Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5K6Y0

Protein Details
Accession Q5K6Y0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
692-712HTPLPFNRTRHLRNPWNADREHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:1990247  F:N6-methyladenosine-containing RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cne:CNN01810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MSAIPEQPAVEALNDQLQSIQLDGSRHAANGKHSNRPYVQLRPHPAQLQPPPPPQPQSQAYQPYAQAYTPYPQHYHQAPYTTYLTYSPYPNHLAWRPLPGSEQTSPIDPTNQHHHQHQHYGLWGSPPVSPVNAPPPQFLTGQSRTAMFDDFGVGGAVSGAGTAYYGGRPPYGSPPSVWQSPTAPSSFFYTPFQQHASGMGPAMQVSDWSTFKAHVNLPGPSKSGPISPTDSKEPERKSYHPQPPSKRSDWVMWVGNVPNNTSHEELWHFFNVTIPITNTESDAEPWRGPSSIFLISRSSCAFVNLSSQTDLERAVSFFNGKPLRPWDARCPRMVCRVRRKDDDLRSGVGAQRGTGMHRQWVKKDKEREKEKEEGKTGQMSAATVSSGPPSPAILAPAPDGPGRRRDSIVSEEEKKFSSGSYASTNSSFLMRHFPRRVFILKSLTTAELEESVRTGMWRTQQHNEPILDQAFRTSQSVFLIFGANRAGEFFGYARMIEPIDKEQAKHRQSSAGTASRRSTTGDSDRFFLPPYHSRVTTMSPGELATPREDSYFHVSTGHRKTDPPKMPNHAAPNSSMAEILATAEEQRAHTFDPKTLQRDYEYPSVTLTLAEAETGVTSSSEKSSQQASPELGPASQEPQKMDDQGILRKDTLPPPSPPEQDVEKLQQAEQETSKELSNEGWGHYFRIEWIRHTPLPFNRTRHLRNPWNADREVKVSRDGTEVEPSVGLQLMAEWDNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.12
9 0.13
10 0.15
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.2
15 0.22
16 0.27
17 0.36
18 0.4
19 0.46
20 0.48
21 0.55
22 0.54
23 0.59
24 0.58
25 0.57
26 0.62
27 0.62
28 0.67
29 0.65
30 0.68
31 0.65
32 0.62
33 0.61
34 0.6
35 0.6
36 0.6
37 0.63
38 0.64
39 0.65
40 0.66
41 0.61
42 0.6
43 0.55
44 0.52
45 0.53
46 0.54
47 0.52
48 0.51
49 0.49
50 0.44
51 0.42
52 0.37
53 0.3
54 0.25
55 0.27
56 0.28
57 0.31
58 0.3
59 0.3
60 0.36
61 0.37
62 0.41
63 0.39
64 0.4
65 0.37
66 0.39
67 0.4
68 0.34
69 0.31
70 0.25
71 0.26
72 0.23
73 0.26
74 0.23
75 0.25
76 0.29
77 0.29
78 0.35
79 0.35
80 0.38
81 0.37
82 0.43
83 0.39
84 0.36
85 0.38
86 0.34
87 0.36
88 0.32
89 0.34
90 0.27
91 0.28
92 0.3
93 0.28
94 0.29
95 0.24
96 0.28
97 0.33
98 0.39
99 0.39
100 0.43
101 0.49
102 0.5
103 0.57
104 0.55
105 0.49
106 0.45
107 0.44
108 0.4
109 0.34
110 0.31
111 0.24
112 0.22
113 0.21
114 0.18
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.23
119 0.27
120 0.27
121 0.27
122 0.29
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.3
127 0.29
128 0.31
129 0.3
130 0.27
131 0.26
132 0.27
133 0.25
134 0.17
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.02
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.19
158 0.22
159 0.23
160 0.23
161 0.28
162 0.33
163 0.35
164 0.34
165 0.27
166 0.26
167 0.28
168 0.3
169 0.25
170 0.21
171 0.18
172 0.23
173 0.23
174 0.22
175 0.22
176 0.24
177 0.25
178 0.28
179 0.29
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.22
184 0.18
185 0.16
186 0.14
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.08
191 0.06
192 0.08
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.15
199 0.19
200 0.18
201 0.21
202 0.24
203 0.26
204 0.29
205 0.29
206 0.3
207 0.26
208 0.26
209 0.2
210 0.2
211 0.18
212 0.18
213 0.22
214 0.24
215 0.27
216 0.31
217 0.33
218 0.35
219 0.41
220 0.41
221 0.43
222 0.45
223 0.46
224 0.5
225 0.57
226 0.62
227 0.64
228 0.69
229 0.71
230 0.75
231 0.79
232 0.73
233 0.67
234 0.6
235 0.55
236 0.5
237 0.46
238 0.39
239 0.32
240 0.31
241 0.28
242 0.27
243 0.23
244 0.2
245 0.17
246 0.16
247 0.18
248 0.17
249 0.15
250 0.15
251 0.18
252 0.18
253 0.19
254 0.18
255 0.16
256 0.15
257 0.17
258 0.16
259 0.14
260 0.14
261 0.11
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.18
282 0.18
283 0.2
284 0.19
285 0.17
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.09
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.19
309 0.22
310 0.28
311 0.28
312 0.31
313 0.35
314 0.43
315 0.45
316 0.47
317 0.47
318 0.44
319 0.52
320 0.56
321 0.55
322 0.56
323 0.64
324 0.65
325 0.67
326 0.7
327 0.69
328 0.69
329 0.69
330 0.6
331 0.51
332 0.46
333 0.42
334 0.37
335 0.3
336 0.22
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.14
343 0.17
344 0.23
345 0.24
346 0.28
347 0.37
348 0.42
349 0.46
350 0.55
351 0.6
352 0.64
353 0.72
354 0.73
355 0.69
356 0.71
357 0.67
358 0.63
359 0.57
360 0.5
361 0.42
362 0.38
363 0.32
364 0.25
365 0.21
366 0.14
367 0.12
368 0.09
369 0.08
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.12
387 0.11
388 0.18
389 0.21
390 0.22
391 0.22
392 0.22
393 0.25
394 0.28
395 0.32
396 0.29
397 0.32
398 0.31
399 0.32
400 0.31
401 0.28
402 0.23
403 0.18
404 0.16
405 0.1
406 0.11
407 0.14
408 0.15
409 0.16
410 0.16
411 0.17
412 0.14
413 0.15
414 0.13
415 0.1
416 0.18
417 0.19
418 0.26
419 0.3
420 0.31
421 0.31
422 0.35
423 0.38
424 0.32
425 0.34
426 0.33
427 0.29
428 0.3
429 0.3
430 0.27
431 0.24
432 0.2
433 0.16
434 0.12
435 0.12
436 0.1
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.14
444 0.2
445 0.24
446 0.3
447 0.35
448 0.4
449 0.44
450 0.42
451 0.36
452 0.34
453 0.31
454 0.26
455 0.2
456 0.17
457 0.13
458 0.13
459 0.13
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.1
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.06
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.11
486 0.17
487 0.18
488 0.18
489 0.25
490 0.34
491 0.36
492 0.38
493 0.36
494 0.37
495 0.36
496 0.41
497 0.41
498 0.39
499 0.38
500 0.37
501 0.38
502 0.33
503 0.34
504 0.31
505 0.26
506 0.24
507 0.31
508 0.34
509 0.33
510 0.34
511 0.34
512 0.32
513 0.32
514 0.27
515 0.24
516 0.24
517 0.3
518 0.31
519 0.31
520 0.32
521 0.33
522 0.36
523 0.36
524 0.31
525 0.25
526 0.21
527 0.21
528 0.21
529 0.21
530 0.18
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.16
536 0.17
537 0.22
538 0.22
539 0.2
540 0.23
541 0.23
542 0.31
543 0.37
544 0.39
545 0.33
546 0.35
547 0.4
548 0.46
549 0.55
550 0.51
551 0.53
552 0.55
553 0.59
554 0.62
555 0.66
556 0.59
557 0.51
558 0.48
559 0.44
560 0.38
561 0.32
562 0.26
563 0.17
564 0.13
565 0.12
566 0.1
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.07
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.11
575 0.13
576 0.19
577 0.2
578 0.21
579 0.28
580 0.33
581 0.37
582 0.37
583 0.38
584 0.35
585 0.37
586 0.4
587 0.4
588 0.36
589 0.32
590 0.3
591 0.29
592 0.26
593 0.22
594 0.17
595 0.11
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.06
605 0.07
606 0.09
607 0.11
608 0.11
609 0.13
610 0.18
611 0.2
612 0.22
613 0.25
614 0.26
615 0.25
616 0.28
617 0.27
618 0.22
619 0.21
620 0.2
621 0.21
622 0.22
623 0.23
624 0.21
625 0.24
626 0.27
627 0.27
628 0.27
629 0.27
630 0.26
631 0.3
632 0.33
633 0.32
634 0.3
635 0.3
636 0.34
637 0.35
638 0.39
639 0.37
640 0.37
641 0.41
642 0.48
643 0.49
644 0.45
645 0.44
646 0.42
647 0.41
648 0.43
649 0.42
650 0.4
651 0.39
652 0.38
653 0.36
654 0.34
655 0.35
656 0.32
657 0.28
658 0.26
659 0.26
660 0.26
661 0.23
662 0.21
663 0.18
664 0.22
665 0.21
666 0.2
667 0.23
668 0.22
669 0.24
670 0.24
671 0.23
672 0.2
673 0.27
674 0.26
675 0.26
676 0.32
677 0.38
678 0.41
679 0.44
680 0.49
681 0.49
682 0.55
683 0.58
684 0.57
685 0.58
686 0.64
687 0.68
688 0.7
689 0.72
690 0.75
691 0.77
692 0.81
693 0.81
694 0.79
695 0.75
696 0.7
697 0.64
698 0.6
699 0.56
700 0.47
701 0.44
702 0.39
703 0.37
704 0.36
705 0.35
706 0.32
707 0.33
708 0.32
709 0.27
710 0.26
711 0.24
712 0.21
713 0.19
714 0.16
715 0.08
716 0.08
717 0.1