Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KNJ9

Protein Details
Accession Q5KNJ9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
859-880YEKSLKTRKGWRMKGVGQQREKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
845-882RAKDIKKVKWIAAGYEKSLKTRKGWRMKGVGQQREKSR
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG cne:CNA06230  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
Amino Acid Sequences MLRPSIVRKVARIRHARLACQNLHTQDTYPPSFHSLSEKSTTQTSSERNFPLYKPQKHAQEIPLTADTLAALPSEQALSRQLKRRVTQKAVENLPEFTEDELRDFYAALVKSGSKDNGGIYQALEAPSETKKIPMPKKEREEILTGMAGRLVGEGGLALPNGSTRYGKSLELVVNENQSSDAPYAILDVLSQAAILSGPSETSKGKAMEGQLPLRSLEVPLGLVTSKEWDALFQEFIRKGDAAAAESLLDIMDAHGVPVGIERINSVIHVYALQGRSEDVARLTLDVTAMGETVSSDQQDDYILSILRQTPSNPGPAIARLRQAEIAGTPFPQSSYQVVISHLTSPSSIVQPNSHTRAVAWDLFAHMRLTAHPTPTRELYTTMIKSCGEASQPEPERARDLWIEMTEQEKIEPSTEAYNAIIKSLGSTKKDYLEAFDLLRQMLVKHNEAVFVPFEEEDGIPRFSEYVPTLETFASVLEGTKRAGDVNRARWVLSEVIKLSRAGQALNVPKWKEGPSGDLMAAVFMTYAAWNPVLRKREVKMKQASEKPYGAASETAVVEKEEHRLSKGEEFLNVDVLQDVVEPSAGSSSIEYTLEEPPVNDFFTPLSSADAIRECTSLFHRILSDIQSSSSTSDFLPFRHVYITPKLINSYISVYNAHGPSLSSVKDVYDTVWEEASSVTGRSVRPNAWTFIPLLEKCASGSRGGIYPADRSLALSWGRALWSSYLAFFKSASSELASIPSSEHLTIQRRKYLFGLGDRQTEKMWKAVIKLEALHGDVDEAMRLLEEFHATYKPSAITQLYAPLPEVGLQLKMFTPAMTPEADVPPLLLFDDIKPLHQRLVREARAKDIKKVKWIAAGYEKSLKTRKGWRMKGVGQQREKSRAKDLERLLAQQGEMERLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.71
3 0.72
4 0.71
5 0.71
6 0.66
7 0.61
8 0.62
9 0.55
10 0.55
11 0.48
12 0.41
13 0.38
14 0.41
15 0.39
16 0.34
17 0.32
18 0.33
19 0.33
20 0.32
21 0.34
22 0.3
23 0.32
24 0.36
25 0.36
26 0.33
27 0.36
28 0.36
29 0.31
30 0.34
31 0.36
32 0.36
33 0.42
34 0.42
35 0.43
36 0.45
37 0.43
38 0.48
39 0.52
40 0.55
41 0.55
42 0.6
43 0.64
44 0.67
45 0.73
46 0.69
47 0.68
48 0.62
49 0.6
50 0.54
51 0.45
52 0.39
53 0.32
54 0.24
55 0.15
56 0.14
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.14
65 0.21
66 0.28
67 0.37
68 0.44
69 0.51
70 0.56
71 0.64
72 0.68
73 0.7
74 0.7
75 0.7
76 0.72
77 0.7
78 0.7
79 0.63
80 0.54
81 0.48
82 0.42
83 0.34
84 0.27
85 0.26
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.19
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.2
100 0.21
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.21
105 0.22
106 0.21
107 0.17
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.16
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.16
116 0.14
117 0.15
118 0.19
119 0.29
120 0.38
121 0.46
122 0.54
123 0.61
124 0.69
125 0.74
126 0.74
127 0.68
128 0.64
129 0.55
130 0.49
131 0.41
132 0.33
133 0.26
134 0.22
135 0.18
136 0.13
137 0.11
138 0.08
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.14
153 0.17
154 0.17
155 0.18
156 0.22
157 0.23
158 0.24
159 0.27
160 0.24
161 0.25
162 0.25
163 0.24
164 0.19
165 0.17
166 0.16
167 0.13
168 0.12
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.18
194 0.21
195 0.25
196 0.29
197 0.32
198 0.29
199 0.29
200 0.28
201 0.26
202 0.23
203 0.17
204 0.13
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.13
219 0.15
220 0.12
221 0.18
222 0.18
223 0.19
224 0.2
225 0.18
226 0.16
227 0.18
228 0.18
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.03
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.16
298 0.18
299 0.22
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.22
304 0.26
305 0.22
306 0.25
307 0.22
308 0.23
309 0.23
310 0.22
311 0.19
312 0.15
313 0.15
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.12
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.13
338 0.17
339 0.22
340 0.25
341 0.24
342 0.22
343 0.21
344 0.23
345 0.25
346 0.21
347 0.17
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.15
352 0.12
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.15
357 0.15
358 0.18
359 0.2
360 0.22
361 0.24
362 0.26
363 0.27
364 0.21
365 0.21
366 0.2
367 0.24
368 0.23
369 0.22
370 0.21
371 0.19
372 0.19
373 0.18
374 0.16
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.19
379 0.2
380 0.23
381 0.24
382 0.23
383 0.25
384 0.24
385 0.25
386 0.17
387 0.17
388 0.16
389 0.15
390 0.15
391 0.12
392 0.13
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.12
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.08
410 0.08
411 0.13
412 0.16
413 0.15
414 0.17
415 0.18
416 0.2
417 0.22
418 0.22
419 0.19
420 0.19
421 0.18
422 0.16
423 0.16
424 0.15
425 0.13
426 0.13
427 0.1
428 0.08
429 0.12
430 0.13
431 0.13
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.15
436 0.16
437 0.11
438 0.09
439 0.09
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.08
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.15
472 0.19
473 0.24
474 0.3
475 0.3
476 0.3
477 0.29
478 0.3
479 0.26
480 0.23
481 0.2
482 0.15
483 0.15
484 0.16
485 0.16
486 0.15
487 0.15
488 0.14
489 0.11
490 0.11
491 0.16
492 0.2
493 0.23
494 0.25
495 0.23
496 0.23
497 0.25
498 0.25
499 0.23
500 0.19
501 0.19
502 0.18
503 0.19
504 0.19
505 0.17
506 0.16
507 0.13
508 0.12
509 0.08
510 0.05
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.08
519 0.13
520 0.16
521 0.18
522 0.22
523 0.23
524 0.33
525 0.39
526 0.45
527 0.49
528 0.53
529 0.59
530 0.63
531 0.66
532 0.6
533 0.55
534 0.47
535 0.39
536 0.32
537 0.25
538 0.18
539 0.13
540 0.11
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.09
547 0.12
548 0.12
549 0.12
550 0.14
551 0.15
552 0.17
553 0.2
554 0.24
555 0.21
556 0.2
557 0.22
558 0.21
559 0.22
560 0.2
561 0.16
562 0.11
563 0.11
564 0.09
565 0.06
566 0.06
567 0.04
568 0.04
569 0.03
570 0.03
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.05
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.09
580 0.1
581 0.11
582 0.11
583 0.1
584 0.12
585 0.13
586 0.13
587 0.11
588 0.1
589 0.09
590 0.1
591 0.11
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.11
597 0.12
598 0.13
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.12
603 0.15
604 0.18
605 0.17
606 0.16
607 0.15
608 0.17
609 0.18
610 0.19
611 0.19
612 0.15
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.15
617 0.14
618 0.12
619 0.09
620 0.13
621 0.13
622 0.13
623 0.19
624 0.18
625 0.19
626 0.2
627 0.21
628 0.21
629 0.26
630 0.31
631 0.27
632 0.27
633 0.28
634 0.26
635 0.26
636 0.23
637 0.21
638 0.17
639 0.17
640 0.16
641 0.16
642 0.21
643 0.2
644 0.19
645 0.15
646 0.14
647 0.14
648 0.16
649 0.15
650 0.11
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.12
655 0.11
656 0.13
657 0.14
658 0.15
659 0.15
660 0.14
661 0.13
662 0.13
663 0.14
664 0.1
665 0.08
666 0.08
667 0.11
668 0.12
669 0.16
670 0.19
671 0.19
672 0.25
673 0.27
674 0.29
675 0.27
676 0.28
677 0.24
678 0.24
679 0.29
680 0.23
681 0.24
682 0.23
683 0.21
684 0.21
685 0.24
686 0.22
687 0.16
688 0.17
689 0.15
690 0.16
691 0.17
692 0.18
693 0.15
694 0.16
695 0.16
696 0.16
697 0.15
698 0.14
699 0.14
700 0.17
701 0.16
702 0.15
703 0.15
704 0.15
705 0.15
706 0.14
707 0.14
708 0.1
709 0.12
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.15
714 0.15
715 0.14
716 0.14
717 0.13
718 0.13
719 0.13
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.15
724 0.15
725 0.13
726 0.13
727 0.13
728 0.13
729 0.13
730 0.14
731 0.18
732 0.27
733 0.34
734 0.38
735 0.44
736 0.43
737 0.44
738 0.44
739 0.44
740 0.41
741 0.41
742 0.44
743 0.4
744 0.47
745 0.46
746 0.46
747 0.41
748 0.4
749 0.34
750 0.29
751 0.29
752 0.24
753 0.25
754 0.3
755 0.32
756 0.29
757 0.29
758 0.29
759 0.27
760 0.26
761 0.23
762 0.17
763 0.14
764 0.13
765 0.12
766 0.09
767 0.07
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.06
773 0.08
774 0.08
775 0.1
776 0.12
777 0.14
778 0.14
779 0.16
780 0.16
781 0.15
782 0.19
783 0.18
784 0.18
785 0.18
786 0.23
787 0.22
788 0.21
789 0.22
790 0.18
791 0.17
792 0.16
793 0.17
794 0.12
795 0.13
796 0.12
797 0.13
798 0.12
799 0.15
800 0.14
801 0.12
802 0.12
803 0.12
804 0.14
805 0.14
806 0.14
807 0.15
808 0.18
809 0.18
810 0.17
811 0.15
812 0.13
813 0.13
814 0.13
815 0.1
816 0.09
817 0.09
818 0.18
819 0.17
820 0.21
821 0.25
822 0.26
823 0.32
824 0.34
825 0.35
826 0.36
827 0.47
828 0.51
829 0.54
830 0.54
831 0.57
832 0.65
833 0.65
834 0.64
835 0.64
836 0.61
837 0.63
838 0.67
839 0.61
840 0.59
841 0.58
842 0.56
843 0.56
844 0.54
845 0.49
846 0.52
847 0.5
848 0.48
849 0.53
850 0.49
851 0.46
852 0.53
853 0.59
854 0.61
855 0.69
856 0.72
857 0.75
858 0.79
859 0.82
860 0.82
861 0.81
862 0.79
863 0.79
864 0.77
865 0.78
866 0.76
867 0.71
868 0.7
869 0.69
870 0.66
871 0.67
872 0.64
873 0.64
874 0.62
875 0.61
876 0.55
877 0.48
878 0.42
879 0.36
880 0.33