FuNGI

P0CO12

Protein Details

Accession

P0CO12

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
915-943	SAEFSRSPKRHRAQSPPRRYPERDDRPPP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
912-942	RPSSAEFSRSPKRHRAQSPPRRYPERDDRPP

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 10, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR045243 Rna14-like IPR008847 Suf IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0031124 P:mRNA 3'-end processing GO:0031123 P:RNA 3'-end processing
KEGG	cne:CNB02560 -
Pfam	View protein in Pfam PF05843 Suf

Amino Acid Sequences

MSHEHPAEIVHQLQSIDSIQQDLADTAAAVVDAASQSLPPQHAAQDQKSHSTLLDNAEAMESILESAIPAAPGSSSTAAASDAIGDNNFTASGPPPISNTVVAPSAADDETGDVIVVESETPTTTNVVEAVVNPENDGDVPIESTEQSSGQPAEQPTEQPTEQPTEQPAEQPAVETPQAPQSTPAAPAASAVESIPTTLEETHLEQIVQAPAPTVHTEPLTPVVDIKMEEKPMIEHVAWIPPQGIHSDVFLPEGLTEYSPSVSQNGELIRSWRADPSNPTLLLSLFNWAVQKTEVEDARAWYRVLAVDNPTAAQPLLALINLELALSNFAEVEAIFASTLKGSAGITTAADVSIWAAYLHYIRRQNPLTEGSANAADVRSTITEAYEFALRECGFDRESGDIWDEYIKFVASGPATNQWDTQAKNDNLRKIYQRAVCIPLNNIEALWKSYDNFESSLNKLTAKKYLAEKSPAYMTARTALRELRALSDPIPKPILPPYPTFTEQDRQVVGAWKACLRWEEGNPLVIENHELLQSRIGYALRKCLGEMRHFPELWHYAASYYSKLGKQDEAAEILEAGVNACPKSFLLTFAYAELQEERKAFPTCHSLYTTLISKLNPEVDELRQNVAREIDIARGPPIPGSEKAAVAAAVGDSIDADGNDISDIQRLVEEREQRGALVAQRRGKDIEELMVGISVVWIMYMRFARRAEGIKAARGVFGKARKSPHLTWQVFEASALMEYHTNKDAAVAIRIFELGLKQFSEDVDYVIKYLQFLLSINDDNNARALFERSVVRIMGDKARPLWDAWARYEYTYGDLSAVHKLEARMSEVFPEDAPLKRFAQRWSYNGIDQIAIRDLGFNRARMGVAAPPAFAIAPVLPPVHASIPAPIAVPTPVQPPQESYKRPAPEDIPPRRPSSAEFSRSPKRHRAQSPPRRYPERDDRPPPGRYRDSLPPVKAPSSIPPPPLAGPAYATPSSGAYGGDKDRSGLEKPLAWFMAQLPNARSFDGPVFRPDDIMKLFGGLSLPGAGMPPAPPISRGPPPPPMQSRGYYEPERDRRYGGHGSGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.16
4	0.14
5	0.14
6	0.12
7	0.13
8	0.14
9	0.12
10	0.11
11	0.09
12	0.08
13	0.06
14	0.07
15	0.06
16	0.04
17	0.04
18	0.05
19	0.05
20	0.05
21	0.06
22	0.05
23	0.07
24	0.11
25	0.12
26	0.13
27	0.15
28	0.18
29	0.25
30	0.32
31	0.37
32	0.42
33	0.44
34	0.48
35	0.47
36	0.45
37	0.38
38	0.35
39	0.32
40	0.28
41	0.28
42	0.22
43	0.22
44	0.21
45	0.21
46	0.17
47	0.14
48	0.09
49	0.06
50	0.06
51	0.05
52	0.04
53	0.05
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.06
59	0.07
60	0.1
61	0.11
62	0.11
63	0.11
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.11
68	0.1
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.1
74	0.1
75	0.1
76	0.08
77	0.08
78	0.09
79	0.13
80	0.15
81	0.15
82	0.17
83	0.2
84	0.22
85	0.21
86	0.21
87	0.19
88	0.18
89	0.17
90	0.15
91	0.13
92	0.14
93	0.13
94	0.12
95	0.1
96	0.1
97	0.11
98	0.1
99	0.09
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.06
108	0.06
109	0.07
110	0.08
111	0.08
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.1
117	0.15
118	0.17
119	0.17
120	0.16
121	0.16
122	0.15
123	0.15
124	0.15
125	0.1
126	0.07
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.09
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.12
136	0.13
137	0.12
138	0.17
139	0.17
140	0.2
141	0.2
142	0.22
143	0.23
144	0.28
145	0.27
146	0.24
147	0.26
148	0.29
149	0.29
150	0.29
151	0.28
152	0.27
153	0.28
154	0.29
155	0.28
156	0.24
157	0.23
158	0.22
159	0.2
160	0.19
161	0.19
162	0.17
163	0.16
164	0.21
165	0.22
166	0.21
167	0.22
168	0.2
169	0.21
170	0.23
171	0.23
172	0.16
173	0.15
174	0.16
175	0.16
176	0.13
177	0.12
178	0.1
179	0.09
180	0.08
181	0.09
182	0.08
183	0.07
184	0.08
185	0.08
186	0.09
187	0.1
188	0.13
189	0.15
190	0.15
191	0.14
192	0.13
193	0.16
194	0.17
195	0.15
196	0.12
197	0.11
198	0.11
199	0.13
200	0.15
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.14
206	0.19
207	0.18
208	0.16
209	0.15
210	0.15
211	0.15
212	0.16
213	0.17
214	0.15
215	0.15
216	0.16
217	0.15
218	0.16
219	0.17
220	0.19
221	0.17
222	0.15
223	0.15
224	0.21
225	0.2
226	0.2
227	0.18
228	0.15
229	0.16
230	0.15
231	0.15
232	0.1
233	0.11
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.11
239	0.09
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.1
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.11
252	0.11
253	0.13
254	0.13
255	0.14
256	0.15
257	0.17
258	0.17
259	0.19
260	0.2
261	0.22
262	0.26
263	0.31
264	0.34
265	0.33
266	0.33
267	0.29
268	0.27
269	0.26
270	0.21
271	0.17
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.11
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.1
280	0.15
281	0.15
282	0.16
283	0.17
284	0.19
285	0.21
286	0.22
287	0.2
288	0.15
289	0.15
290	0.14
291	0.15
292	0.15
293	0.16
294	0.16
295	0.16
296	0.16
297	0.15
298	0.14
299	0.12
300	0.09
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.06
346	0.08
347	0.13
348	0.19
349	0.21
350	0.28
351	0.3
352	0.31
353	0.33
354	0.34
355	0.32
356	0.28
357	0.26
358	0.21
359	0.19
360	0.18
361	0.15
362	0.11
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.13
377	0.12
378	0.13
379	0.14
380	0.15
381	0.13
382	0.13
383	0.15
384	0.12
385	0.13
386	0.13
387	0.13
388	0.11
389	0.11
390	0.13
391	0.12
392	0.1
393	0.1
394	0.09
395	0.07
396	0.07
397	0.1
398	0.07
399	0.08
400	0.09
401	0.15
402	0.17
403	0.17
404	0.17
405	0.17
406	0.2
407	0.2
408	0.22
409	0.26
410	0.25
411	0.33
412	0.37
413	0.4
414	0.38
415	0.41
416	0.41
417	0.36
418	0.41
419	0.36
420	0.36
421	0.34
422	0.37
423	0.35
424	0.32
425	0.3
426	0.26
427	0.23
428	0.2
429	0.17
430	0.13
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.09
435	0.08
436	0.1
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.13
441	0.15
442	0.16
443	0.19
444	0.18
445	0.19
446	0.2
447	0.2
448	0.23
449	0.21
450	0.23
451	0.25
452	0.3
453	0.31
454	0.33
455	0.33
456	0.3
457	0.3
458	0.28
459	0.25
460	0.2
461	0.18
462	0.18
463	0.19
464	0.18
465	0.18
466	0.17
467	0.15
468	0.17
469	0.16
470	0.14
471	0.14
472	0.15
473	0.15
474	0.23
475	0.22
476	0.22
477	0.23
478	0.2
479	0.2
480	0.23
481	0.28
482	0.21
483	0.23
484	0.24
485	0.27
486	0.29
487	0.3
488	0.28
489	0.26
490	0.26
491	0.26
492	0.23
493	0.18
494	0.18
495	0.2
496	0.18
497	0.16
498	0.15
499	0.14
500	0.14
501	0.14
502	0.14
503	0.13
504	0.15
505	0.14
506	0.18
507	0.18
508	0.2
509	0.19
510	0.19
511	0.16
512	0.13
513	0.12
514	0.08
515	0.08
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.09
523	0.09
524	0.1
525	0.1
526	0.16
527	0.15
528	0.15
529	0.15
530	0.18
531	0.21
532	0.23
533	0.28
534	0.27
535	0.3
536	0.3
537	0.3
538	0.3
539	0.29
540	0.25
541	0.2
542	0.16
543	0.12
544	0.13
545	0.14
546	0.1
547	0.09
548	0.11
549	0.12
550	0.13
551	0.14
552	0.14
553	0.14
554	0.16
555	0.16
556	0.15
557	0.14
558	0.12
559	0.11
560	0.1
561	0.09
562	0.06
563	0.05
564	0.04
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.11
574	0.13
575	0.13
576	0.14
577	0.15
578	0.12
579	0.12
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.1
585	0.13
586	0.14
587	0.14
588	0.15
589	0.21
590	0.21
591	0.23
592	0.24
593	0.22
594	0.22
595	0.24
596	0.24
597	0.19
598	0.19
599	0.16
600	0.15
601	0.15
602	0.17
603	0.14
604	0.14
605	0.14
606	0.15
607	0.19
608	0.19
609	0.2
610	0.2
611	0.2
612	0.19
613	0.17
614	0.15
615	0.12
616	0.12
617	0.12
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.12
623	0.11
624	0.11
625	0.12
626	0.12
627	0.16
628	0.16
629	0.15
630	0.16
631	0.15
632	0.14
633	0.1
634	0.1
635	0.05
636	0.04
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.06
653	0.07
654	0.1
655	0.14
656	0.18
657	0.18
658	0.21
659	0.21
660	0.2
661	0.21
662	0.19
663	0.19
664	0.22
665	0.26
666	0.28
667	0.29
668	0.3
669	0.31
670	0.3
671	0.28
672	0.22
673	0.19
674	0.14
675	0.14
676	0.12
677	0.11
678	0.1
679	0.07
680	0.06
681	0.04
682	0.03
683	0.02
684	0.03
685	0.02
686	0.05
687	0.07
688	0.09
689	0.13
690	0.13
691	0.15
692	0.18
693	0.22
694	0.22
695	0.28
696	0.29
697	0.27
698	0.3
699	0.29
700	0.28
701	0.25
702	0.24
703	0.21
704	0.25
705	0.28
706	0.29
707	0.33
708	0.35
709	0.42
710	0.43
711	0.47
712	0.52
713	0.48
714	0.44
715	0.44
716	0.41
717	0.34
718	0.31
719	0.22
720	0.11
721	0.11
722	0.11
723	0.08
724	0.08
725	0.09
726	0.12
727	0.12
728	0.12
729	0.11
730	0.12
731	0.14
732	0.13
733	0.15
734	0.13
735	0.12
736	0.13
737	0.13
738	0.12
739	0.09
740	0.09
741	0.08
742	0.09
743	0.08
744	0.09
745	0.09
746	0.09
747	0.12
748	0.11
749	0.11
750	0.12
751	0.12
752	0.12
753	0.12
754	0.12
755	0.09
756	0.09
757	0.08
758	0.07
759	0.07
760	0.09
761	0.11
762	0.12
763	0.12
764	0.14
765	0.14
766	0.14
767	0.15
768	0.13
769	0.1
770	0.1
771	0.12
772	0.11
773	0.13
774	0.15
775	0.15
776	0.17
777	0.16
778	0.16
779	0.16
780	0.18
781	0.22
782	0.22
783	0.23
784	0.23
785	0.25
786	0.26
787	0.23
788	0.28
789	0.26
790	0.27
791	0.28
792	0.3
793	0.29
794	0.28
795	0.29
796	0.23
797	0.2
798	0.18
799	0.15
800	0.12
801	0.12
802	0.13
803	0.15
804	0.15
805	0.13
806	0.14
807	0.14
808	0.17
809	0.17
810	0.19
811	0.17
812	0.17
813	0.19
814	0.18
815	0.19
816	0.16
817	0.17
818	0.15
819	0.17
820	0.19
821	0.2
822	0.21
823	0.25
824	0.29
825	0.31
826	0.39
827	0.41
828	0.41
829	0.44
830	0.45
831	0.42
832	0.41
833	0.38
834	0.29
835	0.24
836	0.24
837	0.19
838	0.16
839	0.14
840	0.14
841	0.13
842	0.2
843	0.22
844	0.21
845	0.21
846	0.21
847	0.21
848	0.19
849	0.2
850	0.15
851	0.18
852	0.18
853	0.17
854	0.16
855	0.16
856	0.15
857	0.13
858	0.11
859	0.06
860	0.07
861	0.09
862	0.09
863	0.08
864	0.09
865	0.11
866	0.11
867	0.12
868	0.11
869	0.12
870	0.13
871	0.14
872	0.14
873	0.12
874	0.12
875	0.12
876	0.12
877	0.12
878	0.15
879	0.19
880	0.2
881	0.21
882	0.24
883	0.31
884	0.39
885	0.42
886	0.43
887	0.47
888	0.5
889	0.52
890	0.53
891	0.48
892	0.49
893	0.56
894	0.6
895	0.6
896	0.59
897	0.61
898	0.58
899	0.55
900	0.49
901	0.48
902	0.48
903	0.45
904	0.46
905	0.49
906	0.58
907	0.63
908	0.66
909	0.67
910	0.65
911	0.69
912	0.73
913	0.77
914	0.78
915	0.83
916	0.87
917	0.88
918	0.89
919	0.87
920	0.83
921	0.82
922	0.82
923	0.81
924	0.8
925	0.78
926	0.78
927	0.76
928	0.79
929	0.76
930	0.74
931	0.69
932	0.61
933	0.6
934	0.61
935	0.63
936	0.64
937	0.61
938	0.59
939	0.58
940	0.56
941	0.52
942	0.44
943	0.43
944	0.43
945	0.44
946	0.39
947	0.37
948	0.38
949	0.37
950	0.38
951	0.32
952	0.24
953	0.22
954	0.22
955	0.26
956	0.23
957	0.22
958	0.19
959	0.18
960	0.19
961	0.16
962	0.15
963	0.1
964	0.14
965	0.17
966	0.19
967	0.19
968	0.19
969	0.21
970	0.24
971	0.25
972	0.26
973	0.26
974	0.28
975	0.3
976	0.35
977	0.33
978	0.29
979	0.27
980	0.25
981	0.31
982	0.29
983	0.31
984	0.28
985	0.34
986	0.35
987	0.35
988	0.32
989	0.26
990	0.3
991	0.32
992	0.31
993	0.29
994	0.32
995	0.31
996	0.33
997	0.31
998	0.31
999	0.27
1000	0.27
1001	0.22
1002	0.19
1003	0.19
1004	0.17
1005	0.17
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.08
1015	0.11
1016	0.13
1017	0.14
1018	0.16
1019	0.2
1020	0.26
1021	0.33
1022	0.39
1023	0.4
1024	0.47
1025	0.51
1026	0.59
1027	0.62
1028	0.61
1029	0.58
1030	0.57
1031	0.59
1032	0.57
1033	0.59
1034	0.54
1035	0.55
1036	0.61
1037	0.65
1038	0.67
1039	0.62
1040	0.58
1041	0.53
1042	0.56
1043	0.56
1044	0.51

P0CO12

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer