310	0.24
311	0.19
312	0.22
313	0.25
314	0.22
315	0.23
316	0.21
317	0.2
318	0.19
319	0.17
320	0.15
321	0.12
322	0.11
323	0.11
324	0.11
325	0.1
326	0.12
327	0.13
328	0.14
329	0.19
330	0.2
331	0.2
332	0.23
333	0.24
334	0.24
335	0.25
336	0.3
337	0.3
338	0.32
339	0.37
340	0.4
341	0.41
342	0.44
343	0.45
344	0.38
345	0.34
346	0.35
347	0.31
348	0.28
349	0.28
350	0.23
351	0.23
352	0.22
353	0.2
354	0.16
355	0.15
356	0.12
357	0.12
358	0.12
359	0.1
360	0.1
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.14
377	0.18
378	0.22
379	0.23
380	0.28
381	0.35
382	0.35
383	0.35
384	0.4
385	0.39
386	0.38
387	0.37
388	0.34
389	0.27
390	0.28
391	0.3
392	0.23
393	0.21
394	0.18
395	0.16
396	0.15
397	0.14
398	0.12
399	0.1
400	0.08
401	0.07
402	0.09
403	0.1
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.1
413	0.13
414	0.13
415	0.14
416	0.14
417	0.16
418	0.16
419	0.16
420	0.14
421	0.2
422	0.23
423	0.21
424	0.22
425	0.2
426	0.21
427	0.22
428	0.23
429	0.15
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.16
434	0.15
435	0.13
436	0.13
437	0.13
438	0.14
439	0.15
440	0.13
441	0.1
442	0.12
443	0.13
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.22
449	0.25
450	0.26
451	0.28
452	0.29
453	0.3
454	0.32
455	0.4
456	0.39
457	0.38
458	0.41
459	0.38
460	0.37
461	0.4
462	0.41
463	0.33
464	0.36
465	0.41
466	0.45
467	0.54
468	0.57
469	0.54
470	0.57
471	0.59
472	0.58
473	0.57
474	0.54
475	0.55
476	0.59
477	0.64
478	0.63
479	0.64
480	0.61
481	0.61
482	0.57
483	0.56
484	0.51
485	0.47
486	0.47
487	0.42
488	0.39
489	0.35
490	0.32
491	0.24
492	0.2
493	0.17
494	0.12
495	0.1
496	0.12
497	0.16
498	0.24
499	0.26
500	0.29
501	0.33
502	0.32
503	0.35
504	0.34
505	0.31
506	0.25
507	0.23
508	0.22
509	0.22
510	0.22
511	0.18
512	0.17
513	0.13
514	0.11
515	0.09
516	0.08
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.07
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.09
525	0.11
526	0.12
527	0.14
528	0.12
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.09
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.09
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.12
541	0.13
542	0.17
543	0.22
544	0.27
545	0.28
546	0.29
547	0.29
548	0.29
549	0.27
550	0.24
551	0.18
552	0.11
553	0.09
554	0.07
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.04
562	0.05
563	0.06
564	0.08
565	0.11
566	0.19
567	0.25
568	0.26
569	0.27
570	0.31
571	0.3
572	0.29
573	0.33
574	0.28
575	0.24
576	0.25
577	0.26
578	0.23
579	0.26
580	0.25
581	0.19
582	0.18
583	0.23
584	0.23
585	0.22
586	0.25
587	0.27
588	0.29
589	0.3
590	0.3
591	0.24
592	0.25
593	0.26
594	0.21
595	0.21
596	0.18
597	0.17
598	0.17
599	0.17
600	0.15
601	0.13
602	0.15
603	0.22
604	0.24
605	0.31
606	0.32
607	0.34
608	0.38
609	0.41
610	0.44
611	0.38
612	0.38
613	0.33
614	0.38
615	0.37
616	0.34
617	0.3
618	0.25
619	0.22
620	0.19
621	0.19
622	0.15
623	0.23
624	0.27
625	0.3
626	0.31
627	0.31
628	0.32
629	0.33
630	0.31
631	0.24
632	0.26
633	0.27
634	0.27
635	0.26
636	0.24
637	0.23
638	0.2
639	0.18
640	0.14
641	0.11
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.12
646	0.14
647	0.15
648	0.15
649	0.15
650	0.14
651	0.16
652	0.18
653	0.16
654	0.15
655	0.15
656	0.19
657	0.2
658	0.26
659	0.34
660	0.39
661	0.41
662	0.44
663	0.47
664	0.45
665	0.54
666	0.58
667	0.59
668	0.54
669	0.59
670	0.63
671	0.59
672	0.55
673	0.46
674	0.37
675	0.27
676	0.25
677	0.19
678	0.12
679	0.12
680	0.11
681	0.12
682	0.11
683	0.14
684	0.14
685	0.13
686	0.18
687	0.18
688	0.21
689	0.2
690	0.21
691	0.17
692	0.18
693	0.2
694	0.15
695	0.15
696	0.12
697	0.1
698	0.1
699	0.12
700	0.11
701	0.14
702	0.15
703	0.14
704	0.16
705	0.19
706	0.25
707	0.28
708	0.3
709	0.27
710	0.29
711	0.3
712	0.3
713	0.3
714	0.25
715	0.2
716	0.18
717	0.16
718	0.14
719	0.13
720	0.1
721	0.07
722	0.06
723	0.07
724	0.06
725	0.07
726	0.07
727	0.08
728	0.08
729	0.08
730	0.08
731	0.09
732	0.11
733	0.11
734	0.11
735	0.11
736	0.14
737	0.14
738	0.13
739	0.13
740	0.12
741	0.12
742	0.15
743	0.16
744	0.18
745	0.24
746	0.28
747	0.28
748	0.32
749	0.33
750	0.31
751	0.29
752	0.27
753	0.21
754	0.17
755	0.16
756	0.12
757	0.1
758	0.08
759	0.09
760	0.1
761	0.11
762	0.1
763	0.11
764	0.11
765	0.11
766	0.13
767	0.15
768	0.15
769	0.18
770	0.19
771	0.21
772	0.27
773	0.26
774	0.26
775	0.28
776	0.3
777	0.28
778	0.3
779	0.31
780	0.29
781	0.34
782	0.37
783	0.38
784	0.41
785	0.48
786	0.48
787	0.49
788	0.49
789	0.49
790	0.48
791	0.45
792	0.46
793	0.44
794	0.44
795	0.45
796	0.45
797	0.46
798	0.46
799	0.45
800	0.37
801	0.32
802	0.29
803	0.26
804	0.29
805	0.27
806	0.26
807	0.28
808	0.28
809	0.28
810	0.27
811	0.27
812	0.23
813	0.22
814	0.21
815	0.17
816	0.17
817	0.15
818	0.17
819	0.15
820	0.13
821	0.11
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.12
826	0.14
827	0.14
828	0.15
829	0.19
830	0.19
831	0.19
832	0.19
833	0.18
834	0.17
835	0.19
836	0.19
837	0.18
838	0.21
839	0.22
840	0.21
841	0.22
842	0.18
843	0.18
844	0.17
845	0.16
846	0.14
847	0.15
848	0.15
849	0.19
850	0.19
851	0.21
852	0.21
853	0.2
854	0.2
855	0.18
856	0.19
857	0.16
858	0.19
859	0.15
860	0.14
861	0.14
862	0.13
863	0.13
864	0.11
865	0.09
866	0.05
867	0.04
868	0.05
869	0.05
870	0.06
871	0.07
872	0.1
873	0.14
874	0.21
875	0.28
876	0.33
877	0.41
878	0.43
879	0.46
880	0.44
881	0.42
882	0.44
883	0.42
884	0.41
885	0.35
886	0.34
887	0.3
888	0.3
889	0.28
890	0.21
891	0.16
892	0.13
893	0.14
894	0.15
895	0.22
896	0.24
897	0.28
898	0.29
899	0.3
900	0.3
901	0.27
902	0.26
903	0.18
904	0.17
905	0.13
906	0.12
907	0.1
908	0.1
909	0.11
910	0.1
911	0.11
912	0.1
913	0.13
914	0.12
915	0.16
916	0.17
917	0.18
918	0.18
919	0.17
920	0.19
921	0.16
922	0.16
923	0.14
924	0.14
925	0.13
926	0.13
927	0.15
928	0.21
929	0.23
930	0.26
931	0.29
932	0.36
933	0.38
934	0.47
935	0.52
936	0.52
937	0.52
938	0.5
939	0.49
940	0.47
941	0.48
942	0.44
943	0.41
944	0.41
945	0.48
946	0.53
947	0.57
948	0.55
949	0.54
950	0.54
951	0.57
952	0.56
953	0.56
954	0.58
955	0.57
956	0.61
957	0.67
958	0.69
959	0.67
960	0.63
961	0.56
962	0.53
963	0.48
964	0.41
965	0.35
966	0.31
967	0.26
968	0.24
969	0.21
970	0.17
971	0.15
972	0.14
973	0.13
974	0.13
975	0.16
976	0.18
977	0.23
978	0.29
979	0.3
980	0.31
981	0.34
982	0.38
983	0.38
984	0.43
985	0.4
986	0.35
987	0.34
988	0.32
989	0.28
990	0.21
991	0.16
992	0.1
993	0.1
994	0.1
995	0.12
996	0.14
997	0.2
998	0.27
999	0.31
1000	0.34
1001	0.35
1002	0.4
1003	0.44
1004	0.49
1005	0.45
1006	0.43
1007	0.41
1008	0.4
1009	0.38
1010	0.32
1011	0.27
1012	0.24
1013	0.21
1014	0.17
1015	0.15
1016	0.13
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.15
1020	0.14
1021	0.12
1022	0.16
1023	0.16
1024	0.18
1025	0.21
1026	0.22
1027	0.17
1028	0.15
1029	0.17
1030	0.17
1031	0.23
1032	0.26
1033	0.23
1034	0.25
1035	0.26
1036	0.26
1037	0.27
1038	0.28
1039	0.23
1040	0.21
1041	0.23
1042	0.22
1043	0.21
1044	0.21
1045	0.19
1046	0.15
1047	0.13
1048	0.13
1049	0.13
1050	0.13
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.14
1054	0.13
1055	0.14
1056	0.13
1057	0.11
1058	0.14
1059	0.15
1060	0.16
1061	0.15
1062	0.14
1063	0.14
1064	0.14
1065	0.14
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.11
1069	0.16
1070	0.19
1071	0.21
1072	0.24
1073	0.3
1074	0.32
1075	0.34
1076	0.34
1077	0.35
1078	0.39
1079	0.39
1080	0.45
1081	0.42
1082	0.4
1083	0.42
1084	0.5
1085	0.55
1086	0.58
1087	0.6
1088	0.61
1089	0.65
1090	0.66
1091	0.7
1092	0.68
1093	0.67
1094	0.62
1095	0.68
1096	0.67
1097	0.66
1098	0.68
1099	0.68
1100	0.69
1101	0.65
1102	0.71
1103	0.7
1104	0.71
1105	0.74
1106	0.71
1107	0.65
1108	0.58
1109	0.52
1110	0.45
1111	0.39
1112	0.34
1113	0.28
1114	0.27
1115	0.25
1116	0.25
1117	0.25
1118	0.22
1119	0.18
1120	0.14
1121	0.13
1122	0.12
1123	0.13
1124	0.11
1125	0.11
1126	0.1
1127	0.11
1128	0.13
1129	0.14
1130	0.19
1131	0.2
1132	0.22
1133	0.23
1134	0.24
1135	0.27
1136	0.27
1137	0.27
1138	0.25
1139	0.24
1140	0.23
1141	0.24
1142	0.3

A0A0L6V901

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer