Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHM6

Protein Details
Accession Q5KHM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-131LDEGQSRKRQQRNHVPRLKRYCRGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR008422  Homeobox_KN_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF05920  Homeobox_KN  
Amino Acid Sequences MLSTCDSSSQSIRRSLQDDLLDFQETFAKALGKREVHDLESVVQKGNKLVTAIKWSSSRDLLDKNTASLAYAVASSVKLIGSSALELEGGREDAIGEAMLRIESLLLDEGQSRKRQQRNHVPRLKRYCRGSSSESSIAWPKSTFDNSPKPSEPPIDHTVVRLWFLDNLAYPYPTAQQKDFLAKTAGIQRSQVDSDLTNYRRRAGWTDIMNVWCGGDRNAMKKLMNRVEKGKEQRKKILDAVQGCRDYLTMKENNKVGDWIKEITQNSAFKYRFTGSLPDISAASPCSSIRPCTPRSFSGSSATSSTSSCSEVSEASAIITIPRKRRYTGDESISPFKRVQGQTVEVSGSYEPWSFADLQPMPPSPGAAQEDIDNEFVAPTTYFISATSLSLSSPAEPLTKPRLAC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.46
4 0.45
5 0.43
6 0.38
7 0.37
8 0.34
9 0.3
10 0.27
11 0.26
12 0.21
13 0.19
14 0.18
15 0.2
16 0.19
17 0.25
18 0.32
19 0.29
20 0.31
21 0.38
22 0.39
23 0.37
24 0.37
25 0.33
26 0.29
27 0.32
28 0.32
29 0.28
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.25
34 0.23
35 0.19
36 0.21
37 0.21
38 0.28
39 0.29
40 0.3
41 0.32
42 0.33
43 0.35
44 0.35
45 0.34
46 0.3
47 0.34
48 0.35
49 0.39
50 0.37
51 0.34
52 0.33
53 0.3
54 0.26
55 0.21
56 0.17
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.08
96 0.11
97 0.15
98 0.2
99 0.24
100 0.32
101 0.39
102 0.45
103 0.54
104 0.62
105 0.7
106 0.77
107 0.81
108 0.8
109 0.83
110 0.87
111 0.84
112 0.8
113 0.75
114 0.72
115 0.67
116 0.66
117 0.62
118 0.56
119 0.54
120 0.5
121 0.44
122 0.38
123 0.38
124 0.32
125 0.27
126 0.23
127 0.18
128 0.19
129 0.21
130 0.22
131 0.24
132 0.33
133 0.36
134 0.41
135 0.42
136 0.4
137 0.4
138 0.41
139 0.36
140 0.33
141 0.34
142 0.32
143 0.3
144 0.29
145 0.29
146 0.25
147 0.24
148 0.18
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.09
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.13
160 0.15
161 0.16
162 0.14
163 0.16
164 0.18
165 0.24
166 0.24
167 0.22
168 0.2
169 0.18
170 0.2
171 0.25
172 0.26
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.21
178 0.19
179 0.12
180 0.1
181 0.13
182 0.18
183 0.2
184 0.22
185 0.22
186 0.23
187 0.24
188 0.25
189 0.26
190 0.23
191 0.27
192 0.24
193 0.27
194 0.28
195 0.27
196 0.26
197 0.22
198 0.18
199 0.13
200 0.11
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.14
205 0.17
206 0.19
207 0.2
208 0.23
209 0.31
210 0.34
211 0.38
212 0.37
213 0.4
214 0.43
215 0.49
216 0.55
217 0.57
218 0.55
219 0.55
220 0.61
221 0.59
222 0.58
223 0.56
224 0.54
225 0.5
226 0.49
227 0.49
228 0.47
229 0.44
230 0.4
231 0.35
232 0.28
233 0.22
234 0.18
235 0.19
236 0.19
237 0.21
238 0.25
239 0.26
240 0.27
241 0.27
242 0.28
243 0.23
244 0.2
245 0.21
246 0.18
247 0.18
248 0.22
249 0.22
250 0.22
251 0.26
252 0.25
253 0.25
254 0.32
255 0.31
256 0.26
257 0.3
258 0.28
259 0.25
260 0.25
261 0.27
262 0.21
263 0.26
264 0.26
265 0.23
266 0.22
267 0.19
268 0.18
269 0.15
270 0.13
271 0.09
272 0.09
273 0.12
274 0.13
275 0.16
276 0.22
277 0.27
278 0.3
279 0.37
280 0.41
281 0.41
282 0.47
283 0.48
284 0.44
285 0.43
286 0.41
287 0.35
288 0.32
289 0.3
290 0.24
291 0.2
292 0.2
293 0.15
294 0.15
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.15
307 0.19
308 0.26
309 0.34
310 0.36
311 0.38
312 0.43
313 0.49
314 0.52
315 0.55
316 0.55
317 0.54
318 0.57
319 0.63
320 0.6
321 0.54
322 0.46
323 0.4
324 0.42
325 0.37
326 0.37
327 0.35
328 0.37
329 0.37
330 0.38
331 0.36
332 0.27
333 0.27
334 0.22
335 0.17
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.13
341 0.14
342 0.15
343 0.22
344 0.22
345 0.25
346 0.28
347 0.29
348 0.3
349 0.28
350 0.29
351 0.2
352 0.25
353 0.26
354 0.23
355 0.22
356 0.21
357 0.23
358 0.24
359 0.24
360 0.17
361 0.14
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.15
375 0.13
376 0.12
377 0.14
378 0.15
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.22
385 0.28