Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KKZ0

Protein Details
Accession Q5KKZ0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-69FDDPVKRAQPQMKGKRKKNLTQFGLKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-59GKRK
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11.5, nucl 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
IPR032819  TruB_C  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG cne:CNC01370  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16198  TruB_C_2  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MPKALPTPTLPLNGLFPIAKPSGKSSMRVIDRITPLLLDSKLFDDPVKRAQPQMKGKRKKNLTQFGLKIGQGGTLDPLADGVLVLGVNRGTKHLNQFLECSKEYESIGLIGATTTSMDADDPVLSTAPWEHITREDVEKVLDRFRGEIMQVPPIFSALKMDGKPLYEYARESKPLPRPIPARKCQVSIELIDFTPASVTPGDGGHDYHWPEKRLTSEEKETFRRLTEIVHNAQTGPVETAKTSGNKDQVEEEKLRVVEPLVPDLDAPEYPEISPNNGLRPPTFTVRMTVSSGTYVRSIVNDIGLALGCGAHVVKLTRTRQGEFSLYGDEKALSTASASAPAEGEEASVNEDRREAPGPSGGSIPWTVWERALAERDEMIKREKLEKEEAIMAGMSAEEIHQVYNPEAIKQRRWEGGWKEWEVEVLKRFKPVPVPINGGHGFRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.21
3 0.18
4 0.2
5 0.21
6 0.22
7 0.2
8 0.24
9 0.32
10 0.34
11 0.36
12 0.36
13 0.43
14 0.46
15 0.48
16 0.46
17 0.44
18 0.46
19 0.45
20 0.4
21 0.31
22 0.27
23 0.28
24 0.26
25 0.18
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.18
30 0.19
31 0.18
32 0.21
33 0.3
34 0.35
35 0.33
36 0.39
37 0.45
38 0.53
39 0.6
40 0.67
41 0.69
42 0.73
43 0.8
44 0.84
45 0.87
46 0.86
47 0.86
48 0.86
49 0.82
50 0.81
51 0.76
52 0.72
53 0.68
54 0.58
55 0.49
56 0.39
57 0.33
58 0.23
59 0.21
60 0.16
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.09
77 0.11
78 0.15
79 0.22
80 0.28
81 0.31
82 0.31
83 0.35
84 0.37
85 0.4
86 0.38
87 0.33
88 0.29
89 0.27
90 0.26
91 0.23
92 0.19
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.13
119 0.16
120 0.18
121 0.2
122 0.19
123 0.17
124 0.18
125 0.2
126 0.2
127 0.21
128 0.21
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.15
134 0.2
135 0.18
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.22
140 0.21
141 0.2
142 0.14
143 0.15
144 0.1
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.22
157 0.22
158 0.23
159 0.29
160 0.34
161 0.41
162 0.41
163 0.42
164 0.46
165 0.55
166 0.63
167 0.61
168 0.62
169 0.56
170 0.57
171 0.52
172 0.49
173 0.41
174 0.32
175 0.28
176 0.21
177 0.19
178 0.17
179 0.15
180 0.11
181 0.09
182 0.08
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.1
193 0.12
194 0.16
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.21
199 0.22
200 0.24
201 0.27
202 0.27
203 0.31
204 0.35
205 0.38
206 0.4
207 0.4
208 0.37
209 0.32
210 0.29
211 0.22
212 0.2
213 0.21
214 0.22
215 0.23
216 0.23
217 0.23
218 0.22
219 0.22
220 0.19
221 0.14
222 0.1
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.16
231 0.21
232 0.2
233 0.21
234 0.24
235 0.25
236 0.27
237 0.27
238 0.24
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.17
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.14
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.16
261 0.16
262 0.18
263 0.2
264 0.21
265 0.18
266 0.22
267 0.23
268 0.23
269 0.26
270 0.22
271 0.23
272 0.25
273 0.26
274 0.24
275 0.21
276 0.18
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.03
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.05
299 0.06
300 0.09
301 0.17
302 0.19
303 0.26
304 0.29
305 0.31
306 0.33
307 0.35
308 0.35
309 0.29
310 0.29
311 0.27
312 0.25
313 0.23
314 0.21
315 0.18
316 0.15
317 0.14
318 0.12
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.07
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.09
331 0.06
332 0.06
333 0.09
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.16
340 0.19
341 0.17
342 0.16
343 0.21
344 0.21
345 0.21
346 0.22
347 0.19
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.14
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.17
356 0.17
357 0.2
358 0.24
359 0.21
360 0.19
361 0.21
362 0.25
363 0.26
364 0.26
365 0.27
366 0.27
367 0.29
368 0.36
369 0.38
370 0.39
371 0.43
372 0.43
373 0.42
374 0.43
375 0.4
376 0.33
377 0.28
378 0.23
379 0.15
380 0.13
381 0.09
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.08
388 0.1
389 0.1
390 0.15
391 0.16
392 0.19
393 0.26
394 0.31
395 0.36
396 0.41
397 0.47
398 0.48
399 0.5
400 0.55
401 0.55
402 0.6
403 0.62
404 0.58
405 0.55
406 0.49
407 0.5
408 0.44
409 0.42
410 0.39
411 0.37
412 0.36
413 0.38
414 0.39
415 0.39
416 0.44
417 0.48
418 0.48
419 0.48
420 0.54
421 0.5
422 0.57
423 0.55