Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L6V9T4

Protein Details
Accession A0A0L6V9T4    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-79SSETHEKPQTTPKKKKPKKTADVSTAEYHydrophilic
386-415PPVSTQKSSSKKPSLKKPRKRPAESIEEMTHydrophilic
434-454NPAPGPFIHPSRKKKIKTSTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-70PKKKKPKK
395-407SKKPSLKKPRKRP
446-447KK
Subcellular Location(s) mito 12, plas 5, extr 3, nucl 2, cyto 2, cyto_nucl 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MGRHKTSSQHKPSDFHHLVARFKIPLAPVFLSKPTRSTVQVKAESADELSSSSETHEKPQTTPKKKKPKKTADVSTAEYGSNGALEAVNQTLASLLMRYIPSLGAVLIACLDPPTFLLPDGNGGHIRRPATTGSRIPMPTLPGSAWGVMDVEVKLLGWRPTIGQKLIGRPTNSTPSQLSLVIYRTFNASINANHLRAAGYHYDLNFEFPANWDSIGHPAPPQDPSLPFDLTNQHRHRGCWVDAHGVAVGGDEGTVSFTVMSLMIENHMISVMGSLLDDPFSIDEGPVQSMVARPMPKRRSSDREGEMEGTSEEESDSDGRSGKAASRGRMRAPPEIHSAAASRPRPDLIPPLVPTTSSTTTIPPPLTATNLKALNSALQSEPIGFPPVSTQKSSSKKPSLKKPRKRPAESIEEMTSSIPNPLPAASSALPILHNPAPGPFIHPSRKKKIKTSTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.54
3 0.52
4 0.47
5 0.47
6 0.46
7 0.47
8 0.37
9 0.35
10 0.36
11 0.3
12 0.28
13 0.3
14 0.28
15 0.27
16 0.29
17 0.35
18 0.37
19 0.36
20 0.35
21 0.32
22 0.34
23 0.37
24 0.39
25 0.42
26 0.46
27 0.51
28 0.49
29 0.48
30 0.45
31 0.4
32 0.35
33 0.27
34 0.17
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.16
41 0.17
42 0.22
43 0.28
44 0.29
45 0.32
46 0.42
47 0.51
48 0.56
49 0.66
50 0.71
51 0.76
52 0.83
53 0.91
54 0.91
55 0.92
56 0.92
57 0.91
58 0.91
59 0.89
60 0.86
61 0.8
62 0.72
63 0.62
64 0.51
65 0.4
66 0.3
67 0.2
68 0.14
69 0.09
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.04
100 0.05
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.17
111 0.19
112 0.22
113 0.22
114 0.18
115 0.2
116 0.21
117 0.22
118 0.28
119 0.28
120 0.27
121 0.33
122 0.32
123 0.32
124 0.31
125 0.29
126 0.24
127 0.22
128 0.19
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.15
148 0.18
149 0.18
150 0.22
151 0.24
152 0.3
153 0.35
154 0.38
155 0.34
156 0.33
157 0.36
158 0.38
159 0.36
160 0.32
161 0.27
162 0.25
163 0.25
164 0.23
165 0.2
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.17
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.14
184 0.17
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.14
190 0.13
191 0.15
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.08
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.2
217 0.22
218 0.3
219 0.31
220 0.33
221 0.34
222 0.34
223 0.36
224 0.35
225 0.33
226 0.28
227 0.28
228 0.26
229 0.25
230 0.25
231 0.21
232 0.16
233 0.15
234 0.1
235 0.08
236 0.04
237 0.03
238 0.02
239 0.02
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.12
279 0.14
280 0.16
281 0.26
282 0.32
283 0.37
284 0.43
285 0.49
286 0.53
287 0.55
288 0.62
289 0.57
290 0.55
291 0.52
292 0.48
293 0.41
294 0.33
295 0.28
296 0.2
297 0.15
298 0.11
299 0.08
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.19
311 0.23
312 0.27
313 0.34
314 0.38
315 0.41
316 0.46
317 0.48
318 0.47
319 0.46
320 0.45
321 0.44
322 0.42
323 0.38
324 0.33
325 0.31
326 0.26
327 0.32
328 0.3
329 0.25
330 0.24
331 0.25
332 0.25
333 0.26
334 0.3
335 0.26
336 0.3
337 0.3
338 0.33
339 0.32
340 0.31
341 0.31
342 0.3
343 0.28
344 0.24
345 0.23
346 0.22
347 0.24
348 0.28
349 0.27
350 0.21
351 0.21
352 0.2
353 0.24
354 0.24
355 0.23
356 0.25
357 0.27
358 0.27
359 0.25
360 0.25
361 0.24
362 0.22
363 0.22
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.15
370 0.17
371 0.14
372 0.14
373 0.19
374 0.26
375 0.27
376 0.28
377 0.31
378 0.37
379 0.44
380 0.52
381 0.55
382 0.58
383 0.63
384 0.7
385 0.78
386 0.8
387 0.84
388 0.88
389 0.89
390 0.9
391 0.93
392 0.92
393 0.9
394 0.88
395 0.87
396 0.81
397 0.76
398 0.68
399 0.58
400 0.5
401 0.41
402 0.34
403 0.24
404 0.21
405 0.16
406 0.13
407 0.13
408 0.13
409 0.14
410 0.13
411 0.19
412 0.16
413 0.17
414 0.17
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.22
419 0.18
420 0.19
421 0.18
422 0.18
423 0.19
424 0.19
425 0.24
426 0.23
427 0.29
428 0.38
429 0.47
430 0.55
431 0.64
432 0.74
433 0.76
434 0.8