Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KM08

Protein Details
Accession Q5KM08    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
810-830DENGERKKSGKKQPGVGKGNWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
529-535RAARERR
788-844KMGDGKGDGKGKGKKRERGEGEDENGERKKSGKKQPGVGKGNWTRPSKEEKARLAGE
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001487  Bromodomain  
IPR036427  Bromodomain-like_sf  
IPR018359  Bromodomain_CS  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037782  Spt7  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0005198  F:structural molecule activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNB03400  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00439  Bromodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00633  BROMODOMAIN_1  
PS50014  BROMODOMAIN_2  
CDD cd05510  Bromo_SPT7_like  
Amino Acid Sequences MKYLLNFLGDVPDAPNLADPAFQQLLVDVQSVKGAVKISADAFYESLENIVNELKTSPESIPFQKPVSKREAPDYYDVIKRPMDLSTILRNAKARKYKSKAEFAADLDLIWKNCFEYNSQESHPLRAAARFMKQKADHHLEYLADRAERNKQLQSFLPSATGTASPSLSAIGHSALGGSGLTILLGSRLRDEGLGGDEDAAGESDDAFGEGDAEGEVDREGNDVLDVRSQDFREGGAETRGERGETPSRGKDERGRGTSVASSSRMNGRPNGTNRRSPSAKRPPLTTNLDNVPALLRTPYTIPSLSSLSLAHAGPSFSDKGKARESLSGYPAPAWYPAPPATAAAAAAAASFQEAGDDDESTLEGSWWGKMMDDETLVAGMPAIPKMSPPEPVRRCRPKPPPPAIPPAIPPAIPPPLPNGFASGAQSPPPGLSSSSTATTTATAAKPHDHTKDGPSDRTVSVSVKAVVRRTINNLNAARQAMHRITEFQRIEAEGGILPPRGLSPTPAEKEKEHEEQAERRDFRRIENRAARERRKEGGEVGQEEAVRIMKKCSAGMLAHAGFEGANETALDLFTRVAVDHLDGLGKTFRLLLDGFSHKMTPEEIILHALHENGQVQPRDLEAHLKDDIEREDVKIAEVQRKMRQTFYEVATAPVIQDDMMFADDGEMLLDGNFADELGEDFLGLRELGIDREYGLASLTVPQSLFYGKRKRLANSANGASGKSDLPYPPPPSFIPLAAATLSTHVPALLHAFYAARIEAGLSLDEDDAFEPAHSQIGSLGQILIKGKMGDGKGDGKGKGKKRERGEGEDENGERKKSGKKQPGVGKGNWTRPSKEEKARLAGEKNAAKGETAAVAGDEDAVGEEEDAEGEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.11
7 0.17
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.14
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.14
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.17
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.13
33 0.13
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.16
44 0.16
45 0.19
46 0.24
47 0.29
48 0.36
49 0.38
50 0.4
51 0.45
52 0.48
53 0.48
54 0.52
55 0.53
56 0.49
57 0.54
58 0.58
59 0.55
60 0.56
61 0.55
62 0.51
63 0.5
64 0.48
65 0.42
66 0.36
67 0.33
68 0.29
69 0.25
70 0.23
71 0.2
72 0.23
73 0.27
74 0.34
75 0.34
76 0.35
77 0.39
78 0.42
79 0.48
80 0.53
81 0.53
82 0.57
83 0.63
84 0.7
85 0.74
86 0.79
87 0.74
88 0.71
89 0.67
90 0.58
91 0.57
92 0.46
93 0.38
94 0.3
95 0.28
96 0.23
97 0.19
98 0.17
99 0.13
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.21
104 0.25
105 0.29
106 0.31
107 0.38
108 0.37
109 0.4
110 0.39
111 0.34
112 0.31
113 0.29
114 0.32
115 0.28
116 0.34
117 0.39
118 0.38
119 0.45
120 0.48
121 0.5
122 0.55
123 0.59
124 0.52
125 0.46
126 0.47
127 0.39
128 0.36
129 0.33
130 0.26
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.25
135 0.29
136 0.31
137 0.35
138 0.35
139 0.37
140 0.42
141 0.45
142 0.39
143 0.35
144 0.33
145 0.27
146 0.25
147 0.23
148 0.19
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.19
231 0.23
232 0.26
233 0.31
234 0.32
235 0.36
236 0.37
237 0.4
238 0.42
239 0.45
240 0.49
241 0.48
242 0.47
243 0.42
244 0.43
245 0.42
246 0.36
247 0.29
248 0.22
249 0.19
250 0.18
251 0.25
252 0.27
253 0.26
254 0.28
255 0.3
256 0.36
257 0.43
258 0.52
259 0.49
260 0.52
261 0.54
262 0.58
263 0.59
264 0.55
265 0.58
266 0.59
267 0.63
268 0.58
269 0.59
270 0.56
271 0.59
272 0.62
273 0.54
274 0.47
275 0.41
276 0.41
277 0.36
278 0.31
279 0.24
280 0.17
281 0.15
282 0.11
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.14
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.11
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.12
304 0.1
305 0.15
306 0.17
307 0.2
308 0.23
309 0.26
310 0.25
311 0.29
312 0.33
313 0.32
314 0.34
315 0.31
316 0.28
317 0.26
318 0.25
319 0.2
320 0.17
321 0.13
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.02
340 0.02
341 0.03
342 0.04
