Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CM08

Protein Details
Accession P0CM08    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-291HPPTPLPAKSRRPRDQREDYEARKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-284SRRPRDQR
288-297EARKKGKSAA
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 12, cyto 4.5, nucl 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038704  YEAST_sf  
IPR005033  YEATS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035267  C:NuA4 histone acetyltransferase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNI04050  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03366  YEATS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51037  YEATS  
CDD cd16908  YEATS_Yaf9_like  
Amino Acid Sequences MSSERVRGIQVHRPIIFGSHARLLTEAEKQLAPAGHTHKWTVFLNSAASPPLKQGEPPDYEDIDYLPGGADDLSYFIRKVTFKLHETYATPNRVIDKPPYRVSETGWGEFTVQIRIQLIPESSEKPLGLQHNIKLHHWGAPVEPLPVVSGAPTPTPVPTESNTEVKLEPDTPAPLEESVTPAPTIQRPASEPATNEPGSNQGTPAPPGGDSTEQIKVDVATPALEVIEPSATPAPLSLAARLPIHAWQYDEIVFSDPPRQFLDILNAHPPTPLPAKSRRPRDQREDYEARKKGKSAARGASVTASARASRAGTVDTAAAGTPAPAQIGIPGEPGSADVPLEFTQEMLKGEHNAMLDARVKIVEQMDRWRERLIALEKELAKAKEDVKATAAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.39
4 0.32
5 0.29
6 0.27
7 0.27
8 0.26
9 0.27
10 0.27
11 0.25
12 0.29
13 0.26
14 0.22
15 0.22
16 0.22
17 0.25
18 0.24
19 0.22
20 0.22
21 0.27
22 0.28
23 0.3
24 0.33
25 0.3
26 0.33
27 0.33
28 0.32
29 0.29
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.23
35 0.22
36 0.18
37 0.18
38 0.2
39 0.18
40 0.18
41 0.22
42 0.27
43 0.3
44 0.35
45 0.37
46 0.35
47 0.35
48 0.34
49 0.29
50 0.23
51 0.19
52 0.14
53 0.09
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.04
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.22
68 0.27
69 0.29
70 0.33
71 0.35
72 0.35
73 0.36
74 0.43
75 0.42
76 0.39
77 0.37
78 0.34
79 0.36
80 0.35
81 0.36
82 0.37
83 0.37
84 0.4
85 0.45
86 0.47
87 0.47
88 0.46
89 0.46
90 0.46
91 0.43
92 0.38
93 0.33
94 0.29
95 0.26
96 0.27
97 0.25
98 0.18
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.14
108 0.16
109 0.16
110 0.17
111 0.16
112 0.15
113 0.19
114 0.2
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.3
119 0.32
120 0.32
121 0.32
122 0.3
123 0.28
124 0.26
125 0.23
126 0.18
127 0.21
128 0.21
129 0.17
130 0.16
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.18
147 0.2
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.2
153 0.2
154 0.15
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.14
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.17
176 0.19
177 0.2
178 0.19
179 0.18
180 0.24
181 0.23
182 0.21
183 0.17
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.15
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.11
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.15
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.09
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.17
243 0.16
244 0.18
245 0.18
246 0.19
247 0.18
248 0.19
249 0.25
250 0.22
251 0.23
252 0.26
253 0.25
254 0.24
255 0.24
256 0.22
257 0.19
258 0.2
259 0.22
260 0.22
261 0.3
262 0.41
263 0.49
264 0.6
265 0.66
266 0.72
267 0.77
268 0.82
269 0.84
270 0.81
271 0.82
272 0.8
273 0.77
274 0.78
275 0.75
276 0.7
277 0.61
278 0.54
279 0.53
280 0.5
281 0.51
282 0.49
283 0.5
284 0.5
285 0.49
286 0.49
287 0.42
288 0.37
289 0.3
290 0.24
291 0.18
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.08
323 0.08
324 0.06
325 0.09
326 0.09
327 0.12
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.13
332 0.14
333 0.13
334 0.14
335 0.15
336 0.16
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.18
342 0.21
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.16
347 0.18
348 0.21
349 0.22
350 0.21
351 0.31
352 0.39
353 0.43
354 0.44
355 0.43
356 0.4
357 0.36
358 0.42
359 0.39
360 0.36
361 0.36
362 0.41
363 0.41
364 0.43
365 0.49
366 0.4
367 0.36
368 0.34
369 0.33
370 0.32
371 0.33
372 0.31