Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KDX1

Protein Details
Accession Q5KDX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-418GIGGGGSRKKGKKRKGKPKQREYQDGNEEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-408GSRKKGKKRKGKPKQ
495-506ARRSRVSGGRKR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028651  ING_fam  
IPR024610  ING_N_histone-binding  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cne:CNG02500  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12998  ING  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15505  PHD_ING  
Amino Acid Sequences MPRQPPAKRARLSTRAISSTSEQPEVGPSRSVNDESPTKLDKGKGKAEATTTQTQEKQGKQSEGEMDATEELEAWQDFAADHYETVEQLPLELHRNFRLLRELDDGTLAQMDTLKKLIRTYVSGRIALEQPRSLSTPLEEAALKKSNREEDSIDAERAEETLSHHDSPQEGEEGVNPASEITAEPANSGEPSLNPSLTDEKQKEPGVPLADGAGGLIIPCSPESQTRVPARAKFPSLPSSPTARHNGAIENDDPNIDSLARAAAQQNRSSSIPLRASRPAGPHSLLPEISRLAREIVRTSDEKVAVAIGAYNAVDRHIRALDSALTAQEASILLGLRPSTLPSNAIDEALDLEGSTGKAGTGQLVDGRSRGQGTGDGVGEGDEREVTLGIGGGGSRKKGKKRKGKPKQREYQDGNEEGKVEENWNIPPDPNEPRYCYCNRVSFGEMIGCDNDECPLEWFHLQCLGFENPPTGKWLCDLCKPKTNGHGAGTSAGAARRSRVSGGRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.64
3 0.6
4 0.55
5 0.49
6 0.49
7 0.47
8 0.41
9 0.33
10 0.3
11 0.35
12 0.36
13 0.33
14 0.28
15 0.24
16 0.26
17 0.29
18 0.31
19 0.26
20 0.28
21 0.3
22 0.31
23 0.36
24 0.36
25 0.34
26 0.36
27 0.4
28 0.42
29 0.45
30 0.49
31 0.51
32 0.5
33 0.51
34 0.52
35 0.52
36 0.51
37 0.51
38 0.46
39 0.44
40 0.45
41 0.48
42 0.5
43 0.49
44 0.51
45 0.51
46 0.52
47 0.48
48 0.5
49 0.48
50 0.44
51 0.4
52 0.32
53 0.27
54 0.23
55 0.21
56 0.16
57 0.12
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.16
79 0.17
80 0.19
81 0.2
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.32
86 0.28
87 0.29
88 0.31
89 0.3
90 0.27
91 0.28
92 0.26
93 0.18
94 0.18
95 0.14
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.18
105 0.17
106 0.22
107 0.25
108 0.32
109 0.34
110 0.35
111 0.34
112 0.34
113 0.36
114 0.35
115 0.33
116 0.25
117 0.23
118 0.23
119 0.25
120 0.23
121 0.2
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.17
129 0.24
130 0.23
131 0.22
132 0.26
133 0.32
134 0.33
135 0.34
136 0.32
137 0.28
138 0.36
139 0.36
140 0.33
141 0.25
142 0.24
143 0.21
144 0.19
145 0.15
146 0.08
147 0.08
148 0.13
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.19
155 0.18
156 0.14
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.05
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.16
184 0.17
185 0.24
186 0.23
187 0.24
188 0.29
189 0.3
190 0.29
191 0.26
192 0.29
193 0.24
194 0.21
195 0.19
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.06
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.11
211 0.13
212 0.2
213 0.23
214 0.28
215 0.31
216 0.34
217 0.37
218 0.36
219 0.37
220 0.33
221 0.33
222 0.34
223 0.32
224 0.3
225 0.28
226 0.29
227 0.28
228 0.3
229 0.31
230 0.26
231 0.26
232 0.24
233 0.24
234 0.21
235 0.22
236 0.18
237 0.15
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.1
242 0.09
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.08
250 0.12
251 0.14
252 0.17
253 0.17
254 0.19
255 0.2
256 0.21
257 0.2
258 0.21
259 0.24
260 0.24
261 0.26
262 0.26
263 0.29
264 0.3
265 0.31
266 0.28
267 0.25
268 0.25
269 0.22
270 0.22
271 0.22
272 0.19
273 0.16
274 0.15
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.16
285 0.17
286 0.19
287 0.21
288 0.2
289 0.19
290 0.17
291 0.15
292 0.12
293 0.11
294 0.08
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.09
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.1
359 0.11
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.08
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.07
380 0.08
381 0.11
382 0.18
383 0.24
384 0.34
385 0.44
386 0.54
387 0.62
388 0.72
389 0.82
390 0.86
391 0.92
392 0.93
393 0.95
394 0.95
395 0.93
396 0.92
397 0.88
398 0.86
399 0.83
400 0.78
401 0.69
402 0.6
403 0.51
404 0.41
405 0.36
406 0.26
407 0.2
408 0.17
409 0.16
410 0.17
411 0.19
412 0.2
413 0.19
414 0.2
415 0.24
416 0.28
417 0.33
418 0.35
419 0.38
420 0.4
421 0.46
422 0.48
423 0.49
424 0.47
425 0.49
426 0.47
427 0.46
428 0.46
429 0.4
430 0.39
431 0.37
432 0.31
433 0.25
434 0.23
435 0.19
436 0.16
437 0.15
438 0.14
439 0.11
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.14
444 0.16
445 0.17
446 0.17
447 0.23
448 0.22
449 0.2
450 0.24
451 0.24
452 0.24
453 0.24
454 0.27
455 0.22
456 0.22
457 0.27
458 0.22
459 0.2
460 0.21
461 0.28
462 0.27
463 0.35
464 0.43
465 0.44
466 0.53
467 0.56
468 0.59
469 0.61
470 0.65
471 0.61
472 0.57
473 0.54
474 0.46
475 0.44
476 0.39
477 0.31
478 0.25
479 0.21
480 0.21
481 0.18
482 0.2
483 0.22
484 0.23
485 0.27
486 0.33