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.08
374 0.09
375 0.15
376 0.17
377 0.28
378 0.34
379 0.4
380 0.5
381 0.57
382 0.61
383 0.64
384 0.72
385 0.72
386 0.77
387 0.78
388 0.78
389 0.73
390 0.77
391 0.69
392 0.6
393 0.51
394 0.45
395 0.37
396 0.28
397 0.23
398 0.18
399 0.18
400 0.16
401 0.15
402 0.15
403 0.17
404 0.18
405 0.18
406 0.17
407 0.15
408 0.16
409 0.17
410 0.14
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.12
433 0.14
434 0.18
435 0.2
436 0.19
437 0.2
438 0.23
439 0.31
440 0.31
441 0.3
442 0.27
443 0.28
444 0.26
445 0.26
446 0.24
447 0.16
448 0.15
449 0.14
450 0.15
451 0.14
452 0.16
453 0.16
454 0.18
455 0.19
456 0.19
457 0.23
458 0.27
459 0.27
460 0.32
461 0.32
462 0.31
463 0.31
464 0.3
465 0.26
466 0.2
467 0.22
468 0.15
469 0.16
470 0.14
471 0.16
472 0.18
473 0.26
474 0.25
475 0.22
476 0.22
477 0.21
478 0.22
479 0.18
480 0.16
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.11
492 0.18
493 0.21
494 0.24
495 0.26
496 0.25
497 0.3
498 0.33
499 0.33
500 0.28
501 0.29
502 0.3
503 0.33
504 0.38
505 0.42
506 0.38
507 0.35
508 0.4
509 0.37
510 0.39
511 0.44
512 0.43
513 0.44
514 0.51
515 0.56
516 0.59
517 0.67
518 0.68
519 0.65
520 0.65
521 0.6
522 0.54
523 0.5
524 0.42
525 0.41
526 0.39
527 0.33
528 0.3
529 0.28
530 0.25
531 0.23
532 0.21
533 0.15
534 0.12
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.13
541 0.14
542 0.13
543 0.14
544 0.19
545 0.16
546 0.16
547 0.15
548 0.14
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.06
571 0.07
572 0.08
573 0.08
574 0.07
575 0.08
576 0.07
577 0.08
578 0.09
579 0.09
580 0.13
581 0.16
582 0.17
583 0.17
584 0.18
585 0.16
586 0.16
587 0.16
588 0.11
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.15
602 0.14
603 0.15
604 0.15
605 0.15
606 0.16
607 0.16
608 0.2
609 0.17
610 0.2
611 0.2
612 0.2
613 0.19
614 0.2
615 0.21
616 0.18
617 0.18
618 0.15
619 0.16
620 0.16
621 0.16
622 0.17
623 0.18
624 0.22
625 0.25
626 0.29
627 0.33
628 0.39
629 0.4
630 0.4
631 0.4
632 0.38
633 0.4
634 0.37
635 0.37
636 0.31
637 0.31
638 0.28
639 0.26
640 0.21
641 0.16
642 0.13
643 0.07
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.03
659 0.04
660 0.04
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.07
671 0.06
672 0.05
673 0.05
674 0.06
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.09
680 0.09
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.07
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.11
691 0.13
692 0.17
693 0.21
694 0.31
695 0.34
696 0.41
697 0.46
698 0.48
699 0.55
700 0.58
701 0.59
702 0.57
703 0.56
704 0.54
705 0.5
706 0.47
707 0.38
708 0.33
709 0.25
710 0.17
711 0.17
712 0.13
713 0.18
714 0.24
715 0.29
716 0.29
717 0.32
718 0.32
719 0.34
720 0.35
721 0.3
722 0.26
723 0.21
724 0.21
725 0.18
726 0.18
727 0.14
728 0.14
729 0.13
730 0.1
731 0.09
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.11
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.09
740 0.1
741 0.11
742 0.1
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.08
748 0.08
749 0.07
750 0.09
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.08
755 0.08
756 0.08
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.1
761 0.09
762 0.09
763 0.09
764 0.11
765 0.12
766 0.11
767 0.12
768 0.1
769 0.13
770 0.14
771 0.14
772 0.13
773 0.13
774 0.13
775 0.17
776 0.17
777 0.17
778 0.2
779 0.24
780 0.27
781 0.32
782 0.33
783 0.36
784 0.44
785 0.5
786 0.58
787 0.62
788 0.66
789 0.69
790 0.78
791 0.78
792 0.78
793 0.77
794 0.75
795 0.7
796 0.68
797 0.62
798 0.57
799 0.52
800 0.44
801 0.37
802 0.33
803 0.38
804 0.4
805 0.5
806 0.54
807 0.6
808 0.68
809 0.78
810 0.85
811 0.82
812 0.75
813 0.75
814 0.73
815 0.75
816 0.74
817 0.68
818 0.61
819 0.59
820 0.65
821 0.63
822 0.65
823 0.64
824 0.63
825 0.67
826 0.69
827 0.71
828 0.66
829 0.63
830 0.62
831 0.57
832 0.52
833 0.48
834 0.42
835 0.36
836 0.32
837 0.27
838 0.2
839 0.16
840 0.14
841 0.1
842 0.1
843 0.1
844 0.09
845 0.07
846 0.05
847 0.06
848 0.07
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.06
853 0.06