FuNGI

P0CQ92

Protein Details

Accession

P0CQ92

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-112	DDIIERKRGKPIRAFKDRKRKRDEDATSE	Basic
691-711	KEKLKRGKYDGLSRRLKRRKM	Basic
744-773	EPQPRLEKAGKGKDKKKGKARRVTGGKGSA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-105	RKRGKPIRAFKDRKRKR
686-712	SAEKEKEKLKRGKYDGLSRRLKRRKMA
722-808	AARKTEMGIRAAKKNALPKKITEPQPRLEKAGKGKDKKKGKARRVTGGKGSAFDSEGKKSHEGMRAKPAKVNLEKGKKKGGKGKGRK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000027 P:ribosomal large subunit assembly GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	cne:CND02650 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17947 DEADc_DDX27 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MIIHSSSSNSKKEYTMADDFITTIDSDDEVSNYGEPSALPKIKDDELDPDFQFDLGGGRSEGLDLWGGDEVQGVKKGNEPINVDDIIERKRGKPIRAFKDRKRKRDEDATSEDDLEEDEEEEGDSNDDSDAAKSGDSEEDEMDVDMSEGDGDEEDENEIESLKREDESDEEEEEEEDDYDEEGENEVVDSDSESEEETAAEIARKDAFFSSDPTTTDPTLPSSFTAMNLSRPLLRALTSLQFTAPTPIQARAIPLALLGRDILGSAVTGSGKTAAFMVPILERLCYRDRGKGGAACRVLVLCPTRELAVQCEAVGKALAEKGGLDVRFALLVGGLSLNAQAHTLRTLPDILIATPGRLIDHLTNTPSFTLSALDVLVIDEADRMLEAGFTDELEEIIKACPRSRQTMLFSATMTDSVDELVKLSLDKPIRVFVDPKRNTARGLTQEFVRIRSDDSRSPSLLALCKRTIREKCIIFFRSKALAHQMRIVFGLFGLKAAELHGNLTQEQRLQALNDFKAGTVDYLLATDLASRGLDIKGVETVINYDMPGQLAQYTHRVGRTARAGRKGRSVSLVGEADRKMLKAAIKQAEADQVRHRIIPSEAVTAMKEKLEEFKDDIQEILKEEKEEKLLRQADMEIKKGQNMVEHEAEIFSRPARTWFQSGKEKQASKSAGKDAYVGSFPSTGKSAEKEKEKLKRGKYDGLSRRLKRRKMAIEEDAADAAAARKTEMGIRAAKKNALPKKITEPQPRLEKAGKGKDKKKGKARRVTGGKGSAFDSEGKKSHEGMRAKPAKVNLEKGKKKGGKGKGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.39
3	0.37
4	0.35
5	0.33
6	0.32
7	0.28
8	0.24
9	0.16
10	0.11
11	0.09
12	0.08
13	0.1
14	0.1
15	0.1
16	0.11
17	0.12
18	0.12
19	0.11
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.13
24	0.2
25	0.22
26	0.22
27	0.25
28	0.3
29	0.32
30	0.34
31	0.32
32	0.31
33	0.32
34	0.36
35	0.34
36	0.32
37	0.29
38	0.27
39	0.25
40	0.17
41	0.15
42	0.11
43	0.12
44	0.09
45	0.09
46	0.1
47	0.1
48	0.1
49	0.09
50	0.1
51	0.08
52	0.09
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.16
60	0.16
61	0.16
62	0.21
63	0.28
64	0.31
65	0.35
66	0.37
67	0.37
68	0.4
69	0.39
70	0.35
71	0.3
72	0.29
73	0.27
74	0.29
75	0.27
76	0.24
77	0.34
78	0.4
79	0.45
80	0.51
81	0.59
82	0.63
83	0.73
84	0.8
85	0.81
86	0.86
87	0.89
88	0.89
89	0.89
90	0.84
91	0.81
92	0.83
93	0.81
94	0.78
95	0.76
96	0.71
97	0.63
98	0.58
99	0.49
100	0.37
101	0.3
102	0.22
103	0.14
104	0.09
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.07
117	0.08
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.09
122	0.11
123	0.11
124	0.12
125	0.11
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.11
130	0.09
131	0.08
132	0.06
133	0.05
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.06
147	0.08
148	0.09
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.13
154	0.18
155	0.2
156	0.19
157	0.2
158	0.19
159	0.19
160	0.18
161	0.16
162	0.11
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.05
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.11
194	0.14
195	0.13
196	0.17
197	0.2
198	0.2
199	0.21
200	0.22
201	0.25
202	0.23
203	0.23
204	0.2
205	0.2
206	0.19
207	0.19
208	0.17
209	0.17
210	0.16
211	0.15
212	0.19
213	0.16
214	0.17
215	0.18
216	0.19
217	0.17
218	0.18
219	0.19
220	0.15
221	0.15
222	0.13
223	0.15
224	0.17
225	0.17
226	0.16
227	0.15
228	0.15
229	0.14
230	0.17
231	0.15
232	0.14
233	0.14
234	0.15
235	0.17
236	0.17
237	0.18
238	0.16
239	0.16
240	0.13
241	0.11
242	0.11
243	0.09
244	0.09
245	0.07
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.03
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.06
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.12
271	0.15
272	0.2
273	0.21
274	0.25
275	0.26
276	0.29
277	0.31
278	0.32
279	0.31
280	0.32
281	0.31
282	0.25
283	0.24
284	0.21
285	0.18
286	0.17
287	0.17
288	0.1
289	0.11
290	0.11
291	0.12
292	0.13
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.14
297	0.13
298	0.14
299	0.13
300	0.12
301	0.11
302	0.09
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.07
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.07
335	0.09
336	0.1
337	0.09
338	0.12
339	0.11
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.07
347	0.1
348	0.11
349	0.13
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.12
354	0.11
355	0.08
356	0.08
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.02
370	0.02
371	0.02
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.04
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.04
383	0.05
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.12
388	0.14
389	0.19
390	0.21
391	0.25
392	0.27
393	0.33
394	0.35
395	0.31
396	0.29
397	0.25
398	0.23
399	0.18
400	0.15
401	0.09
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.04
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.11
415	0.14
416	0.16
417	0.17
418	0.2
419	0.22
420	0.32
421	0.33
422	0.37
423	0.39
424	0.39
425	0.39
426	0.37
427	0.36
428	0.32
429	0.34
430	0.3
431	0.25
432	0.3
433	0.3
434	0.3
435	0.26
436	0.2
437	0.18
438	0.21
439	0.24
440	0.22
441	0.26
442	0.28
443	0.27
444	0.27
445	0.26
446	0.24
447	0.25
448	0.23
449	0.22
450	0.21
451	0.24
452	0.24
453	0.32
454	0.33
455	0.34
456	0.39
457	0.38
458	0.39
459	0.44
460	0.45
461	0.38
462	0.36
463	0.34
464	0.32
465	0.3
466	0.28
467	0.29
468	0.3
469	0.29
470	0.34
471	0.31
472	0.26
473	0.26
474	0.25
475	0.16
476	0.12
477	0.12
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.08
485	0.06
486	0.08
487	0.09
488	0.1
489	0.1
490	0.12
491	0.11
492	0.11
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.11
497	0.14
498	0.18
499	0.17
500	0.18
501	0.18
502	0.16
503	0.17
504	0.16
505	0.12
506	0.08
507	0.08
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.04
517	0.04
518	0.06
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.07
533	0.08
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.09
539	0.11
540	0.13
541	0.14
542	0.15
543	0.16
544	0.16
545	0.21
546	0.29
547	0.34
548	0.38
549	0.46
550	0.5
551	0.51
552	0.59
553	0.57
554	0.49
555	0.44
556	0.41
557	0.32
558	0.32
559	0.31
560	0.24
561	0.25
562	0.23
563	0.21
564	0.2
565	0.19
566	0.14
567	0.15
568	0.17
569	0.17
570	0.26
571	0.28
572	0.29
573	0.3
574	0.3
575	0.36
576	0.35
577	0.33
578	0.29
579	0.3
580	0.3
581	0.3
582	0.29
583	0.23
584	0.23
585	0.26
586	0.23
587	0.21
588	0.21
589	0.2
590	0.21
591	0.2
592	0.2
593	0.15
594	0.13
595	0.11
596	0.16
597	0.18
598	0.2
599	0.22
600	0.26
601	0.29
602	0.28
603	0.28
604	0.24
605	0.22
606	0.22
607	0.21
608	0.17
609	0.16
610	0.17
611	0.19
612	0.23
613	0.24
614	0.24
615	0.3
616	0.32
617	0.31
618	0.31
619	0.32
620	0.34
621	0.36
622	0.37
623	0.33
624	0.31
625	0.32
626	0.32
627	0.3
628	0.27
629	0.27
630	0.29
631	0.25
632	0.25
633	0.24
634	0.23
635	0.22
636	0.19
637	0.16
638	0.11
639	0.11
640	0.11
641	0.15
642	0.19
643	0.22
644	0.28
645	0.32
646	0.38
647	0.47
648	0.5
649	0.56
650	0.6
651	0.6
652	0.55
653	0.59
654	0.57
655	0.51
656	0.54
657	0.51
658	0.45
659	0.42
660	0.42
661	0.34
662	0.32
663	0.29
664	0.23
665	0.18
666	0.17
667	0.17
668	0.17
669	0.17
670	0.15
671	0.16
672	0.19
673	0.25
674	0.29
675	0.37
676	0.42
677	0.49
678	0.57
679	0.65
680	0.7
681	0.71
682	0.75
683	0.74
684	0.77
685	0.76
686	0.77
687	0.76
688	0.77
689	0.79
690	0.75
691	0.8
692	0.8
693	0.8
694	0.77
695	0.78
696	0.78
697	0.77
698	0.79
699	0.75
700	0.73
701	0.68
702	0.61
703	0.51
704	0.41
705	0.31
706	0.23
707	0.17
708	0.12
709	0.09
710	0.08
711	0.08
712	0.09
713	0.13
714	0.16
715	0.19
716	0.25
717	0.3
718	0.37
719	0.4
720	0.43
721	0.43
722	0.5
723	0.54
724	0.54
725	0.53
726	0.51
727	0.57
728	0.63
729	0.69
730	0.7
731	0.68
732	0.68
733	0.76
734	0.73
735	0.7
736	0.65
737	0.62
738	0.61
739	0.66
740	0.68
741	0.67
742	0.73
743	0.76
744	0.82
745	0.84
746	0.85
747	0.85
748	0.86
749	0.87
750	0.86
751	0.88
752	0.87
753	0.85
754	0.83
755	0.8
756	0.71
757	0.62
758	0.56
759	0.47
760	0.39
761	0.36
762	0.31
763	0.28
764	0.3
765	0.33
766	0.33
767	0.34
768	0.4
769	0.44
770	0.45
771	0.46
772	0.53
773	0.57
774	0.57
775	0.58
776	0.56
777	0.58
778	0.59
779	0.63
780	0.63
781	0.65
782	0.71
783	0.72
784	0.77
785	0.73
786	0.75
787	0.75
788	0.75

P0CQ92

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer