Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VAV2

Protein Details
Accession A0A0L6VAV2    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-43NEQVNEIQKSKKQKHRKDKPWDTDDIDHHydrophilic
246-267RFLPNFSKRKRAKQAKATSEQQHydrophilic
287-318RAEQAKQKSAQEQKKKKKYTPFPPPQMPRKIDHydrophilic
368-396EEPRKNPVLAKKINERKRKFDHENSDSGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-32KKQKHRK
254-257RKRA
300-304KKKKK
328-386KKKARGKDSISADAAKKAEGRELVSNLKKMNKRLELPPPSEEPRKNPVLAKKINERKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MAIAKPVEDITTSKINEQVNEIQKSKKQKHRKDKPWDTDDIDHWKIEPFELEKDKIKPFTEESSFATLFPKYREVYLKEIWSHLTKILDQHGVACVLNLVEGSMTVKTTRKTVDPYIILKARDLIKLLARSVPINQAVKILEDNVACDVIKIGNIIRNKERFVKRRQRILGPSGSTLKAIELLTDCYLLVQGTTVSAMGPYKGLKIVRRIVVDCMKNIHPIYHIKELMIKRELAKNPKLAGENWDRFLPNFSKRKRAKQAKATSEQQPAATGVEQTSRDTSQAAAFRAEQAKQKSAQEQKKKKKYTPFPPPQMPRKIDLELESGEYFKKKARGKDSISADAAKKAEGRELVSNLKKMNKRLELPPPSEEPRKNPVLAKKINERKRKFDHENSDSGPHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.3
4 0.35
5 0.39
6 0.39
7 0.45
8 0.46
9 0.46
10 0.49
11 0.59
12 0.63
13 0.65
14 0.68
15 0.73
16 0.82
17 0.87
18 0.93
19 0.94
20 0.95
21 0.95
22 0.9
23 0.86
24 0.81
25 0.75
26 0.7
27 0.68
28 0.58
29 0.48
30 0.41
31 0.37
32 0.32
33 0.27
34 0.25
35 0.19
36 0.25
37 0.3
38 0.33
39 0.35
40 0.39
41 0.44
42 0.44
43 0.43
44 0.39
45 0.38
46 0.42
47 0.41
48 0.39
49 0.38
50 0.4
51 0.38
52 0.35
53 0.33
54 0.27
55 0.25
56 0.25
57 0.26
58 0.2
59 0.24
60 0.3
61 0.32
62 0.37
63 0.39
64 0.42
65 0.39
66 0.39
67 0.38
68 0.34
69 0.32
70 0.28
71 0.25
72 0.21
73 0.23
74 0.25
75 0.25
76 0.22
77 0.22
78 0.21
79 0.2
80 0.18
81 0.15
82 0.11
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.05
87 0.03
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.1
94 0.11
95 0.14
96 0.17
97 0.19
98 0.23
99 0.27
100 0.33
101 0.34
102 0.36
103 0.4
104 0.42
105 0.39
106 0.34
107 0.34
108 0.29
109 0.26
110 0.25
111 0.2
112 0.21
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.2
117 0.2
118 0.2
119 0.23
120 0.23
121 0.22
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.15
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.1
141 0.13
142 0.16
143 0.21
144 0.23
145 0.26
146 0.34
147 0.42
148 0.45
149 0.53
150 0.61
151 0.62
152 0.7
153 0.72
154 0.7
155 0.68
156 0.66
157 0.62
158 0.53
159 0.48
160 0.42
161 0.37
162 0.3
163 0.24
164 0.18
165 0.15
166 0.12
167 0.11
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.08
190 0.1
191 0.12
192 0.17
193 0.22
194 0.25
195 0.27
196 0.27
197 0.29
198 0.34
199 0.33
200 0.28
201 0.27
202 0.24
203 0.26
204 0.25
205 0.21
206 0.17
207 0.2
208 0.25
209 0.27
210 0.26
211 0.23
212 0.29
213 0.3
214 0.32
215 0.29
216 0.26
217 0.22
218 0.29
219 0.33
220 0.34
221 0.37
222 0.36
223 0.35
224 0.38
225 0.38
226 0.31
227 0.33
228 0.35
229 0.34
230 0.32
231 0.32
232 0.29
233 0.27
234 0.31
235 0.28
236 0.28
237 0.34
238 0.35
239 0.44
240 0.49
241 0.59
242 0.66
243 0.72
244 0.73
245 0.75
246 0.83
247 0.82
248 0.83
249 0.78
250 0.74
251 0.69
252 0.61
253 0.5
254 0.41
255 0.33
256 0.27
257 0.22
258 0.16
259 0.1
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.18
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.21
274 0.24
275 0.25
276 0.27
277 0.28
278 0.3
279 0.32
280 0.35
281 0.39
282 0.46
283 0.54
284 0.59
285 0.65
286 0.73
287 0.8
288 0.85
289 0.84
290 0.85
291 0.86
292 0.85
293 0.86
294 0.86
295 0.84
296 0.86
297 0.88
298 0.87
299 0.86
300 0.78
301 0.71
302 0.65
303 0.58
304 0.5
305 0.44
306 0.38
307 0.29
308 0.3
309 0.26
310 0.22
311 0.21
312 0.19
313 0.17
314 0.18
315 0.25
316 0.27
317 0.36
318 0.44
319 0.52
320 0.58
321 0.66
322 0.69
323 0.67
324 0.64
325 0.6
326 0.52
327 0.47
328 0.41
329 0.33
330 0.29
331 0.23
332 0.25
333 0.23
334 0.25
335 0.25
336 0.29
337 0.36
338 0.39
339 0.41
340 0.4
341 0.47
342 0.48
343 0.5
344 0.56
345 0.55
346 0.55
347 0.6
348 0.67
349 0.68
350 0.67
351 0.66
352 0.63
353 0.61
354 0.65
355 0.61
356 0.57
357 0.56
358 0.57
359 0.55
360 0.56
361 0.58
362 0.6
363 0.63
364 0.64
365 0.67
366 0.72
367 0.78
368 0.82
369 0.79
370 0.79
371 0.81
372 0.84
373 0.83
374 0.83
375 0.84
376 0.81
377 0.82
378 0.76