FuNGI

P0CR56

Protein Details

Accession

P0CR56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-69	TPGPQLPKYGQRKGWKPKTAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
227-233	KHKKIPR
575-592	GGKRTAEDRDEERRKRAR

Subcellular Location(s)

mito 17, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	cne:CNH00830 -
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MIHSHNNNLSFCSQLITVRKMAALTRALPAPLHTSTTEYEEAPAPLPTTPGPQLPKYGQRKGWKPKTAADFNGGGAYPECHVAQYPLDMGKKNKGQGSTLALQVDQDGLVRYDAIAQHGRAPGSRVQSSFKDLVPLANRTDVTESERQMERPDDLSVAETAERTRLALERITHGKIKAAQPKHVPKTNSDATYIRYTPANQSADEGKQRIIKMTEVQEDPLEPPRFKHKKIPRGPAEPPPPVLQSPPRAATAQDQKDWMIPPCISNWKNNKGYTIPLDKRLAADGRGLQDVHINDNFAKFSESLYIADRHIREEVRARAQLQQLLAQKQKTSKEEELRLLAQRAREDRSGLSSSVSGSVAAASASRLPAETGINLGGYGSESGSEEESDEEEEDEEAIRERNIVREEKRREREKEMRMSNMGSEMRAKMLAKEANRDISEKIALGLAKPSASKETLLDSRLFNREALSTGFASEDSYNLYDKPLFAGSSAAAAIYRPAGSSRNDESFGGGTEEGIKEEMSKDRFQLGNATRGFEGAEGVEAREGPVQFEKDTIVALDGSADPFGVEQFMDAARRGGKRTAEDRDEERRKRARDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.27
3	0.28
4	0.29
5	0.28
6	0.29
7	0.28
8	0.28
9	0.28
10	0.27
11	0.24
12	0.26
13	0.26
14	0.26
15	0.25
16	0.25
17	0.25
18	0.22
19	0.23
20	0.2
21	0.22
22	0.23
23	0.28
24	0.28
25	0.23
26	0.23
27	0.22
28	0.23
29	0.21
30	0.2
31	0.16
32	0.14
33	0.16
34	0.15
35	0.18
36	0.19
37	0.24
38	0.28
39	0.29
40	0.34
41	0.38
42	0.47
43	0.51
44	0.57
45	0.59
46	0.64
47	0.72
48	0.77
49	0.82
50	0.81
51	0.76
52	0.76
53	0.78
54	0.76
55	0.69
56	0.62
57	0.53
58	0.45
59	0.44
60	0.35
61	0.26
62	0.19
63	0.17
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.1
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.13
72	0.14
73	0.18
74	0.21
75	0.24
76	0.26
77	0.33
78	0.38
79	0.41
80	0.42
81	0.39
82	0.38
83	0.39
84	0.44
85	0.38
86	0.36
87	0.32
88	0.27
89	0.25
90	0.23
91	0.19
92	0.12
93	0.1
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.07
99	0.1
100	0.11
101	0.14
102	0.16
103	0.16
104	0.21
105	0.23
106	0.24
107	0.21
108	0.24
109	0.24
110	0.28
111	0.3
112	0.27
113	0.29
114	0.31
115	0.36
116	0.35
117	0.31
118	0.29
119	0.26
120	0.3
121	0.29
122	0.3
123	0.26
124	0.27
125	0.27
126	0.24
127	0.26
128	0.22
129	0.24
130	0.26
131	0.25
132	0.26
133	0.28
134	0.27
135	0.28
136	0.28
137	0.25
138	0.22
139	0.21
140	0.17
141	0.16
142	0.16
143	0.14
144	0.13
145	0.11
146	0.1
147	0.09
148	0.1
149	0.09
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.11
154	0.15
155	0.16
156	0.2
157	0.24
158	0.27
159	0.28
160	0.27
161	0.28
162	0.3
163	0.36
164	0.4
165	0.39
166	0.43
167	0.49
168	0.59
169	0.63
170	0.63
171	0.57
172	0.51
173	0.56
174	0.56
175	0.49
176	0.42
177	0.36
178	0.33
179	0.37
180	0.35
181	0.28
182	0.23
183	0.22
184	0.23
185	0.29
186	0.27
187	0.21
188	0.23
189	0.25
190	0.28
191	0.3
192	0.27
193	0.21
194	0.24
195	0.24
196	0.25
197	0.23
198	0.21
199	0.22
200	0.26
201	0.29
202	0.25
203	0.26
204	0.23
205	0.23
206	0.23
207	0.27
208	0.25
209	0.2
210	0.21
211	0.31
212	0.36
213	0.38
214	0.46
215	0.47
216	0.55
217	0.65
218	0.74
219	0.71
220	0.73
221	0.75
222	0.74
223	0.71
224	0.62
225	0.55
226	0.47
227	0.41
228	0.34
229	0.32
230	0.27
231	0.25
232	0.26
233	0.26
234	0.25
235	0.24
236	0.24
237	0.28
238	0.33
239	0.32
240	0.3
241	0.28
242	0.27
243	0.29
244	0.3
245	0.24
246	0.18
247	0.14
248	0.14
249	0.16
250	0.24
251	0.23
252	0.29
253	0.35
254	0.4
255	0.45
256	0.45
257	0.45
258	0.38
259	0.4
260	0.37
261	0.4
262	0.33
263	0.33
264	0.34
265	0.32
266	0.31
267	0.3
268	0.26
269	0.17
270	0.17
271	0.14
272	0.14
273	0.15
274	0.14
275	0.12
276	0.14
277	0.14
278	0.15
279	0.13
280	0.12
281	0.11
282	0.12
283	0.12
284	0.09
285	0.1
286	0.07
287	0.07
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.15
295	0.15
296	0.14
297	0.16
298	0.15
299	0.15
300	0.19
301	0.23
302	0.24
303	0.26
304	0.26
305	0.29
306	0.3
307	0.31
308	0.25
309	0.27
310	0.26
311	0.28
312	0.3
313	0.26
314	0.26
315	0.28
316	0.32
317	0.29
318	0.32
319	0.34
320	0.38
321	0.42
322	0.42
323	0.41
324	0.38
325	0.38
326	0.33
327	0.28
328	0.24
329	0.23
330	0.23
331	0.23
332	0.22
333	0.22
334	0.2
335	0.23
336	0.23
337	0.2
338	0.18
339	0.15
340	0.15
341	0.15
342	0.14
343	0.09
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.08
388	0.12
389	0.15
390	0.21
391	0.26
392	0.36
393	0.45
394	0.54
395	0.62
396	0.67
397	0.68
398	0.72
399	0.76
400	0.75
401	0.76
402	0.71
403	0.67
404	0.6
405	0.56
406	0.47
407	0.43
408	0.34
409	0.25
410	0.22
411	0.18
412	0.17
413	0.18
414	0.17
415	0.13
416	0.18
417	0.22
418	0.21
419	0.27
420	0.28
421	0.32
422	0.33
423	0.33
424	0.28
425	0.26
426	0.26
427	0.2
428	0.17
429	0.14
430	0.13
431	0.12
432	0.13
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.13
438	0.14
439	0.15
440	0.14
441	0.19
442	0.21
443	0.23
444	0.24
445	0.22
446	0.26
447	0.29
448	0.29
449	0.24
450	0.22
451	0.2
452	0.2
453	0.2
454	0.18
455	0.15
456	0.14
457	0.14
458	0.13
459	0.14
460	0.12
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.14
467	0.12
468	0.13
469	0.15
470	0.14
471	0.13
472	0.12
473	0.13
474	0.11
475	0.12
476	0.11
477	0.09
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.08
485	0.11
486	0.14
487	0.2
488	0.24
489	0.27
490	0.29
491	0.28
492	0.29
493	0.27
494	0.26
495	0.22
496	0.17
497	0.13
498	0.15
499	0.15
500	0.13
501	0.13
502	0.12
503	0.1
504	0.13
505	0.19
506	0.2
507	0.21
508	0.22
509	0.28
510	0.29
511	0.29
512	0.37
513	0.34
514	0.38
515	0.37
516	0.38
517	0.32
518	0.31
519	0.31
520	0.21
521	0.18
522	0.1
523	0.12
524	0.1
525	0.1
526	0.11
527	0.1
528	0.11
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.19
533	0.21
534	0.2
535	0.21
536	0.22
537	0.18
538	0.18
539	0.16
540	0.12
541	0.1
542	0.09
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.09
547	0.09
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.07
552	0.06
553	0.05
554	0.07
555	0.08
556	0.1
557	0.11
558	0.13
559	0.18
560	0.22
561	0.25
562	0.29
563	0.33
564	0.39
565	0.46
566	0.53
567	0.53
568	0.56
569	0.59
570	0.65
571	0.7
572	0.68
573	0.7
574	0.69

P0CR56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer