Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KCA4

Protein Details
Accession Q5KCA4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
531-559STGAGGDDKKKRQRKRGGKDKEEEKKDEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
534-556AGGDDKKKRQRKRGGKDKEEEKK
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 11.5, nucl 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
KEGG cne:CNH00340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MVDTQYAFRAQKTAGVADAPAWEVSNRIPAETVGSKCYAYSPNGEWLAYAMNNCVEIIPSHSSSPTPVTLQQANIVALKFSPMSSYLFTFERPVKTESGEMYKNAKAWDVKNGEIVGGWYQKTMEDWEPIITPNETHLLRAGPSDLAIFSPPFAPRPSTRLKIEGIRGIFISDPSALPATSTNSRPIPAYHEPAVAIWIGEKKGAPASLGLWSLSSLMGKNALQANGNGDIQTETRDMPPTTARKAFYKADKLTVKWNNAGTMALFLAQSDVDNSGKSYYGETNLYLVGLDGTFDGLVELDKEGPIYDFAWSPISREFTVCYGYMPARTQMFDLKAKPVYSFGENPRNTLVYQPQGKLLLSAGFGNLAGGIDIWDVSTRNKVAEFKASNASHCEWSPCGRYVLTATLSPRLRVDNGVKIWWCNGQLLHIQPVEELYQASFAPQRVTEIGSFPAIVPKAPEANPSVAAYRPKGETDGVAAKPAGAYRPPGARNRPEGENASASFGSSRGKPGVRTVPGAGGRQPPGSAPGASTGAGGDDKKKRQRKRGGKDKEEEKKDEAPTQEAVKPEVKEEAGEDAVAKKIRNLMKKLKAIDELKTKLAAGEILEKTQLKKIESEAQVKSEIKALGGNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.21
4 0.19
5 0.2
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.19
13 0.18
14 0.17
15 0.18
16 0.17
17 0.24
18 0.29
19 0.29
20 0.25
21 0.26
22 0.26
23 0.25
24 0.29
25 0.26
26 0.23
27 0.26
28 0.26
29 0.32
30 0.34
31 0.33
32 0.29
33 0.26
34 0.27
35 0.23
36 0.2
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.1
43 0.09
44 0.14
45 0.17
46 0.18
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.24
52 0.22
53 0.2
54 0.22
55 0.26
56 0.28
57 0.29
58 0.3
59 0.29
60 0.28
61 0.27
62 0.24
63 0.18
64 0.15
65 0.16
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.13
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.22
77 0.25
78 0.27
79 0.28
80 0.29
81 0.28
82 0.29
83 0.32
84 0.31
85 0.33
86 0.31
87 0.3
88 0.32
89 0.32
90 0.32
91 0.29
92 0.3
93 0.28
94 0.27
95 0.34
96 0.34
97 0.33
98 0.34
99 0.34
100 0.29
101 0.25
102 0.25
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.18
111 0.17
112 0.16
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.21
118 0.17
119 0.14
120 0.14
121 0.18
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.15
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.18
142 0.18
143 0.24
144 0.31
145 0.34
146 0.36
147 0.38
148 0.4
149 0.41
150 0.44
151 0.43
152 0.37
153 0.32
154 0.29
155 0.27
156 0.24
157 0.18
158 0.15
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.13
167 0.16
168 0.17
169 0.2
170 0.2
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.25
175 0.26
176 0.3
177 0.28
178 0.28
179 0.27
180 0.26
181 0.26
182 0.18
183 0.13
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.09
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.11
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.2
227 0.21
228 0.25
229 0.28
230 0.28
231 0.28
232 0.32
233 0.35
234 0.36
235 0.41
236 0.38
237 0.43
238 0.44
239 0.42
240 0.47
241 0.49
242 0.45
243 0.39
244 0.39
245 0.32
246 0.29
247 0.28
248 0.19
249 0.13
250 0.11
251 0.08
252 0.07
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.12
306 0.14
307 0.13
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.16
319 0.18
320 0.18
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.21
325 0.19
326 0.18
327 0.18
328 0.22
329 0.24
330 0.32
331 0.31
332 0.32
333 0.32
334 0.31
335 0.28
336 0.25
337 0.23
338 0.2
339 0.23
340 0.23
341 0.23
342 0.23
343 0.23
344 0.2
345 0.18
346 0.13
347 0.1
348 0.09
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.04
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.11
368 0.13
369 0.14
370 0.22
371 0.23
372 0.23
373 0.31
374 0.31
375 0.3
376 0.32
377 0.32
378 0.26
379 0.25
380 0.24
381 0.17
382 0.2
383 0.22
384 0.2
385 0.2
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.19
390 0.17
391 0.16
392 0.16
393 0.21
394 0.22
395 0.22
396 0.21
397 0.2
398 0.19
399 0.22
400 0.24
401 0.25
402 0.25
403 0.28
404 0.28
405 0.26
406 0.27
407 0.25
408 0.22
409 0.16
410 0.15
411 0.14
412 0.17
413 0.18
414 0.21
415 0.19
416 0.18
417 0.17
418 0.18
419 0.16
420 0.13
421 0.11
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.13
431 0.13
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.13
437 0.14
438 0.12
439 0.15
440 0.13
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.16
445 0.16
446 0.19
447 0.18
448 0.2
449 0.21
450 0.21
451 0.21
452 0.2
453 0.22
454 0.21
455 0.21
456 0.21
457 0.2
458 0.21
459 0.2
460 0.17
461 0.19
462 0.24
463 0.22
464 0.22
465 0.21
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.16
470 0.11
471 0.13
472 0.15
473 0.22
474 0.27
475 0.34
476 0.4
477 0.45
478 0.51
479 0.53
480 0.53
481 0.51
482 0.5
483 0.47
484 0.43
485 0.37
486 0.34
487 0.29
488 0.25
489 0.21
490 0.18
491 0.16
492 0.14
493 0.16
494 0.17
495 0.19
496 0.2
497 0.27
498 0.35
499 0.36
500 0.38
501 0.36
502 0.39
503 0.4
504 0.41
505 0.38
506 0.34
507 0.34
508 0.31
509 0.3
510 0.23
511 0.24
512 0.24
513 0.2
514 0.16
515 0.16
516 0.17
517 0.17
518 0.16
519 0.12
520 0.11
521 0.13
522 0.13
523 0.17
524 0.24
525 0.32
526 0.42
527 0.52
528 0.6
529 0.69
530 0.79
531 0.84
532 0.87
533 0.9
534 0.91
535 0.91
536 0.92
537 0.92
538 0.91
539 0.87
540 0.81
541 0.76
542 0.72
543 0.66
544 0.62
545 0.54
546 0.47
547 0.42
548 0.42
549 0.39
550 0.33
551 0.33
552 0.32
553 0.3
554 0.28
555 0.3
556 0.25
557 0.23
558 0.23
559 0.23
560 0.19
561 0.18
562 0.17
563 0.15
564 0.19
565 0.21
566 0.19
567 0.17
568 0.24
569 0.31
570 0.39
571 0.45
572 0.51
573 0.59
574 0.66
575 0.69
576 0.67
577 0.69
578 0.63
579 0.63
580 0.62
581 0.56
582 0.51
583 0.48
584 0.42
585 0.34
586 0.31
587 0.25
588 0.17
589 0.22
590 0.21
591 0.21
592 0.25
593 0.26
594 0.27
595 0.32
596 0.34
597 0.27
598 0.28
599 0.32
600 0.38
601 0.44
602 0.49
603 0.47
604 0.46
605 0.5
606 0.49
607 0.44
608 0.4
609 0.33
610 0.27