Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHI2

Protein Details
Accession Q5KHI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1020-1044VGEAKGAWRKEKREREKGKENDADGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1018-1038RAVGEAKGAWRKEKREREKGK
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 6.5, cyto_mito 6, extr 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037794  TAF12  
IPR003228  TFIID_TAF12_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF03847  TFIID_20kDa  
CDD cd07981  TAF12  
Amino Acid Sequences MSGPSQQLAPNMAASLAQLSPAKLSQLQQQIPDLLTDAEKLLPEDKRNEVFREKMLSKMVTQARQQQAQQQQQQQGMGMNMGQMGNGMMNLQNKPQMANQSAHQDQIRLQLAQQQQQQHVAAMLEKSRQAAAAQHQQTGAGPRQPTPKPGQQAMTPNPMAQAAMSASPNSHGIGSPQVNMRQSPSTTSGGAGRPMLNMQGIKTLVENFPKLLELKRMGKLKPEQERLFDQFINSPDGRNHLQQFQAHQARALVERGLANPVAMPPGTQPQPHSTQTPIMNNMNLPLTAQQQMAALQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQGFGQQQQHALAAQLSQQFPQGILPAGCNTQLTAQQMQQIQLQRLAAAQAQLANQGHAALNVQQGRPPNPAMINQAAALARAAAAAQVAQGGAQGQSPHMQQGTPQASAPNLTQTPNQGQASQNFNSPHPHPSVQNAARPIPGTRPPMTLQQMLHNIQPHLARVAPDKVESVKAVLVRLASMSDEEREATLRQSTHWIPLWQRATAQPINNAQHQNPQQLAAAQAQVQAAAAAQAQAQAHAAVQAQALAASHGQSGSPHINFANVNAARASGTPGQGGTPLPGNMNLPNLHIPVGKQRGSISATSANGQSPQVRPPVLQGQSPGDIANAAGGGGPDPSLVQLMIEQGIPVHQAAQVLARQQQLAAASASLGVGMGLGGIPTFPQGSQAQAQAQAQAQLAGMGGMQGMPGMGSVGGIGQQMGVAGQQQQPQQQQRNITPAMLIAQYSHEIPPRPPPLRPELILPDAPAPADRTGSLLARASATYTPVGSSSSVNAQGQTQTGSASASASAFGSGSQTQAQIQEEGRDMRSTLFKPLNSMETGTKLVGRGTLGWNRVVRELVDDWPEGLREVVDEEAEDEEDGNGVMGDEGEHKGRVSGMPGQRKRKVQELAEEVDKALRIPKDSETLLLEIFDEHCDIVSESSCMLAKHRKASTVDRKDIQLSWELLYGRIIPGFSADRIRADQSRSSARHRQANAGYAAKLRAVGEAKGAWRKEKREREKGKENDADGEREEHEREKGTVALNGVGDGVGVGASISVGPAIGQGMKGIKVEEVVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.1
4 0.12
5 0.12
6 0.12
7 0.15
8 0.16
9 0.18
10 0.18
11 0.21
12 0.26
13 0.35
14 0.37
15 0.38
16 0.4
17 0.4
18 0.37
19 0.36
20 0.29
21 0.2
22 0.18
23 0.16
24 0.14
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.18
29 0.22
30 0.26
31 0.3
32 0.35
33 0.41
34 0.44
35 0.49
36 0.5
37 0.49
38 0.49
39 0.53
40 0.48
41 0.46
42 0.47
43 0.44
44 0.38
45 0.43
46 0.46
47 0.43
48 0.46
49 0.51
50 0.53
51 0.56
52 0.57
53 0.57
54 0.6
55 0.64
56 0.67
57 0.66
58 0.65
59 0.62
60 0.61
61 0.54
62 0.46
63 0.37
64 0.29
65 0.21
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.2
80 0.2
81 0.22
82 0.26
83 0.3
84 0.3
85 0.31
86 0.33
87 0.37
88 0.38
89 0.4
90 0.37
91 0.31
92 0.29
93 0.35
94 0.35
95 0.27
96 0.26
97 0.3
98 0.34
99 0.4
100 0.43
101 0.41
102 0.4
103 0.44
104 0.44
105 0.37
106 0.33
107 0.27
108 0.24
109 0.21
110 0.21
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.18
115 0.18
116 0.16
117 0.19
118 0.24
119 0.32
120 0.33
121 0.34
122 0.33
123 0.33
124 0.34
125 0.34
126 0.31
127 0.27
128 0.26
129 0.28
130 0.37
131 0.38
132 0.43
133 0.45
134 0.48
135 0.5
136 0.54
137 0.53
138 0.5
139 0.58
140 0.57
141 0.58
142 0.5
143 0.44
144 0.4
145 0.36
146 0.3
147 0.2
148 0.17
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.11
158 0.09
159 0.1
160 0.17
161 0.19
162 0.2
163 0.24
164 0.27
165 0.28
166 0.29
167 0.31
168 0.28
169 0.27
170 0.29
171 0.29
172 0.28
173 0.26
174 0.27
175 0.28
176 0.25
177 0.26
178 0.23
179 0.19
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.16
184 0.15
185 0.13
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.18
192 0.22
193 0.22
194 0.18
195 0.18
196 0.19
197 0.2
198 0.19
199 0.22
200 0.25
201 0.3
202 0.36
203 0.41
204 0.4
205 0.47
206 0.52
207 0.54
208 0.58
209 0.62
210 0.59
211 0.58
212 0.63
213 0.6
214 0.57
215 0.49
216 0.4
217 0.35
218 0.34
219 0.35
220 0.29
221 0.25
222 0.21
223 0.26
224 0.27
225 0.29
226 0.3
227 0.27
228 0.31
229 0.32
230 0.35
231 0.4
232 0.43
233 0.38
234 0.36
235 0.34
236 0.31
237 0.31
238 0.28
239 0.19
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.14
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.15
253 0.17
254 0.18
255 0.2
256 0.24
257 0.3
258 0.31
259 0.32
260 0.28
261 0.32
262 0.36
263 0.38
264 0.38
265 0.34
266 0.33
267 0.31
268 0.3
269 0.25
270 0.2
271 0.16
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.15
283 0.2
284 0.25
285 0.29
286 0.32
287 0.36
288 0.4
289 0.47
290 0.5
291 0.53
292 0.56
293 0.59
294 0.62
295 0.65
296 0.67
297 0.67
298 0.67
299 0.66
300 0.65
301 0.58
302 0.53
303 0.46
304 0.43
305 0.38
306 0.35
307 0.34
308 0.29
309 0.29
310 0.28
311 0.27
312 0.22
313 0.2
314 0.15
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.12
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.15
336 0.15
337 0.16
338 0.2
339 0.21
340 0.22
341 0.24
342 0.25
343 0.23
344 0.23
345 0.22
346 0.18
347 0.16
348 0.16
349 0.13
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.12
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.18
368 0.2
369 0.22
370 0.22
371 0.2
372 0.19
373 0.21
374 0.23
375 0.22
376 0.2
377 0.18
378 0.19
379 0.16
380 0.15
381 0.12
382 0.08
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.18
406 0.2
407 0.19
408 0.19
409 0.18
410 0.18
411 0.2
412 0.19
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.16
418 0.19
419 0.23
420 0.23
421 0.21
422 0.22
423 0.25
424 0.29
425 0.27
426 0.28
427 0.24
428 0.25
429 0.27
430 0.26
431 0.26
432 0.24
433 0.25
434 0.22
435 0.24
436 0.32
437 0.31
438 0.33
439 0.32
440 0.29
441 0.29
442 0.29
443 0.26
444 0.21
445 0.24
446 0.26
447 0.25
448 0.27
449 0.27
450 0.33
451 0.35
452 0.34
453 0.29
