FuNGI

A0A0L0NAW1

Protein Details

Accession

A0A0L0NAW1

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-40	GQNGLPRSQKPNPLRPMRRKPRPNPLVAPPRKA	Hydrophilic
182-207	APVAKDTNPKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-50	SQKPNPLRPMRRKPRPNPLVAPPRKAAIKPAQKLSP
190-206	PKRPKKQKEEKTMFNRA
498-506	KKSKSLKRA
521-526	RKKMKK
667-672	RLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGGQNGLPRSQKPNPLRPMRRKPRPNPLVAPPRKAAIKPAQKLSPSPSRPPVLNGPKPNIEELRKQYGGWSEAPPPYQYSDIPIMTTKKALLDGVRYHLIKFAQSKLNDKPVDPTDQDAFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKEEGPQPLQIDEKEAEMLAQIKADREAQRAIDQAKIAPVAKDTNPKRPKKQKEEKTMFNRAPKSEAAKKESDIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSEANVAFMIDKSVFRMVPLEKWYKFTSKPPFRPFTIDQAEAYMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGLSDLEATRRLFYGRGQMVKTESDTFRAASRLEKLDHDELDISGDEFQDDDEAPHFDRNDDEDAKESKVRIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKTTKKALIKRDREEIYESDDSEENPWSSSSNDDSSDEDEDENKEGDKKDPDGKDGQAEAKDKSKVAGSKGTTTPQGKQKQGDLVKKSKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTVGTAPGSRAGTPLPQTNAARRPKIAGAGSGSDGEATAGEMSDGAGPRKKIKVVGSSGRGTPAASRAGSPNPAQGGASPASQSGAGIEPWEILEKIPPEGIAIGDLIKPFHGRVGERPGQMPKGEWIRLVKQLCDYGSDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.54
3	0.62
4	0.63
5	0.67
6	0.69
7	0.75
8	0.83
9	0.85
10	0.9
11	0.91
12	0.93
13	0.94
14	0.93
15	0.94
16	0.92
17	0.9
18	0.86
19	0.85
20	0.86
21	0.82
22	0.79
23	0.69
24	0.65
25	0.6
26	0.54
27	0.52
28	0.51
29	0.54
30	0.54
31	0.6
32	0.61
33	0.59
34	0.62
35	0.61
36	0.61
37	0.56
38	0.57
39	0.57
40	0.55
41	0.54
42	0.56
43	0.59
44	0.59
45	0.62
46	0.61
47	0.6
48	0.62
49	0.63
50	0.63
51	0.59
52	0.54
53	0.54
54	0.53
55	0.56
56	0.5
57	0.48
58	0.47
59	0.46
60	0.44
61	0.38
62	0.35
63	0.32
64	0.35
65	0.37
66	0.34
67	0.3
68	0.29
69	0.29
70	0.25
71	0.24
72	0.26
73	0.25
74	0.25
75	0.27
76	0.28
77	0.27
78	0.28
79	0.23
80	0.19
81	0.2
82	0.2
83	0.19
84	0.22
85	0.24
86	0.27
87	0.32
88	0.31
89	0.3
90	0.32
91	0.3
92	0.28
93	0.29
94	0.3
95	0.32
96	0.34
97	0.39
98	0.42
99	0.51
100	0.48
101	0.45
102	0.45
103	0.41
104	0.45
105	0.4
106	0.38
107	0.31
108	0.32
109	0.32
110	0.29
111	0.27
112	0.21
113	0.21
114	0.17
115	0.22
116	0.27
117	0.32
118	0.37
119	0.4
120	0.47
121	0.53
122	0.62
123	0.62
124	0.64
125	0.64
126	0.63
127	0.68
128	0.67
129	0.62
130	0.57
131	0.55
132	0.5
133	0.5
134	0.48
135	0.43
136	0.4
137	0.38
138	0.35
139	0.3
140	0.28
141	0.22
142	0.22
143	0.18
144	0.16
145	0.15
146	0.14
147	0.12
148	0.11
149	0.12
150	0.08
151	0.1
152	0.09
153	0.09
154	0.11
155	0.17
156	0.18
157	0.19
158	0.22
159	0.22
160	0.24
161	0.27
162	0.27
163	0.24
164	0.22
165	0.21
166	0.2
167	0.2
168	0.18
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.19
173	0.27
174	0.29
175	0.38
176	0.47
177	0.54
178	0.63
179	0.7
180	0.78
181	0.8
182	0.87
183	0.87
184	0.89
185	0.89
186	0.89
187	0.87
188	0.86
189	0.8
190	0.77
191	0.71
192	0.61
193	0.56
194	0.49
195	0.47
196	0.45
197	0.46
198	0.44
199	0.41
200	0.41
201	0.47
202	0.47
203	0.44
204	0.39
205	0.35
206	0.32
207	0.31
208	0.31
209	0.24
210	0.23
211	0.2
212	0.18
213	0.16
214	0.13
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.09
226	0.05
227	0.06
228	0.06
229	0.05
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.13
248	0.12
249	0.16
250	0.21
251	0.26
252	0.25
253	0.28
254	0.31
255	0.31
256	0.32
257	0.37
258	0.42
259	0.46
260	0.55
261	0.59
262	0.61
263	0.58
264	0.63
265	0.58
266	0.56
267	0.5
268	0.43
269	0.35
270	0.33
271	0.32
272	0.26
273	0.26
274	0.19
275	0.14
276	0.13
277	0.14
278	0.12
279	0.13
280	0.16
281	0.18
282	0.21
283	0.22
284	0.23
285	0.24
286	0.27
287	0.29
288	0.27
289	0.27
290	0.23
291	0.22
292	0.21
293	0.21
294	0.17
295	0.14
296	0.15
297	0.13
298	0.14
299	0.16
300	0.16
301	0.15
302	0.15
303	0.15
304	0.12
305	0.1
306	0.17
307	0.18
308	0.22
309	0.21
310	0.22
311	0.23
312	0.23
313	0.24
314	0.19
315	0.16
316	0.16
317	0.16
318	0.15
319	0.15
320	0.15
321	0.14
322	0.12
323	0.15
324	0.15
325	0.15
326	0.15
327	0.19
328	0.2
329	0.2
330	0.19
331	0.16
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.08
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.07
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.16
356	0.18
357	0.19
358	0.2
359	0.18
360	0.19
361	0.24
362	0.28
363	0.31
364	0.36
365	0.41
366	0.43
367	0.46
368	0.47
369	0.44
370	0.4
371	0.34
372	0.28
373	0.21
374	0.17
375	0.14
376	0.09
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.06
383	0.05
384	0.07
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.13
391	0.14
392	0.14
393	0.2
394	0.22
395	0.25
396	0.25
397	0.26
398	0.28
399	0.35
400	0.42
401	0.39
402	0.43
403	0.45
404	0.54
405	0.57
406	0.63
407	0.66
408	0.67
409	0.66
410	0.67
411	0.63
412	0.56
413	0.54
414	0.45
415	0.41
416	0.34
417	0.3
418	0.24
419	0.23
420	0.21
421	0.19
422	0.19
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.09
427	0.1
428	0.11
429	0.12
430	0.13
431	0.14
432	0.15
433	0.16
434	0.17
435	0.18
436	0.17
437	0.15
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.12
443	0.13
444	0.13
445	0.17
446	0.19
447	0.21
448	0.28
449	0.29
450	0.32
451	0.33
452	0.33
453	0.32
454	0.32
455	0.31
456	0.28
457	0.28
458	0.26
459	0.28
460	0.28
461	0.25
462	0.24
463	0.25
464	0.23
465	0.25
466	0.3
467	0.28
468	0.32
469	0.35
470	0.36
471	0.38
472	0.37
473	0.4
474	0.41
475	0.47
476	0.45
477	0.45
478	0.46
479	0.49
480	0.55
481	0.58
482	0.56
483	0.56
484	0.56
485	0.61
486	0.64
487	0.6
488	0.59
489	0.59
490	0.59
491	0.58
492	0.62
493	0.6
494	0.57
495	0.53
496	0.48
497	0.43
498	0.36
499	0.29
500	0.22
501	0.23
502	0.22
503	0.21
504	0.22
505	0.22
506	0.27
507	0.36
508	0.41
509	0.38
510	0.45
511	0.53
512	0.59
513	0.64
514	0.68
515	0.68
516	0.69
517	0.68
518	0.63
519	0.6
520	0.51
521	0.44
522	0.35
523	0.27
524	0.25
525	0.25
526	0.26
527	0.22
528	0.27
529	0.29
530	0.36
531	0.43
532	0.47
533	0.48
534	0.44
535	0.45
536	0.41
537	0.45
538	0.39
539	0.34
540	0.3
541	0.29
542	0.29
543	0.25
544	0.23
545	0.16
546	0.15
547	0.12
548	0.08
549	0.06
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.08
556	0.09
557	0.11
558	0.15
559	0.17
560	0.22
561	0.26
562	0.28
563	0.31
564	0.35
565	0.41
566	0.46
567	0.53
568	0.54
569	0.53
570	0.52
571	0.5
572	0.44
573	0.35
574	0.29
575	0.24
576	0.22
577	0.2
578	0.2
579	0.21
580	0.25
581	0.29
582	0.28
583	0.29
584	0.26
585	0.26
586	0.25
587	0.22
588	0.22
589	0.2
590	0.2
591	0.16
592	0.14
593	0.14
594	0.14
595	0.13
596	0.1
597	0.1
598	0.09
599	0.1
600	0.1
601	0.09
602	0.1
603	0.13
604	0.11
605	0.1
606	0.15
607	0.15
608	0.16
609	0.17
610	0.16
611	0.15
612	0.15
613	0.15
614	0.11
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.12
619	0.11
620	0.11
621	0.13
622	0.12
623	0.15
624	0.18
625	0.19
626	0.25
627	0.35
628	0.41
629	0.42
630	0.47
631	0.49
632	0.49
633	0.48
634	0.43
635	0.41
636	0.42
637	0.41
638	0.4
639	0.41
640	0.41
641	0.48
642	0.49
643	0.44
644	0.41
645	0.44
646	0.4
647	0.39
648	0.37
649	0.37
650	0.43
651	0.49
652	0.51

A0A0L0NAW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer