Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0G2FTJ0

Protein Details
Accession A0A0G2FTJ0    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-32GSDHEEVRPKKSKRKHRHEGEGDKMDVBasic
34-104GAPNATETPKKEKRKHKEKKRKERPETADTEDVEAEPAASPEKKRKKHKSTDKKEKKSKHHRSAASPEKPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-24RPKKSKRKHRHE
42-58PKKEKRKHKEKKRKERP
74-102PEKKRKKHKSTDKKEKKSKHHRSAASPEK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
Amino Acid Sequences MSTDMGSDHEEVRPKKSKRKHRHEGEGDKMDVDGAPNATETPKKEKRKHKEKKRKERPETADTEDVEAEPAASPEKKRKKHKSTDKKEKKSKHHRSAASPEKPAEQAERKEEAHEAIVPDPKEYPFFMQTFSQRIPIWPAAFDEPLTKTAREYLDPMLNRYSPKFKGVLLAYKNVNLSEQPRRADREDPPTDDTPVVLESVECYAPPFAWLTADLHLFIPSRGAWMEGVINLQSEGHIGVVCFDKFNASISRRSLPRGWTWVDQPEEEEPEPEPVAAEDPFVEGQEDGEGEEGKKAELPQLRSSGYWLDRKGDKVRGKIYFRIKNFSSGSTGDYTYLSLQGTMLDDEAERESVAEEKAVEKARRARQSPGGLLYPTMRLPEFSMTKLKDESI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.56
3 0.64
4 0.72
5 0.75
6 0.85
7 0.88
8 0.88
9 0.93
10 0.94
11 0.94
12 0.92
13 0.88
14 0.78
15 0.67
16 0.56
17 0.45
18 0.35
19 0.26
20 0.18
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.13
26 0.17
27 0.19
28 0.27
29 0.36
30 0.46
31 0.56
32 0.66
33 0.75
34 0.83
35 0.9
36 0.92
37 0.93
38 0.94
39 0.97
40 0.97
41 0.97
42 0.96
43 0.96
44 0.92
45 0.9
46 0.85
47 0.81
48 0.75
49 0.65
50 0.57
51 0.47
52 0.38
53 0.29
54 0.22
55 0.16
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.14
61 0.24
62 0.35
63 0.43
64 0.54
65 0.65
66 0.73
67 0.82
68 0.9
69 0.91
70 0.93
71 0.96
72 0.96
73 0.96
74 0.95
75 0.94
76 0.94
77 0.94
78 0.93
79 0.93
80 0.91
81 0.86
82 0.85
83 0.85
84 0.85
85 0.8
86 0.73
87 0.63
88 0.56
89 0.51
90 0.44
91 0.41
92 0.37
93 0.35
94 0.36
95 0.39
96 0.37
97 0.37
98 0.37
99 0.31
100 0.25
101 0.23
102 0.19
103 0.17
104 0.2
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.23
117 0.26
118 0.25
119 0.26
120 0.22
121 0.22
122 0.26
123 0.26
124 0.24
125 0.2
126 0.21
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.16
131 0.14
132 0.17
133 0.18
134 0.16
135 0.14
136 0.18
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.23
142 0.24
143 0.25
144 0.24
145 0.24
146 0.24
147 0.24
148 0.26
149 0.21
150 0.24
151 0.23
152 0.2
153 0.24
154 0.25
155 0.3
156 0.26
157 0.29
158 0.27
159 0.28
160 0.28
161 0.22
162 0.21
163 0.14
164 0.17
165 0.21
166 0.24
167 0.24
168 0.26
169 0.3
170 0.32
171 0.36
172 0.36
173 0.38
174 0.37
175 0.39
176 0.41
177 0.38
178 0.37
179 0.32
180 0.28
181 0.18
182 0.15
183 0.11
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.11
234 0.15
235 0.16
236 0.2
237 0.23
238 0.28
239 0.29
240 0.32
241 0.33
242 0.31
243 0.33
244 0.35
245 0.36
246 0.33
247 0.34
248 0.37
249 0.35
250 0.32
251 0.29
252 0.26
253 0.27
254 0.24
255 0.22
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.15
260 0.13
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.06
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.15
284 0.2
285 0.25
286 0.28
287 0.32
288 0.33
289 0.31
290 0.33
291 0.33
292 0.33
293 0.34
294 0.31
295 0.32
296 0.34
297 0.39
298 0.43
299 0.46
300 0.47
301 0.48
302 0.54
303 0.58
304 0.6
305 0.63
306 0.67
307 0.66
308 0.63
309 0.64
310 0.57
311 0.57
312 0.54
313 0.48
314 0.42
315 0.34
316 0.34
317 0.29
318 0.29
319 0.22
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.16
324 0.13
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.11
344 0.16
345 0.24
346 0.25
347 0.29
348 0.38
349 0.47
350 0.55
351 0.57
352 0.59
353 0.61
354 0.68
355 0.67
356 0.63
357 0.57
358 0.48
359 0.47
360 0.42
361 0.36
362 0.28
363 0.25
364 0.2
365 0.18
366 0.2
367 0.26
368 0.27
369 0.27
370 0.35
371 0.35
372 0.38