FuNGI

A0A0L6V178

Protein Details

Accession

A0A0L6V178

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
213-232	FTGKQNKQNSSKKNNNQPKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.5, nucl 10, cyto 9, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MAEAAVGRNPNDGFRQAMLKTALEMTPQLTDENYSIWKDKMEALLQLRGVLTKLNSPIMPLTDDENDELKLLLIAKMDNVTHNNVVTTDNANSAKSLWLAIKERFASSQASNRARVFNDFLYLSFKEDAVESFITNVRVAMKKLIDVGIDLPKDVLAYLILFKFPPTLNTLKRQLMHTDKNLTAEFVCDHLTQFNNETRAESKESTSTEAALFTGKQNKQNSSKKNNNQPKSSQRCTEGFHNPKQDENHTSDTCWHLHPDRAPDWWKESQAKWKANKEKSQTGQANYYMSLLTLWINQGDAESRLILDSGASAHIFNDKRFFSELELKNLDVIKTGKAGATLPIAGQGTVRLKWGKATITLSNCLYVPDIVINLVSAGALDAKGCTLSSNAGRFKVDYQNLKVFEGKINGNLYTIDNPSEVGSESMINLTTDGQLLQQIHESFGHASVARLSKFIPDSITQKKRDCFECTACAVAKITKSPFKGISTLASKPFERIHLDLIGPISPQSKLQHRFILTVVDNFSGYLAGFPLTSKDQTTDVLINLLENENKRLGYFPTYVASDGGGEFVGRSDFNRRCGENKACSVSQV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.29
3	0.25
4	0.3
5	0.3
6	0.26
7	0.26
8	0.26
9	0.24
10	0.2
11	0.21
12	0.17
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.14
17	0.15
18	0.14
19	0.16
20	0.18
21	0.18
22	0.2
23	0.2
24	0.2
25	0.2
26	0.23
27	0.26
28	0.25
29	0.29
30	0.3
31	0.34
32	0.33
33	0.33
34	0.29
35	0.24
36	0.22
37	0.19
38	0.16
39	0.17
40	0.19
41	0.22
42	0.21
43	0.22
44	0.24
45	0.23
46	0.24
47	0.2
48	0.21
49	0.2
50	0.21
51	0.21
52	0.21
53	0.19
54	0.18
55	0.17
56	0.13
57	0.12
58	0.11
59	0.11
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.13
64	0.13
65	0.16
66	0.17
67	0.2
68	0.21
69	0.21
70	0.2
71	0.19
72	0.19
73	0.18
74	0.18
75	0.15
76	0.18
77	0.19
78	0.19
79	0.18
80	0.18
81	0.17
82	0.15
83	0.16
84	0.12
85	0.17
86	0.21
87	0.23
88	0.28
89	0.28
90	0.29
91	0.28
92	0.28
93	0.27
94	0.26
95	0.32
96	0.35
97	0.37
98	0.41
99	0.41
100	0.44
101	0.41
102	0.42
103	0.38
104	0.3
105	0.29
106	0.25
107	0.23
108	0.25
109	0.24
110	0.23
111	0.19
112	0.18
113	0.15
114	0.15
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.11
119	0.12
120	0.15
121	0.15
122	0.15
123	0.15
124	0.14
125	0.16
126	0.17
127	0.2
128	0.18
129	0.18
130	0.2
131	0.21
132	0.17
133	0.15
134	0.17
135	0.19
136	0.18
137	0.17
138	0.15
139	0.14
140	0.14
141	0.13
142	0.1
143	0.04
144	0.05
145	0.07
146	0.07
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.11
151	0.11
152	0.12
153	0.15
154	0.21
155	0.25
156	0.31
157	0.37
158	0.39
159	0.41
160	0.41
161	0.44
162	0.45
163	0.48
164	0.46
165	0.46
166	0.43
167	0.44
168	0.42
169	0.36
170	0.27
171	0.22
172	0.17
173	0.12
174	0.14
175	0.11
176	0.11
177	0.13
178	0.13
179	0.14
180	0.16
181	0.19
182	0.19
183	0.19
184	0.2
185	0.19
186	0.22
187	0.25
188	0.23
189	0.21
190	0.22
191	0.23
192	0.25
193	0.23
194	0.21
195	0.17
196	0.16
197	0.15
198	0.12
199	0.11
200	0.1
201	0.19
202	0.2
203	0.26
204	0.3
205	0.35
206	0.44
207	0.52
208	0.59
209	0.6
210	0.68
211	0.7
212	0.77
213	0.82
214	0.78
215	0.76
216	0.74
217	0.75
218	0.74
219	0.7
220	0.63
221	0.57
222	0.53
223	0.51
224	0.5
225	0.49
226	0.47
227	0.48
228	0.52
229	0.48
230	0.49
231	0.48
232	0.46
233	0.39
234	0.38
235	0.39
236	0.31
237	0.31
238	0.3
239	0.29
240	0.27
241	0.23
242	0.21
243	0.16
244	0.19
245	0.21
246	0.25
247	0.23
248	0.26
249	0.29
250	0.28
251	0.31
252	0.3
253	0.31
254	0.29
255	0.3
256	0.36
257	0.41
258	0.47
259	0.48
260	0.54
261	0.6
262	0.63
263	0.68
264	0.64
265	0.64
266	0.59
267	0.63
268	0.58
269	0.5
270	0.46
271	0.41
272	0.35
273	0.27
274	0.25
275	0.16
276	0.12
277	0.09
278	0.07
279	0.06
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.1
302	0.11
303	0.12
304	0.15
305	0.15
306	0.16
307	0.18
308	0.18
309	0.16
310	0.26
311	0.27
312	0.29
313	0.3
314	0.28
315	0.29
316	0.29
317	0.25
318	0.17
319	0.16
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.07
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.08
334	0.09
335	0.1
336	0.11
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.14
341	0.16
342	0.15
343	0.16
344	0.19
345	0.22
346	0.23
347	0.26
348	0.24
349	0.23
350	0.22
351	0.19
352	0.16
353	0.11
354	0.09
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.07
375	0.11
376	0.17
377	0.19
378	0.21
379	0.21
380	0.22
381	0.25
382	0.31
383	0.33
384	0.32
385	0.35
386	0.4
387	0.41
388	0.41
389	0.39
390	0.32
391	0.3
392	0.28
393	0.24
394	0.21
395	0.22
396	0.21
397	0.19
398	0.19
399	0.17
400	0.17
401	0.17
402	0.14
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.11
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.09
422	0.09
423	0.1
424	0.13
425	0.13
426	0.14
427	0.14
428	0.16
429	0.13
430	0.14
431	0.15
432	0.11
433	0.11
434	0.14
435	0.18
436	0.16
437	0.16
438	0.16
439	0.19
440	0.2
441	0.2
442	0.19
443	0.18
444	0.25
445	0.35
446	0.42
447	0.43
448	0.48
449	0.52
450	0.54
451	0.56
452	0.56
453	0.53
454	0.51
455	0.51
456	0.46
457	0.46
458	0.4
459	0.37
460	0.32
461	0.27
462	0.23
463	0.23
464	0.26
465	0.28
466	0.3
467	0.33
468	0.36
469	0.35
470	0.36
471	0.33
472	0.35
473	0.34
474	0.36
475	0.37
476	0.36
477	0.34
478	0.34
479	0.35
480	0.32
481	0.32
482	0.3
483	0.29
484	0.28
485	0.28
486	0.27
487	0.26
488	0.22
489	0.17
490	0.17
491	0.14
492	0.12
493	0.15
494	0.18
495	0.27
496	0.31
497	0.36
498	0.42
499	0.43
500	0.45
501	0.42
502	0.45
503	0.37
504	0.35
505	0.33
506	0.26
507	0.24
508	0.22
509	0.21
510	0.13
511	0.11
512	0.08
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.1
518	0.13
519	0.14
520	0.15
521	0.16
522	0.18
523	0.19
524	0.23
525	0.22
526	0.19
527	0.19
528	0.18
529	0.16
530	0.17
531	0.18
532	0.18
533	0.17
534	0.2
535	0.2
536	0.21
537	0.21
538	0.21
539	0.22
540	0.24
541	0.24
542	0.23
543	0.25
544	0.26
545	0.26
546	0.25
547	0.22
548	0.17
549	0.15
550	0.13
551	0.09
552	0.08
553	0.07
554	0.08
555	0.09
556	0.08
557	0.1
558	0.19
559	0.23
560	0.29
561	0.36
562	0.38
563	0.4
564	0.49
565	0.56
566	0.55
567	0.59
568	0.6

A0A0L6V178

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer