Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0N1W6

Protein Details
Accession A0A0L0N1W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-268ASAGGKAKRERERKIKQTIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-51GNRRGGAR
252-263GKAKRERERKIK
276-319ERTRGGARGGRGGARGGRGGERGGDRGRGGNFRGAARGGASRGG
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSNVASQEKPTVPVKTVDKAASRTTKRNVEPQAPAAPAARGSGGNRRGGARGSEGAFRDRGVGSDRNHGRSTEEAPRNGPRGGYGARVRGGKPFRVIIASRPHVLRRDEATREELDANELIGRGSRRPREHDDRHPSRATGHGSGSDKQAAQSWGATEGDAELKDEQAGDVIAQTEKKDALVEDGAAEEPAEPEDKSVSYSDYVAQQAEKKAALEADFKVREANEGSKLDKKWANAKTLEKEEEDFIASAGGKAKRERERKIKQTIDFDPRFVEPERTRGGARGGRGGARGGRGGERGGDRGRGGNFRGAARGGASRGGRDNAAAPINTKDESAFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.42
4 0.43
5 0.43
6 0.43
7 0.49
8 0.52
9 0.54
10 0.56
11 0.59
12 0.63
13 0.62
14 0.68
15 0.67
16 0.65
17 0.65
18 0.62
19 0.6
20 0.52
21 0.49
22 0.41
23 0.34
24 0.27
25 0.23
26 0.19
27 0.14
28 0.16
29 0.24
30 0.27
31 0.3
32 0.31
33 0.32
34 0.32
35 0.32
36 0.32
37 0.27
38 0.27
39 0.25
40 0.28
41 0.28
42 0.29
43 0.27
44 0.25
45 0.23
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.24
50 0.23
51 0.32
52 0.37
53 0.39
54 0.4
55 0.39
56 0.37
57 0.34
58 0.37
59 0.38
60 0.39
61 0.36
62 0.39
63 0.44
64 0.44
65 0.42
66 0.36
67 0.26
68 0.25
69 0.25
70 0.27
71 0.26
72 0.26
73 0.29
74 0.31
75 0.31
76 0.34
77 0.36
78 0.33
79 0.33
80 0.3
81 0.28
82 0.3
83 0.3
84 0.28
85 0.34
86 0.33
87 0.33
88 0.34
89 0.35
90 0.36
91 0.38
92 0.35
93 0.31
94 0.35
95 0.35
96 0.35
97 0.36
98 0.32
99 0.32
100 0.29
101 0.24
102 0.19
103 0.16
104 0.14
105 0.11
106 0.1
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.11
111 0.18
112 0.24
113 0.27
114 0.33
115 0.42
116 0.5
117 0.57
118 0.64
119 0.68
120 0.68
121 0.71
122 0.66
123 0.58
124 0.49
125 0.47
126 0.4
127 0.31
128 0.25
129 0.24
130 0.25
131 0.26
132 0.26
133 0.23
134 0.19
135 0.17
136 0.19
137 0.15
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.2
211 0.18
212 0.2
213 0.22
214 0.27
215 0.27
216 0.31
217 0.31
218 0.31
219 0.34
220 0.37
221 0.4
222 0.4
223 0.45
224 0.46
225 0.5
226 0.5
227 0.43
228 0.4
229 0.35
230 0.31
231 0.26
232 0.19
233 0.13
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.19
241 0.27
242 0.35
243 0.44
244 0.52
245 0.57
246 0.66
247 0.72
248 0.8
249 0.8
250 0.77
251 0.76
252 0.75
253 0.75
254 0.66
255 0.58
256 0.5
257 0.42
258 0.4
259 0.34
260 0.35
261 0.26
262 0.31
263 0.33
264 0.33
265 0.33
266 0.32
267 0.37
268 0.32
269 0.32
270 0.32
271 0.3
272 0.3
273 0.3
274 0.31
275 0.26
276 0.25
277 0.25
278 0.2
279 0.21
280 0.2
281 0.2
282 0.22
283 0.21
284 0.24
285 0.24
286 0.25
287 0.24
288 0.27
289 0.3
290 0.3
291 0.3
292 0.31
293 0.32
294 0.3
295 0.32
296 0.28
297 0.26
298 0.23
299 0.24
300 0.19
301 0.22
302 0.22
303 0.22
304 0.25
305 0.27
306 0.25
307 0.23
308 0.25
309 0.23
310 0.26
311 0.24
312 0.22
313 0.23
314 0.26
315 0.25
316 0.23
317 0.2
318 0.18
319 0.22
320 0.25
321 0.21