FuNGI

A0A0L0N825

Protein Details

Accession

A0A0L0N825

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
437-456	VPTLRKRKAIDIFMRPKKRV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
451-455	RPKKR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MPPVKSLLEIATMVCIKNIKGLESVGDYLPYESVRHILLKVDSAYQMRQIELNSPQLQGETGEIWIKIIENDFPLEYKATAYKPQSPDKWYRVWEKYKKEHDLAIEESENKLKNALAGLQEVKEKNTSKIVERKYLPRAGRTGPKRAWGQRDTTSSALTFKAGSRTKTNTGASVMRKVRREVKEIAAIHGQLSRPIRGPTRQTEVKKAPSAMVNDYRRAANPQYRTTNKAPESLSAVEQYEKRATFISDSEEDDDAPFGEVAKKLTTKPAAKKPATAPIKNPVAEAAKVSLLKKKPTIQPTVLRPASSTKPATKAQSTSTPATPKQTANTTTATNITTPQKQDKPGAVTKPTTTAATTTTTTTTTTGKGAATLANKFRRSPTKPQATSNPPADSATTKPSAADSRLPATRTTPTREGSAGPSSSEELIATLAEAAPVPTLRKRKAIDIFMRPKKRVH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.15
4	0.21
5	0.21
6	0.18
7	0.19
8	0.2
9	0.21
10	0.23
11	0.25
12	0.2
13	0.2
14	0.18
15	0.17
16	0.18
17	0.16
18	0.13
19	0.11
20	0.13
21	0.13
22	0.15
23	0.15
24	0.17
25	0.18
26	0.21
27	0.22
28	0.23
29	0.24
30	0.25
31	0.26
32	0.28
33	0.27
34	0.24
35	0.24
36	0.23
37	0.24
38	0.26
39	0.33
40	0.28
41	0.28
42	0.27
43	0.26
44	0.25
45	0.21
46	0.18
47	0.11
48	0.11
49	0.12
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.16
66	0.16
67	0.23
68	0.26
69	0.33
70	0.38
71	0.46
72	0.5
73	0.53
74	0.59
75	0.58
76	0.61
77	0.58
78	0.61
79	0.62
80	0.67
81	0.69
82	0.7
83	0.75
84	0.78
85	0.79
86	0.73
87	0.67
88	0.6
89	0.57
90	0.49
91	0.44
92	0.37
93	0.3
94	0.29
95	0.29
96	0.26
97	0.21
98	0.19
99	0.15
100	0.14
101	0.14
102	0.16
103	0.13
104	0.15
105	0.17
106	0.17
107	0.22
108	0.22
109	0.22
110	0.24
111	0.24
112	0.24
113	0.29
114	0.29
115	0.31
116	0.4
117	0.43
118	0.45
119	0.47
120	0.52
121	0.53
122	0.58
123	0.53
124	0.49
125	0.49
126	0.46
127	0.52
128	0.5
129	0.52
130	0.46
131	0.51
132	0.54
133	0.56
134	0.59
135	0.53
136	0.53
137	0.5
138	0.52
139	0.5
140	0.44
141	0.38
142	0.3
143	0.29
144	0.24
145	0.18
146	0.14
147	0.11
148	0.18
149	0.2
150	0.22
151	0.26
152	0.3
153	0.34
154	0.38
155	0.38
156	0.32
157	0.32
158	0.35
159	0.32
160	0.36
161	0.38
162	0.37
163	0.38
164	0.4
165	0.46
166	0.44
167	0.47
168	0.42
169	0.41
170	0.45
171	0.43
172	0.42
173	0.35
174	0.31
175	0.26
176	0.25
177	0.2
178	0.16
179	0.17
180	0.16
181	0.16
182	0.18
183	0.21
184	0.22
185	0.27
186	0.27
187	0.34
188	0.39
189	0.4
190	0.46
191	0.48
192	0.5
193	0.47
194	0.44
195	0.38
196	0.34
197	0.34
198	0.3
199	0.33
200	0.3
201	0.29
202	0.29
203	0.28
204	0.25
205	0.26
206	0.25
207	0.23
208	0.25
209	0.3
210	0.36
211	0.38
212	0.43
213	0.43
214	0.47
215	0.42
216	0.42
217	0.37
218	0.31
219	0.33
220	0.28
221	0.26
222	0.19
223	0.18
224	0.15
225	0.15
226	0.16
227	0.15
228	0.14
229	0.14
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.13
234	0.15
235	0.13
236	0.15
237	0.16
238	0.15
239	0.15
240	0.14
241	0.13
242	0.09
243	0.08
244	0.07
245	0.05
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.1
250	0.11
251	0.11
252	0.16
253	0.23
254	0.28
255	0.35
256	0.43
257	0.51
258	0.5
259	0.55
260	0.53
261	0.56
262	0.57
263	0.51
264	0.44
265	0.43
266	0.48
267	0.43
268	0.4
269	0.33
270	0.28
271	0.27
272	0.24
273	0.18
274	0.14
275	0.16
276	0.17
277	0.2
278	0.21
279	0.24
280	0.27
281	0.33
282	0.38
283	0.43
284	0.49
285	0.48
286	0.52
287	0.55
288	0.61
289	0.55
290	0.48
291	0.42
292	0.4
293	0.38
294	0.36
295	0.34
296	0.27
297	0.31
298	0.35
299	0.38
300	0.37
301	0.36
302	0.34
303	0.38
304	0.4
305	0.38
306	0.39
307	0.39
308	0.37
309	0.4
310	0.39
311	0.33
312	0.32
313	0.35
314	0.33
315	0.31
316	0.32
317	0.28
318	0.26
319	0.26
320	0.23
321	0.18
322	0.19
323	0.21
324	0.23
325	0.25
326	0.32
327	0.35
328	0.38
329	0.42
330	0.43
331	0.46
332	0.48
333	0.5
334	0.47
335	0.45
336	0.42
337	0.42
338	0.38
339	0.32
340	0.26
341	0.21
342	0.19
343	0.19
344	0.19
345	0.17
346	0.16
347	0.16
348	0.16
349	0.17
350	0.17
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.15
358	0.17
359	0.21
360	0.28
361	0.34
362	0.36
363	0.36
364	0.43
365	0.49
366	0.52
367	0.58
368	0.61
369	0.65
370	0.67
371	0.72
372	0.75
373	0.73
374	0.74
375	0.69
376	0.61
377	0.51
378	0.48
379	0.43
380	0.36
381	0.31
382	0.3
383	0.26
384	0.23
385	0.22
386	0.25
387	0.27
388	0.28
389	0.3
390	0.28
391	0.32
392	0.36
393	0.37
394	0.34
395	0.33
396	0.38
397	0.38
398	0.42
399	0.42
400	0.4
401	0.42
402	0.42
403	0.41
404	0.38
405	0.39
406	0.32
407	0.27
408	0.27
409	0.26
410	0.25
411	0.23
412	0.18
413	0.12
414	0.11
415	0.1
416	0.08
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.09
424	0.12
425	0.18
426	0.27
427	0.31
428	0.39
429	0.41
430	0.49
431	0.57
432	0.64
433	0.66
434	0.69
435	0.76
436	0.78
437	0.85

A0A0L0N825

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer