FuNGI

A0A0L6V0U4

Protein Details

Accession

A0A0L6V0U4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
224-244	TDESKKCKKGWHNPRATGHTL	Hydrophilic
442-461	KITKASFKTKHQRAKRPFEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 3, cyto 2, pero 1, E.R. 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSEPDNTLATAAQTASEMDKINTTILKTAIEAIPLLTNDNYTLWKNRVENVLDLQDLRTALTSSTGVLSSTEDIQLRTIITSKLESSIHANVITHDNEKSAKKIWKSISEYFASSQASNRARVFNAVLHVQFNPNDVQDFITQVKTSISRLHEVGIDLPKDIIAYLILHKLPASMTNISQQITHSDKPITAELVLDHLRLYANDQQSLANSGTFSKTASVSLLTDESKKCKKGWHNPRATGHTLPNCWFLYPHLRPDSEKGRKGEASVSSFHSSLTKLSANFILDSGSSSHMISDEDLFISIDHSEQGLVRTSSGEESLEIKGIGTIKLSHENGNLFLHNVLFVPNLVVNLLSVRCLVLDDFNVQFLKNSFSISRNNNLIISGRYEGNLPCLTFSNLKEKSFLSAAEALHKSMGHVSYHRLRQKLGIHLKNFGKCEACALGKITKASFKTKHQRAKRPFEELHLDLIGPISPSSREGDRFILTVVDSNTRYCSAIPISQKSDVYNTLATTLDFEAKRFGYYPTILTDSKLSRRHWSDLVKVSTLTLNQIPSHRSAKSPYEQFRGRTIPLDFFHPIGNPVSFLNEPKKPGSKLYPKGSKGRLIGYNEELLSYRILSDDGRLIDTKSVQFLDFDLEEKSYLLDDEEEFEIIQERTQPQSQIENEKESVELDERENIEIKEETEEEEEVNTMPAEDTGYISDDSEEEISELLVPTASTRVLRERTSKDGDSFVFFHVDDLIVAGKVDVFEDLFLLRFPNSSAHDPDTLLGMELNQDANSVTLSQPKLIKKGLELLGMEDCKPVLTPLSPGIKLLAPTEEEKKEFNRLNINYRSHTGLLNFLSCRTRPDLAPAVSMLSSFNSNPGIKHWQQILHCWKYLKGTIDMKLTLRPDLSDNNNNIKYFTDATWADDLESRLSRSGTICFWKSCPIAWNSKKQKNIALSSTEAELNALSDGVQESQWITYLIEELWKEKLKPSEFNVDNQGLIEKIKNFGSNSKTKHLDIKMKWLRELKNSNQINVKLIPSEEMVADALTKASNADSLKRLQHRCFLVLVSPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.13
4	0.14
5	0.13
6	0.16
7	0.16
8	0.18
9	0.2
10	0.19
11	0.19
12	0.19
13	0.19
14	0.18
15	0.21
16	0.2
17	0.18
18	0.17
19	0.15
20	0.17
21	0.16
22	0.18
23	0.14
24	0.14
25	0.14
26	0.15
27	0.17
28	0.17
29	0.23
30	0.23
31	0.3
32	0.31
33	0.35
34	0.41
35	0.41
36	0.41
37	0.41
38	0.42
39	0.37
40	0.36
41	0.31
42	0.27
43	0.24
44	0.21
45	0.16
46	0.13
47	0.12
48	0.13
49	0.12
50	0.11
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.13
56	0.12
57	0.14
58	0.16
59	0.15
60	0.16
61	0.16
62	0.17
63	0.15
64	0.15
65	0.16
66	0.14
67	0.15
68	0.17
69	0.17
70	0.19
71	0.19
72	0.2
73	0.22
74	0.25
75	0.25
76	0.24
77	0.23
78	0.21
79	0.26
80	0.27
81	0.24
82	0.2
83	0.2
84	0.24
85	0.26
86	0.27
87	0.3
88	0.35
89	0.37
90	0.45
91	0.5
92	0.55
93	0.6
94	0.63
95	0.62
96	0.57
97	0.56
98	0.49
99	0.46
100	0.38
101	0.31
102	0.28
103	0.3
104	0.3
105	0.32
106	0.33
107	0.33
108	0.31
109	0.34
110	0.33
111	0.28
112	0.29
113	0.28
114	0.27
115	0.25
116	0.25
117	0.25
118	0.24
119	0.22
120	0.21
121	0.17
122	0.17
123	0.16
124	0.17
125	0.15
126	0.18
127	0.17
128	0.18
129	0.17
130	0.17
131	0.19
132	0.18
133	0.19
134	0.22
135	0.23
136	0.24
137	0.25
138	0.26
139	0.25
140	0.24
141	0.28
142	0.27
143	0.24
144	0.21
145	0.21
146	0.19
147	0.17
148	0.16
149	0.11
150	0.06