454 0.29
455 0.33
456 0.31
457 0.31
458 0.27
459 0.24
460 0.23
461 0.22
462 0.18
463 0.14
464 0.13
465 0.12
466 0.13
467 0.16
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.15
472 0.15
473 0.14
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.1
494 0.09
495 0.1
496 0.14
497 0.15
498 0.17
499 0.19
500 0.2
501 0.19
502 0.26
503 0.28
504 0.23
505 0.23
506 0.21
507 0.25
508 0.26
509 0.26
510 0.23
511 0.27
512 0.29
513 0.32
514 0.32
515 0.27
516 0.31
517 0.32
518 0.3
519 0.25
520 0.24
521 0.2
522 0.18
523 0.19
524 0.13
525 0.11
526 0.09
527 0.1
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.04
535 0.03
536 0.03
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.07
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.12
566 0.18
567 0.15
568 0.15
569 0.15
570 0.15
571 0.14
572 0.14
573 0.17
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.09
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.17
597 0.22
598 0.21
599 0.2
600 0.2
601 0.22
602 0.24
603 0.24
604 0.19
605 0.17
606 0.17
607 0.17
608 0.18
609 0.15
610 0.14
611 0.14
612 0.14
613 0.12
614 0.14
615 0.16
616 0.16
617 0.16
618 0.18
619 0.25
620 0.24
621 0.23
622 0.22
623 0.22
624 0.23
625 0.23
626 0.2
627 0.12
628 0.1
629 0.09
630 0.07
631 0.05
632 0.04
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.03
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.03
644 0.04
645 0.04
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.04
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.08
658 0.09
659 0.1
660 0.13
661 0.14
662 0.13
663 0.12
664 0.14
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.07
672 0.05
673 0.04
674 0.03
675 0.02
676 0.02
677 0.02
678 0.02
679 0.02
680 0.02
681 0.02
682 0.02
683 0.03
684 0.03
685 0.03
686 0.07
687 0.07
688 0.1
689 0.12
690 0.13
691 0.14
692 0.16
693 0.17
694 0.16
695 0.16
696 0.15
697 0.14
698 0.12
699 0.11
700 0.09
701 0.08
702 0.06
703 0.06
704 0.04
705 0.03
706 0.03
707 0.03
708 0.02
709 0.02
710 0.02
711 0.02
712 0.02
713 0.02
714 0.02
715 0.02
716 0.03
717 0.03
718 0.04
719 0.04
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.03
724 0.03
725 0.04
726 0.06
727 0.09
728 0.13
729 0.15
730 0.2
731 0.27
732 0.34
733 0.41
734 0.42
735 0.45
736 0.44
737 0.49
738 0.45
739 0.39
740 0.31
741 0.24
742 0.22
743 0.17
744 0.14
745 0.08
746 0.09
747 0.09
748 0.1
749 0.12
750 0.12
751 0.14
752 0.15
753 0.23
754 0.3
755 0.32
756 0.33
757 0.36
758 0.41
759 0.44
760 0.44
761 0.4
762 0.36
763 0.38
764 0.37
765 0.33
766 0.27
767 0.23
768 0.22
769 0.18
770 0.15
771 0.11
772 0.12
773 0.11
774 0.11
775 0.12
776 0.13
777 0.14
778 0.12
779 0.12
780 0.12
781 0.12
782 0.12
783 0.11
784 0.12
785 0.11
786 0.1
787 0.1
788 0.09
789 0.11
790 0.1
791 0.1
792 0.1
793 0.12
794 0.15
795 0.15
796 0.15
797 0.15
798 0.15
799 0.15
800 0.15
801 0.12
802 0.09
803 0.09
804 0.09
805 0.08
806 0.08
807 0.07
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.06
813 0.05
814 0.08
815 0.07
816 0.09
817 0.09
818 0.1
819 0.11
820 0.13
821 0.14
822 0.14
823 0.15
824 0.16
825 0.17
826 0.19
827 0.2
828 0.18
829 0.17
830 0.17
831 0.22
832 0.21
833 0.25
834 0.28
835 0.27
836 0.3
837 0.31
838 0.33
839 0.28
840 0.3
841 0.24
842 0.22
843 0.23
844 0.2
845 0.19
846 0.16
847 0.16
848 0.14
849 0.14
850 0.13
851 0.17
852 0.22
853 0.22
854 0.27
855 0.28
856 0.28
857 0.29
858 0.28
859 0.23
860 0.22
861 0.22
862 0.21
863 0.22
864 0.2
865 0.2
866 0.19
867 0.19
868 0.15
869 0.13
870 0.1
871 0.07
872 0.08
873 0.08
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.08
878 0.09
879 0.08
880 0.07
881 0.06
882 0.07
883 0.06
884 0.05
885 0.04
886 0.04
887 0.04
888 0.03
889 0.04
890 0.06
891 0.08
892 0.09
893 0.1
894 0.1
895 0.1
896 0.12
897 0.12
898 0.13
899 0.2
900 0.27
901 0.37
902 0.46
903 0.54
904 0.6
905 0.67
906 0.67
907 0.67
908 0.67
909 0.61
910 0.62
911 0.6
912 0.58
913 0.54
914 0.51
915 0.42
916 0.36
917 0.31
918 0.22
919 0.21
920 0.18
921 0.17
922 0.19
923 0.22
924 0.25
925 0.26
926 0.28
927 0.25
928 0.25
929 0.22
930 0.2
931 0.17
932 0.13
933 0.13
934 0.12
935 0.1
936 0.08
937 0.08
938 0.09
939 0.1
940 0.1
941 0.1
942 0.1
943 0.09
944 0.11
945 0.12
946 0.11
947 0.15
948 0.23
949 0.27
950 0.34
951 0.37
952 0.41
953 0.45
954 0.55
955 0.62
956 0.63
957 0.66
958 0.61
959 0.62
960 0.59
961 0.56
962 0.48
963 0.43
964 0.35
965 0.28
966 0.29
967 0.26
968 0.23
969 0.23
970 0.21
971 0.16
972 0.15
973 0.14
974 0.1
975 0.13
976 0.15
977 0.15
978 0.19
979 0.19
980 0.21
981 0.24
982 0.29
983 0.29
984 0.31
985 0.34
986 0.35
987 0.44
988 0.45
989 0.5
990 0.55
991 0.58
992 0.63
993 0.61
994 0.64
995 0.59
996 0.61
997 0.59
998 0.53
999 0.48
1000 0.41
1001 0.4
1002 0.31
1003 0.28
1004 0.22
1005 0.22
1006 0.21
1007 0.19
1008 0.2
1009 0.22
1010 0.27
1011 0.33
1012 0.35
1013 0.38
1014 0.43
1015 0.51
1016 0.58
1017 0.66
1018 0.71
1019 0.75
1020 0.84
1021 0.85
1022 0.89
1023 0.89
1024 0.88
1025 0.85
1026 0.76
1027 0.74
1028 0.67
1029 0.6
1030 0.51
1031 0.46
1032 0.37
1033 0.33
1034 0.34
1035 0.28
1036 0.28
1037 0.27
1038 0.27
1039 0.26
1040 0.27
1041 0.25
1042 0.26
1043 0.24
1044 0.24
1045 0.21
1046 0.2
1047 0.18
1048 0.14
1049 0.12
1050 0.09
1051 0.07
1052 0.04
1053 0.03
1054 0.03
1055 0.03
1056 0.03
1057 0.03
1058 0.03
1059 0.03
1060 0.03
1061 0.03
1062 0.04
1063 0.06
1064 0.06
1065 0.06
1066 0.09
1067 0.11
1068 0.13
1069 0.14
1070 0.14
1071 0.13