Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VJU8

Protein Details
Accession A0A0L6VJU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-226IQTTTPKPKLNQKSKRSKKAANTQTTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-217KSKRSK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, cyto 3, plas 2, mito 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
cd03488  Topoisomer_IB_N_htopoI_like  
Amino Acid Sequences MARVITDTNGRPPTKRVISESSSEDDTPIVRTNFDPIPSLQAKRSKSASKPTQLLRPPPNSEPSQDALTSSALSDADDDDESDHVKVEDEDEALMNSSDDDDQPIANSSYKPTQGPKRSIDESSASTTLTTNTDPPSGQKGKMPKLKKVSQSSAASPSSDDDQPLVSRQPSSAKPFDASSKRPKSAPQAEEAESDSKPLIQTTTPKPKLNQKSKRSKKAANTQTTACISPAQHNGVLFPPDYEPLPGHVKMKYNGKSVDLPPEAEEVAYFFGSMLNSDHVQKPTFCRNFFDDWREVLKQHPPRDGTKITDFSKCDFTPMFDYFETERERKKSMSKVEKERIRDERLEVEKKYATCLLDGRVEKVGNFRVEPPSLFRGRGDHPKTGKLKKRIYAEDIHINCSAESKFPEPPPGHHWAEIVHVPTASWLAYWKENINGHTKYVFLAAGSSLTGQSDMRKFEKARKLKDHIDRIRADYRAKLKDREMAVRQRATAMYLIDRFALRAGNEKSSEEEADTVGCCSLRLEHVLLEPPCTVTFDFLGKDSIRFFNKFEVDEAVFRNLMIFKKQKGPSDMIFDRLSTTSLNKHLSNYMEGLTAKVFRTYNASITFEQELEKNMRDLTSKSPMTDKMLAYTKANRQVAVLCNHQKAYKRRELRMKLLTDISKLDPQTRASCLIEESDLDEEWMERHEQLTLQKKKEALAAELAALPPSKEELEFAKKEDSKKTKASEMVQLVIRWRTMSPTECEEYKSEELAKEDALAEIMKAKRQPPSHKNPVGSFSDNDLKKFKGADCQIAAAKALLKDRDEGKETSLGTSKTNYIVCPLQIPGCLMLGVKSITLVPIKSFPKQLSPSISMFSFFFLLFCVGLLGLHKQQLTGSFEIQHPSHPTLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.53
3 0.52
4 0.52
5 0.54
6 0.56
7 0.57
8 0.51
9 0.46
10 0.41
11 0.35
12 0.28
13 0.25
14 0.23
15 0.24
16 0.21
17 0.19
18 0.19
19 0.24
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.22
24 0.3
25 0.33
26 0.36
27 0.37
28 0.41
29 0.43
30 0.46
31 0.52
32 0.52
33 0.54
34 0.62
35 0.65
36 0.67
37 0.71
38 0.7
39 0.73
40 0.72
41 0.75
42 0.73
43 0.71
44 0.69
45 0.66
46 0.68
47 0.61
48 0.57
49 0.52
50 0.47
51 0.42
52 0.36
53 0.32
54 0.26
55 0.24
56 0.21
57 0.16
58 0.14
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.16
95 0.18
96 0.23
97 0.26
98 0.28
99 0.33
100 0.42
101 0.49
102 0.56
103 0.57
104 0.59
105 0.6
106 0.59
107 0.55
108 0.49
109 0.43
110 0.41
111 0.36
112 0.29
113 0.25
114 0.24
115 0.21
116 0.19
117 0.17
118 0.14
119 0.16
120 0.18
121 0.18
122 0.2
123 0.28
124 0.29
125 0.29
126 0.32
127 0.38
128 0.46
129 0.55
130 0.57
131 0.56
132 0.62
133 0.69
134 0.73
135 0.73
136 0.71
137 0.71
138 0.7
139 0.65
140 0.62
141 0.56
142 0.47
143 0.38
144 0.33
145 0.28
146 0.24
147 0.21
148 0.14
149 0.15
150 0.16
151 0.18
152 0.19
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.23
157 0.26
158 0.33
159 0.34
160 0.33
161 0.33
162 0.35
163 0.42
164 0.43
165 0.44
166 0.48
167 0.53
168 0.53
169 0.53
170 0.56
171 0.57
172 0.61
173 0.57
174 0.52
175 0.49
176 0.48
177 0.48
178 0.46
179 0.39
180 0.28
181 0.27
182 0.2
183 0.16
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.18
189 0.27
190 0.38
191 0.43
192 0.46
193 0.49
194 0.58
195 0.67
196 0.71
197 0.72
198 0.71
199 0.77
200 0.85
201 0.91
202 0.89
203 0.87
204 0.86
205 0.86
206 0.86
207 0.83
208 0.76
209 0.67
210 0.65
211 0.59
212 0.49
213 0.39
214 0.32
215 0.24
216 0.25
217 0.28
218 0.25
219 0.24
220 0.23
221 0.24
222 0.23
223 0.23
224 0.18
225 0.15
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.13
232 0.18
233 0.18
234 0.19
235 0.21
236 0.25
237 0.28
238 0.37
239 0.38
240 0.39
241 0.39
242 0.4
243 0.43
244 0.4
245 0.45
246 0.37
247 0.33
248 0.29
249 0.29
250 0.25
251 0.2
252 0.18
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.07
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.12
265 0.16
266 0.16
267 0.18
268 0.19
269 0.23
270 0.31
271 0.36
272 0.35
273 0.35
274 0.38
275 0.43
276 0.46
277 0.47
278 0.39
279 0.36
280 0.39
281 0.37
282 0.33
283 0.29
284 0.34
285 0.35
286 0.37
287 0.41
288 0.39
289 0.41
290 0.47
291 0.47
292 0.43
293 0.42
294 0.43
295 0.4
296 0.42
297 0.4
298 0.36
299 0.39
300 0.34
301 0.31
302 0.25
303 0.25
304 0.24
305 0.25
306 0.26
307 0.19
308 0.22
309 0.2
310 0.24
311 0.26
312 0.24
313 0.27
314 0.26
315 0.29
316 0.29
317 0.34
318 0.37
319 0.42
320 0.51
321 0.55
322 0.62
323 0.69
324 0.72
325 0.71
326 0.7
327 0.67
328 0.61
329 0.55
330 0.47
331 0.47
332 0.48
333 0.48
334 0.42
335 0.39
336 0.36
337 0.34
338 0.34
339 0.29
340 0.22
341 0.18
342 0.19
343 0.17
344 0.21
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.2
349 0.19
350 0.21
351 0.23
352 0.18
353 0.18
354 0.19
355 0.2
356 0.2
357 0.21
358 0.21
359 0.22
360 0.23
361 0.22
362 0.21
363 0.21
364 0.24
365 0.34
366 0.34
367 0.35
368 0.36
369 0.43
370 0.5
371 0.55
372 0.59
373 0.59
374 0.61
375 0.6
376 0.65
377 0.61
378 0.59
379 0.54
380 0.5
381 0.5
382 0.44
383 0.41
384 0.35
385 0.31
386 0.26
387 0.24
388 0.2
389 0.12
390 0.13
391 0.12
392 0.15
393 0.15
394 0.23
395 0.22
396 0.24
397 0.28
398 0.33
399 0.32
400 0.29
401 0.28
402 0.22
403 0.24
404 0.22
405 0.18
406 0.12
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.07
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.13
419 0.15
420 0.17
421 0.22
422 0.21
423 0.21
424 0.2
425 0.2
426 0.16
427 0.15
428 0.13
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.07
440 0.09
441 0.12
442 0.13
443 0.17
444 0.18
445 0.26
446 0.36
447 0.4
448 0.46
449 0.52
450 0.56
451 0.61
452 0.68
453 0.7
454 0.66
455 0.66
456 0.6
457 0.57
458 0.56
459 0.49
460 0.42
461 0.36
462 0.38
463 0.38
464 0.39
465 0.37
466 0.35
467 0.39
468 0.4
469 0.41
470 0.4
471 0.41
472 0.43
473 0.41
474 0.4
475 0.35
476 0.33
477 0.27
478 0.23
479 0.16
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.1
488 0.07
489 0.14
490 0.15
491 0.18
492 0.19
493 0.19
494 0.21
495 0.21
496 0.21
497 0.14
498 0.13
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.08
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.16
514 0.16
515 0.17
516 0.16
517 0.15
518 0.14
519 0.15
520 0.14
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.13
527 0.11
528 0.12
529 0.13
530 0.16
531 0.18
532 0.19
533 0.19
534 0.23
535 0.25
536 0.24
537 0.23
538 0.23
539 0.21
540 0.22
541 0.22
542 0.18
543 0.16
544 0.15
545 0.15
546 0.13
547 0.13
548 0.17
549 0.18
550 0.19
551 0.29
552 0.33
553 0.36
554 0.38
555 0.42
556 0.38
557 0.44
558 0.42
559 0.37
560 0.33
561 0.29
562 0.27
563 0.23
564 0.21
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.18
569 0.21
570 0.2
571 0.21
572 0.23
573 0.24
574 0.24
575 0.22
576 0.18
577 0.17
578 0.16
579 0.15
580 0.13
581 0.14
582 0.12
583 0.14
584 0.13
585 0.12
586 0.18
587 0.18
588 0.22
589 0.23
590 0.26
591 0.23
592 0.26
593 0.27
594 0.21
595 0.21
596 0.17
597 0.17
598 0.16
599 0.17
600 0.14
601 0.14
602 0.14
603 0.15
604 0.17
605 0.19
606 0.25
607 0.24
608 0.25
609 0.28
610 0.29
611 0.33
612 0.36
613 0.3
614 0.27
615 0.31
616 0.32
617 0.31
618 0.35
619 0.36
620 0.39
621 0.4
622 0.35
623 0.31
624 0.34
625 0.37
626 0.35
627 0.37
628 0.34
629 0.36
630 0.37
631 0.39
632 0.42
633 0.45
634 0.5
635 0.52
636 0.54
637 0.59
638 0.69
639 0.72
640 0.74
641 0.74
642 0.68
643 0.61
644 0.6
645 0.53
646 0.44
647 0.4
648 0.35
649 0.31
650 0.29
651 0.28
652 0.25
653 0.27
654 0.29
655 0.28
656 0.29
657 0.25
658 0.25
659 0.23
660 0.21
661 0.19
662 0.16
663 0.15
664 0.13
665 0.11
666 0.11
667 0.1
668 0.09
669 0.08
670 0.09
671 0.09
672 0.07
673 0.08
674 0.09
675 0.11
676 0.18
677 0.29
678 0.36
679 0.37
680 0.4
681 0.41
682 0.41
683 0.44
684 0.39
685 0.31
686 0.27
687 0.24
688 0.22
689 0.22
690 0.21
691 0.17
692 0.15
693 0.12
694 0.08
695 0.09
696 0.09
697 0.08
698 0.09
699 0.15
700 0.23
701 0.24
702 0.26
703 0.33
704 0.36
705 0.4
706 0.48
707 0.5
708 0.48
709 0.54
710 0.56
711 0.54
712 0.56
713 0.56
714 0.55
715 0.51
716 0.48
717 0.44
718 0.41
719 0.37
720 0.33
721 0.3
722 0.23
723 0.2
724 0.19
725 0.21
726 0.24
727 0.25
728 0.29
729 0.32
730 0.32
731 0.34
732 0.32
733 0.34
734 0.32
735 0.3
736 0.27
737 0.25
738 0.26
739 0.25
740 0.23
741 0.18
742 0.16
743 0.14
744 0.12
745 0.11
746 0.09
747 0.14
748 0.15
749 0.17
750 0.2
751 0.23
752 0.3
753 0.38
754 0.48
755 0.52
756 0.62
757 0.69
758 0.73
759 0.75
760 0.71
761 0.69
762 0.65
763 0.59
764 0.5
765 0.45
766 0.47
767 0.42
768 0.41
769 0.39
770 0.33
771 0.32
772 0.33
773 0.29
774 0.3
775 0.33
776 0.38
777 0.37
778 0.39
779 0.39
780 0.36
781 0.35
782 0.26
783 0.25
784 0.2
785 0.23
786 0.22
787 0.21
788 0.25
789 0.29
790 0.33
791 0.34
792 0.33
793 0.32
794 0.34
795 0.34
796 0.33
797 0.34
798 0.29
799 0.27
800 0.28
801 0.27
802 0.27
803 0.27
804 0.24
805 0.23
806 0.25
807 0.24
808 0.24
809 0.24
810 0.22
811 0.22
812 0.23
813 0.19
814 0.17
815 0.17
816 0.14
817 0.13
818 0.13
819 0.12
820 0.11
821 0.1
822 0.1
823 0.12
824 0.14
825 0.14
826 0.14
827 0.21
828 0.25
829 0.28
830 0.34
831 0.33
832 0.4
833 0.44
834 0.47
835 0.48
836 0.49
837 0.47
838 0.45
839 0.43
840 0.36
841 0.31
842 0.27
843 0.21
844 0.16
845 0.14
846 0.12
847 0.12
848 0.11
849 0.1
850 0.09
851 0.07
852 0.08
853 0.1
854 0.13
855 0.15
856 0.18
857 0.18
858 0.18
859 0.2
860 0.25
861 0.29
862 0.27
863 0.27
864 0.27
865 0.29
866 0.33
867 0.32
868 0.32
869 0.32