Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KMC2

Protein Details
Accession Q5KMC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
447-468LYFEPRKEKDDRPKAKGQRTGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
459-461PKA
485-495GRGGRGPRGRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13, nucl 8.5, mito_nucl 6.998, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032710  NTF2-like_dom_sf  
IPR002075  NTF2_dom  
IPR018222  Nuclear_transport_factor_2_euk  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR039539  Ras_GTPase_bind_prot  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:1990861  C:Ubp3-Bre5 deubiquitination complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0034517  P:ribophagy  
KEGG cne:CNB02200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02136  NTF2  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50177  NTF2_DOMAIN  
PS50102  RRM  
CDD cd00780  NTF2  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MASTQPPVAAPDQSKIRPQDVGWQFVPQYYNFVNSQPHRLHCFYNKRSTFIHGEEGEDVTPAFGQQEIHDRILQIGYNQCKVYIHSMDSQSSADGGIIILVLGELSNNHQSWRKFSQTFFLAEQPGGYFVLNDIFRYLREDVDEDESAPQETVQPQEEPAQPEVAAEKLPEATTVTQEPAEDPVPEPAPVSAPAEVVVDAVPEEAEIAAVPDKDVAPEQEPPVVKEPEAAPEPVEETPKPAASVTESIASPAPAAPIPAAKAASPSPAAPKAAAPTTNGSSPASTTPAAPSKPMTWASMAASNVWGKTASPSATAPAPAPAPAPAAAPAPGPAQPKKDEKPAPAAGTGQGQRRQQTIDPSKVQTAHCFVKLPNWSPDSQSSSDFLTDAELSKIASRFGEVKSTEIVKSKACAFVEFARVESARKAIQHSLPVEQGGEGGTKFPNGTLYFEPRKEKDDRPKAKGQRTGGQQGQGQGQRQVNGGAGGRGGRGPRGRGGQGNQGDRQPQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.45
4 0.42
5 0.41
6 0.45
7 0.43
8 0.46
9 0.4
10 0.4
11 0.37
12 0.37
13 0.39
14 0.29
15 0.29
16 0.24
17 0.27
18 0.23
19 0.26
20 0.31
21 0.32
22 0.4
23 0.4
24 0.44
25 0.47
26 0.49
27 0.52
28 0.54
29 0.62
30 0.61
31 0.66
32 0.64
33 0.61
34 0.6
35 0.59
36 0.56
37 0.48
38 0.49
39 0.38
40 0.38
41 0.36
42 0.36
43 0.3
44 0.23
45 0.2
46 0.12
47 0.11
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.07
52 0.08
53 0.18
54 0.21
55 0.24
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.26
60 0.25
61 0.19
62 0.22
63 0.24
64 0.27
65 0.26
66 0.26
67 0.25
68 0.26
69 0.3
70 0.26
71 0.26
72 0.28
73 0.31
74 0.32
75 0.32
76 0.3
77 0.24
78 0.2
79 0.17
80 0.11
81 0.08
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.02
90 0.02
91 0.03
92 0.06
93 0.11
94 0.11
95 0.13
96 0.19
97 0.2
98 0.27
99 0.33
100 0.38
101 0.37
102 0.37
103 0.43
104 0.41
105 0.44
106 0.4
107 0.37
108 0.31
109 0.28
110 0.27
111 0.2
112 0.17
113 0.14
114 0.12
115 0.08
116 0.07
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.16
124 0.17
125 0.12
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.2
130 0.21
131 0.17
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.15
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.11
205 0.12
206 0.15
207 0.15
208 0.17
209 0.21
210 0.21
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.17
217 0.12
218 0.12
219 0.14
220 0.13
221 0.15
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.05
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.12
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.12
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.19
280 0.2
281 0.18
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.19
286 0.18
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.07
294 0.09
295 0.11
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.12
318 0.16
319 0.17
320 0.2
321 0.25
322 0.31
323 0.34
324 0.42
325 0.43
326 0.43
327 0.49
328 0.49
329 0.47
330 0.41
331 0.39
332 0.31
333 0.31
334 0.32
335 0.29
336 0.3
337 0.3
338 0.31
339 0.32
340 0.34
341 0.31
342 0.38
343 0.4
344 0.42
345 0.44
346 0.45
347 0.46
348 0.47
349 0.46
350 0.39
351 0.37
352 0.32
353 0.3
354 0.29
355 0.26
356 0.29
357 0.34
358 0.34
359 0.35
360 0.35
361 0.34
362 0.36
363 0.4
364 0.39
365 0.35
366 0.32
367 0.27
368 0.26
369 0.25
370 0.22
371 0.17
372 0.13
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.09
377 0.1
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.14
384 0.15
385 0.22
386 0.19
387 0.2
388 0.23
389 0.25
390 0.25
391 0.26
392 0.27
393 0.21
394 0.23
395 0.24
396 0.27
397 0.25
398 0.24
399 0.24
400 0.26
401 0.32
402 0.29
403 0.28
404 0.26
405 0.26
406 0.26
407 0.24
408 0.22
409 0.18
410 0.2
411 0.23
412 0.26
413 0.29
414 0.34
415 0.35
416 0.35
417 0.34
418 0.33
419 0.29
420 0.23
421 0.2
422 0.14
423 0.13
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.15
431 0.15
432 0.19
433 0.22
434 0.31
435 0.37
436 0.42
437 0.48
438 0.45
439 0.49
440 0.51
441 0.56
442 0.59
443 0.63
444 0.68
445 0.69
446 0.77
447 0.81
448 0.84
449 0.83
450 0.78
451 0.75
452 0.74
453 0.75
454 0.69
455 0.64
456 0.58
457 0.53
458 0.55
459 0.51
460 0.46
461 0.43
462 0.42
463 0.39
464 0.37
465 0.35
466 0.28
467 0.26
468 0.24
469 0.18
470 0.16
471 0.15
472 0.15
473 0.17
474 0.17
475 0.2
476 0.24
477 0.26
478 0.31
479 0.37
480 0.41
481 0.45
482 0.48
483 0.51
484 0.55
485 0.58
486 0.55
487 0.54