FuNGI

A3GHD1

Protein Details

Accession

A3GHD1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
580-599	EQNDRRKYNGKKSQRHQISK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022712 Beta_Casp IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR035639 CPSF2_MBL IPR001279 Metallo-B-lactamas IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
KEGG	pic:PICST_81097 -
Pfam	View protein in Pfam PF10996 Beta-Casp PF13299 CPSF100_C PF16661 Lactamase_B_6
CDD	cd16293 CPSF2-like_MBL-fold

Amino Acid Sequences

MFTFTLLTPSASDFSFRAALLSFDNEFRVLADPSWNGKDVNSVMFMEQHLRNTNIILLSHSTPEFISGYVLMCLKFPNLMANIQVYSTLPVNQLGRLSTVEFYRANGMLGPLNTALLELDEVDEWFDKISLLKYLQILNVFDNKVVITPYNAGHTLGGTFWLITKRSDRVIYAPAWNHSKDSFLNGASFLSSSSGNPLSQLLRPTAFITSTDMGSVMSHKKRTEKFLQLVDATLANGGAAVIPTSLSGRFLELFHLIDEHLQGAPIPVYFLSYSGTKVLSYASNLIDWMSSSVQSQWEEAESSTNYKNLPFDPSKVDLLLSPEELIQLSGPKIVFCSGIDLRNGELSAEAFQYLCQDEKSTILLTEKSLFGVDETLNTVLYKEWHSLTKQKLGGKVEDGVAVPLERVFSIDDWTREENLSGTALTDFQERIAVRRKEKLLAKVRDRKNQNLLNSDLVGEEDSSEDEDGNSSDEETKVSETTETTTVVASTVASGPSVADELAAHEAFITDHIKQSLEENRPLDLKITYKLKPRQAMFPYFINTHKQKFDDYGEVIDVKDFQKTDEVNNNKIILEGKKKFEQNDRRKYNGKKSQRHQISKLTPQELLNNQLLEKYLDTLFAPRRRVPLGAASTYSNTNQQLKVRCGLSFVDLSGLVDIRSLGVIVSSLKPSNLLLLPDFTTDESNNAEYNGLIGVQSFFSSQQEDQKQEDTKKNVYNSSRYMSLSSIRSGLSGFVSYGAGNKMNILVVNSKETIKIGTDSDAGGISLSNFEVNLDDNIIEDLKWQSIDGNYRVAQLYGELEIHNQDLSKKRHREVGDYINSSTLFTLKKVKKEDFIRRQAAVAEDVKNSLLLSSGPKLAIGNIALPDLKKKLVSKNLNAEFKSEGTLVVNDKLAIRKVAYGAVDTDDTGDIVIEGNVGPLYYVVKDCIREMLAYV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.17
4	0.16
5	0.14
6	0.16
7	0.16
8	0.19
9	0.17
10	0.16
11	0.18
12	0.17
13	0.17
14	0.17
15	0.18
16	0.15
17	0.14
18	0.18
19	0.2
20	0.25
21	0.28
22	0.28
23	0.26
24	0.24
25	0.29
26	0.27
27	0.26
28	0.23
29	0.21
30	0.2
31	0.22
32	0.23
33	0.23
34	0.23
35	0.25
36	0.27
37	0.28
38	0.28
39	0.27
40	0.29
41	0.25
42	0.24
43	0.21
44	0.21
45	0.21
46	0.23
47	0.22
48	0.2
49	0.17
50	0.19
51	0.17
52	0.14
53	0.13
54	0.11
55	0.12
56	0.13
57	0.14
58	0.12
59	0.12
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.12
64	0.15
65	0.16
66	0.17
67	0.19
68	0.2
69	0.2
70	0.19
71	0.19
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.15
76	0.13
77	0.16
78	0.17
79	0.18
80	0.19
81	0.18
82	0.18
83	0.18
84	0.18
85	0.17
86	0.17
87	0.19
88	0.18
89	0.18
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.17
94	0.18
95	0.17
96	0.17
97	0.18
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.12
102	0.1
103	0.07
104	0.07
105	0.05
106	0.06
107	0.06
108	0.06
109	0.08
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.08
116	0.1
117	0.12
118	0.13
119	0.16
120	0.18
121	0.2
122	0.22
123	0.24
124	0.23
125	0.22
126	0.28
127	0.25
128	0.23
129	0.22
130	0.19
131	0.17
132	0.17
133	0.15
134	0.11
135	0.13
136	0.14
137	0.17
138	0.17
139	0.17
140	0.16
141	0.16
142	0.14
143	0.11
144	0.12
145	0.08
146	0.07
147	0.09
148	0.13
149	0.13
150	0.15
151	0.19
152	0.21
153	0.25
154	0.27
155	0.26
156	0.26
157	0.3
158	0.31
159	0.34
160	0.34
161	0.34
162	0.37
163	0.36
164	0.34
165	0.3
166	0.3
167	0.24
168	0.26
169	0.24
170	0.21
171	0.21
172	0.19
173	0.19
174	0.16
175	0.15
176	0.1
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.12
181	0.13
182	0.12
183	0.13
184	0.15
185	0.16
186	0.18
187	0.2
188	0.18
189	0.17
190	0.18
191	0.19
192	0.19
193	0.17
194	0.15
195	0.18
196	0.17
197	0.16
198	0.15
199	0.14
200	0.12
201	0.12
202	0.15
203	0.18
204	0.21
205	0.25
206	0.27
207	0.35
208	0.39
209	0.47
210	0.52
211	0.54
212	0.55
213	0.56
214	0.58
215	0.51
216	0.47
217	0.41
218	0.32
219	0.23
220	0.17
221	0.11
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.1
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.11
242	0.12
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.09
264	0.09
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.1
274	0.09
275	0.1
276	0.08
277	0.07
278	0.08
279	0.09
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.11
287	0.13
288	0.11
289	0.14
290	0.14
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.16
295	0.15
296	0.21
297	0.2
298	0.21
299	0.25
300	0.28
301	0.28
302	0.26
303	0.25
304	0.19
305	0.2
306	0.19
307	0.15
308	0.12
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.06
314	0.07
315	0.06
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.14
324	0.13
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.16
329	0.16
330	0.16
331	0.1
332	0.09
333	0.07
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.11
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.11
351	0.11
352	0.13
353	0.12
354	0.11
355	0.1
356	0.09
357	0.08
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.08
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.12
372	0.15
373	0.21
374	0.24
375	0.3
376	0.32
377	0.34
378	0.37
379	0.37
380	0.37
381	0.32
382	0.3
383	0.23
384	0.21
385	0.18
386	0.13
387	0.11
388	0.09
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.08
397	0.1
398	0.11
399	0.13
400	0.15
401	0.16
402	0.15
403	0.15
404	0.13
405	0.11
406	0.11
407	0.08
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.1
416	0.09
417	0.12
418	0.21
419	0.25
420	0.26
421	0.32
422	0.34
423	0.37
424	0.41
425	0.48
426	0.49
427	0.52
428	0.59
429	0.63
430	0.68
431	0.7
432	0.7
433	0.66
434	0.65
435	0.61
436	0.56
437	0.5
438	0.46
439	0.39
440	0.35
441	0.29
442	0.21
443	0.16
444	0.12
445	0.08
446	0.06
447	0.05
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.08
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.05
484	0.04
485	0.03
486	0.03
487	0.04
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.08
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.09
500	0.09
501	0.12
502	0.19
503	0.2
504	0.24
505	0.24
506	0.25
507	0.25
508	0.25
509	0.23
510	0.16
511	0.15
512	0.15
513	0.19
514	0.21
515	0.29
516	0.35
517	0.4
518	0.45
519	0.45
520	0.49
521	0.5
522	0.51
523	0.45
524	0.41
525	0.38
526	0.34
527	0.34
528	0.32
529	0.3
530	0.28
531	0.28
532	0.27
533	0.25
534	0.26
535	0.28
536	0.25
537	0.23
538	0.21
539	0.19
540	0.18
541	0.17
542	0.14
543	0.13
544	0.09
545	0.1
546	0.09
547	0.08
548	0.12
549	0.13
550	0.17
551	0.24
552	0.28
553	0.29
554	0.31
555	0.31
556	0.27
557	0.27
558	0.26
559	0.2
560	0.26
561	0.27
562	0.29
563	0.33
564	0.36
565	0.38
566	0.46
567	0.53
568	0.55
569	0.62
570	0.65
571	0.66
572	0.71
573	0.75
574	0.76
575	0.75
576	0.75
577	0.74
578	0.72
579	0.78
580	0.8
581	0.8
582	0.74
583	0.73
584	0.7
585	0.69
586	0.7
587	0.61
588	0.53
589	0.47
590	0.48
591	0.4
592	0.37
593	0.3
594	0.24
595	0.21
596	0.2
597	0.2
598	0.15
599	0.13
600	0.11
601	0.09
602	0.1
603	0.1
604	0.14
605	0.2
606	0.24
607	0.28
608	0.28
609	0.31
610	0.32
611	0.33
612	0.3
613	0.31
614	0.3
615	0.28
616	0.27
617	0.25
618	0.25
619	0.26
620	0.25
621	0.2
622	0.18
623	0.2
624	0.21
625	0.25
626	0.29
627	0.31
628	0.34
629	0.32
630	0.29
631	0.28
632	0.26
633	0.24
634	0.19
635	0.16
636	0.13
637	0.11
638	0.12
639	0.1
640	0.09
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.04
646	0.04
647	0.03
648	0.03
649	0.04
650	0.06
651	0.07
652	0.09
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.1
657	0.13
658	0.13
659	0.13
660	0.12
661	0.14
662	0.15
663	0.15
664	0.16
665	0.13
666	0.13
667	0.12
668	0.13
669	0.13
670	0.13
671	0.12
672	0.12
673	0.11
674	0.09
675	0.09
676	0.08
677	0.06
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.06
683	0.06
684	0.07
685	0.08
686	0.11
687	0.12
688	0.19
689	0.24
690	0.27
691	0.29
692	0.34
693	0.39
694	0.42
695	0.49
696	0.46
697	0.47
698	0.5
699	0.51
700	0.53
701	0.52
702	0.52
703	0.49
704	0.47
705	0.44
706	0.39
707	0.37
708	0.31
709	0.31
710	0.27
711	0.24
712	0.22
713	0.19
714	0.18
715	0.17
716	0.16
717	0.12
718	0.11
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.1
724	0.11
725	0.11
726	0.1
727	0.11
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.11
732	0.13
733	0.13
734	0.17
735	0.17
736	0.17
737	0.17
738	0.18
739	0.17
740	0.15
741	0.16
742	0.13
743	0.14
744	0.15
745	0.14
746	0.14
747	0.13
748	0.11
749	0.09
750	0.08
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.06
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.08
762	0.08
763	0.09
764	0.09
765	0.09
766	0.09
767	0.1
768	0.1
769	0.1
770	0.09
771	0.1
772	0.14
773	0.2
774	0.2
775	0.24
776	0.23
777	0.26
778	0.26
779	0.24
780	0.21
781	0.16
782	0.16
783	0.12
784	0.12
785	0.1
786	0.11
787	0.12
788	0.12
789	0.12
790	0.11
791	0.14
792	0.22
793	0.29
794	0.38
795	0.44
796	0.46
797	0.54
798	0.56
799	0.58
800	0.58
801	0.61
802	0.61
803	0.57
804	0.55
805	0.5
806	0.47
807	0.4
808	0.32
809	0.25
810	0.16
811	0.15
812	0.25
813	0.27
814	0.35
815	0.42
816	0.46
817	0.51
818	0.61
819	0.7
820	0.7
821	0.75
822	0.74
823	0.67
824	0.64
825	0.58
826	0.5
827	0.44
828	0.38
829	0.31
830	0.26
831	0.25
832	0.24
833	0.22
834	0.19
835	0.14
836	0.11
837	0.09
838	0.12
839	0.14
840	0.16
841	0.16
842	0.16
843	0.17
844	0.17
845	0.18
846	0.15
847	0.15
848	0.13
849	0.15
850	0.15
851	0.16
852	0.19
853	0.19
854	0.2
855	0.22
856	0.26
857	0.34
858	0.43
859	0.52
860	0.57
861	0.65
862	0.72
863	0.75
864	0.71
865	0.64
866	0.56
867	0.48
868	0.43
869	0.32
870	0.24
871	0.18
872	0.21
873	0.21
874	0.2
875	0.2
876	0.17
877	0.2
878	0.23
879	0.23
880	0.22
881	0.21
882	0.21
883	0.22
884	0.25
885	0.24
886	0.21
887	0.21
888	0.21
889	0.21
890	0.18
891	0.18
892	0.14
893	0.13
894	0.11
895	0.1
896	0.07
897	0.07
898	0.07
899	0.06
900	0.05
901	0.06
902	0.06
903	0.06
904	0.06
905	0.06
906	0.08
907	0.09
908	0.1
909	0.12
910	0.16
911	0.18
912	0.19
913	0.23
914	0.23

A3GHD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer