Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6VDS3

Protein Details
Accession A0A0L6VDS3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-410DEDVKERRGKYSKRRPSEKQPLLKTVKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-409ERRGKYSKRRPSEKQPLLKTVK
Subcellular Location(s) plas 24, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
Amino Acid Sequences MAPKTIADTHLTASFIIIASAAILHLAYPHLSLEPQLSSSTDQLLFPFIQMNKVLPKLIHLSYLDPLTAKYYKGLDDLYFIGFWVVIWLSLREILMKLFFYPLGFSMGLGKNKLQRFSEQGWTLVYCSIFWCMGIVSWCLTIPISVASSLIDLADGFHLPGNTQRVPRPDSLLEHTTILARLSSNLFEWPEQILLSLSDRILVPTNFCHSSREAPQRLPPNVYTSVAYTDHIVTVILVGGSYATNFTGIGTAVHTTMDLSDIILAFAKMLNYMQVGLIGDVTFLVFVVSWIYTRHYILIRIVFSIYKYIPQDIQFIWDPSRGHIASRSLFYSFLGLLTALEIILIIWLYMIIKVLWKVVRGQPPEDTRISILIYHLILNRDTDEDVKERRGKYSKRRPSEKQPLLKTVKLPERSHRTSTRTQRRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.14
3 0.12
4 0.09
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.05
9 0.04
10 0.04
11 0.04
12 0.05
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.2
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.19
32 0.18
33 0.16
34 0.21
35 0.17
36 0.19
37 0.2
38 0.22
39 0.24
40 0.25
41 0.27
42 0.21
43 0.24
44 0.26
45 0.26
46 0.28
47 0.24
48 0.25
49 0.25
50 0.26
51 0.23
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.2
61 0.22
62 0.17
63 0.18
64 0.19
65 0.18
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.17
94 0.21
95 0.23
96 0.24
97 0.25
98 0.28
99 0.31
100 0.35
101 0.31
102 0.29
103 0.34
104 0.37
105 0.43
106 0.37
107 0.35
108 0.32
109 0.31
110 0.29
111 0.24
112 0.19
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.09
148 0.14
149 0.15
150 0.18
151 0.21
152 0.25
153 0.28
154 0.3
155 0.31
156 0.28
157 0.29
158 0.32
159 0.31
160 0.27
161 0.24
162 0.23
163 0.19
164 0.17
165 0.14
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.16
196 0.15
197 0.19
198 0.25
199 0.33
200 0.32
201 0.32
202 0.37
203 0.42
204 0.43
205 0.42
206 0.35
207 0.31
208 0.3
209 0.29
210 0.24
211 0.18
212 0.19
213 0.17
214 0.16
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.02
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.17
285 0.21
286 0.19
287 0.18
288 0.19
289 0.17
290 0.16
291 0.18
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.23
299 0.2
300 0.24
301 0.22
302 0.22
303 0.22
304 0.23
305 0.22
306 0.2
307 0.27
308 0.23
309 0.22
310 0.24
311 0.27
312 0.26
313 0.28
314 0.28
315 0.21
316 0.21
317 0.21
318 0.18
319 0.14
320 0.11
321 0.1
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.03
330 0.04
331 0.03
332 0.03
333 0.02
334 0.03
335 0.03
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.07
340 0.08
341 0.12
342 0.14
343 0.14
344 0.19
345 0.26
346 0.35
347 0.37
348 0.39
349 0.43
350 0.47
351 0.51
352 0.48
353 0.42
354 0.35
355 0.33
356 0.31
357 0.24
358 0.19
359 0.17
360 0.16
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.18
365 0.18
366 0.19
367 0.18
368 0.18
369 0.17
370 0.18
371 0.21
372 0.25
373 0.32
374 0.37
375 0.37
376 0.44
377 0.52
378 0.58
379 0.64
380 0.72
381 0.75
382 0.79
383 0.87
384 0.87
385 0.89
386 0.91
387 0.9
388 0.89
389 0.86
390 0.85
391 0.83
392 0.79
393 0.72
394 0.71
395 0.7
396 0.68
397 0.65
398 0.65
399 0.68
400 0.7
401 0.73
402 0.71
403 0.69
404 0.71
405 0.78