151	0.07
152	0.09
153	0.13
154	0.13
155	0.14
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.15
160	0.17
161	0.15
162	0.16
163	0.21
164	0.24
165	0.23
166	0.24
167	0.21
168	0.23
169	0.26
170	0.26
171	0.24
172	0.23
173	0.24
174	0.26
175	0.27
176	0.23
177	0.17
178	0.17
179	0.14
180	0.18
181	0.18
182	0.15
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.11
187	0.15
188	0.18
189	0.19
190	0.21
191	0.21
192	0.21
193	0.22
194	0.25
195	0.21
196	0.15
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.13
202	0.11
203	0.11
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.12
209	0.14
210	0.14
211	0.18
212	0.19
213	0.25
214	0.3
215	0.33
216	0.32
217	0.39
218	0.48
219	0.54
220	0.64
221	0.68
222	0.72
223	0.78
224	0.83
225	0.81
226	0.76
227	0.69
228	0.65
229	0.6
230	0.52
231	0.46
232	0.44
233	0.38
234	0.33
235	0.29
236	0.25
237	0.3
238	0.3
239	0.36
240	0.35
241	0.36
242	0.38
243	0.44
244	0.51
245	0.5
246	0.53
247	0.48
248	0.49
249	0.48
250	0.48
251	0.47
252	0.42
253	0.36
254	0.32
255	0.34
256	0.31
257	0.3
258	0.29
259	0.24
260	0.19
261	0.17
262	0.18
263	0.16
264	0.14
265	0.16
266	0.18
267	0.18
268	0.18
269	0.17
270	0.14
271	0.11
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.11
301	0.12
302	0.11
303	0.08
304	0.1
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.08
313	0.09
314	0.11
315	0.17
316	0.18
317	0.19
318	0.2
319	0.21
320	0.22
321	0.22
322	0.2
323	0.15
324	0.14
325	0.12
326	0.1
327	0.09
328	0.08
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.09
348	0.09
349	0.11
350	0.11
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.13
355	0.11
356	0.13
357	0.13
358	0.15
359	0.22
360	0.24
361	0.28
362	0.27
363	0.28
364	0.26
365	0.25
366	0.24
367	0.18
368	0.18
369	0.15
370	0.13
371	0.12
372	0.13
373	0.13
374	0.15
375	0.16
376	0.13
377	0.12
378	0.13
379	0.15
380	0.17
381	0.18
382	0.24
383	0.26
384	0.26
385	0.27
386	0.26
387	0.27
388	0.24
389	0.23
390	0.16
391	0.17
392	0.17
393	0.21
394	0.21
395	0.19
396	0.19
397	0.18
398	0.15
399	0.14
400	0.15
401	0.1
402	0.11
403	0.15
404	0.21
405	0.29
406	0.33
407	0.31
408	0.3
409	0.35
410	0.39
411	0.44
412	0.47
413	0.47
414	0.44
415	0.5
416	0.54
417	0.52
418	0.48
419	0.4
420	0.31
421	0.25
422	0.26
423	0.21
424	0.17
425	0.14
426	0.16
427	0.16
428	0.16
429	0.17
430	0.15
431	0.17
432	0.19
433	0.24
434	0.26
435	0.32
436	0.42
437	0.5
438	0.59
439	0.64
440	0.72
441	0.75
442	0.82
443	0.77
444	0.75
445	0.67
446	0.62
447	0.59
448	0.5
449	0.43
450	0.32
451	0.27
452	0.19
453	0.18
454	0.14
455	0.08
456	0.07
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.08
461	0.09
462	0.1
463	0.12
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.14
468	0.13
469	0.11
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.12
476	0.12
477	0.13
478	0.11
479	0.11
480	0.1
481	0.15
482	0.17
483	0.2
484	0.22
485	0.23
486	0.24
487	0.23
488	0.23
489	0.19
490	0.18
491	0.15
492	0.13
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.1
498	0.12
499	0.11
500	0.11
501	0.12
502	0.12
503	0.13
504	0.12
505	0.12
506	0.11
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.16
511	0.15
512	0.15
513	0.17
514	0.17
515	0.22
516	0.27
517	0.27
518	0.29
519	0.33
520	0.35
521	0.37
522	0.39
523	0.38
524	0.4
525	0.41
526	0.35
527	0.32
528	0.29
529	0.25
530	0.21
531	0.17
532	0.11
533	0.1
534	0.11
535	0.12
536	0.13
537	0.15
538	0.18
539	0.17
540	0.17
541	0.19
542	0.23
543	0.28
544	0.33
545	0.34
546	0.38
547	0.4
548	0.41
549	0.42
550	0.4
551	0.35
552	0.31
553	0.28
554	0.26
555	0.24
556	0.26
557	0.22
558	0.19
559	0.19
560	0.16
561	0.16
562	0.13
563	0.13
564	0.09
565	0.08
566	0.1
567	0.1
568	0.12
569	0.15
570	0.17
571	0.19
572	0.21
573	0.25
574	0.24
575	0.27
576	0.33
577	0.39
578	0.44
579	0.51
580	0.57
581	0.56
582	0.62
583	0.62
584	0.58
585	0.5
586	0.47
587	0.44
588	0.38
589	0.37
590	0.32
591	0.31
592	0.25
593	0.24
594	0.2
595	0.15
596	0.12
597	0.09
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.1
607	0.11
608	0.11
609	0.13
610	0.12
611	0.11
612	0.11
613	0.1
614	0.1
615	0.1
616	0.11
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.06
625	0.06
626	0.05
627	0.06
628	0.05
629	0.07
630	0.08
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.09
635	0.08
636	0.09
637	0.09
638	0.1
639	0.13
640	0.14
641	0.15
642	0.15
643	0.21
644	0.23
645	0.29
646	0.3
647	0.3
648	0.3
649	0.29
650	0.28
651	0.22
652	0.21
653	0.14
654	0.14
655	0.11
656	0.14
657	0.14
658	0.15
659	0.16
660	0.15
661	0.15
662	0.14
663	0.14
664	0.13
665	0.12
666	0.13
667	0.12
668	0.13
669	0.11
670	0.1
671	0.1
672	0.08
673	0.08
674	0.07
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.06
681	0.06
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.07
687	0.08
688	0.08
689	0.07
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.04
696	0.04
697	0.04
698	0.04
699	0.05
700	0.06
701	0.06
702	0.08
703	0.14
704	0.17
705	0.2
706	0.27
707	0.3
708	0.36
709	0.42
710	0.42
711	0.38
712	0.38
713	0.36
714	0.32
715	0.3
716	0.24
717	0.2
718	0.18
719	0.16
720	0.13
721	0.12
722	0.09
723	0.08
724	0.07
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.04
730	0.05
731	0.04
732	0.04
733	0.04
734	0.05
735	0.05
736	0.05
737	0.05
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.07
742	0.1
743	0.14
744	0.18
745	0.21
746	0.23
747	0.24
748	0.24
749	0.24
750	0.22
751	0.18
752	0.14
753	0.11
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.08
758	0.06
759	0.06
760	0.06
761	0.06
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.12
766	0.13
767	0.15
768	0.21
769	0.23
770	0.27
771	0.29
772	0.29
773	0.25
774	0.32
775	0.32
776	0.3
777	0.28
778	0.26
779	0.28
780	0.28
781	0.27
782	0.19
783	0.16
784	0.13
785	0.13
786	0.11
787	0.08
788	0.08
789	0.1
790	0.15
791	0.21
792	0.21
793	0.21
794	0.22
795	0.22
796	0.22
797	0.21
798	0.17
799	0.14
800	0.17
801	0.22
802	0.23
803	0.23
804	0.25
805	0.26
806	0.32
807	0.33
808	0.34
809	0.38
810	0.39
811	0.47
812	0.52
813	0.54
814	0.49
815	0.48
816	0.48
817	0.4
818	0.38
819	0.3
820	0.27
821	0.24
822	0.24
823	0.23
824	0.21
825	0.24
826	0.22
827	0.25
828	0.25
829	0.26
830	0.23
831	0.29
832	0.35
833	0.33
834	0.34
835	0.31
836	0.28
837	0.25
838	0.25
839	0.18
840	0.11
841	0.12
842	0.1
843	0.12
844	0.14
845	0.15
846	0.15
847	0.19
848	0.27
849	0.26
850	0.31
851	0.34
852	0.35
853	0.36
854	0.45
855	0.5
856	0.47
857	0.49
858	0.45
859	0.43
860	0.42
861	0.45
862	0.4
863	0.37
864	0.37
865	0.38
866	0.41
867	0.42
868	0.38
869	0.38
870	0.36
871	0.31
872	0.26
873	0.23
874	0.22
875	0.26
876	0.32
877	0.35
878	0.38
879	0.45
880	0.48
881	0.47
882	0.45
883	0.39
884	0.35
885	0.3
886	0.26
887	0.24
888	0.2
889	0.24
890	0.25
891	0.24
892	0.22
893	0.22
894	0.22
895	0.2
896	0.21
897	0.19
898	0.19
899	0.19
900	0.19
901	0.18
902	0.2
903	0.21
904	0.26
905	0.28
906	0.29
907	0.3
908	0.35
909	0.34
910	0.34
911	0.36
912	0.34
913	0.42
914	0.46
915	0.55
916	0.59
917	0.66
918	0.7
919	0.67
920	0.69
921	0.66
922	0.67
923	0.61
924	0.55
925	0.5
926	0.45
927	0.44
928	0.37
929	0.28
930	0.22
931	0.17
932	0.13
933	0.1
934	0.08
935	0.06
936	0.06
937	0.07
938	0.08
939	0.08
940	0.07
941	0.08
942	0.08
943	0.09
944	0.1
945	0.09
946	0.08
947	0.1
948	0.09
949	0.13
950	0.13
951	0.14
952	0.2
953	0.23
954	0.24
955	0.28
956	0.37
957	0.37
958	0.42
959	0.46
960	0.5
961	0.49
962	0.52
963	0.54
964	0.46
965	0.42
966	0.36
967	0.33
968	0.22
969	0.22
970	0.22
971	0.16
972	0.17
973	0.19
974	0.22
975	0.23
976	0.3
977	0.36
978	0.4
979	0.45
980	0.5
981	0.52
982	0.51
983	0.58
984	0.59
985	0.62
986	0.57
987	0.62
988	0.63
989	0.62
990	0.67
991	0.66
992	0.63
993	0.63
994	0.68
995	0.65
996	0.66
997	0.65
998	0.64
999	0.64
1000	0.6
1001	0.55
1002	0.49
1003	0.43
1004	0.35
1005	0.33
1006	0.3
1007	0.23
1008	0.23
1009	0.18
1010	0.16
1011	0.14
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.1
1015	0.09
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.07
1019	0.07
1020	0.12
1021	0.13
1022	0.18
1023	0.21
1024	0.27
1025	0.35
1026	0.44
1027	0.51
1028	0.51
1029	0.57
1030	0.57
1031	0.56
1032	0.53
1033	0.46

A0A0L6V0U4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer