Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CS40

Protein Details
Accession P0CS40    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-363EPDSDEEKSKKKKKDNGMKDMSRGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-352SKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.833, cyto 8, cyto_mito 6.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR017422  WDR55  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MPDIKLKNQASLCASTRLFLAYTSIKPFDVAFHPKEPVVFSSLLTGQVCAWSYDDATGETSSSWSVRPSKRTARALSIEENGDEIWMGGKSGSLLCALTPPKVIQLSTRDGSMTRERDSAHECPINRVYCVNRNLVATGDDDGVIKLWDPRQADSIRTYSQHFDYISDFTYFDDKRQLVATSGDGHLSVIDIRSNKSTPLTVSEDQEDELLSIVPIKGGQKAIVGSGLGILSVWNRQMGWADSVDRIPGHPASIDAIVALTPDIIATGSEDGMIRVIQVLPHKFLGVVATHEEFPVERIRLDRNNKWLGSVSHDECLKLTDVEDLFEDSDEDDEMEEDEPDSDEEKSKKKKKDNGMKDMSRGQAENDGSFFADL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.33
3 0.32
4 0.29
5 0.24
6 0.18
7 0.2
8 0.18
9 0.21
10 0.26
11 0.27
12 0.25
13 0.25
14 0.26
15 0.25
16 0.27
17 0.31
18 0.31
19 0.33
20 0.35
21 0.35
22 0.36
23 0.34
24 0.29
25 0.26
26 0.22
27 0.18
28 0.2
29 0.21
30 0.23
31 0.21
32 0.19
33 0.15
34 0.17
35 0.17
36 0.14
37 0.14
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.13
42 0.11
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.13
52 0.21
53 0.27
54 0.33
55 0.4
56 0.49
57 0.58
58 0.65
59 0.65
60 0.64
61 0.64
62 0.62
63 0.58
64 0.51
65 0.43
66 0.35
67 0.32
68 0.23
69 0.18
70 0.13
71 0.09
72 0.07
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.22
93 0.27
94 0.26
95 0.26
96 0.23
97 0.22
98 0.26
99 0.3
100 0.28
101 0.24
102 0.26
103 0.26
104 0.29
105 0.34
106 0.32
107 0.3
108 0.31
109 0.29
110 0.32
111 0.37
112 0.35
113 0.3
114 0.3
115 0.28
116 0.32
117 0.35
118 0.32
119 0.28
120 0.27
121 0.27
122 0.25
123 0.22
124 0.15
125 0.13
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.19
139 0.2
140 0.22
141 0.23
142 0.25
143 0.22
144 0.23
145 0.24
146 0.21
147 0.21
148 0.21
149 0.19
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.13
156 0.11
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.18
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.04
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.1
186 0.15
187 0.2
188 0.19
189 0.2
190 0.21
191 0.21
192 0.2
193 0.19
194 0.15
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.08
265 0.13
266 0.15
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.17
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.12
281 0.13
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.16
286 0.22
287 0.3
288 0.38
289 0.43
290 0.46
291 0.53
292 0.52
293 0.52
294 0.5
295 0.43
296 0.42
297 0.43
298 0.37
299 0.33
300 0.34
301 0.32
302 0.28
303 0.29
304 0.23
305 0.16
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.17
311 0.16
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.16
331 0.2
332 0.29
333 0.39
334 0.47
335 0.56
336 0.65
337 0.73
338 0.79
339 0.86
340 0.88
341 0.88
342 0.9
343 0.86
344 0.82
345 0.8
346 0.73
347 0.65
348 0.55
349 0.46
350 0.43
351 0.39
352 0.35
353 0.28
354 0.25