Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0N399

Protein Details
Accession A0A0L0N399    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-280HDPEERRRRQHDNRSRYRERDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-290RRRQHDNRSRYRERDGDSRRGDRRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 7.5, mito 6, cyto 3.5, extr 3, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences HLASTAALFPDHLSQPVHAYPPPPLRFLSRSAIISRGSTTHHSCSSISPPKTASTAPCLRMHDFAATCQPCTTSHHPAAAASRGLDNFDMDLDIEMGDAAYLAEDAPITDLPQADDILQPDEPEEPGEVVDDEPTNDNASSPKTVVPTKIHVRGLDTLHTDDIKAHVNAHFGPVDKVEWIDDGSANLVFGSEPTAREAIVALSAIEVADATALAVGESLPGKPVEGKPEISLQVRFAIESDRKQAGAALRSRYYLLHPEHDPEERRRRQHDNRSRYRERDGDSRRGDRRRRDSDDQVETFEVSMYDDAPQPRRARRYSDSEDRPRSHATVNRGKELFGDRPARRDRSASPRRDGDGNAHMDGLASSSRNNRARARSIKERLSTDNSAKELFPTKSSGRGGQLDELERSIGSARLQEEDMPKIVAVPDASAGGAFNIRGLASQHRGSDGGFAIKGAAASANELFPGKLGGSNAGKELLDASRVKRRQKAQDLFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.25
4 0.28
5 0.24
6 0.24
7 0.3
8 0.39
9 0.41
10 0.38
11 0.37
12 0.4
13 0.42
14 0.45
15 0.44
16 0.39
17 0.4
18 0.39
19 0.41
20 0.36
21 0.34
22 0.31
23 0.26
24 0.25
25 0.27
26 0.3
27 0.32
28 0.33
29 0.34
30 0.33
31 0.35
32 0.41
33 0.45
34 0.42
35 0.39
36 0.39
37 0.39
38 0.41
39 0.39
40 0.33
41 0.32
42 0.38
43 0.39
44 0.43
45 0.45
46 0.45
47 0.44
48 0.42
49 0.4
50 0.33
51 0.31
52 0.36
53 0.32
54 0.31
55 0.29
56 0.28
57 0.23
58 0.3
59 0.34
60 0.33
61 0.35
62 0.38
63 0.38
64 0.38
65 0.41
66 0.37
67 0.31
68 0.23
69 0.23
70 0.2
71 0.21
72 0.19
73 0.16
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.11
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.13
129 0.15
130 0.16
131 0.18
132 0.23
133 0.25
134 0.29
135 0.34
136 0.4
137 0.4
138 0.38
139 0.39
140 0.39
141 0.38
142 0.34
143 0.3
144 0.24
145 0.23
146 0.23
147 0.19
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.17
157 0.16
158 0.13
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.09
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.16
215 0.19
216 0.22
217 0.21
218 0.2
219 0.16
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.12
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.19
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.19
232 0.17
233 0.2
234 0.22
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.22
239 0.21
240 0.2
241 0.21
242 0.2
243 0.2
244 0.2
245 0.22
246 0.23
247 0.26
248 0.28
249 0.29
250 0.38
251 0.4
252 0.44
253 0.48
254 0.55
255 0.62
256 0.7
257 0.72
258 0.73
259 0.77
260 0.82
261 0.83
262 0.77
263 0.73
264 0.67
265 0.6
266 0.6
267 0.55
268 0.55
269 0.54
270 0.58
271 0.6
272 0.63
273 0.67
274 0.66
275 0.7
276 0.69
277 0.72
278 0.71
279 0.72
280 0.72
281 0.73
282 0.64
283 0.56
284 0.47
285 0.39
286 0.32
287 0.24
288 0.16
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.09
294 0.11
295 0.14
296 0.2
297 0.23
298 0.29
299 0.35
300 0.37
301 0.41
302 0.44
303 0.51
304 0.53
305 0.59
306 0.63
307 0.66
308 0.71
309 0.66
310 0.65
311 0.58
312 0.52
313 0.47
314 0.42
315 0.41
316 0.43
317 0.43
318 0.46
319 0.43
320 0.41
321 0.39
322 0.39
323 0.34
324 0.31
325 0.38
326 0.32
327 0.4
328 0.46
329 0.48
330 0.44
331 0.45
332 0.45
333 0.47
334 0.56
335 0.55
336 0.55
337 0.55
338 0.56
339 0.55
340 0.49
341 0.44
342 0.42
343 0.38
344 0.33
345 0.28
346 0.25
347 0.23
348 0.21
349 0.17
350 0.1
351 0.07
352 0.08
353 0.12
354 0.21
355 0.26
356 0.3
357 0.36
358 0.41
359 0.5
360 0.57
361 0.61
362 0.63
363 0.66
364 0.69
365 0.68
366 0.65
367 0.62
368 0.6
369 0.58
370 0.52
371 0.5
372 0.44
373 0.4
374 0.36
375 0.33
376 0.32
377 0.28
378 0.25
379 0.25
380 0.25
381 0.3
382 0.32
383 0.33
384 0.32
385 0.34
386 0.35
387 0.34
388 0.36
389 0.32
390 0.31
391 0.28
392 0.23
393 0.19
394 0.17
395 0.14
396 0.12
397 0.1
398 0.13
399 0.13
400 0.15
401 0.16
402 0.2
403 0.22
404 0.23
405 0.24
406 0.21
407 0.19
408 0.18
409 0.18
410 0.15
411 0.13
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.1
426 0.15
427 0.19
428 0.23
429 0.23
430 0.24
431 0.25
432 0.25
433 0.26
434 0.22
435 0.21
436 0.18
437 0.17
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.11
442 0.11
443 0.07
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.11
450 0.1
451 0.11
452 0.09
453 0.11
454 0.11
455 0.17
456 0.2
457 0.21
458 0.22
459 0.23
460 0.22
461 0.2
462 0.22
463 0.16
464 0.19
465 0.2
466 0.24
467 0.32
468 0.39
469 0.46
470 0.52
471 0.6
472 0.66
473 0.74