Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CR14

Protein Details
Accession P0CR14    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24SSDNTVAPKRKLKPARKQVASDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-15RKLKP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0036002  F:pre-mRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0045787  P:positive regulation of cell cycle  
GO:0033120  P:positive regulation of RNA splicing  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MSSDNTVAPKRKLKPARKQVASDEVDKSQGYQAGREYNIWYNKWAGGDREDALASKVHSQTRCIISRDAGYTRADATGNKYCCLFFARGCCPYGYECQYLHRLPLPSHQLPDNSRDCFGREKHADYRDDMGGVGSFNRQNRTLYIGKIQESPDKKQMTETLLRHFGEWGKIVKYNILFGRGVAFVTYETDHQASFAKEAMANQSMDGDEILNVRWATEDPNPGEKVAEEKRIEEIGQKAIAGMLDENLVEATQAVRALEDGDVEDFYHIETSKPEEEEENRPAKKGKSEGGFFNADALDNIKFYAELAKKQAEEEKEKARKVPAKQVGMSLLGGYGSGDESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.81
3 0.85
4 0.84
5 0.83
6 0.8
7 0.8
8 0.73
9 0.66
10 0.59
11 0.5
12 0.45
13 0.39
14 0.34
15 0.26
16 0.27
17 0.23
18 0.21
19 0.23
20 0.27
21 0.28
22 0.28
23 0.29
24 0.33
25 0.38
26 0.37
27 0.35
28 0.32
29 0.32
30 0.33
31 0.32
32 0.27
33 0.24
34 0.26
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.18
43 0.22
44 0.25
45 0.26
46 0.28
47 0.34
48 0.4
49 0.44
50 0.41
51 0.39
52 0.35
53 0.38
54 0.4
55 0.35
56 0.3
57 0.26
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.19
62 0.15
63 0.2
64 0.26
65 0.26
66 0.25
67 0.25
68 0.23
69 0.24
70 0.27
71 0.23
72 0.17
73 0.22
74 0.27
75 0.29
76 0.31
77 0.3
78 0.27
79 0.28
80 0.32
81 0.3
82 0.27
83 0.25
84 0.28
85 0.33
86 0.32
87 0.31
88 0.3
89 0.27
90 0.25
91 0.31
92 0.36
93 0.32
94 0.34
95 0.34
96 0.34
97 0.33
98 0.39
99 0.37
100 0.3
101 0.29
102 0.28
103 0.28
104 0.29
105 0.29
106 0.31
107 0.29
108 0.33
109 0.39
110 0.44
111 0.44
112 0.4
113 0.42
114 0.34
115 0.31
116 0.25
117 0.18
118 0.13
119 0.11
120 0.1
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.21
129 0.21
130 0.2
131 0.24
132 0.25
133 0.25
134 0.27
135 0.28
136 0.28
137 0.3
138 0.32
139 0.34
140 0.33
141 0.31
142 0.3
143 0.31
144 0.3
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.32
149 0.32
150 0.31
151 0.29
152 0.25
153 0.19
154 0.19
155 0.17
156 0.13
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.17
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.07
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.1
204 0.13
205 0.18
206 0.18
207 0.23
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.2
212 0.23
213 0.22
214 0.27
215 0.23
216 0.23
217 0.25
218 0.26
219 0.26
220 0.24
221 0.22
222 0.18
223 0.18
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.1
229 0.08
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.13
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.2
263 0.24
264 0.3
265 0.37
266 0.4
267 0.37
268 0.39
269 0.42
270 0.41
271 0.44
272 0.42
273 0.42
274 0.41
275 0.45
276 0.47
277 0.48
278 0.47
279 0.4
280 0.37
281 0.3
282 0.23
283 0.19
284 0.17
285 0.13
286 0.1
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.17
292 0.18
293 0.21
294 0.26
295 0.3
296 0.31
297 0.34
298 0.4
299 0.37
300 0.42
301 0.44
302 0.5
303 0.53
304 0.55
305 0.57
306 0.6
307 0.6
308 0.6
309 0.65
310 0.63
311 0.63
312 0.63
313 0.62
314 0.56
315 0.51
316 0.44
317 0.33
318 0.24
319 0.16
320 0.14
321 0.1
322 0.08