Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KDK8

Protein Details
Accession Q5KDK8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-165EISSTKGRKRGRKSNAELAAHydrophilic
206-227GEQERTKKKAVKKSRIAKDEPQBasic
230-253DEGNEIVKRKRKPREYPKKVYEIPBasic
573-598DPNPSMQTKGRKSNLKKKTKETVDVDHydrophilic
639-660DVDETKKMPKEKGRVKKKAVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-133KRKRGSK
151-158KGRKRGRK
210-221RTKKKAVKKSRI
237-247KRKRKPREYPK
644-657KKMPKEKGRVKKKA
Subcellular Location(s) mito 19, mito_nucl 12.833, cyto_mito 10.833, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004601  UvdE  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990043  F:5' deoxyribonuclease (pyrimidine dimer) activity  
GO:0000404  F:heteroduplex DNA loop binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0043504  P:mitochondrial DNA repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006290  P:pyrimidine dimer repair  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03851  UvdE  
Amino Acid Sequences MRFLSLFRPPPLSAITTEATLRRQYPSYLPKSIPTLSHIETSMPPRRSARKALQPSSTDMAPFATSPRSLEQSLAPSPPSKPPKATLLAVAMAMDEENLTPPSASDVEDDQVSKVVMNGAADRASIKRKRGSKMAVEEGGKVEIGEISSTKGRKRGRKSNAELAAAKEEAESEEELDFREDMAIPAKGKKNGQRITVESTATAKNGEQERTKKKAVKKSRIAKDEPQYDDEGNEIVKRKRKPREYPKKVYEIPDVERKTTTFRGRLGYACLNTVLRANKPESIFCSRTCRIASIEEEGIELPKGLGLMNVRDLKTLIQWNEDNKIRFMRMSSEMFPFASHAKYGYSLDFADAELKEAGDLAKKYRHRLTMHPGQFTQLGSPKKAVVDASIRELEYHCEIMDRMGLGPDGVMIIHMGGVYGDKESTLARFKENYTTLTSDQVKARLVLENDEICYNVDDLLPVCTELDIPIIFDYHHDALNPSAGPPAELIPKIAEVWNKKGIKMKQHLSEPRPGAESIMERRAHADRCQTLPAELPDDVDLMIEAKDKEQAVFELYRIYGLEDVIHDNLRPPDPNPSMQTKGRKSNLKKKTKETVDVDSQAEPVQLSDIEKEGDGGMGDEGIKKNGQVVEIDDVGIEVDVDETKKMPKEKGRVKKKAVAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.24
4 0.26
5 0.25
6 0.25
7 0.27
8 0.27
9 0.27
10 0.28
11 0.29
12 0.36
13 0.44
14 0.48
15 0.51
16 0.5
17 0.5
18 0.53
19 0.53
20 0.46
21 0.39
22 0.38
23 0.34
24 0.35
25 0.32
26 0.29
27 0.3
28 0.36
29 0.41
30 0.37
31 0.39
32 0.43
33 0.5
34 0.54
35 0.59
36 0.61
37 0.63
38 0.71
39 0.74
40 0.75
41 0.69
42 0.69
43 0.64
44 0.55
45 0.44
46 0.34
47 0.29
48 0.22
49 0.2
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.17
54 0.2
55 0.23
56 0.22
57 0.24
58 0.25
59 0.28
60 0.3
61 0.3
62 0.28
63 0.26
64 0.28
65 0.36
66 0.4
67 0.39
68 0.4
69 0.41
70 0.47
71 0.5
72 0.49
73 0.44
74 0.39
75 0.36
76 0.32
77 0.28
78 0.2
79 0.15
80 0.13
81 0.09
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.16
96 0.17
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.22
112 0.26
113 0.3
114 0.36
115 0.43
116 0.49
117 0.56
118 0.6
119 0.6
120 0.63
121 0.65
122 0.63
123 0.57
124 0.53
125 0.46
126 0.39
127 0.3
128 0.22
129 0.15
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.09
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.24
139 0.32
140 0.4
141 0.5
142 0.58
143 0.64
144 0.73
145 0.78
146 0.81
147 0.8
148 0.75
149 0.67
150 0.59
151 0.52
152 0.41
153 0.34
154 0.24
155 0.18
156 0.13
157 0.13
158 0.11
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.18
173 0.22
174 0.25
175 0.3
176 0.37
177 0.44
178 0.47
179 0.52
180 0.51
181 0.5
182 0.53
183 0.51
184 0.44
185 0.35
186 0.33
187 0.28
188 0.23
189 0.2
190 0.14
191 0.16
192 0.2
193 0.23
194 0.26
195 0.34
196 0.41
197 0.47
198 0.53
199 0.53
200 0.58
201 0.65
202 0.7
203 0.72
204 0.74
205 0.78
206 0.82
207 0.83
208 0.81
209 0.78
210 0.76
211 0.73
212 0.66
213 0.58
214 0.51
215 0.44
216 0.38
217 0.31
218 0.22
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.23
224 0.29
225 0.38
226 0.47
227 0.57
228 0.65
229 0.73
230 0.8
231 0.84
232 0.88
233 0.86
234 0.85
235 0.79
236 0.73
237 0.68
238 0.61
239 0.54
240 0.53
241 0.47
242 0.4
243 0.37
244 0.33
245 0.31
246 0.33
247 0.34
248 0.29
249 0.3
250 0.31
251 0.33
252 0.33
253 0.33
254 0.3
255 0.26
256 0.23
257 0.21
258 0.18
259 0.17
260 0.19
261 0.16
262 0.13
263 0.16
264 0.17
265 0.2
266 0.21
267 0.21
268 0.23
269 0.28
270 0.29
271 0.28
272 0.34
273 0.3
274 0.33
275 0.32
276 0.29
277 0.24
278 0.25
279 0.25
280 0.2
281 0.2
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.13
286 0.1
287 0.08
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.11
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.14
301 0.16
302 0.2
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.19
307 0.23
308 0.26
309 0.24
310 0.22
311 0.22
312 0.2
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.17
317 0.19
318 0.2
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.16
324 0.13
325 0.11
326 0.09
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.1
338 0.08
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.15
349 0.17
350 0.22
351 0.26
352 0.33
353 0.33
354 0.39
355 0.45
356 0.49
357 0.52
358 0.5
359 0.46
360 0.41
361 0.39
362 0.33
363 0.27
364 0.23
365 0.2
366 0.18
367 0.19
368 0.19
369 0.17
370 0.18
371 0.16
372 0.13
373 0.15
374 0.15
375 0.18
376 0.19
377 0.18
378 0.18
379 0.18
380 0.17
381 0.14
382 0.14
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.07
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.17
416 0.18
417 0.25
418 0.26
419 0.26
420 0.25
421 0.28
422 0.26
423 0.31
424 0.31
425 0.28
426 0.28
427 0.28
428 0.25
429 0.22
430 0.22
431 0.2
432 0.19
433 0.18
434 0.2
435 0.18
436 0.19
437 0.18
438 0.17
439 0.14
440 0.14
441 0.11
442 0.09
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.12
461 0.11
462 0.12
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.15
467 0.14
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.12
474 0.13
475 0.13
476 0.14
477 0.12
478 0.13
479 0.14
480 0.16
481 0.19
482 0.19
483 0.25
484 0.33
485 0.33
486 0.35
487 0.42
488 0.44
489 0.49
490 0.54
491 0.56
492 0.54
493 0.62
494 0.69
495 0.65
496 0.69
497 0.62
498 0.55
499 0.51
500 0.43
501 0.35
502 0.29
503 0.3
504 0.25
505 0.3
506 0.29
507 0.26
508 0.3
509 0.34
510 0.34
511 0.33
512 0.37
513 0.34
514 0.36
515 0.4
516 0.37
517 0.33
518 0.34
519 0.32
520 0.27
521 0.23
522 0.21
523 0.18
524 0.18
525 0.16
526 0.12
527 0.1
528 0.07
529 0.07
530 0.09
531 0.08
532 0.08
533 0.12
534 0.12
535 0.13
536 0.14
537 0.14
538 0.16
539 0.16
540 0.16
541 0.16
542 0.16
543 0.16
544 0.15
545 0.15
546 0.12
547 0.11
548 0.12
549 0.1
550 0.13
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.16
555 0.2
556 0.21
557 0.22
558 0.2
559 0.28
560 0.32
561 0.37
562 0.38
563 0.41
564 0.45
565 0.5
566 0.59
567 0.57
568 0.62
569 0.65
570 0.71
571 0.74
572 0.78
573 0.82
574 0.83
575 0.83
576 0.82
577 0.85
578 0.83
579 0.83
580 0.78
581 0.75
582 0.73
583 0.69
584 0.62
585 0.52
586 0.45
587 0.36
588 0.31
589 0.23
590 0.14
591 0.12
592 0.1
593 0.11
594 0.12
595 0.12
596 0.13
597 0.13
598 0.13
599 0.12
600 0.11
601 0.1
602 0.09
603 0.08
604 0.07
605 0.08
606 0.11
607 0.12
608 0.14
609 0.14
610 0.13
611 0.18
612 0.19
613 0.2
614 0.17
615 0.2
616 0.22
617 0.22
618 0.23
619 0.18
620 0.16
621 0.15
622 0.13
623 0.09
624 0.04
625 0.05
626 0.06
627 0.07
628 0.08
629 0.09
630 0.14
631 0.2
632 0.25
633 0.32
634 0.4
635 0.5
636 0.6
637 0.7
638 0.77
639 0.81
640 0.85