Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9WTV5

Protein Details
Accession A0A0F9WTV5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-406IKKKICYKTKDKFNLYKKIRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027075  CPSF2  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF16661  Lactamase_B_6  
Amino Acid Sequences MKNIITFEPLIETFKEVYCHLLTINNTRILINCGGDLSFYTQELLNIINSCDCILVTSFDSACINGLWTILDRGYFKPVYMSVPIKEYSLIFHPFEYKNIFEIKYLQPFNVNNVQICAFASGNSLGASLFKITSNLENIYVGYNINHRKENHLNGIDLKNITDSYVFITNTNYCIKENINSSTRNEQFLNLIKNWFTSKNKKMIIYVTYPRLHEIGLLLNTIKDKKIVILDKYIKKFINKSKNMIEWSNTSLIEQNDVYEYSNIEKVEYYSLLNDFDICILLDDDISLLDKFNDENLCVIFIDKKFNITHKPIYQYNGSYEIKTDIKENDIFEESSEEEIEKHWSELKNELKFDYNGNIIEESTLNTNDLFLETYRDIYGYPSLEPIKKKICYKTKDKFNLYKKIRNYDDYGEYIDKEKFVVKIERNERILEPVTTVKVYSETKKLIKSDFIPKCKMQIFNLQGSSDLKNIKVILQNIDSKKILLVEDSLVNAKFMYSYLLCAVKNVQICNSLINLSSSKNINILNVSDIMNNMENEGVKVYNSKMFRFKGFREDDKLKYIERPDKITVCDFNNLTKKLMSVNLKIEKNKNVYVVQDKVRVKIEQDKIILDGEVGDIYYHIKDIIYDSIISL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.18
4 0.22
5 0.2
6 0.2
7 0.18
8 0.21
9 0.23
10 0.29
11 0.35
12 0.34
13 0.34
14 0.33
15 0.34
16 0.34
17 0.33
18 0.26
19 0.2
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.09
56 0.11
57 0.1
58 0.12
59 0.14
60 0.15
61 0.21
62 0.21
63 0.2
64 0.21
65 0.22
66 0.24
67 0.27
68 0.29
69 0.24
70 0.27
71 0.28
72 0.25
73 0.25
74 0.22
75 0.19
76 0.21
77 0.23
78 0.2
79 0.21
80 0.26
81 0.26
82 0.29
83 0.3
84 0.26
85 0.24
86 0.28
87 0.28
88 0.23
89 0.28
90 0.29
91 0.34
92 0.34
93 0.32
94 0.33
95 0.33
96 0.38
97 0.41
98 0.37
99 0.29
100 0.3
101 0.3
102 0.25
103 0.24
104 0.21
105 0.13
106 0.11
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.12
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.12
129 0.1
130 0.16
131 0.21
132 0.24
133 0.29
134 0.28
135 0.36
136 0.42
137 0.48
138 0.5
139 0.47
140 0.45
141 0.45
142 0.46
143 0.42
144 0.35
145 0.28
146 0.21
147 0.18
148 0.17
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.16
156 0.16
157 0.19
158 0.21
159 0.19
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.22
165 0.25
166 0.27
167 0.28
168 0.31
169 0.38
170 0.39
171 0.38
172 0.35
173 0.3
174 0.3
175 0.33
176 0.34
177 0.27
178 0.27
179 0.23
180 0.24
181 0.26
182 0.28
183 0.29
184 0.33
185 0.38
186 0.45
187 0.49
188 0.49
189 0.49
190 0.47
191 0.45
192 0.42
193 0.41
194 0.39
195 0.38
196 0.37
197 0.36
198 0.32
199 0.27
200 0.21
201 0.17
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.17
214 0.21
215 0.21
216 0.29
217 0.37
218 0.44
219 0.46
220 0.49
221 0.44
222 0.42
223 0.47
224 0.48
225 0.51
226 0.48
227 0.5
228 0.52
229 0.55
230 0.56
231 0.5
232 0.43
233 0.34
234 0.34
235 0.31
236 0.25
237 0.2
238 0.2
239 0.18
240 0.18
241 0.15
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.13
290 0.13
291 0.15
292 0.15
293 0.18
294 0.23
295 0.24
296 0.29
297 0.28
298 0.33
299 0.32
300 0.34
301 0.33
302 0.29
303 0.27
304 0.28
305 0.25
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.18
312 0.12
313 0.14
314 0.16
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.13
320 0.14
321 0.12
322 0.1
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.22
334 0.28
335 0.29
336 0.29
337 0.3
338 0.28
339 0.28
340 0.28
341 0.23
342 0.17
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.12
367 0.09
368 0.1
369 0.12
370 0.14
371 0.18
372 0.19
373 0.22
374 0.27
375 0.3
376 0.35
377 0.41
378 0.48
379 0.51
380 0.6
381 0.65
382 0.69
383 0.74
384 0.76
385 0.77
386 0.76
387 0.8
388 0.77
389 0.75
390 0.7
391 0.69
392 0.65
393 0.59
394 0.55
395 0.49
396 0.46
397 0.4
398 0.38
399 0.3
400 0.27
401 0.26
402 0.22
403 0.17
404 0.14
405 0.14
406 0.12
407 0.15
408 0.22
409 0.24
410 0.33
411 0.39
412 0.44
413 0.44
414 0.46
415 0.42
416 0.39
417 0.37
418 0.28
419 0.24
420 0.2
421 0.2
422 0.18
423 0.17
424 0.13
425 0.15
426 0.17
427 0.18
428 0.21
429 0.25
430 0.28
431 0.32
432 0.34
433 0.32
434 0.34
435 0.35
436 0.41
437 0.45
438 0.47
439 0.48
440 0.47
441 0.51
442 0.51
443 0.49
444 0.41
445 0.43
446 0.42
447 0.42
448 0.44
449 0.38
450 0.35
451 0.34
452 0.33
453 0.26
454 0.23
455 0.17
456 0.17
457 0.18
458 0.2
459 0.22
460 0.22
461 0.23
462 0.26
463 0.33
464 0.33
465 0.37
466 0.33
467 0.29
468 0.28
469 0.25
470 0.21
471 0.14
472 0.14
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.15
477 0.13
478 0.13
479 0.12
480 0.1
481 0.08
482 0.07
483 0.1
484 0.08
485 0.1
486 0.13
487 0.16
488 0.16
489 0.17
490 0.19
491 0.19
492 0.22
493 0.21
494 0.21
495 0.2
496 0.21
497 0.22
498 0.21
499 0.18
500 0.15
501 0.17
502 0.16
503 0.14
504 0.17
505 0.17
506 0.17
507 0.19
508 0.19
509 0.18
510 0.19
511 0.18
512 0.17
513 0.17
514 0.18
515 0.15
516 0.15
517 0.16
518 0.16
519 0.15
520 0.13
521 0.13
522 0.12
523 0.12
524 0.13
525 0.11
526 0.09
527 0.11
528 0.13
529 0.17
530 0.2
531 0.23
532 0.29
533 0.31
534 0.39
535 0.43
536 0.44
537 0.49
538 0.54
539 0.57
540 0.58
541 0.61
542 0.58
543 0.58
544 0.57
545 0.49
546 0.48
547 0.5
548 0.5
549 0.48
550 0.5
551 0.5
552 0.51
553 0.53
554 0.52
555 0.48
556 0.43
557 0.45
558 0.4
559 0.42
560 0.46
561 0.44
562 0.41
563 0.37
564 0.34
565 0.31
566 0.38
567 0.36
568 0.33
569 0.41
570 0.47
571 0.52
572 0.58
573 0.61
574 0.61
575 0.61
576 0.59
577 0.55
578 0.48
579 0.49
580 0.5
581 0.51
582 0.48
583 0.51
584 0.49
585 0.48
586 0.51
587 0.46
588 0.43
589 0.46
590 0.48
591 0.46
592 0.47
593 0.44
594 0.41
595 0.4
596 0.36
597 0.26
598 0.19
599 0.12
600 0.1
601 0.09
602 0.07
603 0.06
604 0.08
605 0.09
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.11
611 0.15
612 0.15