Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0NHJ8

Protein Details
Accession A0A0L0NHJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
433-460GHVREREKARQERRKEEERKLRQNRMGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-279PPKFKHKKIPRGPPSPPP
383-398AREERAAAGRGRRNSR
439-455REKARQERRKEEERKLR
Subcellular Location(s) mito 18, mito_nucl 13.333, cyto_mito 10.333, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences REAKPHLGRHTRNISHSTVLLLQSSRPQFHHITSCACKMASITASLQASLPKPKYTGEDEEEASRSQQRGPRIVGAGHLDETQIVLKRAGPPPYGQRLGWRPRSQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGKKNATTXSNALAIQVDAEGKVKYDAIARRGHGDGRIVHTSFKDLIPLRQRADAGEIDLSRPDQDSVAATTEKTKNALAALVSGAVAAQKPKNVNVGNRRDPTFVRYTPANQMGDNSKKQDRIMKIVERQRDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEMWKIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDIAINDKHAQFAEAVKMAERHAREEVQQRAMMQQRLAEKEKAQKEDNLRSLAQKAREERAAAGRGRRNSRTSRDSRDSRDSRDSRDSRSRSRSYSYSESGSDSEDGHVREREKARQERRKEEERKLRQNRMGTERRIQVMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQTSGFDSGFNEDNHYDKPLFAAQDAISSIYRPRANMEDDDPEAGDKEMAKIQKTSRFGEALGKGTFKGAAEVEAREGPVQFEKETADPFNVDKFLSEVDQNSSSKRGYGLQDEGSRQSKRPRVEDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.54
3 0.5
4 0.43
5 0.37
6 0.32
7 0.29
8 0.24
9 0.22
10 0.27
11 0.32
12 0.32
13 0.3
14 0.34
15 0.34
16 0.39
17 0.45
18 0.41
19 0.44
20 0.46
21 0.48
22 0.45
23 0.42
24 0.36
25 0.29
26 0.31
27 0.25
28 0.22
29 0.2
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.23
36 0.29
37 0.3
38 0.27
39 0.28
40 0.3
41 0.34
42 0.37
43 0.41
44 0.38
45 0.39
46 0.39
47 0.41
48 0.41
49 0.37
50 0.32
51 0.29
52 0.25
53 0.27
54 0.29
55 0.32
56 0.36
57 0.39
58 0.43
59 0.41
60 0.4
61 0.38
62 0.38
63 0.34
64 0.29
65 0.25
66 0.19
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.16
74 0.23
75 0.28
76 0.32
77 0.31
78 0.33
79 0.4
80 0.48
81 0.49
82 0.42
83 0.45
84 0.5
85 0.57
86 0.63
87 0.6
88 0.56
89 0.59
90 0.66
91 0.61
92 0.54
93 0.49
94 0.41
95 0.36
96 0.33
97 0.26
98 0.2
99 0.18
100 0.14
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.06
105 0.07
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.13
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.22
115 0.24
116 0.26
117 0.29
118 0.26
119 0.26
120 0.27
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.23
125 0.2
126 0.17
127 0.14
128 0.13
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.14
137 0.18
138 0.21
139 0.26
140 0.26
141 0.29
142 0.31
143 0.32
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.26
148 0.3
149 0.27
150 0.27
151 0.26
152 0.27
153 0.25
154 0.22
155 0.22
156 0.19
157 0.25
158 0.32
159 0.36
160 0.35
161 0.36
162 0.36
163 0.31
164 0.34
165 0.27
166 0.21
167 0.2
168 0.18
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.12
173 0.13
174 0.11
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.17
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.18
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.07
201 0.1
202 0.11
203 0.13
204 0.2
205 0.23
206 0.3
207 0.38
208 0.46
209 0.52
210 0.54
211 0.55
212 0.51
213 0.49
214 0.46
215 0.43
216 0.35
217 0.3
218 0.28
219 0.28
220 0.32
221 0.37
222 0.32
223 0.25
224 0.27
225 0.3
226 0.34
227 0.33
228 0.32
229 0.29
230 0.3
231 0.32
232 0.37
233 0.33
234 0.34
235 0.38
236 0.4
237 0.45
238 0.49
239 0.54
240 0.49
241 0.49
242 0.45
243 0.41
244 0.39
245 0.41
246 0.44
247 0.42
248 0.42
249 0.5
250 0.54
251 0.53
252 0.6
253 0.6
254 0.62
255 0.67
256 0.76
257 0.74
258 0.76
259 0.78
260 0.77
261 0.75
262 0.7
263 0.64
264 0.54
265 0.51
266 0.47
267 0.48
268 0.48
269 0.48
270 0.46
271 0.46
272 0.49
273 0.44
274 0.41
275 0.41
276 0.4
277 0.38
278 0.35
279 0.33
280 0.31
281 0.31
282 0.29
283 0.27
284 0.2
285 0.15
286 0.17
287 0.18
288 0.27
289 0.29
290 0.37
291 0.41
292 0.47
293 0.51
294 0.48
295 0.47
296 0.41
297 0.39
298 0.34
299 0.38
300 0.33
301 0.34
302 0.36
303 0.33
304 0.29
305 0.3
306 0.28
307 0.18
308 0.18
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.1
323 0.1
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.14
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.18
338 0.25
339 0.28
340 0.28
341 0.28
342 0.26
343 0.28
344 0.32
345 0.3
346 0.23
347 0.22
348 0.23
349 0.27
350 0.3
351 0.27
352 0.25
353 0.32
354 0.37
355 0.39
356 0.36
357 0.37
358 0.4
359 0.46
360 0.47
361 0.43
362 0.38
363 0.35
364 0.38
365 0.37
366 0.35
367 0.31
368 0.3
369 0.3
370 0.32
371 0.31
372 0.29
373 0.31
374 0.31
375 0.29
376 0.32
377 0.34
378 0.38
379 0.43
380 0.45
381 0.44
382 0.46
383 0.51
384 0.54
385 0.56
386 0.58
387 0.61
388 0.63
389 0.64
390 0.68
391 0.64
392 0.61
393 0.65
394 0.58
395 0.56
396 0.6
397 0.56
398 0.53
399 0.59
400 0.59
401 0.57
402 0.63
403 0.61
404 0.55
405 0.57
406 0.53
407 0.5
408 0.51
409 0.46
410 0.39
411 0.36
412 0.34
413 0.3
414 0.28
415 0.22
416 0.16
417 0.15
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.18
422 0.17
423 0.24
424 0.27
425 0.33
426 0.4
427 0.49
428 0.57
429 0.64
430 0.71
431 0.74
432 0.78
433 0.81
434 0.8
435 0.81
436 0.81
437 0.82
438 0.85
439 0.84
440 0.86
441 0.81
442 0.79
443 0.76
444 0.75
445 0.73
446 0.66
447 0.64
448 0.6
449 0.56
450 0.51
451 0.43
452 0.38
453 0.4
454 0.43
455 0.41
456 0.41
457 0.4
458 0.43
459 0.45
460 0.43
461 0.34
462 0.28
463 0.24
464 0.2
465 0.2
466 0.17
467 0.15
468 0.12
469 0.14
470 0.14
471 0.16
472 0.17
473 0.18
474 0.19
475 0.21
476 0.22
477 0.23
478 0.29
479 0.31
480 0.32
481 0.36
482 0.35
483 0.38
484 0.4
485 0.38
486 0.3
487 0.27
488 0.25
489 0.23
490 0.25
491 0.21
492 0.17
493 0.17
494 0.2
495 0.21
496 0.2
497 0.2
498 0.17
499 0.19
500 0.2
501 0.22
502 0.2
503 0.16
504 0.19
505 0.19
506 0.19
507 0.17
508 0.19
509 0.15
510 0.17
511 0.18
512 0.17
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.19
517 0.2
518 0.18
519 0.21
520 0.24
521 0.27
522 0.3
523 0.32
524 0.31
525 0.31
526 0.32
527 0.29
528 0.25
529 0.22
530 0.18
531 0.16
532 0.11
533 0.11
534 0.15
535 0.17
536 0.19
537 0.23
538 0.28
539 0.35
540 0.39
541 0.4
542 0.4
543 0.38
544 0.38
545 0.42
546 0.4
547 0.37
548 0.35
549 0.32
550 0.28
551 0.27
552 0.27
553 0.19
554 0.18
555 0.13
556 0.15
557 0.16
558 0.17
559 0.19
560 0.19
561 0.2
562 0.18
563 0.18
564 0.17
565 0.2
566 0.21
567 0.18
568 0.18
569 0.2
570 0.21
571 0.25
572 0.24
573 0.21
574 0.21
575 0.22
576 0.24
577 0.23
578 0.21
579 0.18
580 0.17
581 0.17
582 0.17
583 0.18
584 0.16
585 0.2
586 0.25
587 0.25
588 0.26
589 0.28
590 0.26
591 0.26
592 0.25
593 0.26
594 0.26
595 0.32
596 0.34
597 0.38
598 0.43
599 0.45
600 0.49
601 0.51
602 0.49
603 0.47
604 0.52
605 0.52
606 0.54
607 0.58
608 0.61